MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_020125	CAAA	2	8	1918433	1918440	75 %	0 %	0 %	25 %	442315525
43002	NC_020125	A	7	7	1918450	1918456	100 %	0 %	0 %	0 %	442315525
43003	NC_020125	TCA	2	6	1918471	1918476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315525
43004	NC_020125	T	7	7	1918496	1918502	0 %	100 %	0 %	0 %	442315526
43005	NC_020125	AAAT	2	8	1918537	1918544	75 %	25 %	0 %	0 %	442315526
43006	NC_020125	TCC	2	6	1918611	1918616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315526
43007	NC_020125	AT	3	6	1918623	1918628	50 %	50 %	0 %	0 %	442315526
43008	NC_020125	T	6	6	1918644	1918649	0 %	100 %	0 %	0 %	442315526
43009	NC_020125	TTCCT	2	10	1918668	1918677	0 %	60 %	0 %	40 %	442315526
43010	NC_020125	CTT	2	6	1918694	1918699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315526
43011	NC_020125	CTG	2	6	1918811	1918816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315526
43012	NC_020125	CAA	2	6	1918829	1918834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315526
43013	NC_020125	ATC	2	6	1918887	1918892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315526
43014	NC_020125	TC	3	6	1918924	1918929	0 %	50 %	0 %	50 %	442315526
43015	NC_020125	CTT	2	6	1919072	1919077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315526
43016	NC_020125	ATA	2	6	1919124	1919129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315526
43017	NC_020125	ACT	3	9	1919151	1919159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315526
43018	NC_020125	ATA	2	6	1919201	1919206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315526
43019	NC_020125	GAG	2	6	1919209	1919214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442315526
43020	NC_020125	T	7	7	1919249	1919255	0 %	100 %	0 %	0 %	442315526
43021	NC_020125	GATT	2	8	1919267	1919274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43022	NC_020125	AGT	2	6	1919341	1919346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315527
43023	NC_020125	GATT	2	8	1919426	1919433	25 %	50 %	25 %	0 %	442315527
43024	NC_020125	ATAA	2	8	1919444	1919451	75 %	25 %	0 %	0 %	442315527
43025	NC_020125	TCT	2	6	1919461	1919466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315527
43026	NC_020125	GCA	2	6	1919473	1919478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442315527
43027	NC_020125	TCT	2	6	1919536	1919541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315527
43028	NC_020125	ATA	2	6	1919568	1919573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315527
43029	NC_020125	GTTT	2	8	1919594	1919601	0 %	75 %	25 %	0 %	442315527
43030	NC_020125	GCT	2	6	1919620	1919625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315527
43031	NC_020125	T	6	6	1919628	1919633	0 %	100 %	0 %	0 %	442315527
43032	NC_020125	TTC	2	6	1919666	1919671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315527
43033	NC_020125	TTTC	2	8	1919732	1919739	0 %	75 %	0 %	25 %	442315527
43034	NC_020125	ATA	2	6	1919745	1919750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315527
43035	NC_020125	ATG	2	6	1919814	1919819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315527
43036	NC_020125	CTT	2	6	1919897	1919902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315527
43037	NC_020125	TTC	3	9	1920006	1920014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315527
43038	NC_020125	T	6	6	1920039	1920044	0 %	100 %	0 %	0 %	442315527
43039	NC_020125	TAT	2	6	1920059	1920064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315527
43040	NC_020125	ATA	2	6	1920141	1920146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315527
43041	NC_020125	CTTCC	2	10	1920190	1920199	0 %	40 %	0 %	60 %	442315527
43042	NC_020125	TAA	2	6	1920205	1920210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315527
43043	NC_020125	CAA	2	6	1920249	1920254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315527
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43045	NC_020125	GAA	2	6	1920353	1920358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315527
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43047	NC_020125	TAC	2	6	1920483	1920488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315528
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43052	NC_020125	CTT	2	6	1920703	1920708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315528
43053	NC_020125	TAT	2	6	1920730	1920735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315528
43054	NC_020125	ACC	2	6	1920753	1920758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315528
43055	NC_020125	T	6	6	1920761	1920766	0 %	100 %	0 %	0 %	442315528
43056	NC_020125	TCAAA	2	10	1920784	1920793	60 %	20 %	0 %	20 %	442315528
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43059	NC_020125	TTTG	2	8	1920983	1920990	0 %	75 %	25 %	0 %	442315528
43060	NC_020125	TCT	3	9	1921008	1921016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315528
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43064	NC_020125	T	6	6	1921104	1921109	0 %	100 %	0 %	0 %	442315529
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43071	NC_020125	ATTT	2	8	1921423	1921430	25 %	75 %	0 %	0 %	442315529
43072	NC_020125	ATTC	2	8	1921447	1921454	25 %	50 %	0 %	25 %	442315529
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43075	NC_020125	CCT	2	6	1921751	1921756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315529
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43078	NC_020125	AAAC	2	8	1921984	1921991	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43079	NC_020125	TTTTA	2	10	1922024	1922033	20 %	80 %	0 %	0 %	442315530
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43081	NC_020125	T	6	6	1922149	1922154	0 %	100 %	0 %	0 %	442315530
43082	NC_020125	GC	3	6	1922156	1922161	0 %	0 %	50 %	50 %	442315530
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43086	NC_020125	TCC	2	6	1922270	1922275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315530
