MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50005	NC_021012	ATT	3	9	2415739	2415747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148228
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50114	NC_021012	T	7	7	2419816	2419822	0 %	100 %	0 %	0 %	479148234
50115	NC_021012	A	6	6	2419858	2419863	100 %	0 %	0 %	0 %	479148234
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50119	NC_021012	GATGCA	2	12	2420055	2420066	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479148234
50120	NC_021012	AGC	2	6	2420068	2420073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148234
50121	NC_021012	GAA	2	6	2420199	2420204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148234
50122	NC_021012	GAT	2	6	2420214	2420219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148234
50123	NC_021012	AGA	2	6	2420231	2420236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148234
50124	NC_021012	TGG	2	6	2420239	2420244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479148234
50125	NC_021012	ATT	2	6	2420257	2420262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148234
50126	NC_021012	GGAAGA	2	12	2420276	2420287	50 %	0 %	50 %	0 %	479148234
50127	NC_021012	AGG	2	6	2420407	2420412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148234
50128	NC_021012	CAGGG	2	10	2420413	2420422	20 %	0 %	60 %	20 %	479148234
50129	NC_021012	TTG	2	6	2420533	2420538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479148234
50130	NC_021012	AGAAA	2	10	2420547	2420556	80 %	0 %	20 %	0 %	479148234
50131	NC_021012	GAG	2	6	2420610	2420615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148234
50132	NC_021012	GGC	2	6	2420627	2420632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148234
50133	NC_021012	GTT	2	6	2420744	2420749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479148234
50134	NC_021012	AAG	2	6	2420892	2420897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148234
50135	NC_021012	GAT	2	6	2420904	2420909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148234
50136	NC_021012	GAAA	2	8	2421083	2421090	75 %	0 %	25 %	0 %	479148234
50137	NC_021012	A	8	8	2421102	2421109	100 %	0 %	0 %	0 %	479148234
50138	NC_021012	ACGG	2	8	2421190	2421197	25 %	0 %	50 %	25 %	479148235
50139	NC_021012	CAT	2	6	2421232	2421237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148235
50140	NC_021012	GCA	2	6	2421349	2421354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148235
50141	NC_021012	CAT	2	6	2421374	2421379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148235
50142	NC_021012	GAG	2	6	2421409	2421414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148235
50143	NC_021012	GTA	2	6	2421415	2421420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148235
50144	NC_021012	A	6	6	2421420	2421425	100 %	0 %	0 %	0 %	479148235
50145	NC_021012	GGA	2	6	2421450	2421455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148235
50146	NC_021012	AG	3	6	2421517	2421522	50 %	0 %	50 %	0 %	479148235
50147	NC_021012	GCT	2	6	2421589	2421594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148235
50148	NC_021012	TAC	2	6	2421635	2421640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148235
50149	NC_021012	CAT	2	6	2421661	2421666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148235
50150	NC_021012	A	6	6	2421671	2421676	100 %	0 %	0 %	0 %	479148235
50151	NC_021012	GGA	2	6	2421681	2421686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148235
50152	NC_021012	GAAA	2	8	2421698	2421705	75 %	0 %	25 %	0 %	479148235
50153	NC_021012	TAAGAA	2	12	2421750	2421761	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479148235
50154	NC_021012	GAT	2	6	2421784	2421789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148235
50155	NC_021012	GAA	2	6	2421793	2421798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148235
50156	NC_021012	AGG	2	6	2421819	2421824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50157	NC_021012	ATTT	2	8	2421843	2421850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50158	NC_021012	CAT	2	6	2421887	2421892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50159	NC_021012	GAA	2	6	2421915	2421920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50160	NC_021012	AATG	2	8	2421936	2421943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50161	NC_021012	CAG	2	6	2422002	2422007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50162	NC_021012	AG	3	6	2422141	2422146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50163	NC_021012	AGA	2	6	2422175	2422180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50164	NC_021012	GCC	2	6	2422202	2422207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50165	NC_021012	AGA	2	6	2422252	2422257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50166	NC_021012	T	6	6	2422284	2422289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50167	NC_021012	CAG	2	6	2422315	2422320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50168	NC_021012	AAG	2	6	2422354	2422359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50169	NC_021012	CATA	2	8	2422373	2422380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50170	NC_021012	GATT	2	8	2422496	2422503	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50171	NC_021012	T	6	6	2422502	2422507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50172	NC_021012	A	6	6	2422529	2422534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50173	NC_021012	AGA	2	6	2422540	2422545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50174	NC_021012	CATGC	2	10	2422578	2422587	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50175	NC_021012	GTTGT	2	10	2422623	2422632	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
