MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_020125	T	7	7	312432	312438	0 %	100 %	0 %	0 %	442314006
7003	NC_020125	ATC	2	6	312554	312559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314006
7004	NC_020125	ATTTA	2	10	312599	312608	40 %	60 %	0 %	0 %	442314006
7005	NC_020125	TCT	2	6	312609	312614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314006
7006	NC_020125	AAT	2	6	312679	312684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_020125	ATC	2	6	312707	312712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_020125	CCT	2	6	312809	312814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314007
7009	NC_020125	CCT	3	9	312854	312862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314007
7010	NC_020125	TTG	2	6	312882	312887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314007
7011	NC_020125	CTTAT	2	10	312902	312911	20 %	60 %	0 %	20 %	442314007
7012	NC_020125	TGA	2	6	312921	312926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314007
7013	NC_020125	A	6	6	312952	312957	100 %	0 %	0 %	0 %	442314007
7014	NC_020125	ATA	2	6	312970	312975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314007
7015	NC_020125	AAT	2	6	313100	313105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314007
7016	NC_020125	CCA	2	6	313121	313126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314007
7017	NC_020125	CAC	2	6	313134	313139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314007
7018	NC_020125	TAA	2	6	313246	313251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314007
7019	NC_020125	ATA	2	6	313259	313264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314007
7020	NC_020125	ATTTA	2	10	313273	313282	40 %	60 %	0 %	0 %	442314007
7021	NC_020125	TAT	2	6	313357	313362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_020125	ATAATT	2	12	313381	313392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_020125	ATC	2	6	313398	313403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_020125	AGT	2	6	313412	313417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314008
7025	NC_020125	CGG	2	6	313430	313435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442314008
7026	NC_020125	AGC	2	6	313451	313456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314008
7027	NC_020125	GCA	2	6	313466	313471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314008
7028	NC_020125	TTAT	2	8	313494	313501	25 %	75 %	0 %	0 %	442314008
7029	NC_020125	AGA	2	6	313532	313537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314008
7030	NC_020125	CTA	2	6	313572	313577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314008
7031	NC_020125	GAA	2	6	313659	313664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314008
7032	NC_020125	GAA	2	6	313675	313680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314008
7033	NC_020125	CTTT	2	8	313743	313750	0 %	75 %	0 %	25 %	442314008
7034	NC_020125	CAC	2	6	313793	313798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314008
7035	NC_020125	AGA	2	6	313799	313804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314008
7036	NC_020125	ACC	2	6	313818	313823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314008
7037	NC_020125	ATC	2	6	313825	313830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314008
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7039	NC_020125	A	6	6	313983	313988	100 %	0 %	0 %	0 %	442314008
7040	NC_020125	CAA	2	6	314040	314045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314008
7041	NC_020125	AAGG	2	8	314058	314065	50 %	0 %	50 %	0 %	442314008
7042	NC_020125	ATC	2	6	314101	314106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314008
7043	NC_020125	GAA	2	6	314136	314141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314008
7044	NC_020125	A	7	7	314157	314163	100 %	0 %	0 %	0 %	442314008
7045	NC_020125	TGG	2	6	314252	314257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314008
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7050	NC_020125	A	7	7	314618	314624	100 %	0 %	0 %	0 %	442314009
7051	NC_020125	GGA	2	6	314811	314816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314009
7052	NC_020125	TGA	2	6	314862	314867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314009
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7054	NC_020125	GGT	2	6	315064	315069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314009
7055	NC_020125	ACCG	2	8	315106	315113	25 %	0 %	25 %	50 %	442314009
7056	NC_020125	TAG	2	6	315221	315226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314009
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7058	NC_020125	AGT	2	6	315330	315335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314009
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7060	NC_020125	TGG	2	6	315401	315406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314009
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7062	NC_020125	TAT	2	6	315549	315554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314009
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7069	NC_020125	CATA	2	8	315756	315763	50 %	25 %	0 %	25 %	442314009
7070	NC_020125	TAT	2	6	315799	315804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314009
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7073	NC_020125	ATA	2	6	315828	315833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314009
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7076	NC_020125	TAT	2	6	316118	316123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314010
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7081	NC_020125	T	7	7	316333	316339	0 %	100 %	0 %	0 %	442314010
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7094	NC_020125	CCCT	2	8	316565	316572	0 %	25 %	0 %	75 %	442314010
7095	NC_020125	CTT	2	6	316637	316642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314010
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7097	NC_020125	TTTA	2	8	316776	316783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_020125	TTTGAA	2	12	316832	316843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	442314011
