MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_020125	TTAT	2	8	1517909	1517916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34002	NC_020125	AT	3	6	1517927	1517932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34003	NC_020125	GTA	2	6	1517943	1517948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34004	NC_020125	T	6	6	1517985	1517990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34005	NC_020125	TAA	2	6	1518023	1518028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34006	NC_020125	TTCT	2	8	1518029	1518036	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34007	NC_020125	AT	3	6	1518054	1518059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34008	NC_020125	TTAA	2	8	1518061	1518068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34009	NC_020125	TAAT	2	8	1518077	1518084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34010	NC_020125	T	6	6	1518084	1518089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34011	NC_020125	ATT	2	6	1518091	1518096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34012	NC_020125	ATA	2	6	1518111	1518116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34013	NC_020125	T	6	6	1518142	1518147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34014	NC_020125	T	7	7	1518166	1518172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34015	NC_020125	ATT	2	6	1518174	1518179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34016	NC_020125	TGT	2	6	1518195	1518200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34017	NC_020125	ATA	2	6	1518201	1518206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34018	NC_020125	A	6	6	1518208	1518213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34019	NC_020125	TAC	2	6	1518240	1518245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315123
34020	NC_020125	TCAT	2	8	1518278	1518285	25 %	50 %	0 %	25 %	442315123
34021	NC_020125	CAG	2	6	1518316	1518321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442315123
34022	NC_020125	GAA	2	6	1518393	1518398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315123
34023	NC_020125	ATT	2	6	1518459	1518464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315123
34024	NC_020125	A	6	6	1518525	1518530	100 %	0 %	0 %	0 %	442315123
34025	NC_020125	GAA	3	9	1518570	1518578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315123
34026	NC_020125	AG	3	6	1518636	1518641	50 %	0 %	50 %	0 %	442315123
34027	NC_020125	AGA	2	6	1518654	1518659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315123
34028	NC_020125	TGA	2	6	1518898	1518903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315123
34029	NC_020125	AAG	2	6	1518943	1518948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315123
34030	NC_020125	ATG	2	6	1518993	1518998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315123
34031	NC_020125	TAT	2	6	1519013	1519018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315123
34032	NC_020125	TTG	2	6	1519030	1519035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442315123
34033	NC_020125	TTC	2	6	1519041	1519046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315123
34034	NC_020125	AAG	2	6	1519048	1519053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315123
34035	NC_020125	AAG	2	6	1519147	1519152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315123
34036	NC_020125	GGC	2	6	1519274	1519279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442315123
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34039	NC_020125	CTA	3	9	1519417	1519425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315123
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34041	NC_020125	AAC	2	6	1519536	1519541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315123
34042	NC_020125	TTA	2	6	1519548	1519553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315123
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34044	NC_020125	TGT	2	6	1519909	1519914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442315123
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34055	NC_020125	TAAT	2	8	1520460	1520467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34056	NC_020125	AGG	2	6	1520476	1520481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34057	NC_020125	CCT	2	6	1520490	1520495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34058	NC_020125	TTA	2	6	1520504	1520509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34059	NC_020125	TGT	2	6	1520553	1520558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34060	NC_020125	TTG	3	9	1520559	1520567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34062	NC_020125	A	8	8	1520575	1520582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34063	NC_020125	A	6	6	1520610	1520615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34064	NC_020125	T	7	7	1520626	1520632	0 %	100 %	0 %	0 %	442315124
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34071	NC_020125	CAA	2	6	1521292	1521297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34072	NC_020125	TTA	2	6	1521327	1521332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34073	NC_020125	TAT	2	6	1521354	1521359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315125
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34075	NC_020125	T	6	6	1521415	1521420	0 %	100 %	0 %	0 %	442315125
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34082	NC_020125	TCT	2	6	1521713	1521718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315125
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34089	NC_020125	TAT	2	6	1521873	1521878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315125
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34091	NC_020125	AAT	2	6	1521897	1521902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315125
34092	NC_020125	CTG	2	6	1521949	1521954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315125
34093	NC_020125	CTTC	2	8	1521981	1521988	0 %	50 %	0 %	50 %	442315125
