MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68501	NC_021012	CACCG	2	10	3316668	3316677	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68502	NC_021012	GAA	2	6	3316709	3316714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148989
68503	NC_021012	ACA	2	6	3316746	3316751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479148989
68504	NC_021012	CAT	2	6	3316804	3316809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148989
68505	NC_021012	ATG	2	6	3316827	3316832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148989
68506	NC_021012	GCT	2	6	3316834	3316839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148989
68507	NC_021012	CCG	2	6	3316860	3316865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479148989
68508	NC_021012	CGG	2	6	3316879	3316884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148989
68509	NC_021012	GCG	2	6	3316958	3316963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148989
68510	NC_021012	TGC	2	6	3316975	3316980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148989
68511	NC_021012	TGA	2	6	3317120	3317125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68512	NC_021012	GGC	2	6	3317131	3317136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68513	NC_021012	GAGG	2	8	3317144	3317151	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68514	NC_021012	TTC	2	6	3317162	3317167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68515	NC_021012	CCA	2	6	3317258	3317263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68516	NC_021012	ATC	2	6	3317268	3317273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68517	NC_021012	ACGGG	2	10	3317285	3317294	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68518	NC_021012	CACC	2	8	3317384	3317391	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68519	NC_021012	TCA	2	6	3317434	3317439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68520	NC_021012	AGGG	2	8	3317499	3317506	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68521	NC_021012	GCA	2	6	3317608	3317613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68522	NC_021012	AAAG	2	8	3317648	3317655	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68523	NC_021012	CGC	2	6	3317681	3317686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68524	NC_021012	GCC	2	6	3317694	3317699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68525	NC_021012	CCA	2	6	3317716	3317721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68526	NC_021012	GGCA	2	8	3317761	3317768	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68527	NC_021012	TTC	2	6	3317798	3317803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68528	NC_021012	TGC	2	6	3317809	3317814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68529	NC_021012	GGC	2	6	3317845	3317850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68530	NC_021012	GCT	2	6	3317919	3317924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68531	NC_021012	GCC	2	6	3317958	3317963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68532	NC_021012	A	6	6	3318022	3318027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68533	NC_021012	ACC	2	6	3318036	3318041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68534	NC_021012	ACA	2	6	3318049	3318054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68535	NC_021012	GGC	2	6	3318122	3318127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68536	NC_021012	GGC	2	6	3318149	3318154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68537	NC_021012	CAG	2	6	3318171	3318176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68538	NC_021012	TTC	2	6	3318185	3318190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68539	NC_021012	GGA	2	6	3318194	3318199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68540	NC_021012	GCC	2	6	3318219	3318224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68541	NC_021012	GCC	2	6	3318228	3318233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68542	NC_021012	CAG	2	6	3318351	3318356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68543	NC_021012	AAAGCA	2	12	3318366	3318377	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68544	NC_021012	GCC	2	6	3318423	3318428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68545	NC_021012	GGA	2	6	3318545	3318550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68546	NC_021012	CCG	2	6	3318554	3318559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68547	NC_021012	CAGGAA	2	12	3318624	3318635	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68548	NC_021012	T	6	6	3318718	3318723	0 %	100 %	0 %	0 %	479148990
68549	NC_021012	GAT	2	6	3318765	3318770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148990
68550	NC_021012	CCG	2	6	3318780	3318785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479148990
68551	NC_021012	CGG	2	6	3318848	3318853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148990
68552	NC_021012	T	6	6	3318865	3318870	0 %	100 %	0 %	0 %	479148990
68553	NC_021012	ACT	3	9	3318990	3318998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68554	NC_021012	AGG	2	6	3319014	3319019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68555	NC_021012	TAC	2	6	3319050	3319055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148991
68556	NC_021012	T	6	6	3319074	3319079	0 %	100 %	0 %	0 %	479148991
68557	NC_021012	TGC	2	6	3319096	3319101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148991
68558	NC_021012	CGG	2	6	3319172	3319177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148991
