MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_020125	T	6	6	670359	670364	0 %	100 %	0 %	0 %	442314337
15002	NC_020125	T	7	7	670366	670372	0 %	100 %	0 %	0 %	442314337
15003	NC_020125	T	7	7	670386	670392	0 %	100 %	0 %	0 %	442314337
15004	NC_020125	TTC	2	6	670399	670404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314337
15005	NC_020125	ATA	2	6	670452	670457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314338
15006	NC_020125	GTTT	2	8	670461	670468	0 %	75 %	25 %	0 %	442314338
15007	NC_020125	GTTT	2	8	670505	670512	0 %	75 %	25 %	0 %	442314338
15008	NC_020125	GTA	2	6	670523	670528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314338
15009	NC_020125	TTTG	2	8	670597	670604	0 %	75 %	25 %	0 %	442314338
15010	NC_020125	T	7	7	670624	670630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_020125	T	7	7	670661	670667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_020125	TTTA	2	8	670685	670692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_020125	CTT	2	6	670711	670716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15014	NC_020125	CAT	2	6	670841	670846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314339
15015	NC_020125	CAC	3	9	670853	670861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314339
15016	NC_020125	AAG	2	6	670864	670869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314339
15017	NC_020125	TCT	2	6	670894	670899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314339
15018	NC_020125	AGG	4	12	670902	670913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314339
15019	NC_020125	CTA	2	6	670958	670963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314340
15020	NC_020125	ATT	2	6	670983	670988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314340
15021	NC_020125	TTA	3	9	670989	670997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314340
15022	NC_020125	AT	4	8	671039	671046	50 %	50 %	0 %	0 %	442314340
15023	NC_020125	T	7	7	671110	671116	0 %	100 %	0 %	0 %	442314340
15024	NC_020125	CTT	2	6	671122	671127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314340
15025	NC_020125	TAT	3	9	671161	671169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314340
15026	NC_020125	ATT	2	6	671201	671206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314340
15027	NC_020125	AT	3	6	671239	671244	50 %	50 %	0 %	0 %	442314340
15028	NC_020125	CTT	3	9	671245	671253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314340
15029	NC_020125	TGAT	2	8	671256	671263	25 %	50 %	25 %	0 %	442314340
15030	NC_020125	A	6	6	671282	671287	100 %	0 %	0 %	0 %	442314340
15031	NC_020125	A	7	7	671289	671295	100 %	0 %	0 %	0 %	442314340
15032	NC_020125	ATTT	2	8	671329	671336	25 %	75 %	0 %	0 %	442314341
15033	NC_020125	TATT	2	8	671355	671362	25 %	75 %	0 %	0 %	442314341
15034	NC_020125	TAA	2	6	671365	671370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314341
15035	NC_020125	TAA	2	6	671392	671397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314341
15036	NC_020125	TTG	2	6	671417	671422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314341
15037	NC_020125	TA	3	6	671480	671485	50 %	50 %	0 %	0 %	442314341
15038	NC_020125	TCATT	2	10	671614	671623	20 %	60 %	0 %	20 %	442314341
15039	NC_020125	CCG	2	6	671649	671654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442314341
15040	NC_020125	GA	3	6	671664	671669	50 %	0 %	50 %	0 %	442314341
15041	NC_020125	T	6	6	671726	671731	0 %	100 %	0 %	0 %	442314341
15042	NC_020125	CTTG	2	8	671741	671748	0 %	50 %	25 %	25 %	442314341
15043	NC_020125	TCA	2	6	671760	671765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314341
15044	NC_020125	ACC	2	6	671813	671818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15045	NC_020125	TGC	2	6	671852	671857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_020125	A	6	6	671959	671964	100 %	0 %	0 %	0 %	442314342
15047	NC_020125	TAA	2	6	671979	671984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314342
15048	NC_020125	TGAT	2	8	672051	672058	25 %	50 %	25 %	0 %	442314342
15049	NC_020125	TAT	2	6	672074	672079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314342
15050	NC_020125	T	8	8	672079	672086	0 %	100 %	0 %	0 %	442314342
15051	NC_020125	AT	3	6	672087	672092	50 %	50 %	0 %	0 %	442314342
15052	NC_020125	CTAAA	2	10	672137	672146	60 %	20 %	0 %	20 %	442314342
15053	NC_020125	A	6	6	672144	672149	100 %	0 %	0 %	0 %	442314342
15054	NC_020125	TAG	2	6	672238	672243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314342
15055	NC_020125	AAT	2	6	672260	672265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314342
15056	NC_020125	T	6	6	672275	672280	0 %	100 %	0 %	0 %	442314342
15057	NC_020125	T	6	6	672318	672323	0 %	100 %	0 %	0 %	442314342
15058	NC_020125	TCT	2	6	672351	672356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314342
15059	NC_020125	TAA	2	6	672401	672406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314342
15060	NC_020125	TG	3	6	672508	672513	0 %	50 %	50 %	0 %	442314343
15061	NC_020125	GCT	2	6	672591	672596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314343
15062	NC_020125	CAT	2	6	672692	672697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314343
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15064	NC_020125	TTA	2	6	672729	672734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314344
15065	NC_020125	T	8	8	672756	672763	0 %	100 %	0 %	0 %	442314344
