MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020125	T	7	7	553438	553444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_020125	ATAG	2	8	553464	553471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_020125	AGC	2	6	553527	553532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314234
12504	NC_020125	GTA	2	6	553543	553548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314234
12505	NC_020125	CA	4	8	553633	553640	50 %	0 %	0 %	50 %	442314234
12506	NC_020125	TGT	2	6	553661	553666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314234
12507	NC_020125	T	6	6	553666	553671	0 %	100 %	0 %	0 %	442314234
12508	NC_020125	TGG	2	6	553772	553777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314234
12509	NC_020125	CTG	2	6	553778	553783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314234
12510	NC_020125	TGA	2	6	553787	553792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314234
12511	NC_020125	TTA	2	6	553844	553849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314234
12512	NC_020125	TTG	2	6	553876	553881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314234
12513	NC_020125	AAT	2	6	553926	553931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_020125	A	6	6	553946	553951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_020125	AAT	2	6	553954	553959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_020125	AAAT	2	8	553986	553993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_020125	AGT	2	6	554021	554026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314235
12518	NC_020125	TGG	2	6	554041	554046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314235
12519	NC_020125	GAA	2	6	554070	554075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314235
12520	NC_020125	A	6	6	554129	554134	100 %	0 %	0 %	0 %	442314235
12521	NC_020125	AGCAA	2	10	554186	554195	60 %	0 %	20 %	20 %	442314235
12522	NC_020125	GGT	2	6	554220	554225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314235
12523	NC_020125	CTT	2	6	554230	554235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314235
12524	NC_020125	TGG	2	6	554275	554280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314235
12525	NC_020125	CTA	2	6	554308	554313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314235
12526	NC_020125	A	6	6	554313	554318	100 %	0 %	0 %	0 %	442314235
12527	NC_020125	AAAT	2	8	554332	554339	75 %	25 %	0 %	0 %	442314235
12528	NC_020125	ATT	2	6	554367	554372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314235
12529	NC_020125	TAAAA	2	10	554435	554444	80 %	20 %	0 %	0 %	442314235
12530	NC_020125	GTA	2	6	554451	554456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314235
12531	NC_020125	GGC	2	6	554489	554494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442314235
12532	NC_020125	ATG	2	6	554509	554514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314235
12533	NC_020125	TGA	2	6	554612	554617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314235
12534	NC_020125	AGA	2	6	554630	554635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314235
12535	NC_020125	AGA	2	6	554771	554776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314235
12536	NC_020125	GTG	2	6	554803	554808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314235
12537	NC_020125	GAT	2	6	554871	554876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314235
12538	NC_020125	AAG	2	6	554894	554899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314235
12539	NC_020125	CTG	2	6	554927	554932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314235
12540	NC_020125	AGC	2	6	554960	554965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314235
12541	NC_020125	T	7	7	555056	555062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_020125	T	7	7	555072	555078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_020125	ATA	2	6	555086	555091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314236
12544	NC_020125	AAG	2	6	555222	555227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314236
12545	NC_020125	AG	3	6	555324	555329	50 %	0 %	50 %	0 %	442314236
12546	NC_020125	CCT	2	6	555384	555389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314236
12547	NC_020125	ACG	2	6	555404	555409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314236
12548	NC_020125	CAT	2	6	555428	555433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314236
12549	NC_020125	AGT	2	6	555467	555472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314236
12550	NC_020125	ACC	2	6	555512	555517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314236
12551	NC_020125	A	6	6	555560	555565	100 %	0 %	0 %	0 %	442314236
12552	NC_020125	CCA	2	6	555622	555627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314236
12553	NC_020125	TTGTCT	2	12	555663	555674	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	442314236
12554	NC_020125	A	7	7	555693	555699	100 %	0 %	0 %	0 %	442314236
12555	NC_020125	A	6	6	555704	555709	100 %	0 %	0 %	0 %	442314236
12556	NC_020125	ATC	2	6	555930	555935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314237
