MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Breinl

Total Repeats: 30250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020993	ATA	2	6	44	49	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693374
2	NC_020993	GGA	2	6	70	75	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478693374
3	NC_020993	ATA	2	6	108	113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693374
4	NC_020993	AGA	3	9	145	153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693374
5	NC_020993	GTA	2	6	181	186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693374
6	NC_020993	T	7	7	193	199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020993	T	6	6	201	206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020993	TTTA	2	8	215	222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020993	AT	3	6	231	236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020993	GCA	2	6	249	254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020993	A	9	9	266	274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020993	TTC	2	6	290	295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020993	TAA	2	6	332	337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693375
14	NC_020993	ATT	2	6	350	355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693375
15	NC_020993	TTC	2	6	391	396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478693375
16	NC_020993	CTTT	2	8	402	409	0 %	75 %	0 %	25 %	478693375
17	NC_020993	AAT	3	9	412	420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693375
18	NC_020993	AAT	2	6	460	465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693375
19	NC_020993	T	6	6	514	519	0 %	100 %	0 %	0 %	478693375
20	NC_020993	T	6	6	589	594	0 %	100 %	0 %	0 %	478693375
21	NC_020993	AAAAT	2	10	605	614	80 %	20 %	0 %	0 %	478693375
22	NC_020993	TC	3	6	616	621	0 %	50 %	0 %	50 %	478693375
23	NC_020993	TTAT	2	8	641	648	25 %	75 %	0 %	0 %	478693375
24	NC_020993	T	6	6	668	673	0 %	100 %	0 %	0 %	478693375
25	NC_020993	AAG	2	6	675	680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693375
26	NC_020993	ATT	2	6	704	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020993	ACG	2	6	740	745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478693376
28	NC_020993	T	7	7	746	752	0 %	100 %	0 %	0 %	478693376
29	NC_020993	TCT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478693376
30	NC_020993	CTAA	2	8	810	817	50 %	25 %	0 %	25 %	478693376
31	NC_020993	ATT	2	6	843	848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693376
32	NC_020993	TTAAT	2	10	870	879	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020993	AT	3	6	884	889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020993	CA	3	6	959	964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020993	CAT	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693377
36	NC_020993	T	6	6	1073	1078	0 %	100 %	0 %	0 %	478693377
37	NC_020993	CCG	2	6	1123	1128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478693377
38	NC_020993	T	7	7	1279	1285	0 %	100 %	0 %	0 %	478693377
39	NC_020993	TAAT	2	8	1340	1347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020993	TA	3	6	1349	1354	50 %	50 %	0 %	0 %	478693378
41	NC_020993	A	6	6	1364	1369	100 %	0 %	0 %	0 %	478693378
42	NC_020993	T	6	6	1372	1377	0 %	100 %	0 %	0 %	478693378
43	NC_020993	ACG	3	9	1444	1452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478693378
44	NC_020993	T	6	6	1462	1467	0 %	100 %	0 %	0 %	478693378
45	NC_020993	T	7	7	1516	1522	0 %	100 %	0 %	0 %	478693378
46	NC_020993	CAG	2	6	1524	1529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478693378
47	NC_020993	ATA	2	6	1642	1647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020993	T	8	8	1649	1656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020993	T	7	7	1673	1679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020993	TGA	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020993	AATA	2	8	1712	1719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020993	AAG	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693379
53	NC_020993	TTA	2	6	1846	1851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693379
54	NC_020993	CTTG	2	8	1869	1876	0 %	50 %	25 %	25 %	478693379
55	NC_020993	ATAGAT	2	12	1914	1925	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	478693379
56	NC_020993	TAAA	2	8	1933	1940	75 %	25 %	0 %	0 %	478693379
57	NC_020993	A	6	6	1943	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	478693379
58	NC_020993	TAG	2	6	1987	1992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693379
59	NC_020993	TAA	2	6	1993	1998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693379
60	NC_020993	TGG	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478693379
61	NC_020993	ATT	2	6	2030	2035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693379
62	NC_020993	TTA	2	6	2046	2051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693379
63	NC_020993	AAG	2	6	2110	2115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693379
64	NC_020993	TAA	2	6	2156	2161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693379
65	NC_020993	AGA	2	6	2168	2173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693379
66	NC_020993	TAT	2	6	2204	2209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693379
67	NC_020993	TTG	2	6	2221	2226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693379
68	NC_020993	CAT	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693379
69	NC_020993	TAA	2	6	2312	2317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693379
70	NC_020993	AAT	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693379
71	NC_020993	GTG	2	6	2356	2361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478693379
