MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_020125	A	6	6	869822	869827	100 %	0 %	0 %	0 %	442314523
19502	NC_020125	AAT	2	6	869877	869882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19503	NC_020125	TCTA	2	8	869900	869907	25 %	50 %	0 %	25 %	442314524
19504	NC_020125	TCA	2	6	870046	870051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314524
19505	NC_020125	TGG	2	6	870081	870086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314524
19506	NC_020125	TCA	2	6	870103	870108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314524
19507	NC_020125	GTT	2	6	870218	870223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314524
19508	NC_020125	ATAA	2	8	870233	870240	75 %	25 %	0 %	0 %	442314524
19509	NC_020125	ACT	2	6	870270	870275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314524
19510	NC_020125	GTG	2	6	870312	870317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314524
19511	NC_020125	ACC	2	6	870320	870325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314524
19512	NC_020125	GCA	2	6	870341	870346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314524
19513	NC_020125	ATT	2	6	870351	870356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314524
19514	NC_020125	T	6	6	870416	870421	0 %	100 %	0 %	0 %	442314524
19515	NC_020125	GAG	2	6	870442	870447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314524
19516	NC_020125	TAG	2	6	870465	870470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314524
19517	NC_020125	AATA	2	8	870509	870516	75 %	25 %	0 %	0 %	442314524
19518	NC_020125	CCGT	2	8	870556	870563	0 %	25 %	25 %	50 %	442314524
19519	NC_020125	T	6	6	870571	870576	0 %	100 %	0 %	0 %	442314524
19520	NC_020125	AATGG	2	10	870580	870589	40 %	20 %	40 %	0 %	442314524
19521	NC_020125	A	6	6	870747	870752	100 %	0 %	0 %	0 %	442314524
19522	NC_020125	AGC	2	6	870863	870868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314525
19523	NC_020125	GAT	2	6	870894	870899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314525
19524	NC_020125	TA	3	6	870927	870932	50 %	50 %	0 %	0 %	442314525
19525	NC_020125	AACCAA	2	12	871078	871089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314525
19526	NC_020125	T	6	6	871108	871113	0 %	100 %	0 %	0 %	442314525
19527	NC_020125	CAAA	2	8	871137	871144	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19528	NC_020125	AGA	2	6	871150	871155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19529	NC_020125	A	6	6	871162	871167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19530	NC_020125	T	6	6	871214	871219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19531	NC_020125	CAG	2	6	871439	871444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19532	NC_020125	GT	3	6	871604	871609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19533	NC_020125	ACT	2	6	871807	871812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19534	NC_020125	TTA	2	6	871817	871822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19535	NC_020125	TGT	2	6	871835	871840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19536	NC_020125	TTG	2	6	872145	872150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19537	NC_020125	TTA	2	6	872348	872353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19538	NC_020125	ATA	2	6	872420	872425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19539	NC_020125	TGTT	2	8	872430	872437	0 %	75 %	25 %	0 %	442314526
19540	NC_020125	T	6	6	872448	872453	0 %	100 %	0 %	0 %	442314526
19541	NC_020125	AATTA	2	10	872492	872501	60 %	40 %	0 %	0 %	442314526
19542	NC_020125	GTA	2	6	872546	872551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19543	NC_020125	A	6	6	872569	872574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19544	NC_020125	A	7	7	872647	872653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19545	NC_020125	AGT	3	9	872733	872741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314527
19546	NC_020125	AGT	2	6	872745	872750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314527
19547	NC_020125	A	6	6	872766	872771	100 %	0 %	0 %	0 %	442314527
19548	NC_020125	GCA	2	6	872827	872832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314527
19549	NC_020125	TTTA	2	8	872892	872899	25 %	75 %	0 %	0 %	442314527
19550	NC_020125	TAA	2	6	872956	872961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314527
19551	NC_020125	AG	3	6	872979	872984	50 %	0 %	50 %	0 %	442314527
19552	NC_020125	AGA	2	6	872988	872993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314527
19553	NC_020125	CAG	2	6	873005	873010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314527
19554	NC_020125	AAGT	2	8	873019	873026	50 %	25 %	25 %	0 %	442314527
19555	NC_020125	ATT	2	6	873069	873074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314527
19556	NC_020125	T	6	6	873086	873091	0 %	100 %	0 %	0 %	442314527
19557	NC_020125	TCTT	2	8	873249	873256	0 %	75 %	0 %	25 %	442314527
19558	NC_020125	TTC	2	6	873308	873313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314527
19559	NC_020125	TAG	2	6	873356	873361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314527
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19561	NC_020125	TCT	2	6	873418	873423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314527
19562	NC_020125	CTA	2	6	873428	873433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314527
19563	NC_020125	CTGCAT	2	12	873461	873472	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	442314527
19564	NC_020125	TAG	2	6	873545	873550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314527
19565	NC_020125	TGA	2	6	873623	873628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314527
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19567	NC_020125	ACT	2	6	873685	873690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314527
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19569	NC_020125	GTT	2	6	873830	873835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314527
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19573	NC_020125	TAG	2	6	873971	873976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314527
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19575	NC_020125	TCG	2	6	874030	874035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314527
19576	NC_020125	TGT	3	9	874092	874100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314527
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19578	NC_020125	CT	3	6	874207	874212	0 %	50 %	0 %	50 %	442314528
19579	NC_020125	TCT	2	6	874222	874227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314528
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19588	NC_020125	CTT	2	6	874581	874586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314528
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19593	NC_020125	CGAAG	2	10	874675	874684	40 %	0 %	40 %	20 %	442314528
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19598	NC_020125	TGA	2	6	875046	875051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314528
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19605	NC_020125	TCT	2	6	875369	875374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314528
19606	NC_020125	TGGT	2	8	875405	875412	0 %	50 %	50 %	0 %	442314528
19607	NC_020125	TC	3	6	875466	875471	0 %	50 %	0 %	50 %	442314528
19608	NC_020125	ATAA	2	8	875484	875491	75 %	25 %	0 %	0 %	442314528
19609	NC_020125	AAG	2	6	875499	875504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314528
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19613	NC_020125	TCTATT	2	12	875614	875625	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	442314528
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19615	NC_020125	GTA	2	6	875764	875769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314528
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19617	NC_020125	TCTAG	2	10	875801	875810	20 %	40 %	20 %	20 %	442314528
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19989	NC_020125	AAG	2	6	893275	893280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314541
19990	NC_020125	AATG	2	8	893291	893298	50 %	25 %	25 %	0 %	442314541
19991	NC_020125	TGC	2	6	893309	893314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314541
19992	NC_020125	AAC	2	6	893363	893368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314541
19993	NC_020125	TTA	2	6	893492	893497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314541
19994	NC_020125	T	7	7	893690	893696	0 %	100 %	0 %	0 %	442314541
19995	NC_020125	TAC	2	6	893708	893713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314541
19996	NC_020125	AAGA	2	8	893813	893820	75 %	0 %	25 %	0 %	442314541
19997	NC_020125	CTA	2	6	893830	893835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314541
19998	NC_020125	TGG	2	6	893958	893963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314541
19999	NC_020125	CTA	2	6	894046	894051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314541
20000	NC_020125	TGA	2	6	894110	894115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314541

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