68559	NC_021012	GAT	2	6	3319217	3319222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148991
68560	NC_021012	CCA	2	6	3319238	3319243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479148991
68561	NC_021012	AGC	2	6	3319297	3319302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148991
68562	NC_021012	TGA	2	6	3319339	3319344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148991
68563	NC_021012	CCA	2	6	3319449	3319454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479148991
68564	NC_021012	AGAGAT	2	12	3319478	3319489	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479148991
68565	NC_021012	AG	5	10	3319496	3319505	50 %	0 %	50 %	0 %	479148991
68566	NC_021012	CCCCGC	2	12	3319520	3319531	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	479148991
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68568	NC_021012	TAT	2	6	3319614	3319619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148991
68569	NC_021012	CCA	2	6	3319678	3319683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479148991
68570	NC_021012	AAGGC	2	10	3319714	3319723	40 %	0 %	40 %	20 %	479148991
68571	NC_021012	ATT	2	6	3319747	3319752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148991
68572	NC_021012	AGG	2	6	3319759	3319764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148991
68573	NC_021012	CCG	2	6	3319821	3319826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479148992
68574	NC_021012	GGA	2	6	3319831	3319836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148992
68575	NC_021012	AAG	2	6	3319887	3319892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148992
68576	NC_021012	GACTGC	2	12	3319943	3319954	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479148992
68577	NC_021012	AGC	2	6	3319974	3319979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148992
68578	NC_021012	GCC	2	6	3319982	3319987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479148992
68579	NC_021012	GGA	2	6	3320017	3320022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148992
68580	NC_021012	CCGC	2	8	3320106	3320113	0 %	0 %	25 %	75 %	479148992
68581	NC_021012	GCG	2	6	3320172	3320177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148992
68582	NC_021012	GCC	2	6	3320201	3320206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479148992
68583	NC_021012	TGC	2	6	3320281	3320286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148992
68584	NC_021012	AT	3	6	3320308	3320313	50 %	50 %	0 %	0 %	479148992
68585	NC_021012	CTG	2	6	3320336	3320341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148992
68586	NC_021012	TGA	2	6	3320347	3320352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148992
68587	NC_021012	GGA	2	6	3320461	3320466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148992
68588	NC_021012	GCA	2	6	3320470	3320475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148992
68589	NC_021012	GCA	2	6	3320547	3320552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148992
68590	NC_021012	TGA	2	6	3320601	3320606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148992
68591	NC_021012	AGC	2	6	3320607	3320612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148992
68592	NC_021012	GAAAC	2	10	3320632	3320641	60 %	0 %	20 %	20 %	479148993
68593	NC_021012	CAC	2	6	3320649	3320654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479148993
68594	NC_021012	CCG	2	6	3320664	3320669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479148993
68595	NC_021012	TG	3	6	3320677	3320682	0 %	50 %	50 %	0 %	479148993
68596	NC_021012	CTT	2	6	3320724	3320729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479148993
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68598	NC_021012	GGAAGC	2	12	3320778	3320789	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479148993
68599	NC_021012	A	6	6	3320798	3320803	100 %	0 %	0 %	0 %	479148993
68600	NC_021012	GACC	2	8	3320813	3320820	25 %	0 %	25 %	50 %	479148993
68601	NC_021012	AAG	2	6	3320824	3320829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68602	NC_021012	CCG	2	6	3320859	3320864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68603	NC_021012	GCTG	2	8	3320900	3320907	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68604	NC_021012	GGA	2	6	3320916	3320921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68605	NC_021012	AGAC	2	8	3320932	3320939	50 %	0 %	25 %	25 %	479148994
68606	NC_021012	CAAC	2	8	3320940	3320947	50 %	0 %	0 %	50 %	479148994
68607	NC_021012	GAC	2	6	3321085	3321090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148994
68608	NC_021012	GA	3	6	3321345	3321350	50 %	0 %	50 %	0 %	479148994
68609	NC_021012	CAAG	2	8	3321410	3321417	50 %	0 %	25 %	25 %	479148994
68610	NC_021012	GGACGA	2	12	3321438	3321449	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479148994
68611	NC_021012	ATT	2	6	3321457	3321462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148994
68612	NC_021012	AGC	2	6	3321551	3321556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148994
68613	NC_021012	GCA	2	6	3321596	3321601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148994
68614	NC_021012	CGC	2	6	3321604	3321609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479148994
68615	NC_021012	ACC	2	6	3321611	3321616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479148994
68616	NC_021012	ACC	2	6	3321773	3321778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479148994
68617	NC_021012	AGC	2	6	3321830	3321835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148994
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