MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_020125	GA	3	6	2030822	2030827	50 %	0 %	50 %	0 %	442315628
45502	NC_020125	ACTCA	2	10	2030874	2030883	40 %	20 %	0 %	40 %	442315628
45503	NC_020125	TGA	2	6	2030891	2030896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315628
45504	NC_020125	TCA	2	6	2030953	2030958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315628
45505	NC_020125	AGC	2	6	2031055	2031060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442315628
45506	NC_020125	AGA	2	6	2031062	2031067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315628
45507	NC_020125	GGAA	2	8	2031086	2031093	50 %	0 %	50 %	0 %	442315628
45508	NC_020125	ATG	2	6	2031097	2031102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315628
45509	NC_020125	GCG	2	6	2031130	2031135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442315628
45510	NC_020125	TTA	2	6	2031163	2031168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315628
45511	NC_020125	CCA	2	6	2031200	2031205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315628
45512	NC_020125	GAA	2	6	2031223	2031228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315628
45513	NC_020125	TTA	2	6	2031253	2031258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315628
45514	NC_020125	CAC	2	6	2031259	2031264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315628
45515	NC_020125	GTG	2	6	2031370	2031375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442315628
45516	NC_020125	AGA	2	6	2031461	2031466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315628
45517	NC_020125	ATG	2	6	2031475	2031480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315628
45518	NC_020125	A	6	6	2031519	2031524	100 %	0 %	0 %	0 %	442315628
45519	NC_020125	AGT	2	6	2031594	2031599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315628
45520	NC_020125	AAAT	2	8	2031637	2031644	75 %	25 %	0 %	0 %	442315628
45521	NC_020125	AGA	2	6	2031680	2031685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315628
45522	NC_020125	AGA	2	6	2031704	2031709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315628
45523	NC_020125	CTA	2	6	2031720	2031725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315628
45524	NC_020125	A	6	6	2031769	2031774	100 %	0 %	0 %	0 %	442315628
45525	NC_020125	A	7	7	2031852	2031858	100 %	0 %	0 %	0 %	442315628
45526	NC_020125	ATG	2	6	2031933	2031938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315628
45527	NC_020125	TGAA	2	8	2031970	2031977	50 %	25 %	25 %	0 %	442315628
45528	NC_020125	T	6	6	2032031	2032036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45529	NC_020125	ATTT	2	8	2032053	2032060	25 %	75 %	0 %	0 %	442315629
45530	NC_020125	TAA	2	6	2032105	2032110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315629
45531	NC_020125	TCT	2	6	2032149	2032154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315629
45532	NC_020125	CT	3	6	2032153	2032158	0 %	50 %	0 %	50 %	442315629
45533	NC_020125	GAT	2	6	2032320	2032325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315629
45534	NC_020125	A	7	7	2032346	2032352	100 %	0 %	0 %	0 %	442315629
45535	NC_020125	CT	3	6	2032452	2032457	0 %	50 %	0 %	50 %	442315629
45536	NC_020125	TAT	2	6	2032519	2032524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315629
45537	NC_020125	TAC	2	6	2032532	2032537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315629
45538	NC_020125	TAG	2	6	2032600	2032605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315629
45539	NC_020125	TTC	2	6	2032707	2032712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315629
45540	NC_020125	TATT	2	8	2032724	2032731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45541	NC_020125	TA	3	6	2032766	2032771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45542	NC_020125	AAAT	2	8	2032779	2032786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45543	NC_020125	AC	3	6	2032841	2032846	50 %	0 %	0 %	50 %	442315630
45544	NC_020125	TCT	2	6	2032923	2032928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315630
45545	NC_020125	ACT	2	6	2033020	2033025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315630
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45550	NC_020125	A	6	6	2033206	2033211	100 %	0 %	0 %	0 %	442315630
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45553	NC_020125	TCT	2	6	2033374	2033379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315630
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45557	NC_020125	TTCG	2	8	2033534	2033541	0 %	50 %	25 %	25 %	442315630
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45569	NC_020125	CT	3	6	2033968	2033973	0 %	50 %	0 %	50 %	442315631
45570	NC_020125	CAAAT	2	10	2034013	2034022	60 %	20 %	0 %	20 %	442315631
