MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E

Total Repeats: 30267

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_020992	TGTA	2	8	408459	408466	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_020992	ATA	2	6	408544	408549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_020992	TA	3	6	408604	408609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_020992	AATA	2	8	408610	408617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_020992	AGC	2	6	408633	408638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_020992	TAT	2	6	408644	408649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_020992	AT	3	6	408675	408680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_020992	GCA	2	6	408720	408725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_020992	A	7	7	408761	408767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_020992	GCA	2	6	408804	408809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_020992	TAA	3	9	408820	408828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_020992	TAA	2	6	408877	408882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_020992	TAT	2	6	408886	408891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_020992	TCAAAA	2	12	408971	408982	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11015	NC_020992	T	6	6	408987	408992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_020992	ATTT	2	8	409002	409009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_020992	AAATA	2	10	409053	409062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_020992	TCA	2	6	409116	409121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_020992	ATT	3	9	409134	409142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_020992	TTA	2	6	409174	409179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_020992	A	7	7	409189	409195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_020992	AT	3	6	409223	409228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_020992	A	6	6	409364	409369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_020992	A	8	8	409395	409402	100 %	0 %	0 %	0 %	478692784
11025	NC_020992	CTA	2	6	409436	409441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692784
11026	NC_020992	TAG	2	6	409442	409447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692784
11027	NC_020992	TGC	2	6	409473	409478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692784
11028	NC_020992	ATA	2	6	409487	409492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692784
11029	NC_020992	ACA	2	6	409495	409500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478692784
11030	NC_020992	GCA	2	6	409504	409509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692784
11031	NC_020992	GCT	2	6	409543	409548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692784
11032	NC_020992	TTA	2	6	409580	409585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692784
11033	NC_020992	TGCTAA	2	12	409587	409598	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478692784
11034	NC_020992	TAC	2	6	409689	409694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692784
11035	NC_020992	CAG	2	6	409720	409725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692784
11036	NC_020992	TGC	2	6	409749	409754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692784
11037	NC_020992	TAACA	2	10	409767	409776	60 %	20 %	0 %	20 %	478692784
11038	NC_020992	AAG	2	6	409796	409801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692784
11039	NC_020992	TGG	2	6	409845	409850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692784
11040	NC_020992	GCT	2	6	409852	409857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692784
11041	NC_020992	TGC	3	9	409899	409907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692784
11042	NC_020992	AATTT	2	10	409922	409931	40 %	60 %	0 %	0 %	478692784
11043	NC_020992	AAG	2	6	409949	409954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478692784
11044	NC_020992	CTC	2	6	409955	409960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478692784
11045	NC_020992	TGG	2	6	409992	409997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692784
11046	NC_020992	GAT	2	6	410077	410082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692784
11047	NC_020992	GGT	2	6	410143	410148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692784
11048	NC_020992	ATTAGT	2	12	410187	410198	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	478692784
11049	NC_020992	TGC	2	6	410211	410216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692784
11050	NC_020992	GGT	2	6	410245	410250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692784
11051	NC_020992	TAT	2	6	410262	410267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692784
11052	NC_020992	GCA	2	6	410281	410286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692784
11053	NC_020992	TC	3	6	410303	410308	0 %	50 %	0 %	50 %	478692784
11054	NC_020992	AGG	2	6	410310	410315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478692784
11055	NC_020992	TGC	2	6	410316	410321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692784
11056	NC_020992	GCA	2	6	410395	410400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692784
11057	NC_020992	ACC	2	6	410503	410508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478692784
11058	NC_020992	TAA	2	6	410537	410542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692784
11059	NC_020992	CTA	2	6	410564	410569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692784
11060	NC_020992	AC	3	6	410585	410590	50 %	0 %	0 %	50 %	478692784
11061	NC_020992	A	6	6	410643	410648	100 %	0 %	0 %	0 %	478692784
11062	NC_020992	TGG	2	6	410814	410819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692784
11063	NC_020992	TAAT	2	8	410849	410856	50 %	50 %	0 %	0 %	478692784
11064	NC_020992	AAT	3	9	410884	410892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692784
11065	NC_020992	GGT	2	6	410956	410961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692784
11066	NC_020992	TGC	2	6	410967	410972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692784
11067	NC_020992	ACA	2	6	410976	410981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478692784
11068	NC_020992	TGG	2	6	411051	411056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692784
11069	NC_020992	GGT	2	6	411079	411084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692784
11070	NC_020992	ATTAA	2	10	411088	411097	60 %	40 %	0 %	0 %	478692784
11071	NC_020992	ATA	2	6	411110	411115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692784
11072	NC_020992	ACT	2	6	411142	411147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692784
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11074	NC_020992	AGT	2	6	411172	411177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692784
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11076	NC_020992	GTA	2	6	411209	411214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692784
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11079	NC_020992	AAT	2	6	411322	411327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692784
11080	NC_020992	TACT	2	8	411351	411358	25 %	50 %	0 %	25 %	478692784
11081	NC_020992	TAA	2	6	411359	411364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692784
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11085	NC_020992	CTA	2	6	411479	411484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692784
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11088	NC_020992	TAC	2	6	411564	411569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692784
11089	NC_020992	TGG	2	6	411606	411611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692784
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11092	NC_020992	TAC	2	6	411684	411689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692784
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11094	NC_020992	TGG	2	6	411720	411725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692784
11095	NC_020992	AAT	2	6	411763	411768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692784
11096	NC_020992	TAC	2	6	411771	411776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692784
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11100	NC_020992	ATT	2	6	411889	411894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692784
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11103	NC_020992	A	6	6	412230	412235	100 %	0 %	0 %	0 %	478692784
11104	NC_020992	GTG	2	6	412259	412264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692784
11105	NC_020992	TAA	2	6	412272	412277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692784
11106	NC_020992	GGTTTA	2	12	412294	412305	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478692784
11107	NC_020992	TAC	2	6	412341	412346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692784
11108	NC_020992	AAC	2	6	412354	412359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478692784
11109	NC_020992	GTA	2	6	412364	412369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692784
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11111	NC_020992	TAC	2	6	412410	412415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692784
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11115	NC_020992	TAA	2	6	412542	412547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692784
11116	NC_020992	TTAG	2	8	412576	412583	25 %	50 %	25 %	0 %	478692784
11117	NC_020992	GGT	3	9	412729	412737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478692784
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11119	NC_020992	TCT	2	6	412764	412769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692784
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