MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_021012	TTTC	2	8	2602493	2602500	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54002	NC_021012	A	6	6	2602576	2602581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54003	NC_021012	ATGGGG	2	12	2602673	2602684	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54004	NC_021012	TC	3	6	2602776	2602781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54005	NC_021012	AGG	2	6	2602828	2602833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54006	NC_021012	GAT	2	6	2602883	2602888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54007	NC_021012	ATT	2	6	2602915	2602920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54008	NC_021012	CATC	2	8	2603095	2603102	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54009	NC_021012	ATT	2	6	2603240	2603245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54010	NC_021012	CTT	2	6	2603251	2603256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54011	NC_021012	T	6	6	2603399	2603404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54012	NC_021012	TTTA	2	8	2603410	2603417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54013	NC_021012	TTCTA	2	10	2603481	2603490	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54014	NC_021012	TA	3	6	2603554	2603559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54015	NC_021012	TA	3	6	2603688	2603693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54016	NC_021012	A	6	6	2603712	2603717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54017	NC_021012	GGA	2	6	2603747	2603752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54019	NC_021012	GAT	2	6	2603871	2603876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148383
54020	NC_021012	TAT	2	6	2603971	2603976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148383
54021	NC_021012	GTT	3	9	2604103	2604111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479148384
54022	NC_021012	A	6	6	2604181	2604186	100 %	0 %	0 %	0 %	479148384
54023	NC_021012	GCA	2	6	2604235	2604240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148384
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54025	NC_021012	TGA	2	6	2604273	2604278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148384
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54031	NC_021012	AT	3	6	2604597	2604602	50 %	50 %	0 %	0 %	479148384
54032	NC_021012	AT	3	6	2604648	2604653	50 %	50 %	0 %	0 %	479148384
54033	NC_021012	GAA	2	6	2604733	2604738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148384
54034	NC_021012	TGGG	2	8	2604778	2604785	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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54042	NC_021012	GATC	2	8	2604999	2605006	25 %	25 %	25 %	25 %	479148386
54043	NC_021012	GAA	2	6	2605090	2605095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148386
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54052	NC_021012	AT	4	8	2605438	2605445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54053	NC_021012	GATG	2	8	2605451	2605458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54054	NC_021012	ATG	2	6	2605609	2605614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54058	NC_021012	ATTTA	2	10	2605806	2605815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54059	NC_021012	TTA	2	6	2605835	2605840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54060	NC_021012	TCT	2	6	2605901	2605906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54064	NC_021012	TTTG	2	8	2606008	2606015	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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54125	NC_021012	GCG	2	6	2608947	2608952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148389
54126	NC_021012	GCA	2	6	2609010	2609015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148389
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54132	NC_021012	GCA	2	6	2609256	2609261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148389
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54136	NC_021012	GCA	2	6	2609505	2609510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148389
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54143	NC_021012	CCA	2	6	2609760	2609765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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54231	NC_021012	AGGC	2	8	2614023	2614030	25 %	0 %	50 %	25 %	479148393
54232	NC_021012	A	6	6	2614036	2614041	100 %	0 %	0 %	0 %	479148393
54233	NC_021012	T	6	6	2614071	2614076	0 %	100 %	0 %	0 %	479148393
54234	NC_021012	GGT	2	6	2614129	2614134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479148393
54235	NC_021012	AT	3	6	2614138	2614143	50 %	50 %	0 %	0 %	479148393
54236	NC_021012	TG	4	8	2614167	2614174	0 %	50 %	50 %	0 %	479148393
54237	NC_021012	GATA	2	8	2614237	2614244	50 %	25 %	25 %	0 %	479148393
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54240	NC_021012	AGT	2	6	2614306	2614311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148393
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54243	NC_021012	AGA	2	6	2614417	2614422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148393
54244	NC_021012	TAA	2	6	2614423	2614428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148393
54245	NC_021012	ATTT	2	8	2614429	2614436	25 %	75 %	0 %	0 %	479148393
54246	NC_021012	TGC	2	6	2614466	2614471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54247	NC_021012	GCA	2	6	2614563	2614568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54248	NC_021012	AG	3	6	2614594	2614599	50 %	0 %	50 %	0 %	479148394
54249	NC_021012	GA	3	6	2614622	2614627	50 %	0 %	50 %	0 %	479148394
