MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_020125	AG	3	6	531360	531365	50 %	0 %	50 %	0 %	442314214
12002	NC_020125	ATA	2	6	531376	531381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314214
12003	NC_020125	TGG	2	6	531453	531458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314214
12004	NC_020125	TC	3	6	531557	531562	0 %	50 %	0 %	50 %	442314214
12005	NC_020125	AAG	2	6	531648	531653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314214
12006	NC_020125	TAAC	2	8	531678	531685	50 %	25 %	0 %	25 %	442314214
12007	NC_020125	TCA	2	6	531686	531691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314214
12008	NC_020125	TTA	2	6	531692	531697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314214
12009	NC_020125	ACT	2	6	531701	531706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314214
12010	NC_020125	ATG	2	6	531781	531786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314214
12011	NC_020125	GCC	2	6	531857	531862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442314214
12012	NC_020125	TTA	2	6	531890	531895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314214
12013	NC_020125	A	6	6	531979	531984	100 %	0 %	0 %	0 %	442314214
12014	NC_020125	TA	3	6	531999	532004	50 %	50 %	0 %	0 %	442314214
12015	NC_020125	GCTCCT	2	12	532061	532072	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	442314214
12016	NC_020125	CT	3	6	532071	532076	0 %	50 %	0 %	50 %	442314214
12017	NC_020125	CAT	2	6	532086	532091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314214
12018	NC_020125	CTT	2	6	532104	532109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314214
12019	NC_020125	AT	5	10	532114	532123	50 %	50 %	0 %	0 %	442314214
12020	NC_020125	TAT	3	9	532206	532214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314214
12021	NC_020125	TAC	2	6	532263	532268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314214
12022	NC_020125	TC	3	6	532321	532326	0 %	50 %	0 %	50 %	442314214
12023	NC_020125	TCT	2	6	532352	532357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314214
12024	NC_020125	ATG	2	6	532371	532376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314214
12025	NC_020125	TACC	2	8	532434	532441	25 %	25 %	0 %	50 %	442314214
12026	NC_020125	A	6	6	532444	532449	100 %	0 %	0 %	0 %	442314214
12027	NC_020125	ATC	2	6	532468	532473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314214
12028	NC_020125	AT	3	6	532474	532479	50 %	50 %	0 %	0 %	442314214
12029	NC_020125	ATT	2	6	532543	532548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314214
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12032	NC_020125	TAG	2	6	532767	532772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314214
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12034	NC_020125	AT	3	6	532836	532841	50 %	50 %	0 %	0 %	442314214
12035	NC_020125	ATC	2	6	532855	532860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314214
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12038	NC_020125	TTTC	2	8	533100	533107	0 %	75 %	0 %	25 %	442314214
12039	NC_020125	ACT	4	12	533126	533137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314214
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12041	NC_020125	A	6	6	533217	533222	100 %	0 %	0 %	0 %	442314214
12042	NC_020125	TAA	2	6	533226	533231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314214
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12044	NC_020125	ACT	2	6	533280	533285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12045	NC_020125	TAT	2	6	533307	533312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_020125	T	7	7	533324	533330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_020125	TAA	2	6	533349	533354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_020125	A	6	6	533384	533389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12049	NC_020125	AAATA	2	10	533408	533417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12050	NC_020125	ATA	3	9	533415	533423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_020125	T	6	6	533428	533433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12052	NC_020125	ATA	2	6	533434	533439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_020125	T	6	6	533470	533475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_020125	TAAAA	2	10	533479	533488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12055	NC_020125	TAT	2	6	533489	533494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314215
12056	NC_020125	A	7	7	533514	533520	100 %	0 %	0 %	0 %	442314215
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12059	NC_020125	CGTTT	2	10	533816	533825	0 %	60 %	20 %	20 %	442314215
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12062	NC_020125	GAA	2	6	533925	533930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314215
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12070	NC_020125	ACC	2	6	534268	534273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314215
12071	NC_020125	A	7	7	534279	534285	100 %	0 %	0 %	0 %	442314215
12072	NC_020125	TGA	2	6	534320	534325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314215
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12075	NC_020125	TATTT	2	10	534526	534535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12079	NC_020125	GTAA	2	8	534628	534635	50 %	25 %	25 %	0 %	442314216
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12083	NC_020125	CAT	2	6	534725	534730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314216
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12089	NC_020125	TGC	2	6	535008	535013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314216
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12092	NC_020125	ATA	2	6	535048	535053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314216
12093	NC_020125	TTTTA	2	10	535054	535063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12094	NC_020125	ATTCC	2	10	535072	535081	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12095	NC_020125	T	6	6	535102	535107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12096	NC_020125	T	7	7	535110	535116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12097	NC_020125	ATTT	2	8	535122	535129	25 %	75 %	0 %	0 %	442314217
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12106	NC_020125	ATCTT	2	10	535584	535593	20 %	60 %	0 %	20 %	442314217
12107	NC_020125	TCC	2	6	535619	535624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314217
12108	NC_020125	TAA	2	6	535633	535638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314217
12109	NC_020125	CCT	3	9	535653	535661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314217
12110	NC_020125	ATA	2	6	535662	535667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314217
12111	NC_020125	AT	3	6	535687	535692	50 %	50 %	0 %	0 %	442314217
12112	NC_020125	CAA	2	6	535802	535807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314217
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12114	NC_020125	TCT	2	6	535947	535952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314217
