MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10003	NC_020125	TTG	2	6	439135	439140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314127
10004	NC_020125	AAG	2	6	439170	439175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_020125	T	6	6	439176	439181	0 %	100 %	0 %	0 %	442314128
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10011	NC_020125	ACTT	2	8	439366	439373	25 %	50 %	0 %	25 %	442314128
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10017	NC_020125	A	6	6	439618	439623	100 %	0 %	0 %	0 %	442314128
10018	NC_020125	TA	3	6	439629	439634	50 %	50 %	0 %	0 %	442314128
10019	NC_020125	GTA	2	6	439681	439686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314128
10020	NC_020125	A	7	7	439803	439809	100 %	0 %	0 %	0 %	442314128
10021	NC_020125	TTAA	2	8	439838	439845	50 %	50 %	0 %	0 %	442314128
10022	NC_020125	A	6	6	439988	439993	100 %	0 %	0 %	0 %	442314128
10023	NC_020125	ATC	2	6	440020	440025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314128
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10094	NC_020125	GCCA	2	8	443433	443440	25 %	0 %	25 %	50 %	442314131
10095	NC_020125	A	6	6	443459	443464	100 %	0 %	0 %	0 %	442314131
10096	NC_020125	AT	3	6	443505	443510	50 %	50 %	0 %	0 %	442314131
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10103	NC_020125	TA	3	6	443923	443928	50 %	50 %	0 %	0 %	442314131
10104	NC_020125	AGAGT	2	10	443930	443939	40 %	20 %	40 %	0 %	442314131
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10111	NC_020125	ATTTA	2	10	444255	444264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_020125	A	7	7	444271	444277	100 %	0 %	0 %	0 %	442314132
10113	NC_020125	A	7	7	444324	444330	100 %	0 %	0 %	0 %	442314132
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10123	NC_020125	AG	3	6	444918	444923	50 %	0 %	50 %	0 %	442314133
10124	NC_020125	AAG	2	6	444970	444975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314133
10125	NC_020125	AT	3	6	444989	444994	50 %	50 %	0 %	0 %	442314133
10126	NC_020125	TAAAA	2	10	445004	445013	80 %	20 %	0 %	0 %	442314133
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10140	NC_020125	AGT	2	6	445754	445759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314133
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10163	NC_020125	T	6	6	447008	447013	0 %	100 %	0 %	0 %	442314134
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10168	NC_020125	TAA	2	6	447397	447402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10234	NC_020125	A	7	7	450570	450576	100 %	0 %	0 %	0 %	442314137
10235	NC_020125	ATG	2	6	450594	450599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314137
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10240	NC_020125	GACC	2	8	450930	450937	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10241	NC_020125	TAT	2	6	450981	450986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10242	NC_020125	A	6	6	450993	450998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10243	NC_020125	CCA	2	6	451016	451021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314138
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10245	NC_020125	TCT	2	6	451094	451099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314138
10246	NC_020125	CCT	2	6	451106	451111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314138
10247	NC_020125	TC	3	6	451130	451135	0 %	50 %	0 %	50 %	442314138
10248	NC_020125	T	6	6	451149	451154	0 %	100 %	0 %	0 %	442314138
10249	NC_020125	GCC	2	6	451163	451168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442314138
10250	NC_020125	CAC	2	6	451315	451320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314138
10251	NC_020125	ACC	2	6	451342	451347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314138
10252	NC_020125	TCA	2	6	451356	451361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314138
10253	NC_020125	GGTTA	2	10	451381	451390	20 %	40 %	40 %	0 %	442314138
10254	NC_020125	TCT	2	6	451430	451435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314138
10255	NC_020125	ATT	2	6	451477	451482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314138
10256	NC_020125	CTT	2	6	451518	451523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314138
10257	NC_020125	TTA	2	6	451589	451594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314138
10258	NC_020125	TAA	2	6	451735	451740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314138
10259	NC_020125	AT	3	6	451745	451750	50 %	50 %	0 %	0 %	442314138
10260	NC_020125	ATTTT	2	10	451754	451763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10261	NC_020125	T	6	6	451760	451765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_020125	TAT	2	6	451803	451808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314139
10263	NC_020125	TAC	2	6	451872	451877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314139