12557	NC_020125	TCC	2	6	555997	556002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314237
12558	NC_020125	AAT	2	6	556020	556025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314237
12559	NC_020125	CTGG	2	8	556034	556041	0 %	25 %	50 %	25 %	442314237
12560	NC_020125	GA	3	6	556134	556139	50 %	0 %	50 %	0 %	442314237
12561	NC_020125	AAAACA	2	12	556153	556164	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	442314237
12562	NC_020125	AAT	2	6	556171	556176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314237
12563	NC_020125	TCT	2	6	556188	556193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314238
12564	NC_020125	TAG	2	6	556195	556200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314238
12565	NC_020125	AGGA	2	8	556243	556250	50 %	0 %	50 %	0 %	442314238
12566	NC_020125	TCA	2	6	556275	556280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314238
12567	NC_020125	CTTG	2	8	556292	556299	0 %	50 %	25 %	25 %	442314238
12568	NC_020125	T	6	6	556329	556334	0 %	100 %	0 %	0 %	442314238
12569	NC_020125	AGG	2	6	556387	556392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314238
12570	NC_020125	TCA	2	6	556436	556441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314238
12571	NC_020125	CTTG	2	8	556554	556561	0 %	50 %	25 %	25 %	442314238
12572	NC_020125	CCTGTG	2	12	556592	556603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314238
12573	NC_020125	TTG	2	6	556675	556680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314238
12574	NC_020125	GAA	2	6	556693	556698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314238
12575	NC_020125	TAG	2	6	556760	556765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314238
12576	NC_020125	TTTGA	2	10	556828	556837	20 %	60 %	20 %	0 %	442314238
12577	NC_020125	GAG	2	6	556849	556854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314238
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12579	NC_020125	A	6	6	556981	556986	100 %	0 %	0 %	0 %	442314238
12580	NC_020125	T	6	6	557012	557017	0 %	100 %	0 %	0 %	442314238
12581	NC_020125	TTC	2	6	557149	557154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314238
12582	NC_020125	AGAA	2	8	557178	557185	75 %	0 %	25 %	0 %	442314238
12583	NC_020125	CCA	2	6	557258	557263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314238
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12585	NC_020125	GTT	2	6	557307	557312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314238
12586	NC_020125	ACC	2	6	557341	557346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314238
12587	NC_020125	GCTTCG	2	12	557411	557422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314238
12588	NC_020125	T	6	6	557440	557445	0 %	100 %	0 %	0 %	442314238
12589	NC_020125	GGT	2	6	557506	557511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314238
12590	NC_020125	ATG	2	6	557567	557572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314238
12591	NC_020125	A	6	6	557653	557658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_020125	AAC	2	6	557780	557785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314239
12593	NC_020125	GTT	2	6	557801	557806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314239
12594	NC_020125	GTG	2	6	557851	557856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314239
12595	NC_020125	GA	3	6	557863	557868	50 %	0 %	50 %	0 %	442314239
12596	NC_020125	TTG	2	6	557880	557885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314239
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12602	NC_020125	GAAAA	2	10	558280	558289	80 %	0 %	20 %	0 %	442314239
12603	NC_020125	GAA	2	6	558325	558330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314239
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12605	NC_020125	A	7	7	558373	558379	100 %	0 %	0 %	0 %	442314239
12606	NC_020125	ATT	2	6	558389	558394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314239
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12608	NC_020125	TCT	2	6	558460	558465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314239
12609	NC_020125	CAT	2	6	558495	558500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314239
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12611	NC_020125	ATC	2	6	558576	558581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314239
12612	NC_020125	ATG	2	6	558622	558627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314239
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12615	NC_020125	A	7	7	558701	558707	100 %	0 %	0 %	0 %	442314239
12616	NC_020125	TA	3	6	558741	558746	50 %	50 %	0 %	0 %	442314239
12617	NC_020125	GAC	2	6	558747	558752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314239
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12620	NC_020125	GTTC	2	8	558951	558958	0 %	50 %	25 %	25 %	442314239
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12999	NC_020125	AG	3	6	577147	577152	50 %	0 %	50 %	0 %	442314254
13000	NC_020125	TTA	2	6	577225	577230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314254

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