50176	NC_021012	GGCA	2	8	2422649	2422656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50177	NC_021012	ACAG	2	8	2422702	2422709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50178	NC_021012	GAA	2	6	2422770	2422775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50179	NC_021012	ATGCG	2	10	2422811	2422820	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50180	NC_021012	TGGA	2	8	2422821	2422828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50181	NC_021012	CCA	2	6	2422870	2422875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50182	NC_021012	TAT	2	6	2422893	2422898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50183	NC_021012	GAA	2	6	2422919	2422924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50184	NC_021012	GGA	2	6	2422946	2422951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50185	NC_021012	GGA	2	6	2422965	2422970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50186	NC_021012	TACAA	2	10	2423100	2423109	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50187	NC_021012	AGA	2	6	2423189	2423194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50188	NC_021012	GAA	2	6	2423201	2423206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50189	NC_021012	TTG	2	6	2423248	2423253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50190	NC_021012	GGA	2	6	2423354	2423359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50191	NC_021012	CTG	2	6	2423366	2423371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50192	NC_021012	ATT	2	6	2423376	2423381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50193	NC_021012	AAG	2	6	2423450	2423455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50194	NC_021012	GGA	2	6	2423502	2423507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50195	NC_021012	TGA	2	6	2423607	2423612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50196	NC_021012	AGC	2	6	2423617	2423622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50197	NC_021012	TGCCTG	2	12	2423668	2423679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50198	NC_021012	ATA	2	6	2423808	2423813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50199	NC_021012	AAC	2	6	2423861	2423866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50200	NC_021012	AAGGCA	2	12	2423876	2423887	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50201	NC_021012	TTC	2	6	2423966	2423971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50202	NC_021012	ATG	2	6	2423973	2423978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50205	NC_021012	TCAGTT	2	12	2424109	2424120	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50206	NC_021012	AGA	2	6	2424309	2424314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50207	NC_021012	GAA	2	6	2424338	2424343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50208	NC_021012	ACA	2	6	2424345	2424350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50209	NC_021012	TAT	2	6	2424361	2424366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50210	NC_021012	CT	3	6	2424367	2424372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50211	NC_021012	GCA	2	6	2424379	2424384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50212	NC_021012	TGG	2	6	2424405	2424410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50213	NC_021012	GGA	2	6	2424422	2424427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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50216	NC_021012	AAG	2	6	2424582	2424587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50217	NC_021012	ATC	2	6	2424599	2424604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50218	NC_021012	CAG	2	6	2424709	2424714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50219	NC_021012	AGTC	2	8	2424731	2424738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50220	NC_021012	GAT	2	6	2424745	2424750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50221	NC_021012	TGA	2	6	2424762	2424767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50222	NC_021012	GAG	2	6	2424878	2424883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50223	NC_021012	AGA	3	9	2424943	2424951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50224	NC_021012	AT	3	6	2424964	2424969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50225	NC_021012	N	173	173	2424972	2425144	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50226	NC_021012	ATGA	2	8	2425207	2425214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50227	NC_021012	A	6	6	2425272	2425277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50228	NC_021012	AT	3	6	2425281	2425286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50229	NC_021012	AAGG	2	8	2425347	2425354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50230	NC_021012	TGTC	2	8	2425399	2425406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50231	NC_021012	GGA	2	6	2425436	2425441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50232	NC_021012	TGG	2	6	2425481	2425486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50233	NC_021012	CTG	2	6	2425497	2425502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50234	NC_021012	TATGG	2	10	2425554	2425563	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50235	NC_021012	GTA	2	6	2425639	2425644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50236	NC_021012	TAA	2	6	2425650	2425655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50237	NC_021012	GAG	2	6	2425733	2425738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50238	NC_021012	GAG	2	6	2425761	2425766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148236
50239	NC_021012	T	6	6	2425777	2425782	0 %	100 %	0 %	0 %	479148236
50240	NC_021012	AAC	2	6	2425881	2425886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479148236
50241	NC_021012	TGA	2	6	2425898	2425903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148236
50242	NC_021012	GAA	2	6	2425920	2425925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148236
50243	NC_021012	TGC	2	6	2425939	2425944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148236
50244	NC_021012	GAA	2	6	2426049	2426054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148236
50245	NC_021012	GAA	2	6	2426182	2426187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148237
