MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36005	NC_020125	GAC	2	6	1606396	1606401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442315201
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36158	NC_020125	A	6	6	1612347	1612352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36233	NC_020125	GTA	2	6	1615616	1615621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315212
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36237	NC_020125	AAAG	2	8	1615888	1615895	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36238	NC_020125	TTCT	2	8	1615932	1615939	0 %	75 %	0 %	25 %	442315213
36239	NC_020125	CCA	2	6	1615981	1615986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315213
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36242	NC_020125	TGC	2	6	1616126	1616131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315213
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36246	NC_020125	TA	3	6	1616210	1616215	50 %	50 %	0 %	0 %	442315213
36247	NC_020125	TCA	2	6	1616229	1616234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315213
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36254	NC_020125	T	6	6	1616552	1616557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36255	NC_020125	T	6	6	1616570	1616575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36256	NC_020125	ATT	2	6	1616652	1616657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315214
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36359	NC_020125	AAT	2	6	1621328	1621333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315219
36360	NC_020125	ATA	2	6	1621360	1621365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315219
36361	NC_020125	GAA	2	6	1621400	1621405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315219
36362	NC_020125	GGAA	2	8	1621431	1621438	50 %	0 %	50 %	0 %	442315219
36363	NC_020125	TATC	2	8	1621507	1621514	25 %	50 %	0 %	25 %	442315219
36364	NC_020125	GAC	2	6	1621576	1621581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442315219
36365	NC_020125	CAA	2	6	1621582	1621587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315219
36366	NC_020125	AAT	2	6	1621612	1621617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315219
36367	NC_020125	AGT	2	6	1621639	1621644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315219
36368	NC_020125	GATT	2	8	1621675	1621682	25 %	50 %	25 %	0 %	442315219
36369	NC_020125	ATC	2	6	1621709	1621714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315219
36370	NC_020125	T	7	7	1621739	1621745	0 %	100 %	0 %	0 %	442315219
36371	NC_020125	TCA	2	6	1621752	1621757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315219
36372	NC_020125	TCG	2	6	1621794	1621799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315219
36373	NC_020125	CATA	2	8	1621828	1621835	50 %	25 %	0 %	25 %	442315219
36374	NC_020125	TAA	2	6	1622094	1622099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315219
36375	NC_020125	ATT	2	6	1622126	1622131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315219
36376	NC_020125	TGG	2	6	1622141	1622146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442315219
36377	NC_020125	ATC	2	6	1622169	1622174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315219
36378	NC_020125	CAA	2	6	1622178	1622183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315219
36379	NC_020125	AAT	2	6	1622192	1622197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315219
36380	NC_020125	ATAG	2	8	1622208	1622215	50 %	25 %	25 %	0 %	442315219
36381	NC_020125	TCA	2	6	1622371	1622376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315219
36382	NC_020125	AAT	2	6	1622415	1622420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315219
36383	NC_020125	AAT	2	6	1622473	1622478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315219
36384	NC_020125	CAT	2	6	1622513	1622518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315219
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36388	NC_020125	GTC	2	6	1622782	1622787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315219
36389	NC_020125	AAAATA	2	12	1622809	1622820	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	442315219
36390	NC_020125	CATTG	2	10	1622849	1622858	20 %	40 %	20 %	20 %	442315219
36391	NC_020125	TAA	2	6	1622871	1622876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315219
36392	NC_020125	GCGT	2	8	1622943	1622950	0 %	25 %	50 %	25 %	442315219
36393	NC_020125	TAGA	2	8	1623019	1623026	50 %	25 %	25 %	0 %	442315219
36394	NC_020125	TTA	2	6	1623031	1623036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315219
36395	NC_020125	T	6	6	1623077	1623082	0 %	100 %	0 %	0 %	442315219
36396	NC_020125	TCA	2	6	1623097	1623102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315219
36397	NC_020125	T	7	7	1623105	1623111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36398	NC_020125	AAT	2	6	1623127	1623132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36399	NC_020125	AAAAGA	2	12	1623150	1623161	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36400	NC_020125	ATC	2	6	1623194	1623199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36401	NC_020125	TTC	2	6	1623237	1623242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315220
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36403	NC_020125	AACC	2	8	1623369	1623376	50 %	0 %	0 %	50 %	442315220
36404	NC_020125	ATTT	2	8	1623432	1623439	25 %	75 %	0 %	0 %	442315220
36405	NC_020125	AAT	2	6	1623443	1623448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315220
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36415	NC_020125	TTAC	2	8	1623770	1623777	25 %	50 %	0 %	25 %	442315220
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36433	NC_020125	ATA	2	6	1624465	1624470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315221
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36437	NC_020125	T	6	6	1624610	1624615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36438	NC_020125	CTT	2	6	1624732	1624737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315222
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36453	NC_020125	CCG	2	6	1625347	1625352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442315222
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36458	NC_020125	T	6	6	1625547	1625552	0 %	100 %	0 %	0 %	442315222
36459	NC_020125	ATT	2	6	1625580	1625585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315222
36460	NC_020125	TAT	2	6	1625586	1625591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36461	NC_020125	T	6	6	1625591	1625596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36462	NC_020125	T	7	7	1625654	1625660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36463	NC_020125	TAAAC	2	10	1625710	1625719	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36464	NC_020125	A	7	7	1625731	1625737	100 %	0 %	0 %	0 %	442315223
36465	NC_020125	AGA	2	6	1625751	1625756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315223
36466	NC_020125	CTT	2	6	1625818	1625823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315223
36467	NC_020125	AGA	2	6	1625979	1625984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315223
36468	NC_020125	TTC	2	6	1626006	1626011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315223
36469	NC_020125	TAA	2	6	1626015	1626020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315223
36470	NC_020125	GAA	2	6	1626059	1626064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315223
36471	NC_020125	TGTA	2	8	1626074	1626081	25 %	50 %	25 %	0 %	442315223
36472	NC_020125	AGA	2	6	1626102	1626107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315223
36473	NC_020125	T	6	6	1626117	1626122	0 %	100 %	0 %	0 %	442315223
36474	NC_020125	TTTC	2	8	1626137	1626144	0 %	75 %	0 %	25 %	442315223
36475	NC_020125	TAT	2	6	1626219	1626224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315223
36476	NC_020125	GAT	2	6	1626286	1626291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315223
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36481	NC_020125	A	6	6	1626533	1626538	100 %	0 %	0 %	0 %	442315223
36482	NC_020125	GAA	2	6	1626571	1626576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315223
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