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45573	NC_020125	T	7	7	2034113	2034119	0 %	100 %	0 %	0 %	442315631
45574	NC_020125	TTG	2	6	2034127	2034132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442315631
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45580	NC_020125	CTT	2	6	2034426	2034431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315631
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45584	NC_020125	T	6	6	2034542	2034547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45585	NC_020125	CAT	2	6	2034597	2034602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45586	NC_020125	ATT	2	6	2034612	2034617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45587	NC_020125	ATA	2	6	2034657	2034662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45588	NC_020125	TAA	2	6	2034694	2034699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45589	NC_020125	TCC	2	6	2034750	2034755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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45591	NC_020125	GAAAA	2	10	2034804	2034813	80 %	0 %	20 %	0 %	442315632
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45593	NC_020125	A	7	7	2034846	2034852	100 %	0 %	0 %	0 %	442315632
45594	NC_020125	A	6	6	2034879	2034884	100 %	0 %	0 %	0 %	442315632
45595	NC_020125	GAA	2	6	2034915	2034920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315632
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45599	NC_020125	ACT	2	6	2035254	2035259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315632
45600	NC_020125	AGAT	2	8	2035265	2035272	50 %	25 %	25 %	0 %	442315632
45601	NC_020125	TCT	2	6	2035401	2035406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315632
45602	NC_020125	ATA	2	6	2035429	2035434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315632
45603	NC_020125	TAA	2	6	2035532	2035537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315632
45604	NC_020125	ATATCA	2	12	2035538	2035549	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	442315632
45605	NC_020125	ATA	2	6	2035558	2035563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315632
45606	NC_020125	TATTCT	2	12	2035567	2035578	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	442315632
45607	NC_020125	TATGAA	2	12	2035623	2035634	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	442315632
45608	NC_020125	TCT	2	6	2035641	2035646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315632
45609	NC_020125	TCC	2	6	2035705	2035710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315632
45610	NC_020125	CAT	2	6	2035724	2035729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315632
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45620	NC_020125	T	7	7	2036246	2036252	0 %	100 %	0 %	0 %	442315632
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45974	NC_020125	ATT	2	6	2050541	2050546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315643
45975	NC_020125	AGG	2	6	2050551	2050556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442315643
45976	NC_020125	CAA	2	6	2050594	2050599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315643
45977	NC_020125	GCT	2	6	2050651	2050656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315643
45978	NC_020125	CT	3	6	2050669	2050674	0 %	50 %	0 %	50 %	442315643
45979	NC_020125	TGG	2	6	2050689	2050694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442315643
45980	NC_020125	ATC	2	6	2050774	2050779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45981	NC_020125	GCAA	2	8	2050810	2050817	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45982	NC_020125	TTGAAA	2	12	2050854	2050865	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	442315644
45983	NC_020125	A	7	7	2050886	2050892	100 %	0 %	0 %	0 %	442315644
45984	NC_020125	ACA	2	6	2050907	2050912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315644
45985	NC_020125	CAT	2	6	2050936	2050941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315644
45986	NC_020125	TGG	2	6	2050949	2050954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442315644
45987	NC_020125	GAT	2	6	2051064	2051069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315644
45988	NC_020125	CTT	2	6	2051081	2051086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315644
45989	NC_020125	T	7	7	2051138	2051144	0 %	100 %	0 %	0 %	442315644
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45991	NC_020125	GAAA	2	8	2051285	2051292	75 %	0 %	25 %	0 %	442315644
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45994	NC_020125	A	6	6	2051389	2051394	100 %	0 %	0 %	0 %	442315644
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46000	NC_020125	TAA	2	6	2051612	2051617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315644

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