MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59001	NC_021012	AGA	2	6	2848215	2848220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59002	NC_021012	TAC	2	6	2848227	2848232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59003	NC_021012	T	6	6	2848266	2848271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59004	NC_021012	ACT	2	6	2848335	2848340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59005	NC_021012	TAT	2	6	2848351	2848356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59006	NC_021012	TGA	2	6	2848496	2848501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59007	NC_021012	TTA	2	6	2848596	2848601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59008	NC_021012	AG	3	6	2848616	2848621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59009	NC_021012	TAT	2	6	2848686	2848691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59010	NC_021012	TTA	2	6	2848703	2848708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59011	NC_021012	AGT	2	6	2848913	2848918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59012	NC_021012	GAT	2	6	2848925	2848930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59013	NC_021012	GAT	2	6	2848965	2848970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59014	NC_021012	GAT	2	6	2849043	2849048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59015	NC_021012	ATG	2	6	2849140	2849145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59016	NC_021012	AGAA	2	8	2849210	2849217	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59017	NC_021012	GGAT	2	8	2849252	2849259	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59018	NC_021012	AAAG	2	8	2849261	2849268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59019	NC_021012	GAA	2	6	2849276	2849281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59020	NC_021012	A	6	6	2849280	2849285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59021	NC_021012	TC	3	6	2849292	2849297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59022	NC_021012	ATT	3	9	2849346	2849354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59023	NC_021012	ATG	2	6	2849377	2849382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59024	NC_021012	GAAT	2	8	2849474	2849481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59025	NC_021012	TGA	3	9	2849506	2849514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59026	NC_021012	TAT	2	6	2849613	2849618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59027	NC_021012	AG	3	6	2849665	2849670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59028	NC_021012	AGA	2	6	2849701	2849706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59029	NC_021012	ATG	2	6	2849737	2849742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59030	NC_021012	AATG	2	8	2849744	2849751	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59031	NC_021012	ATT	2	6	2849829	2849834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59032	NC_021012	ATTGGA	2	12	2849879	2849890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59033	NC_021012	TGCC	2	8	2849928	2849935	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59034	NC_021012	CA	3	6	2849971	2849976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59035	NC_021012	AG	3	6	2850043	2850048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59036	NC_021012	ATA	2	6	2850073	2850078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59037	NC_021012	TGA	2	6	2850095	2850100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59038	NC_021012	AGA	2	6	2850242	2850247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59039	NC_021012	ACTG	2	8	2850269	2850276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59040	NC_021012	TA	3	6	2850325	2850330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59041	NC_021012	AG	3	6	2850331	2850336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59042	NC_021012	ACAA	2	8	2850390	2850397	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59043	NC_021012	TTA	2	6	2850406	2850411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59044	NC_021012	AGA	2	6	2850413	2850418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59045	NC_021012	N	1034	1034	2850426	2851459	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59046	NC_021012	AGT	2	6	2851485	2851490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59047	NC_021012	TTC	2	6	2851613	2851618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59048	NC_021012	AAG	2	6	2851648	2851653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59049	NC_021012	TGGA	2	8	2851756	2851763	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59050	NC_021012	ATTG	2	8	2851824	2851831	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59051	NC_021012	TTG	2	6	2851847	2851852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59052	NC_021012	AAC	2	6	2851855	2851860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59053	NC_021012	TG	3	6	2851868	2851873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59054	NC_021012	CATA	2	8	2851901	2851908	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59055	NC_021012	TTG	2	6	2851937	2851942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59056	NC_021012	GTA	2	6	2852020	2852025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59057	NC_021012	ATCA	2	8	2852164	2852171	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59058	NC_021012	AGA	2	6	2852189	2852194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59059	NC_021012	TCC	2	6	2852217	2852222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59060	NC_021012	AT	3	6	2852265	2852270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59061	NC_021012	AT	3	6	2852384	2852389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59062	NC_021012	AAT	2	6	2852413	2852418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59063	NC_021012	AG	3	6	2852426	2852431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59064	NC_021012	AGC	2	6	2852558	2852563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59065	NC_021012	AAG	2	6	2852566	2852571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59066	NC_021012	TGG	2	6	2852574	2852579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59067	NC_021012	ATG	2	6	2852591	2852596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59068	NC_021012	CATA	2	8	2852606	2852613	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59069	NC_021012	TGA	2	6	2852628	