34094	NC_020125	TTCT	2	8	1522063	1522070	0 %	75 %	0 %	25 %	442315125
34095	NC_020125	TGA	2	6	1522148	1522153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315125
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34100	NC_020125	TAG	2	6	1522427	1522432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315125
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34102	NC_020125	T	7	7	1522509	1522515	0 %	100 %	0 %	0 %	442315125
34103	NC_020125	T	6	6	1522547	1522552	0 %	100 %	0 %	0 %	442315125
34104	NC_020125	CTG	2	6	1522596	1522601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315125
34105	NC_020125	GAT	2	6	1522710	1522715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315125
34106	NC_020125	T	7	7	1522717	1522723	0 %	100 %	0 %	0 %	442315125
34107	NC_020125	ATT	2	6	1522783	1522788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315125
34108	NC_020125	ATT	2	6	1522978	1522983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315125
34109	NC_020125	CTAT	2	8	1523003	1523010	25 %	50 %	0 %	25 %	442315125
34110	NC_020125	TTA	2	6	1523024	1523029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315125
34111	NC_020125	TTTC	2	8	1523060	1523067	0 %	75 %	0 %	25 %	442315125
34112	NC_020125	T	6	6	1523131	1523136	0 %	100 %	0 %	0 %	442315125
34113	NC_020125	ATC	3	9	1523156	1523164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315125
34114	NC_020125	TCT	3	9	1523168	1523176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315125
34115	NC_020125	AAT	2	6	1523184	1523189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315125
34116	NC_020125	ATA	2	6	1523212	1523217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315125
34117	NC_020125	ACAAT	2	10	1523253	1523262	60 %	20 %	0 %	20 %	442315125
34118	NC_020125	GTTT	2	8	1523279	1523286	0 %	75 %	25 %	0 %	442315125
34119	NC_020125	TC	3	6	1523311	1523316	0 %	50 %	0 %	50 %	442315125
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34121	NC_020125	CAT	2	6	1523524	1523529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315125
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34236	NC_020125	TAT	2	6	1527643	1527648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34238	NC_020125	AG	3	6	1527739	1527744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34239	NC_020125	GAT	2	6	1527782	1527787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34240	NC_020125	GAA	2	6	1527842	1527847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34241	NC_020125	AAT	2	6	1527899	1527904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34242	NC_020125	AG	3	6	1527905	1527910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34243	NC_020125	TTTG	2	8	1527927	1527934	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34244	NC_020125	TTA	2	6	1527945	1527950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34245	NC_020125	AAT	2	6	1527953	1527958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34246	NC_020125	TAAA	2	8	1528042	1528049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34247	NC_020125	A	6	6	1528090	1528095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34248	NC_020125	ATA	2	6	1528124	1528129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34249	NC_020125	T	6	6	1528136	1528141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34250	NC_020125	GAA	2	6	1528166	1528171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34251	NC_020125	T	6	6	1528183	1528188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34252	NC_020125	AAT	2	6	1528190	1528195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34253	NC_020125	A	7	7	1528197	1528203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34254	NC_020125	A	6	6	1528227	1528232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34255	NC_020125	TCA	2	6	1528263	1528268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34256	NC_020125	A	6	6	1528336	1528341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34257	NC_020125	A	6	6	1528365	1528370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34258	NC_020125	AAGT	2	8	1528377	1528384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34259	NC_020125	TTTTTA	2	12	1528395	1528406	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34266	NC_020125	TTA	2	6	1528915	1528920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315129
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34270	NC_020125	CTT	2	6	1529228	1529233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315129
34271	NC_020125	GCT	2	6	1529236	1529241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315129
34272	NC_020125	GTC	2	6	1529310	1529315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315129
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34279	NC_020125	AAT	2	6	1529655	1529660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315129
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34281	NC_020125	T	6	6	1530007	1530012	0 %	100 %	0 %	0 %	442315129
34282	NC_020125	CCG	2	6	1530044	1530049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442315129
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34284	NC_020125	TA	3	6	1530086	1530091	50 %	50 %	0 %	0 %	442315129
34285	NC_020125	TAT	2	6	1530123	1530128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34286	NC_020125	CTT	2	6	1530146	1530151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34287	NC_020125	A	8	8	1530158	1530165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34288	NC_020125	A	7	7	1530167	1530173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34289	NC_020125	GAAA	2	8	1530176	1530183	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34290	NC_020125	T	6	6	1530188	1530193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34291	NC_020125	A	6	6	1530289	1530294	100 %	0 %	0 %	0 %	442315130
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34322	NC_020125	AGA	2	6	1531972	1531977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315130
