MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020125	TGTAA	2	10	508806	508815	40 %	40 %	20 %	0 %	442314196
11502	NC_020125	TAA	2	6	508817	508822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314196
11503	NC_020125	TTA	2	6	508833	508838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314196
11504	NC_020125	A	6	6	508877	508882	100 %	0 %	0 %	0 %	442314196
11505	NC_020125	TC	3	6	508884	508889	0 %	50 %	0 %	50 %	442314196
11506	NC_020125	TTA	2	6	508911	508916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314196
11507	NC_020125	TGT	2	6	508979	508984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314196
11508	NC_020125	AT	4	8	509029	509036	50 %	50 %	0 %	0 %	442314196
11509	NC_020125	TTTAG	2	10	509037	509046	20 %	60 %	20 %	0 %	442314196
11510	NC_020125	TCT	2	6	509062	509067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314197
11511	NC_020125	T	6	6	509104	509109	0 %	100 %	0 %	0 %	442314197
11512	NC_020125	TAC	2	6	509151	509156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314197
11513	NC_020125	CCT	2	6	509182	509187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314197
11514	NC_020125	T	6	6	509347	509352	0 %	100 %	0 %	0 %	442314197
11515	NC_020125	CTGCA	2	10	509355	509364	20 %	20 %	20 %	40 %	442314197
11516	NC_020125	CTA	2	6	509369	509374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314197
11517	NC_020125	ATT	2	6	509436	509441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314197
11518	NC_020125	GAA	2	6	509516	509521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314197
11519	NC_020125	ATA	2	6	509543	509548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314197
11520	NC_020125	CTAC	2	8	509602	509609	25 %	25 %	0 %	50 %	442314197
11521	NC_020125	CTG	2	6	509666	509671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314197
11522	NC_020125	ACT	2	6	509700	509705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314197
11523	NC_020125	ATA	2	6	509851	509856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314197
11524	NC_020125	AT	3	6	510028	510033	50 %	50 %	0 %	0 %	442314197
11525	NC_020125	CTTA	2	8	510084	510091	25 %	50 %	0 %	25 %	442314197
11526	NC_020125	TCC	2	6	510174	510179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314197
11527	NC_020125	TGG	2	6	510204	510209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314197
11528	NC_020125	CCT	2	6	510232	510237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314197
11529	NC_020125	TTC	2	6	510261	510266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314197
11530	NC_020125	TTAA	2	8	510313	510320	50 %	50 %	0 %	0 %	442314197
11531	NC_020125	ATG	2	6	510374	510379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314197
11532	NC_020125	TTCT	2	8	510443	510450	0 %	75 %	0 %	25 %	442314197
11533	NC_020125	ATT	2	6	510531	510536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314197
11534	NC_020125	T	6	6	510588	510593	0 %	100 %	0 %	0 %	442314197
11535	NC_020125	TCT	2	6	510683	510688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314197
11536	NC_020125	TTCT	3	12	510685	510696	0 %	75 %	0 %	25 %	442314197
11537	NC_020125	ATT	2	6	510705	510710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314197
11538	NC_020125	AATA	2	8	510843	510850	75 %	25 %	0 %	0 %	442314197
11539	NC_020125	CTT	2	6	510905	510910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314197
11540	NC_020125	GTG	2	6	510923	510928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314197
11541	NC_020125	TTC	2	6	510939	510944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314197
11542	NC_020125	AAC	2	6	510969	510974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314197
11543	NC_020125	CAT	2	6	510980	510985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314197
11544	NC_020125	CTA	2	6	510986	510991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314197
11545	NC_020125	AGG	2	6	511049	511054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314197
11546	NC_020125	AAC	2	6	511140	511145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314197
11547	NC_020125	CTA	2	6	511151	511156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314197
11548	NC_020125	CAT	2	6	511220	511225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314197
11549	NC_020125	TTC	2	6	511272	511277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314197
11550	NC_020125	AGAGT	2	10	511366	511375	40 %	20 %	40 %	0 %	442314197
11551	NC_020125	TCA	2	6	511603	511608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314197
11552	NC_020125	CGCAT	2	10	511654	511663	20 %	20 %	20 %	40 %	442314197
11553	NC_020125	CT	3	6	511665	511670	0 %	50 %	0 %	50 %	442314197
11554	NC_020125	CTT	2	6	511708	511713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314197
11555	NC_020125	TCA	2	6	511774	511779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314197
11556	NC_020125	ACAT	2	8	511792	511799	50 %	25 %	0 %	25 %	442314197
11557	NC_020125	TTC	2	6	511812	511817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314197
11558	NC_020125	TC	3	6	511816	511821	0 %	50 %	0 %	50 %	442314197
11559	NC_020125	ACC	2	6	511843	511848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314197
11560	NC_020125	AGG	2	6	511851	511856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314197
11561	NC_020125	GAA	2	6	511873	511878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314197
11562	NC_020125	CAG	2	6	511898	511903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314197
11563	NC_020125	ACT	2	6	511933	511938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314197
11564	NC_020125	CAT	2	6	511955	511960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314197
11565	NC_020125	ATT	2	6	512049	512054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314197
11566	NC_020125	ATA	2	6	512135	512140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314197
