MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_020125	TTG	2	6	599959	599964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314273
13502	NC_020125	A	6	6	599971	599976	100 %	0 %	0 %	0 %	442314273
13503	NC_020125	ATT	2	6	600035	600040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314274
13504	NC_020125	T	6	6	600039	600044	0 %	100 %	0 %	0 %	442314274
13505	NC_020125	A	7	7	600105	600111	100 %	0 %	0 %	0 %	442314274
13506	NC_020125	GATA	2	8	600149	600156	50 %	25 %	25 %	0 %	442314274
13507	NC_020125	T	7	7	600176	600182	0 %	100 %	0 %	0 %	442314274
13508	NC_020125	GTT	2	6	600183	600188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314274
13509	NC_020125	TGG	2	6	600293	600298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314274
13510	NC_020125	T	8	8	600310	600317	0 %	100 %	0 %	0 %	442314274
13511	NC_020125	ACCA	2	8	600350	600357	50 %	0 %	0 %	50 %	442314274
13512	NC_020125	ACA	2	6	600358	600363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314274
13513	NC_020125	AAAT	2	8	600471	600478	75 %	25 %	0 %	0 %	442314274
13514	NC_020125	TGA	2	6	600687	600692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314274
13515	NC_020125	GGA	2	6	600698	600703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314274
13516	NC_020125	TCA	2	6	600709	600714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314274
13517	NC_020125	AAT	2	6	600738	600743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314274
13518	NC_020125	CCT	2	6	600802	600807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314274
13519	NC_020125	TGA	2	6	600809	600814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314274
13520	NC_020125	T	6	6	600834	600839	0 %	100 %	0 %	0 %	442314274
13521	NC_020125	AG	3	6	600850	600855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_020125	GAA	2	6	600868	600873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314275
13523	NC_020125	CT	3	6	600876	600881	0 %	50 %	0 %	50 %	442314275
13524	NC_020125	GGTA	2	8	600935	600942	25 %	25 %	50 %	0 %	442314275
13525	NC_020125	A	6	6	600966	600971	100 %	0 %	0 %	0 %	442314275
13526	NC_020125	CAT	2	6	600999	601004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314275
13527	NC_020125	GCT	2	6	601024	601029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314275
13528	NC_020125	TAA	2	6	601106	601111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314275
13529	NC_020125	AAC	2	6	601185	601190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314275
13530	NC_020125	TATAA	2	10	601224	601233	60 %	40 %	0 %	0 %	442314275
13531	NC_020125	GA	3	6	601256	601261	50 %	0 %	50 %	0 %	442314275
13532	NC_020125	TTAG	2	8	601270	601277	25 %	50 %	25 %	0 %	442314275
13533	NC_020125	ATC	2	6	601306	601311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314275
13534	NC_020125	AAT	2	6	601323	601328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314275
13535	NC_020125	CTA	2	6	601358	601363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314275
13536	NC_020125	GCT	2	6	601390	601395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314275
13537	NC_020125	GA	3	6	601416	601421	50 %	0 %	50 %	0 %	442314275
13538	NC_020125	A	6	6	601434	601439	100 %	0 %	0 %	0 %	442314275
13539	NC_020125	GGT	2	6	601443	601448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314275
13540	NC_020125	AAT	2	6	601476	601481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314275
13541	NC_020125	ATA	2	6	601486	601491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314275
13542	NC_020125	AGA	2	6	601512	601517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314275
13543	NC_020125	TCT	2	6	601549	601554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314275
13544	NC_020125	T	6	6	601583	601588	0 %	100 %	0 %	0 %	442314275
13545	NC_020125	AAT	2	6	601611	601616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314275
13546	NC_020125	AAATTA	2	12	601628	601639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314275
13547	NC_020125	T	6	6	601777	601782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_020125	AAG	2	6	601833	601838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314276
13549	NC_020125	AT	3	6	601932	601937	50 %	50 %	0 %	0 %	442314276
13550	NC_020125	AAATC	2	10	601940	601949	60 %	20 %	0 %	20 %	442314276
13551	NC_020125	CCT	3	9	601961	601969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314276
13552	NC_020125	ATC	2	6	602023	602028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314276
13553	NC_020125	TTG	2	6	602155	602160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314276
13554	NC_020125	TCC	2	6	602224	602229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314276
13555	NC_020125	A	6	6	602233	602238	100 %	0 %	0 %	0 %	442314276
13556	NC_020125	GA	3	6	602260	602265	50 %	0 %	50 %	0 %	442314276
13557	NC_020125	CAT	2	6	602290	602295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314276
13558	NC_020125	GTA	2	6	602332	602337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314276
13559	NC_020125	T	6	6	602394	602399	0 %	100 %	0 %	0 %	442314276
13560	NC_020125	CTTC	2	8	602402	602409	0 %	50 %	0 %	50 %	442314276
13561	NC_020125	TGCATT	2	12	602413	602424	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	442314276