34323	NC_020125	AAT	2	6	1532013	1532018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34324	NC_020125	ATT	2	6	1532042	1532047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34325	NC_020125	TAG	2	6	1532053	1532058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34326	NC_020125	TC	3	6	1532258	1532263	0 %	50 %	0 %	50 %	442315131
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34332	NC_020125	A	6	6	1532649	1532654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34333	NC_020125	GTA	2	6	1532663	1532668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315132
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34336	NC_020125	TTCT	2	8	1532804	1532811	0 %	75 %	0 %	25 %	442315132
34337	NC_020125	ACC	2	6	1532814	1532819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315132
34338	NC_020125	T	6	6	1532822	1532827	0 %	100 %	0 %	0 %	442315132
34339	NC_020125	TG	3	6	1532936	1532941	0 %	50 %	50 %	0 %	442315132
34340	NC_020125	AAT	2	6	1533117	1533122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315132
34341	NC_020125	CAT	2	6	1533197	1533202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315132
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34343	NC_020125	CA	3	6	1533389	1533394	50 %	0 %	0 %	50 %	442315132
34344	NC_020125	ATT	2	6	1533537	1533542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315132
34345	NC_020125	TGT	2	6	1533554	1533559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442315132
34346	NC_020125	ATTTT	2	10	1533578	1533587	20 %	80 %	0 %	0 %	442315132
34347	NC_020125	CTT	2	6	1533605	1533610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315132
34348	NC_020125	CAG	2	6	1533623	1533628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442315132
34349	NC_020125	TTTTTA	2	12	1533655	1533666	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	442315132
34350	NC_020125	ATT	2	6	1533697	1533702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34351	NC_020125	TTC	2	6	1533858	1533863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315133
34352	NC_020125	CTT	2	6	1533864	1533869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315133
34353	NC_020125	AGC	2	6	1533901	1533906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442315133
34354	NC_020125	TCT	2	6	1534025	1534030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315133
34355	NC_020125	T	7	7	1534033	1534039	0 %	100 %	0 %	0 %	442315133
34356	NC_020125	TTC	2	6	1534210	1534215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315133
34357	NC_020125	TGCTCC	2	12	1534294	1534305	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34358	NC_020125	CTC	2	6	1534326	1534331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34359	NC_020125	TCA	2	6	1534337	1534342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34360	NC_020125	CTA	3	9	1534376	1534384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315134
34361	NC_020125	AT	3	6	1534385	1534390	50 %	50 %	0 %	0 %	442315134
34362	NC_020125	TATTG	2	10	1534479	1534488	20 %	60 %	20 %	0 %	442315134
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34364	NC_020125	ATA	2	6	1534558	1534563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315134
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34366	NC_020125	TCT	2	6	1534671	1534676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315134
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34373	NC_020125	TAT	2	6	1534894	1534899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34374	NC_020125	TC	3	6	1534913	1534918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34375	NC_020125	TTAAA	2	10	1534922	1534931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34376	NC_020125	T	6	6	1534974	1534979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34380	NC_020125	T	6	6	1535078	1535083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34381	NC_020125	TA	4	8	1535095	1535102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34382	NC_020125	AAAG	2	8	1535107	1535114	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34383	NC_020125	TTTA	2	8	1535168	1535175	25 %	75 %	0 %	0 %	442315135
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34417	NC_020125	CTCTA	2	10	1537086	1537095	20 %	40 %	0 %	40 %	442315135
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34433	NC_020125	ATT	2	6	1537779	1537784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315135
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34454	NC_020125	T	6	6	1538695	1538700	0 %	100 %	0 %	0 %	442315135
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34456	NC_020125	CT	3	6	1538841	1538846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34457	NC_020125	ATC	3	9	1538886	1538894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34460	NC_020125	TCATC	2	10	1539005	1539014	20 %	40 %	0 %	40 %	442315136
34461	NC_020125	TCA	2	6	1539016	1539021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315136
34462	NC_020125	CCA	2	6	1539092	1539097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315136
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34464	NC_020125	CCA	2	6	1539196	1539201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315136
34465	NC_020125	CTTC	2	8	1539226	1539233	0 %	50 %	0 %	50 %	442315136
34466	NC_020125	TGGA	2	8	1539255	1539262	25 %	25 %	50 %	0 %	442315136
34467	NC_020125	GTACCT	2	12	1539271	1539282	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	442315136
34468	NC_020125	TGTA	2	8	1539299	1539306	25 %	50 %	25 %	0 %	442315136
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34470	NC_020125	T	6	6	1539327	1539332	0 %	100 %	0 %	0 %	442315136
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34473	NC_020125	CT	3	6	1539367	1539372	0 %	50 %	0 %	50 %	442315136
34474	NC_020125	GTA	2	6	1539452	1539457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315136
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