54250	NC_021012	GAAAA	2	10	2614636	2614645	80 %	0 %	20 %	0 %	479148394
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54253	NC_021012	AGATGT	2	12	2614744	2614755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148394
54254	NC_021012	GCA	2	6	2614802	2614807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148394
54255	NC_021012	TTG	2	6	2614812	2614817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479148394
54256	NC_021012	GCA	2	6	2614829	2614834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148394
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54262	NC_021012	TTGC	2	8	2615294	2615301	0 %	50 %	25 %	25 %	479148395
54263	NC_021012	A	6	6	2615324	2615329	100 %	0 %	0 %	0 %	479148395
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54265	NC_021012	A	7	7	2615428	2615434	100 %	0 %	0 %	0 %	479148395
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54276	NC_021012	AGAC	2	8	2615979	2615986	50 %	0 %	25 %	25 %	479148396
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54310	NC_021012	AATG	2	8	2617249	2617256	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54311	NC_021012	ATA	2	6	2617285	2617290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54312	NC_021012	TA	3	6	2617350	2617355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54313	NC_021012	AT	3	6	2617361	2617366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54314	NC_021012	GA	4	8	2617376	2617383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54315	NC_021012	TGG	2	6	2617507	2617512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479148397
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54357	NC_021012	GT	4	8	2619487	2619494	0 %	50 %	50 %	0 %	479148398
54358	NC_021012	GA	3	6	2619707	2619712	50 %	0 %	50 %	0 %	479148398
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54360	NC_021012	ATT	2	6	2619915	2619920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148398
54361	NC_021012	TAT	2	6	2619926	2619931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148398
54362	NC_021012	A	7	7	2620006	2620012	100 %	0 %	0 %	0 %	479148398
54363	NC_021012	ATGAAA	2	12	2620018	2620029	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479148398
54364	NC_021012	AT	3	6	2620040	2620045	50 %	50 %	0 %	0 %	479148398
54365	NC_021012	AG	3	6	2620057	2620062	50 %	0 %	50 %	0 %	479148398
54366	NC_021012	AT	3	6	2620091	2620096	50 %	50 %	0 %	0 %	479148398
54367	NC_021012	ACAGT	2	10	2620163	2620172	40 %	20 %	20 %	20 %	479148398
54368	NC_021012	GAAAA	2	10	2620197	2620206	80 %	0 %	20 %	0 %	479148398
54369	NC_021012	ACAA	2	8	2620266	2620273	75 %	0 %	0 %	25 %	479148398
54370	NC_021012	GTT	2	6	2620332	2620337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479148398
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54373	NC_021012	CTG	2	6	2620498	2620503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148398
54374	NC_021012	AT	3	6	2620510	2620515	50 %	50 %	0 %	0 %	479148398
54375	NC_021012	A	7	7	2620558	2620564	100 %	0 %	0 %	0 %	479148398
54376	NC_021012	A	7	7	2620588	2620594	100 %	0 %	0 %	0 %	479148398
54377	NC_021012	AGAA	2	8	2620621	2620628	75 %	0 %	25 %	0 %	479148398
54378	NC_021012	GAT	2	6	2620644	2620649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148398
54379	NC_021012	GCA	2	6	2620653	2620658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148398
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54381	NC_021012	CCA	2	6	2620705	2620710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479148398
54382	NC_021012	GCA	2	6	2620713	2620718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148398
54383	NC_021012	GAG	2	6	2620737	2620742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148398
54384	NC_021012	AGA	2	6	2620766	2620771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148398
54385	NC_021012	AGA	2	6	2620796	2620801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148398
54386	NC_021012	GGC	2	6	2620805	2620810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148398
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54388	NC_021012	GCCT	2	8	2620868	2620875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54389	NC_021012	GCA	2	6	2621014	2621019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148399
54390	NC_021012	TGC	2	6	2621043	2621048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148399
54391	NC_021012	TGA	2	6	2621214	2621219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148399
54392	NC_021012	TAT	2	6	2621230	2621235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148399
54393	NC_021012	ATC	2	6	2621246	2621251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148399
54394	NC_021012	T	6	6	2621333	2621338	0 %	100 %	0 %	0 %	479148399
54395	NC_021012	CTG	2	6	2621387	2621392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148399
54396	NC_021012	TTTC	2	8	2621401	2621408	0 %	75 %	0 %	25 %	479148399
54397	NC_021012	AAT	2	6	2621500	2621505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148399
54398	NC_021012	AAT	2	6	2621716	2621721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148399
54399	NC_021012	CTGT	2	8	2621735	2621742	0 %	50 %	25 %	25 %	479148399
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54402	NC_021012	T	6	6	2621859	2621864	0 %	100 %	0 %	0 %	479148399
54403	NC_021012	TGA	2	6	2621878	2621883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148399
54404	NC_021012	GTC	2	6	2621948	2621953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148399
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54408	NC_021012	ATA	2	6	2622078	2622083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148399
