MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021012	A	6	6	388509	388514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_021012	CTGC	2	8	388538	388545	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8003	NC_021012	GAG	2	6	388590	388595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_021012	GAA	2	6	388609	388614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_021012	GAAA	2	8	388639	388646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_021012	GGC	2	6	388707	388712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_021012	AG	3	6	388761	388766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_021012	CAA	2	6	388850	388855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_021012	GAA	2	6	388888	388893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_021012	TGATC	2	10	388943	388952	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8011	NC_021012	AG	3	6	388976	388981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_021012	CA	3	6	389018	389023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8013	NC_021012	GCA	2	6	389040	389045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_021012	GAT	2	6	389208	389213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_021012	TTC	2	6	389220	389225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_021012	TGAT	2	8	389233	389240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_021012	TG	3	6	389256	389261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_021012	A	6	6	389390	389395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_021012	TGA	2	6	389408	389413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_021012	GCG	2	6	389479	389484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_021012	GCA	2	6	389490	389495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_021012	A	6	6	389556	389561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_021012	AATA	2	8	389608	389615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_021012	AGGA	2	8	389622	389629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_021012	AGC	2	6	389652	389657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146526
8026	NC_021012	TAT	2	6	389701	389706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146526
8027	NC_021012	TAT	2	6	389712	389717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146526
8028	NC_021012	GAA	2	6	389740	389745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146526
8029	NC_021012	GGT	2	6	389776	389781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146526
8030	NC_021012	TACAG	2	10	389872	389881	40 %	20 %	20 %	20 %	479146526
8031	NC_021012	GAT	2	6	389905	389910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146526
8032	NC_021012	GCAA	2	8	389944	389951	50 %	0 %	25 %	25 %	479146526
8033	NC_021012	GAA	2	6	389959	389964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146526
8034	NC_021012	CAA	2	6	390050	390055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146526
8035	NC_021012	AGG	2	6	390206	390211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146526
8036	NC_021012	TCC	2	6	390364	390369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146526
8037	NC_021012	GCA	2	6	390382	390387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146526
8038	NC_021012	GCA	2	6	390445	390450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146526
8039	NC_021012	TAT	2	6	390537	390542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146526
8040	NC_021012	ATC	2	6	390577	390582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146526
8041	NC_021012	GAA	2	6	390598	390603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146526
8042	NC_021012	GAA	2	6	390636	390641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146526
8043	NC_021012	ATTG	2	8	390690	390697	25 %	50 %	25 %	0 %	479146526
8044	NC_021012	TGA	2	6	390755	390760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146526
8045	NC_021012	TAT	2	6	390765	390770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146526
8046	NC_021012	TTG	2	6	390791	390796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146526
8047	NC_021012	TTCT	2	8	390816	390823	0 %	75 %	0 %	25 %	479146526
8048	NC_021012	GA	3	6	390837	390842	50 %	0 %	50 %	0 %	479146526
8049	NC_021012	AG	3	6	390867	390872	50 %	0 %	50 %	0 %	479146526
8050	NC_021012	AGA	2	6	390893	390898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146526
8051	NC_021012	GACTT	2	10	390995	391004	20 %	40 %	20 %	20 %	479146526
8052	NC_021012	GGA	2	6	391009	391014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146526
8053	NC_021012	ACT	2	6	391021	391026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146526
8054	NC_021012	AAG	2	6	391088	391093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146526
8055	NC_021012	CAAA	2	8	391118	391125	75 %	0 %	0 %	25 %	479146526
8056	NC_021012	AAC	2	6	391134	391139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146526
8057	NC_021012	AGA	2	6	391173	391178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146526
8058	NC_021012	TGA	2	6	391182	391187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146526
8059	NC_021012	AAT	2	6	391192	391197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146526
8060	NC_021012	CCA	2	6	391229	391234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146526
8061	NC_021012	GTG	2	6	391265	391270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146526
8062	NC_021012	TGCG	2	8	391274	391281	0 %	25 %	50 %	25 %	479146526
8063	NC_021012	TTA	2	6	391298	391303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146526
8064	NC_021012	CAA	2	6	391307	391312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146526
8065	NC_021012	ACG	2	6	391388	391393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146526
8066	NC_021012	ACGAT	2	10	391487	391496	40 %	20 %	20 %	20 %	479146526
8067	NC_021012	AAC	2	6	391623	391628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146526
8068	NC_021012	TAT	2	6	391632	391637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146526