50246	NC_021012	AAT	2	6	2426241	2426246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148237
50247	NC_021012	TTC	2	6	2426260	2426265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479148237
50248	NC_021012	GAT	2	6	2426308	2426313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148237
50249	NC_021012	GTA	2	6	2426409	2426414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50250	NC_021012	GCC	2	6	2426468	2426473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50251	NC_021012	TGAA	2	8	2426476	2426483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50252	NC_021012	GAA	2	6	2426504	2426509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50253	NC_021012	GCA	2	6	2426533	2426538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50254	NC_021012	T	8	8	2426619	2426626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50255	NC_021012	AAT	2	6	2426630	2426635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50256	NC_021012	T	7	7	2426639	2426645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50257	NC_021012	AT	3	6	2426647	2426652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50258	NC_021012	AAAG	2	8	2426721	2426728	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50259	NC_021012	T	6	6	2426778	2426783	0 %	100 %	0 %	0 %	479148238
50260	NC_021012	TTC	2	6	2426816	2426821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479148238
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50262	NC_021012	T	7	7	2426909	2426915	0 %	100 %	0 %	0 %	479148238
50263	NC_021012	TGG	2	6	2426954	2426959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479148238
50264	NC_021012	TA	3	6	2426996	2427001	50 %	50 %	0 %	0 %	479148238
50265	NC_021012	GTT	2	6	2427025	2427030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479148238
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50272	NC_021012	TA	3	6	2427266	2427271	50 %	50 %	0 %	0 %	479148238
50273	NC_021012	TCT	2	6	2427282	2427287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479148238
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50279	NC_021012	A	6	6	2427525	2427530	100 %	0 %	0 %	0 %	479148238
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50284	NC_021012	AT	4	8	2427687	2427694	50 %	50 %	0 %	0 %	479148238
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50300	NC_021012	TAAAA	2	10	2428232	2428241	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50333	NC_021012	CA	3	6	2429700	2429705	50 %	0 %	0 %	50 %	479148240
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50338	NC_021012	A	7	7	2429958	2429964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50339	NC_021012	TGA	2	6	2430004	2430009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50340	NC_021012	TTCT	2	8	2430042	2430049	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50341	NC_021012	TAAA	2	8	2430096	2430103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50342	NC_021012	CTT	2	6	2430221	2430226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50343	NC_021012	AG	3	6	2430264	2430269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50344	NC_021012	ATAA	2	8	2430327	2430334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50345	NC_021012	TGC	2	6	2430369	2430374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50346	NC_021012	CT	3	6	2430445	2430450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50347	NC_021012	TCA	2	6	2430556	2430561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50348	NC_021012	TTG	2	6	2430595	2430600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50349	NC_021012	TAAG	2	8	2430809	2430816	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50350	NC_021012	AGT	2	6	2430867	2430872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50351	NC_021012	CTT	2	6	2430893	2430898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50352	NC_021012	TTG	2	6	2430907	2430912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50353	NC_021012	N	535	535	2430926	2431460	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50354	NC_021012	ATT	2	6	2431481	2431486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50355	NC_021012	ATG	2	6	2431490	2431495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50356	NC_021012	TAA	2	6	2431496	2431501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50357	NC_021012	TATT	2	8	2431508	2431515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50358	NC_021012	ATT	2	6	2431522	2431527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50359	NC_021012	GAAAAA	2	12	2431564	2431575	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50360	NC_021012	AT	3	6	2431576	2431581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50361	NC_021012	AT	3	6	2431583	2431588	50 %	50 %	0 %	0 %	479148241
50362	NC_021012	AGG	2	6	2431594	2431599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148241
50363	NC_021012	A	7	7	2431643	2431649	100 %	0 %	0 %	0 %	479148241
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50491	NC_021012	AAT	2	6	2437375	2437380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50492	NC_021012	GA	3	6	2437391	2437396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50493	NC_021012	A	6	6	2437400	2437405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50494	NC_021012	TAT	2	6	2437445	2437450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50495	NC_021012	ATT	3	9	2437540	2437548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50496	NC_021012	TCA	2	6	2437554	2437559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50497	NC_021012	AT	3	6	2437574	2437579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50498	NC_021012	N	646	646	2437585	2438230	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50499	NC_021012	ATA	2	6	2438240	2438245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50500	NC_021012	CTG	2	6	2438303	2438308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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