12115	NC_020125	CGG	2	6	536005	536010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442314217
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12117	NC_020125	CCT	2	6	536023	536028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314217
12118	NC_020125	CTA	2	6	536032	536037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314217
12119	NC_020125	ACC	2	6	536154	536159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314217
12120	NC_020125	ACC	2	6	536162	536167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314217
12121	NC_020125	T	6	6	536331	536336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12122	NC_020125	TCTG	2	8	536360	536367	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12123	NC_020125	AAC	2	6	536410	536415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12124	NC_020125	TCA	2	6	536418	536423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12126	NC_020125	T	7	7	536433	536439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12127	NC_020125	AT	4	8	536442	536449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12129	NC_020125	TTG	2	6	536464	536469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12130	NC_020125	TGT	2	6	536472	536477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12131	NC_020125	TCA	2	6	536518	536523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12133	NC_020125	TACT	2	8	536590	536597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12134	NC_020125	TC	3	6	536668	536673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12136	NC_020125	ATTTG	2	10	536686	536695	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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12139	NC_020125	ATTT	2	8	536811	536818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12140	NC_020125	ATT	2	6	536846	536851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12142	NC_020125	ATA	2	6	536875	536880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12145	NC_020125	ATA	2	6	536953	536958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12146	NC_020125	T	6	6	536962	536967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12147	NC_020125	AAAAT	2	10	536989	536998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12148	NC_020125	T	6	6	537008	537013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12239	NC_020125	GAA	2	6	541981	541986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12240	NC_020125	ATATT	2	10	542002	542011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12241	NC_020125	T	8	8	542019	542026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12242	NC_020125	A	6	6	542036	542041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12243	NC_020125	A	6	6	542054	542059	100 %	0 %	0 %	0 %	442314221
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12248	NC_020125	GAG	2	6	542346	542351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314221
12249	NC_020125	ATC	3	9	542462	542470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314221
12250	NC_020125	GAT	2	6	542483	542488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314221
12251	NC_020125	AAT	2	6	542547	542552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314221
12252	NC_020125	AGG	2	6	542652	542657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314222
12253	NC_020125	GA	3	6	542714	542719	50 %	0 %	50 %	0 %	442314222
12254	NC_020125	AGG	2	6	542812	542817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314222
12255	NC_020125	TATG	2	8	542839	542846	25 %	50 %	25 %	0 %	442314222
12256	NC_020125	TG	3	6	542868	542873	0 %	50 %	50 %	0 %	442314222
12257	NC_020125	T	6	6	543026	543031	0 %	100 %	0 %	0 %	442314222
12258	NC_020125	TAT	2	6	543078	543083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314223
12259	NC_020125	ATC	2	6	543084	543089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314223
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12261	NC_020125	ATTTTC	2	12	543300	543311	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	442314223
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12265	NC_020125	TAT	2	6	543551	543556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314225
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12268	NC_020125	GTAA	2	8	543613	543620	50 %	25 %	25 %	0 %	442314225
12269	NC_020125	AG	3	6	543661	543666	50 %	0 %	50 %	0 %	442314225
12270	NC_020125	GAT	2	6	543775	543780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314225
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12272	NC_020125	GAAA	2	8	543900	543907	75 %	0 %	25 %	0 %	442314225
12273	NC_020125	A	6	6	543905	543910	100 %	0 %	0 %	0 %	442314225
12274	NC_020125	ATA	2	6	543925	543930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314225
12275	NC_020125	A	7	7	543973	543979	100 %	0 %	0 %	0 %	442314225
12276	NC_020125	TAT	2	6	544041	544046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12277	NC_020125	AG	3	6	544087	544092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12278	NC_020125	GAA	2	6	544100	544105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314226
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12282	NC_020125	AAC	2	6	544172	544177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314226
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12287	NC_020125	AAG	2	6	544311	544316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314226
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12307	NC_020125	AT	3	6	545115	545120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12320	NC_020125	TAA	2	6	545599	545604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12321	NC_020125	GAA	2	6	545635	545640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12322	NC_020125	T	6	6	545649	545654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12323	NC_020125	T	6	6	545665	545670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12363	NC_020125	CCGC	2	8	547249	547256	0 %	0 %	25 %	75 %	442314229
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12366	NC_020125	A	6	6	547357	547362	100 %	0 %	0 %	0 %	442314229
12367	NC_020125	TCA	2	6	547405	547410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314229
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12493	NC_020125	AGAAA	2	10	552834	552843	80 %	0 %	20 %	0 %	442314233
12494	NC_020125	TTCTA	2	10	552858	552867	20 %	60 %	0 %	20 %	442314233
12495	NC_020125	TA	3	6	552927	552932	50 %	50 %	0 %	0 %	442314233
12496	NC_020125	TAAA	2	8	552994	553001	75 %	25 %	0 %	0 %	442314233
12497	NC_020125	GAA	2	6	553038	553043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314233
12498	NC_020125	TAT	3	9	553188	553196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314233
12499	NC_020125	CTT	2	6	553220	553225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314233
12500	NC_020125	ACT	2	6	553399	553404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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