11567	NC_020125	TAA	2	6	512156	512161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_020125	ACA	2	6	512283	512288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314198
11569	NC_020125	TAA	2	6	512318	512323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314198
11570	NC_020125	CAC	2	6	512354	512359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314198
11571	NC_020125	ACA	2	6	512424	512429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314198
11572	NC_020125	AAT	2	6	512474	512479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314198
11573	NC_020125	ATT	2	6	512588	512593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314198
11574	NC_020125	TGC	2	6	512667	512672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314198
11575	NC_020125	TC	3	6	512678	512683	0 %	50 %	0 %	50 %	442314198
11576	NC_020125	TAT	2	6	512749	512754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314198
11577	NC_020125	CTT	2	6	512779	512784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314198
11578	NC_020125	ATA	2	6	512820	512825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314198
11579	NC_020125	TTTAGC	2	12	512903	512914	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	442314198
11580	NC_020125	ATT	2	6	512942	512947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314198
11581	NC_020125	ATTCT	2	10	512974	512983	20 %	60 %	0 %	20 %	442314198
11582	NC_020125	ATT	2	6	513039	513044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314198
11583	NC_020125	A	6	6	513102	513107	100 %	0 %	0 %	0 %	442314198
11584	NC_020125	CCCTT	2	10	513108	513117	0 %	40 %	0 %	60 %	442314198
11585	NC_020125	T	7	7	513135	513141	0 %	100 %	0 %	0 %	442314198
11586	NC_020125	AT	3	6	513172	513177	50 %	50 %	0 %	0 %	442314198
11587	NC_020125	T	6	6	513227	513232	0 %	100 %	0 %	0 %	442314198
11588	NC_020125	TCT	2	6	513240	513245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314198
11589	NC_020125	ATT	2	6	513270	513275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314198
11590	NC_020125	TTA	2	6	513322	513327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_020125	TCA	2	6	513342	513347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_020125	TTTG	2	8	513352	513359	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_020125	GGGT	2	8	513369	513376	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_020125	AATA	2	8	513387	513394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_020125	AAT	2	6	513406	513411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_020125	A	6	6	513421	513426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_020125	CAAAT	2	10	513427	513436	60 %	20 %	0 %	20 %	442314199
11598	NC_020125	A	6	6	513481	513486	100 %	0 %	0 %	0 %	442314199
11599	NC_020125	AG	3	6	513523	513528	50 %	0 %	50 %	0 %	442314199
11600	NC_020125	AG	3	6	513533	513538	50 %	0 %	50 %	0 %	442314199
11601	NC_020125	A	6	6	513547	513552	100 %	0 %	0 %	0 %	442314199
11602	NC_020125	ATCT	2	8	513593	513600	25 %	50 %	0 %	25 %	442314199
11603	NC_020125	AAG	2	6	513607	513612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314199
11604	NC_020125	T	6	6	513665	513670	0 %	100 %	0 %	0 %	442314199
11605	NC_020125	TGT	2	6	513686	513691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314199
11606	NC_020125	ACCT	2	8	513692	513699	25 %	25 %	0 %	50 %	442314199
11607	NC_020125	AAG	2	6	513742	513747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314199
11608	NC_020125	ACT	2	6	513765	513770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314199
11609	NC_020125	TTA	2	6	513826	513831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_020125	TAA	2	6	513881	513886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_020125	CTA	2	6	513973	513978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314200
11612	NC_020125	CTT	2	6	513988	513993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314200
11613	NC_020125	GCT	2	6	514032	514037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314200
11614	NC_020125	TTC	2	6	514052	514057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314200
11615	NC_020125	CTG	2	6	514063	514068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314200
11616	NC_020125	AAT	2	6	514199	514204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314200
11617	NC_020125	CT	4	8	514387	514394	0 %	50 %	0 %	50 %	442314200
11618	NC_020125	CA	3	6	514420	514425	50 %	0 %	0 %	50 %	442314200
11619	NC_020125	TCT	2	6	514446	514451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314200
11620	NC_020125	CAG	2	6	514489	514494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314200
11621	NC_020125	ATAA	2	8	514499	514506	75 %	25 %	0 %	0 %	442314200
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11623	NC_020125	TGATA	2	10	514549	514558	40 %	40 %	20 %	0 %	442314200
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11991	NC_020125	ATAG	2	8	530953	530960	50 %	25 %	25 %	0 %	442314214
11992	NC_020125	CCA	2	6	530967	530972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314214
11993	NC_020125	CTA	2	6	530988	530993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314214
11994	NC_020125	TAA	2	6	531078	531083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314214
11995	NC_020125	CTA	2	6	531143	531148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314214
11996	NC_020125	AGA	2	6	531157	531162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314214
11997	NC_020125	CT	3	6	531201	531206	0 %	50 %	0 %	50 %	442314214
11998	NC_020125	AGC	2	6	531259	531264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314214
11999	NC_020125	TCA	2	6	531315	531320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314214
12000	NC_020125	ATT	2	6	531340	531345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314214

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