8069	NC_021012	CTT	2	6	391654	391659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146526
8070	NC_021012	ATCT	2	8	391725	391732	25 %	50 %	0 %	25 %	479146526
8071	NC_021012	TGA	2	6	391757	391762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146526
8072	NC_021012	AAAAT	2	10	391778	391787	80 %	20 %	0 %	0 %	479146526
8073	NC_021012	GAA	2	6	391806	391811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_021012	CGGG	2	8	391890	391897	0 %	0 %	75 %	25 %	479146527
8075	NC_021012	A	6	6	391967	391972	100 %	0 %	0 %	0 %	479146527
8076	NC_021012	TGG	2	6	392020	392025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146527
8077	NC_021012	TTA	2	6	392032	392037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146527
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8080	NC_021012	GGC	2	6	392115	392120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146527
8081	NC_021012	ATGT	2	8	392142	392149	25 %	50 %	25 %	0 %	479146527
8082	NC_021012	ATT	2	6	392261	392266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146527
8083	NC_021012	A	7	7	392298	392304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_021012	AT	3	6	392313	392318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_021012	AAAG	2	8	392378	392385	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_021012	AAAT	2	8	392553	392560	75 %	25 %	0 %	0 %	479146528
8087	NC_021012	CGG	2	6	392592	392597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146528
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8089	NC_021012	TGT	2	6	392613	392618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146528
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8091	NC_021012	CGG	2	6	392766	392771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146528
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8093	NC_021012	AGA	2	6	392871	392876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146528
8094	NC_021012	GAT	2	6	392901	392906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146528
8095	NC_021012	ATGC	2	8	392969	392976	25 %	25 %	25 %	25 %	479146528
8096	NC_021012	CACAAC	2	12	393066	393077	50 %	0 %	0 %	50 %	479146528
8097	NC_021012	AC	3	6	393076	393081	50 %	0 %	0 %	50 %	479146528
8098	NC_021012	AGG	2	6	393224	393229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146528
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8100	NC_021012	CGG	2	6	393327	393332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146528
8101	NC_021012	TTG	2	6	393353	393358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146528
8102	NC_021012	CAA	2	6	393426	393431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146528
8103	NC_021012	ATG	2	6	393556	393561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146528
8104	NC_021012	AGG	2	6	393566	393571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146528
8105	NC_021012	GA	3	6	393634	393639	50 %	0 %	50 %	0 %	479146528
8106	NC_021012	AGAAT	2	10	393646	393655	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_021012	TAA	2	6	393662	393667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_021012	A	6	6	393673	393678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_021012	T	7	7	393708	393714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_021012	CAT	2	6	393739	393744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146529
8111	NC_021012	GT	3	6	393760	393765	0 %	50 %	50 %	0 %	479146529
8112	NC_021012	TATTTT	2	12	393781	393792	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479146529
8113	NC_021012	ATA	2	6	393828	393833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146529
8114	NC_021012	AGTA	2	8	393862	393869	50 %	25 %	25 %	0 %	479146529
8115	NC_021012	AGT	2	6	393883	393888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146529
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8118	NC_021012	TC	3	6	393953	393958	0 %	50 %	0 %	50 %	479146529
8119	NC_021012	GTTT	2	8	393989	393996	0 %	75 %	25 %	0 %	479146529
8120	NC_021012	TCT	2	6	394030	394035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146529
8121	NC_021012	T	6	6	394193	394198	0 %	100 %	0 %	0 %	479146529
8122	NC_021012	TA	3	6	394219	394224	50 %	50 %	0 %	0 %	479146529
8123	NC_021012	GAAAGT	2	12	394296	394307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479146529
8124	NC_021012	T	6	6	394359	394364	0 %	100 %	0 %	0 %	479146529
8125	NC_021012	TAA	2	6	394422	394427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146529
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8127	NC_021012	TAA	2	6	394493	394498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146529
8128	NC_021012	AAT	2	6	394545	394550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146529
8129	NC_021012	TCC	2	6	394564	394569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8130	NC_021012	ATT	2	6	394576	394581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146530
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8132	NC_021012	GCA	2	6	394665	394670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146530
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8149	NC_021012	GCCT	2	8	395455	395462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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8158	NC_021012	GGA	2	6	395885	395890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8160	NC_021012	A	7	7	396020	396026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8235	NC_021012	A	6	6	400466	400471	100 %	0 %	0 %	0 %	479146534
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8241	NC_021012	GCT	2	6	400787	400792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146535
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8248	NC_021012	CGG	2	6	401106	401111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146535
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8250	NC_021012	ACAG	2	8	401153	401160	50 %	0 %	25 %	25 %	479146535
8251	NC_021012	ACA	2	6	401165	401170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146535
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