54409	NC_021012	T	6	6	2622215	2622220	0 %	100 %	0 %	0 %	479148399
54410	NC_021012	CAG	2	6	2622230	2622235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148399
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54413	NC_021012	AAAAGT	2	12	2622480	2622491	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479148399
54414	NC_021012	TCC	2	6	2622531	2622536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479148399
54415	NC_021012	CTG	2	6	2622562	2622567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54416	NC_021012	T	7	7	2622624	2622630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54417	NC_021012	A	7	7	2622684	2622690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54418	NC_021012	TGAT	2	8	2622705	2622712	25 %	50 %	25 %	0 %	479148400
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54421	NC_021012	T	7	7	2622828	2622834	0 %	100 %	0 %	0 %	479148400
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54424	NC_021012	TGA	2	6	2622889	2622894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148400
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54426	NC_021012	A	6	6	2623021	2623026	100 %	0 %	0 %	0 %	479148400
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54430	NC_021012	TAT	2	6	2623128	2623133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148400
54431	NC_021012	T	6	6	2623135	2623140	0 %	100 %	0 %	0 %	479148400
54432	NC_021012	GA	3	6	2623145	2623150	50 %	0 %	50 %	0 %	479148400
54433	NC_021012	TGA	2	6	2623167	2623172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148400
54434	NC_021012	T	6	6	2623178	2623183	0 %	100 %	0 %	0 %	479148400
54435	NC_021012	T	6	6	2623223	2623228	0 %	100 %	0 %	0 %	479148400
54436	NC_021012	CTG	2	6	2623261	2623266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148400
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54441	NC_021012	AAAAG	2	10	2623592	2623601	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54442	NC_021012	GCAC	2	8	2623782	2623789	25 %	0 %	25 %	50 %	479148401
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54445	NC_021012	TGC	2	6	2623914	2623919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148401
54446	NC_021012	GAA	2	6	2623921	2623926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148401
54447	NC_021012	GCA	2	6	2623937	2623942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148401
54448	NC_021012	ACA	2	6	2624027	2624032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479148401
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54450	NC_021012	GGAAT	2	10	2624104	2624113	40 %	20 %	40 %	0 %	479148401
54451	NC_021012	GAT	2	6	2624146	2624151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148401
54452	NC_021012	CGAT	2	8	2624183	2624190	25 %	25 %	25 %	25 %	479148401
54453	NC_021012	GGAAAG	2	12	2624205	2624216	50 %	0 %	50 %	0 %	479148401
54454	NC_021012	AG	3	6	2624243	2624248	50 %	0 %	50 %	0 %	479148401
54455	NC_021012	AAGC	2	8	2624255	2624262	50 %	0 %	25 %	25 %	479148401
54456	NC_021012	CAT	2	6	2624322	2624327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148401
54457	NC_021012	AT	3	6	2624350	2624355	50 %	50 %	0 %	0 %	479148401
54458	NC_021012	GGA	2	6	2624376	2624381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148401
54459	NC_021012	ATG	2	6	2624432	2624437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148401
54460	NC_021012	AT	3	6	2624469	2624474	50 %	50 %	0 %	0 %	479148401
54461	NC_021012	GCT	2	6	2624607	2624612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148402
54462	NC_021012	TGC	2	6	2624629	2624634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148402
54463	NC_021012	GAT	2	6	2624673	2624678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148402
54464	NC_021012	TCAT	2	8	2624743	2624750	25 %	50 %	0 %	25 %	479148402
54465	NC_021012	ATA	2	6	2624757	2624762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148402
54466	NC_021012	TAA	2	6	2624770	2624775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148402
54467	NC_021012	ACC	2	6	2624851	2624856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479148402
54468	NC_021012	GCAG	2	8	2624921	2624928	25 %	0 %	50 %	25 %	479148402
54469	NC_021012	ATCC	2	8	2624941	2624948	25 %	25 %	0 %	50 %	479148402
54470	NC_021012	AGA	2	6	2624969	2624974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148402
54471	NC_021012	AAAG	2	8	2625010	2625017	75 %	0 %	25 %	0 %	479148402
54472	NC_021012	CCT	2	6	2625068	2625073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479148403
54473	NC_021012	GA	3	6	2625164	2625169	50 %	0 %	50 %	0 %	479148403
54474	NC_021012	GAT	3	9	2625241	2625249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148403
54475	NC_021012	GC	3	6	2625309	2625314	0 %	0 %	50 %	50 %	479148403
54476	NC_021012	TGA	2	6	2625330	2625335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148403
54477	NC_021012	T	6	6	2625362	2625367	0 %	100 %	0 %	0 %	479148403
54478	NC_021012	TGC	2	6	2625633	2625638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148403
54479	NC_021012	CAT	2	6	2625642	2625647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148403
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54481	NC_021012	GAA	2	6	2625774	2625779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148403
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54484	NC_021012	TAT	2	6	2625919	2625924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54485	NC_021012	A	6	6	2625936	2625941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54486	NC_021012	A	6	6	2625979	2625984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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