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10265	NC_020125	TAC	2	6	451999	452004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314139
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10267	NC_020125	AGTTT	2	10	452033	452042	20 %	60 %	20 %	0 %	442314139
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10299	NC_020125	TTA	2	6	453326	453331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10300	NC_020125	A	6	6	453331	453336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10301	NC_020125	CAAT	2	8	453396	453403	50 %	25 %	0 %	25 %	442314141
10302	NC_020125	TGGA	3	12	453418	453429	25 %	25 %	50 %	0 %	442314141
10303	NC_020125	AAATA	2	10	453577	453586	80 %	20 %	0 %	0 %	442314141
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10310	NC_020125	CAG	2	6	453795	453800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314141
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10322	NC_020125	AATAA	2	10	454652	454661	80 %	20 %	0 %	0 %	442314142
10323	NC_020125	AC	3	6	454662	454667	50 %	0 %	0 %	50 %	442314142
10324	NC_020125	TAA	2	6	454702	454707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314142
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10332	NC_020125	TTA	2	6	455010	455015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314142
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10336	NC_020125	TAC	2	6	455200	455205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314142
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10338	NC_020125	TCC	2	6	455256	455261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314142
10339	NC_020125	GGT	2	6	455441	455446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314142
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10344	NC_020125	GCAT	2	8	455709	455716	25 %	25 %	25 %	25 %	442314142
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10348	NC_020125	TAT	2	6	455951	455956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314142
10349	NC_020125	ATG	2	6	455987	455992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314142
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10351	NC_020125	GTAG	2	8	456230	456237	25 %	25 %	50 %	0 %	442314142
10352	NC_020125	ATG	3	9	456251	456259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314142
10353	NC_020125	CGA	2	6	456292	456297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314142
10354	NC_020125	AGA	2	6	456328	456333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314142
10355	NC_020125	CTT	2	6	456451	456456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314143
10356	NC_020125	CATTT	2	10	456502	456511	20 %	60 %	0 %	20 %	442314143
10357	NC_020125	CATA	2	8	456564	456571	50 %	25 %	0 %	25 %	442314143
10358	NC_020125	T	7	7	456622	456628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10359	NC_020125	ATGA	2	8	456629	456636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10360	NC_020125	T	6	6	456637	456642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10361	NC_020125	TTA	2	6	456648	456653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10362	NC_020125	ATAA	2	8	456657	456664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10363	NC_020125	ACT	2	6	456665	456670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10364	NC_020125	A	6	6	456679	456684	100 %	0 %	0 %	0 %	442314144
10365	NC_020125	TAA	2	6	456707	456712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314144
10366	NC_020125	ATC	2	6	456730	456735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314144
10367	NC_020125	ATTT	2	8	456739	456746	25 %	75 %	0 %	0 %	442314144
10368	NC_020125	CAT	2	6	456801	456806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314144
10369	NC_020125	ATCT	2	8	456841	456848	25 %	50 %	0 %	25 %	442314144
10370	NC_020125	ATTG	2	8	456849	456856	25 %	50 %	25 %	0 %	442314144
10371	NC_020125	GTA	2	6	456862	456867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314144
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10442	NC_020125	T	6	6	459655	459660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10491	NC_020125	T	6	6	462248	462253	0 %	100 %	0 %	0 %	442314148
10492	NC_020125	GGCAAG	2	12	462263	462274	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	442314148
10493	NC_020125	ACA	2	6	462346	462351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314148
10494	NC_020125	T	6	6	462466	462471	0 %	100 %	0 %	0 %	442314148
10495	NC_020125	ATT	2	6	462630	462635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314148
10496	NC_020125	TCA	3	9	462648	462656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314148
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10499	NC_020125	A	6	6	462721	462726	100 %	0 %	0 %	0 %	442314148
10500	NC_020125	TA	3	6	462822	462827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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