2852633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59070	NC_021012	GCG	2	6	2852660	2852665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59071	NC_021012	GAT	2	6	2852670	2852675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59072	NC_021012	TA	3	6	2852705	2852710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59073	NC_021012	TCAAAG	2	12	2852716	2852727	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59074	NC_021012	GAT	2	6	2852763	2852768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59075	NC_021012	TGGAAA	2	12	2852772	2852783	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59076	NC_021012	GAAG	2	8	2852820	2852827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59077	NC_021012	GCAAT	2	10	2852864	2852873	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59078	NC_021012	ACA	2	6	2852890	2852895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59079	NC_021012	CAT	2	6	2852907	2852912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59080	NC_021012	ATTG	2	8	2852967	2852974	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59081	NC_021012	GCA	2	6	2852986	2852991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59082	NC_021012	AGA	2	6	2853063	2853068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59083	NC_021012	AAG	2	6	2853109	2853114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59084	NC_021012	CTT	2	6	2853118	2853123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59085	NC_021012	CAG	3	9	2853134	2853142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59086	NC_021012	TTC	2	6	2853195	2853200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59087	NC_021012	GAA	2	6	2853205	2853210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59088	NC_021012	TA	3	6	2853215	2853220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59089	NC_021012	TGA	2	6	2853247	2853252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59090	NC_021012	GAT	2	6	2853307	2853312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148590
59091	NC_021012	AT	3	6	2853341	2853346	50 %	50 %	0 %	0 %	479148590
59092	NC_021012	ACA	2	6	2853389	2853394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479148590
59093	NC_021012	AAT	2	6	2853433	2853438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148590
59094	NC_021012	GATG	2	8	2853468	2853475	25 %	25 %	50 %	0 %	479148590
59095	NC_021012	CAG	2	6	2853486	2853491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148590
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59098	NC_021012	ATTT	2	8	2853638	2853645	25 %	75 %	0 %	0 %	479148590
59099	NC_021012	A	6	6	2853653	2853658	100 %	0 %	0 %	0 %	479148590
59100	NC_021012	TCT	2	6	2853781	2853786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479148590
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59108	NC_021012	CAG	2	6	2854228	2854233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148590
59109	NC_021012	GAT	2	6	2854261	2854266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148590
59110	NC_021012	GAA	2	6	2854317	2854322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148590
59111	NC_021012	AAT	2	6	2854440	2854445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148591
59112	NC_021012	GTG	2	6	2854546	2854551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479148591
59113	NC_021012	GTA	2	6	2854596	2854601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148591
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59115	NC_021012	TGA	2	6	2854856	2854861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148591
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59118	NC_021012	A	6	6	2854933	2854938	100 %	0 %	0 %	0 %	479148592
59119	NC_021012	TCT	2	6	2854987	2854992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479148592
59120	NC_021012	ATG	2	6	2855019	2855024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148592
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59123	NC_021012	TTTG	2	8	2855179	2855186	0 %	75 %	25 %	0 %	479148592
59124	NC_021012	AT	3	6	2855188	2855193	50 %	50 %	0 %	0 %	479148592
59125	NC_021012	TGA	2	6	2855235	2855240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148592
59126	NC_021012	CAT	2	6	2855256	2855261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148592
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59171	NC_021012	AG	3	6	2857696	2857701	50 %	0 %	50 %	0 %	479148594
59172	NC_021012	TGA	2	6	2857791	2857796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148594
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59190	NC_021012	AGATG	2	10	2858830	2858839	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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59237	NC_021012	GAAA	2	8	2860881	2860888	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59238	NC_021012	N	472	472	2860898	2861369	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59242	NC_021012	TG	3	6	2861486	2861491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59243	NC_021012	AT	3	6	2861555	2861560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59244	NC_021012	TTG	2	6	2861576	2861581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59245	NC_021012	ATTT	2	8	2861673	2861680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59246	NC_021012	TTG	2	6	2861689	2861694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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59248	NC_021012	GAAA	2	8	2861720	2861727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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59369	NC_021012	AGT	2	6	2868358	2868363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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59374	NC_021012	TC	3	6	2868679	2868684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59375	NC_021012	CCTT	2	8	2868719	2868726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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59381	NC_021012	TTTC	2	8	2868820	2868827	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59382	NC_021012	TTG	2	6	2868831	2868836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59383	NC_021012	TA	3	6	2868865	2868870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59384	NC_021012	ATT	2	6	2868883	2868888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59385	NC_021012	ATT	2	6	2868944	2868949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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