13562	NC_020125	ATA	2	6	602427	602432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314276
13563	NC_020125	ATG	2	6	602495	602500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314276
13564	NC_020125	TC	4	8	602654	602661	0 %	50 %	0 %	50 %	442314276
13565	NC_020125	TTTC	2	8	602667	602674	0 %	75 %	0 %	25 %	442314276
13566	NC_020125	ATTT	2	8	602749	602756	25 %	75 %	0 %	0 %	442314276
13567	NC_020125	AAGT	2	8	602817	602824	50 %	25 %	25 %	0 %	442314276
13568	NC_020125	AT	3	6	602847	602852	50 %	50 %	0 %	0 %	442314276
13569	NC_020125	TC	3	6	602961	602966	0 %	50 %	0 %	50 %	442314276
13570	NC_020125	GTAG	2	8	603039	603046	25 %	25 %	50 %	0 %	442314276
13571	NC_020125	TTA	2	6	603059	603064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314276
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13573	NC_020125	T	8	8	603350	603357	0 %	100 %	0 %	0 %	442314276
13574	NC_020125	ATTG	2	8	603391	603398	25 %	50 %	25 %	0 %	442314276
13575	NC_020125	AAT	3	9	603433	603441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314276
13576	NC_020125	ATA	3	9	603457	603465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314276
13577	NC_020125	TCTT	2	8	603499	603506	0 %	75 %	0 %	25 %	442314276
13578	NC_020125	T	7	7	603505	603511	0 %	100 %	0 %	0 %	442314276
13579	NC_020125	ATT	2	6	603512	603517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314276
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13581	NC_020125	TG	3	6	603560	603565	0 %	50 %	50 %	0 %	442314276
13582	NC_020125	TA	3	6	603651	603656	50 %	50 %	0 %	0 %	442314276
13583	NC_020125	TTA	2	6	603749	603754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314276
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13587	NC_020125	ATTTT	2	10	603969	603978	20 %	80 %	0 %	0 %	442314276
13588	NC_020125	TA	3	6	603993	603998	50 %	50 %	0 %	0 %	442314276
13589	NC_020125	CTT	2	6	604008	604013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314276
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13593	NC_020125	T	6	6	604237	604242	0 %	100 %	0 %	0 %	442314277
13594	NC_020125	AGA	2	6	604255	604260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314277
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13596	NC_020125	TAG	2	6	604334	604339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314277
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13598	NC_020125	T	6	6	604395	604400	0 %	100 %	0 %	0 %	442314277
13599	NC_020125	TTCT	2	8	604433	604440	0 %	75 %	0 %	25 %	442314277
13600	NC_020125	AAT	2	6	604448	604453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314277
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13603	NC_020125	TGTT	2	8	604639	604646	0 %	75 %	25 %	0 %	442314277
13604	NC_020125	CTG	2	6	604715	604720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314277
13605	NC_020125	TTG	2	6	604851	604856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314277
13606	NC_020125	T	6	6	604953	604958	0 %	100 %	0 %	0 %	442314277
13607	NC_020125	TCT	2	6	604971	604976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314277
13608	NC_020125	CTA	2	6	605027	605032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314277
13609	NC_020125	TTC	2	6	605039	605044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314277
13610	NC_020125	CCT	2	6	605059	605064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314277
13611	NC_020125	CTG	2	6	605204	605209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314277
13612	NC_020125	CAT	2	6	605406	605411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314277
13613	NC_020125	ATT	2	6	605643	605648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314277
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13615	NC_020125	TAG	2	6	605765	605770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314277
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13617	NC_020125	AATC	2	8	605882	605889	50 %	25 %	0 %	25 %	442314277
13618	NC_020125	T	7	7	605925	605931	0 %	100 %	0 %	0 %	442314277
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13621	NC_020125	T	7	7	606042	606048	0 %	100 %	0 %	0 %	442314277
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13863	NC_020125	A	7	7	618392	618398	100 %	0 %	0 %	0 %	442314287
13864	NC_020125	T	7	7	618406	618412	0 %	100 %	0 %	0 %	442314287
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13866	NC_020125	A	7	7	618519	618525	100 %	0 %	0 %	0 %	442314287
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13992	NC_020125	AATGTA	2	12	624483	624494	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	442314293
13993	NC_020125	GCT	2	6	624549	624554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314293
13994	NC_020125	AAGT	2	8	624673	624680	50 %	25 %	25 %	0 %	442314293
13995	NC_020125	A	6	6	624694	624699	100 %	0 %	0 %	0 %	442314293
13996	NC_020125	GGT	2	6	624746	624751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314293
13997	NC_020125	TCA	2	6	624759	624764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314293
13998	NC_020125	CAAT	2	8	624925	624932	50 %	25 %	0 %	25 %	442314293
13999	NC_020125	GGT	2	6	625032	625037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314293
14000	NC_020125	GTGA	2	8	625038	625045	25 %	25 %	50 %	0 %	442314293

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