43087	NC_020125	CTC	3	9	1922280	1922288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315530
43088	NC_020125	CGC	2	6	1922290	1922295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442315530
43089	NC_020125	TAA	2	6	1922306	1922311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315530
43090	NC_020125	TTG	2	6	1922348	1922353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442315530
43091	NC_020125	TTGT	2	8	1922358	1922365	0 %	75 %	25 %	0 %	442315530
43092	NC_020125	CTT	2	6	1922409	1922414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315530
43093	NC_020125	TGCTC	2	10	1922707	1922716	0 %	40 %	20 %	40 %	442315530
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43099	NC_020125	TCT	2	6	1923126	1923131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315531
43100	NC_020125	GAT	2	6	1923176	1923181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315531
43101	NC_020125	CTGA	2	8	1923206	1923213	25 %	25 %	25 %	25 %	442315531
43102	NC_020125	TGA	2	6	1923236	1923241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315531
43103	NC_020125	T	6	6	1923245	1923250	0 %	100 %	0 %	0 %	442315531
43104	NC_020125	ATG	2	6	1923274	1923279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315531
43105	NC_020125	CT	3	6	1923378	1923383	0 %	50 %	0 %	50 %	442315531
43106	NC_020125	TTCTT	2	10	1923513	1923522	0 %	80 %	0 %	20 %	442315531
43107	NC_020125	CT	3	6	1923558	1923563	0 %	50 %	0 %	50 %	442315531
43108	NC_020125	A	6	6	1923652	1923657	100 %	0 %	0 %	0 %	442315531
43109	NC_020125	GCCC	2	8	1923669	1923676	0 %	0 %	25 %	75 %	442315531
43110	NC_020125	T	6	6	1923789	1923794	0 %	100 %	0 %	0 %	442315531
43111	NC_020125	TAG	2	6	1923820	1923825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315531
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43115	NC_020125	T	7	7	1923919	1923925	0 %	100 %	0 %	0 %	442315531
43116	NC_020125	AAT	2	6	1924133	1924138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315531
43117	NC_020125	TC	3	6	1924171	1924176	0 %	50 %	0 %	50 %	442315531
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43119	NC_020125	TGTA	2	8	1924203	1924210	25 %	50 %	25 %	0 %	442315531
43120	NC_020125	TAT	2	6	1924401	1924406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315531
43121	NC_020125	T	7	7	1924406	1924412	0 %	100 %	0 %	0 %	442315531
43122	NC_020125	TAA	2	6	1924530	1924535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315532
43123	NC_020125	AT	3	6	1924596	1924601	50 %	50 %	0 %	0 %	442315532
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43151	NC_020125	TAA	2	6	1926248	1926253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315532
43152	NC_020125	T	6	6	1926266	1926271	0 %	100 %	0 %	0 %	442315532
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43174	NC_020125	TAC	2	6	1927547	1927552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315532
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43176	NC_020125	T	9	9	1927606	1927614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43177	NC_020125	AAAGAT	2	12	1927618	1927629	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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43179	NC_020125	AGAATA	2	12	1927679	1927690	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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43183	NC_020125	TTA	2	6	1927808	1927813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315533
43184	NC_020125	GTT	2	6	1927827	1927832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442315533
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43203	NC_020125	A	7	7	1928672	1928678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43204	NC_020125	AAAAT	2	10	1928692	1928701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43205	NC_020125	TCAT	2	8	1928719	1928726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43206	NC_020125	TAT	2	6	1928733	1928738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43207	NC_020125	TAA	2	6	1928783	1928788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43227	NC_020125	CAT	2	6	1929649	1929654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315535
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43229	NC_020125	GT	3	6	1929668	1929673	0 %	50 %	50 %	0 %	442315535
43230	NC_020125	ATG	2	6	1929713	1929718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315535
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43232	NC_020125	TCTGT	2	10	1929845	1929854	0 %	60 %	20 %	20 %	442315535
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43234	NC_020125	TAG	2	6	1929972	1929977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315535
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43478	NC_020125	CAA	2	6	1941299	1941304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315545
43479	NC_020125	A	6	6	1941313	1941318	100 %	0 %	0 %	0 %	442315545
43480	NC_020125	TGC	2	6	1941331	1941336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315545
43481	NC_020125	CAC	2	6	1941406	1941411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315545
43482	NC_020125	AGA	2	6	1941448	1941453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315545
43483	NC_020125	GGA	2	6	1941503	1941508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442315545
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43485	NC_020125	AAG	2	6	1941549	1941554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315545
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43490	NC_020125	AC	4	8	1941853	1941860	50 %	0 %	0 %	50 %	442315545
43491	NC_020125	ATTA	2	8	1941862	1941869	50 %	50 %	0 %	0 %	442315545
43492	NC_020125	AAAT	2	8	1941888	1941895	75 %	25 %	0 %	0 %	442315545
43493	NC_020125	AATC	2	8	1941929	1941936	50 %	25 %	0 %	25 %	442315545
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43498	NC_020125	CAT	2	6	1942170	1942175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315545
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