15066	NC_020125	T	6	6	672782	672787	0 %	100 %	0 %	0 %	442314344
15067	NC_020125	TCC	3	9	672797	672805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314344
15068	NC_020125	TGCA	2	8	672818	672825	25 %	25 %	25 %	25 %	442314344
15069	NC_020125	TA	4	8	672838	672845	50 %	50 %	0 %	0 %	442314344
15070	NC_020125	AAT	2	6	672869	672874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314344
15071	NC_020125	TCTAT	2	10	672894	672903	20 %	60 %	0 %	20 %	442314344
15072	NC_020125	TA	3	6	672983	672988	50 %	50 %	0 %	0 %	442314344
15073	NC_020125	TTC	2	6	673004	673009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314344
15074	NC_020125	AATT	2	8	673022	673029	50 %	50 %	0 %	0 %	442314344
15075	NC_020125	ATT	2	6	673034	673039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314344
15076	NC_020125	AT	3	6	673067	673072	50 %	50 %	0 %	0 %	442314344
15077	NC_020125	TTA	2	6	673074	673079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314344
15078	NC_020125	ATC	2	6	673097	673102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314344
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15080	NC_020125	AAGAA	2	10	673167	673176	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_020125	AGA	2	6	673177	673182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_020125	ATT	2	6	673188	673193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_020125	T	7	7	673199	673205	0 %	100 %	0 %	0 %	442314345
15084	NC_020125	ATG	2	6	673209	673214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314345
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15089	NC_020125	AAT	2	6	673476	673481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314345
15090	NC_020125	AT	3	6	673503	673508	50 %	50 %	0 %	0 %	442314345
15091	NC_020125	TGA	2	6	673510	673515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314345
15092	NC_020125	TAT	2	6	673530	673535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314345
15093	NC_020125	ATA	2	6	673537	673542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314345
15094	NC_020125	ACT	2	6	673543	673548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314345
15095	NC_020125	TC	4	8	673555	673562	0 %	50 %	0 %	50 %	442314345
15096	NC_020125	GCT	2	6	673613	673618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314345
15097	NC_020125	TG	3	6	673648	673653	0 %	50 %	50 %	0 %	442314345
15098	NC_020125	TGTT	2	8	673720	673727	0 %	75 %	25 %	0 %	442314345
15099	NC_020125	T	6	6	673781	673786	0 %	100 %	0 %	0 %	442314345
15100	NC_020125	ATT	2	6	673862	673867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314345
15101	NC_020125	AAG	2	6	673998	674003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314345
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15103	NC_020125	CAG	2	6	674049	674054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314345
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15105	NC_020125	TGC	2	6	674148	674153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314345
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15107	NC_020125	ACT	2	6	674216	674221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314345
15108	NC_020125	A	6	6	674260	674265	100 %	0 %	0 %	0 %	442314345
15109	NC_020125	GTT	2	6	674302	674307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314345
15110	NC_020125	TCT	2	6	674380	674385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314345
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15112	NC_020125	TAC	2	6	674478	674483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314345
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15114	NC_020125	CGT	2	6	674565	674570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314345
15115	NC_020125	GTT	2	6	674577	674582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314345
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15117	NC_020125	AGT	2	6	674628	674633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314345
15118	NC_020125	CTTG	2	8	674654	674661	0 %	50 %	25 %	25 %	442314345
15119	NC_020125	ATA	2	6	674687	674692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314345
15120	NC_020125	TA	3	6	674716	674721	50 %	50 %	0 %	0 %	442314345
15121	NC_020125	GT	3	6	674726	674731	0 %	50 %	50 %	0 %	442314345
15122	NC_020125	AGT	2	6	674784	674789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314345
15123	NC_020125	ACC	2	6	674827	674832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314345
15124	NC_020125	AGA	2	6	674854	674859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314345
15125	NC_020125	GTT	2	6	674914	674919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314345
15126	NC_020125	CTG	2	6	674935	674940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314345
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15172	NC_020125	ATT	2	6	677845	677850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15184	NC_020125	ATA	2	6	678421	678426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15241	NC_020125	CCTC	2	8	681141	681148	0 %	25 %	0 %	75 %	442314348
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15244	NC_020125	TA	3	6	681199	681204	50 %	50 %	0 %	0 %	442314348
15245	NC_020125	AAT	2	6	681211	681216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314348
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