72	NC_020993	TAAT	2	8	2485	2492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020993	TAT	2	6	2594	2599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020993	TCT	2	6	2602	2607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020993	AAT	2	6	2626	2631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693380
76	NC_020993	GCA	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478693380
77	NC_020993	AAG	2	6	2698	2703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693380
78	NC_020993	TAT	2	6	2722	2727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693380
79	NC_020993	GAAA	2	8	2764	2771	75 %	0 %	25 %	0 %	478693380
80	NC_020993	TC	3	6	2808	2813	0 %	50 %	0 %	50 %	478693380
81	NC_020993	TTAA	2	8	2816	2823	50 %	50 %	0 %	0 %	478693380
82	NC_020993	A	6	6	2934	2939	100 %	0 %	0 %	0 %	478693380
83	NC_020993	AAAG	2	8	2966	2973	75 %	0 %	25 %	0 %	478693380
84	NC_020993	TAATA	2	10	3004	3013	60 %	40 %	0 %	0 %	478693380
85	NC_020993	AGA	2	6	3017	3022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693380
86	NC_020993	TAT	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693380
87	NC_020993	TAA	2	6	3043	3048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693380
88	NC_020993	ATC	2	6	3106	3111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693380
89	NC_020993	A	7	7	3148	3154	100 %	0 %	0 %	0 %	478693380
90	NC_020993	TAT	2	6	3172	3177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693380
91	NC_020993	AAG	2	6	3216	3221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693380
92	NC_020993	ATA	2	6	3256	3261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020993	TTA	2	6	3335	3340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020993	TAC	2	6	3344	3349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020993	GTG	2	6	3350	3355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020993	ATT	2	6	3403	3408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020993	CTT	2	6	3414	3419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020993	TTC	2	6	3431	3436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020993	TATT	2	8	3451	3458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020993	ATA	2	6	3526	3531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693381
101	NC_020993	AG	3	6	3548	3553	50 %	0 %	50 %	0 %	478693381
102	NC_020993	A	6	6	3591	3596	100 %	0 %	0 %	0 %	478693381
103	NC_020993	ATT	2	6	3639	3644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693381
104	NC_020993	ACT	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478693381
105	NC_020993	GAT	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693381
106	NC_020993	TGG	3	9	3785	3793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478693381
107	NC_020993	TGG	2	6	3797	3802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478693381
108	NC_020993	ATTGGT	2	12	3861	3872	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478693381
109	NC_020993	A	6	6	3878	3883	100 %	0 %	0 %	0 %	478693381
110	NC_020993	ATG	2	6	3889	3894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693381
111	NC_020993	TAA	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693381
112	NC_020993	GCAAT	2	10	3942	3951	40 %	20 %	20 %	20 %	478693381
113	NC_020993	TAA	2	6	3968	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693381
114	NC_020993	ATT	2	6	4030	4035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020993	T	6	6	4034	4039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020993	GAT	2	6	4040	4045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020993	T	6	6	4060	4065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020993	GTTT	2	8	4074	4081	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020993	A	7	7	4116	4122	100 %	0 %	0 %	0 %	478693382
120	NC_020993	ATA	2	6	4133	4138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693382
121	NC_020993	TGTA	2	8	4167	4174	25 %	50 %	25 %	0 %	478693382
122	NC_020993	TTA	2	6	4177	4182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693382
123	NC_020993	TA	3	6	4241	4246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020993	TTA	2	6	4297	4302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020993	AAG	3	9	4312	4320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020993	TTA	2	6	4325	4330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020993	TTG	2	6	4418	4423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693383
128	NC_020993	GTT	2	6	4449	4454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693383
129	NC_020993	TGA	2	6	4542	4547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478693383
130	NC_020993	CAA	2	6	4581	4586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478693383
131	NC_020993	TTG	2	6	4610	4615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693383
132	NC_020993	AGCA	2	8	4638	4645	50 %	0 %	25 %	25 %	478693383
133	NC_020993	TAA	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478693383
134	NC_020993	GTT	2	6	4715	4720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478693383
135	NC_020993	A	7	7	4867	4873	100 %	0 %	0 %	0 %	478693383
136	NC_020993	ATT	2	6	4890	4895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478693383
137	NC_020993	CAATTA	2	12	4975	4986	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	478693383
138	NC_020993	TATG	2	8	5008	5015	25 %	50 %	25 %	0 %	478693383
139	NC_020993	A	6	6	5087	5092	100 %	0 %	0 %	0 %	478693383
140	NC_020993	TTC	2	6	5109	5114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478693383
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142	NC_020993	AGA	2	6	5160	5165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478693383
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