7099	NC_020125	ATA	2	6	316884	316889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314011
7100	NC_020125	AGT	2	6	316933	316938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314011
7101	NC_020125	TAC	2	6	316945	316950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314011
7102	NC_020125	A	7	7	316991	316997	100 %	0 %	0 %	0 %	442314011
7103	NC_020125	TGC	2	6	317001	317006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314011
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7105	NC_020125	GTAA	2	8	317052	317059	50 %	25 %	25 %	0 %	442314011
7106	NC_020125	CCTAT	2	10	317097	317106	20 %	40 %	0 %	40 %	442314011
7107	NC_020125	TTA	2	6	317235	317240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314011
7108	NC_020125	AT	3	6	317260	317265	50 %	50 %	0 %	0 %	442314011
7109	NC_020125	ATTT	2	8	317276	317283	25 %	75 %	0 %	0 %	442314011
7110	NC_020125	CT	3	6	317360	317365	0 %	50 %	0 %	50 %	442314011
7111	NC_020125	A	6	6	317599	317604	100 %	0 %	0 %	0 %	442314011
7112	NC_020125	GTT	2	6	317684	317689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314011
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7117	NC_020125	GTG	2	6	317849	317854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314011
7118	NC_020125	T	7	7	317944	317950	0 %	100 %	0 %	0 %	442314011
7119	NC_020125	T	8	8	318064	318071	0 %	100 %	0 %	0 %	442314011
7120	NC_020125	TTG	2	6	318152	318157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314011
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7122	NC_020125	T	7	7	318201	318207	0 %	100 %	0 %	0 %	442314011
7123	NC_020125	T	7	7	318284	318290	0 %	100 %	0 %	0 %	442314011
7124	NC_020125	GTA	2	6	318309	318314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314011
7125	NC_020125	A	6	6	318321	318326	100 %	0 %	0 %	0 %	442314011
7126	NC_020125	T	6	6	318329	318334	0 %	100 %	0 %	0 %	442314011
7127	NC_020125	A	8	8	318379	318386	100 %	0 %	0 %	0 %	442314011
7128	NC_020125	TA	3	6	318475	318480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7130	NC_020125	TA	3	6	318495	318500	50 %	50 %	0 %	0 %	442314012
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7133	NC_020125	A	8	8	318544	318551	100 %	0 %	0 %	0 %	442314012
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7154	NC_020125	A	6	6	319417	319422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7234	NC_020125	ATAG	2	8	323151	323158	50 %	25 %	25 %	0 %	442314014
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7238	NC_020125	CAGG	2	8	323398	323405	25 %	0 %	50 %	25 %	442314014
7239	NC_020125	GATTA	2	10	323453	323462	40 %	40 %	20 %	0 %	442314014
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7242	NC_020125	CAA	2	6	323624	323629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314014
7243	NC_020125	CAAA	2	8	323683	323690	75 %	0 %	0 %	25 %	442314014
7244	NC_020125	AAC	2	6	323726	323731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314014
7245	NC_020125	TGT	2	6	323834	323839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314014
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7247	NC_020125	ATTC	2	8	323851	323858	25 %	50 %	0 %	25 %	442314014
7248	NC_020125	CTTA	2	8	323868	323875	25 %	50 %	0 %	25 %	442314014
7249	NC_020125	AGG	2	6	323900	323905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314014
7250	NC_020125	TAT	2	6	323961	323966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314014
7251	NC_020125	AGA	2	6	323981	323986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314014
7252	NC_020125	TAT	2	6	324023	324028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314014
7253	NC_020125	CTTATC	2	12	324040	324051	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	442314014
7254	NC_020125	AATT	2	8	324074	324081	50 %	50 %	0 %	0 %	442314014
7255	NC_020125	AGAGC	2	10	324153	324162	40 %	0 %	40 %	20 %	442314014
7256	NC_020125	TAA	2	6	324176	324181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314014
7257	NC_020125	GA	3	6	324237	324242	50 %	0 %	50 %	0 %	442314014
7258	NC_020125	ATG	2	6	324307	324312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314014
7259	NC_020125	GGT	2	6	324342	324347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314014
7260	NC_020125	TTTG	2	8	324375	324382	0 %	75 %	25 %	0 %	442314014
7261	NC_020125	CCAA	2	8	324396	324403	50 %	0 %	0 %	50 %	442314014
7262	NC_020125	TAT	2	6	324495	324500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314014
7263	NC_020125	A	6	6	324506	324511	100 %	0 %	0 %	0 %	442314014
7264	NC_020125	GAT	2	6	324585	324590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314014
7265	NC_020125	TACT	2	8	324650	324657	25 %	50 %	0 %	25 %	442314014
7266	NC_020125	TCT	2	6	324666	324671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314014
7267	NC_020125	TAGA	2	8	324760	324767	50 %	25 %	25 %	0 %	442314014
7268	NC_020125	CAATA	2	10	324795	324804	60 %	20 %	0 %	20 %	442314014
7269	NC_020125	ATG	2	6	324820	324825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314014
7270	NC_020125	CTA	2	6	324871	324876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314014
7271	NC_020125	TCT	2	6	324951	324956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314014
7272	NC_020125	CTATA	2	10	325076	325085	40 %	40 %	0 %	20 %	442314014
7273	NC_020125	ACT	2	6	325092	325097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314014
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7276	NC_020125	TAC	3	9	325140	325148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314014
7277	NC_020125	ATG	2	6	325153	325158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314014
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7279	NC_020125	TGT	2	6	325247	325252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314014
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7281	NC_020125	AAG	2	6	325412	325417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314014
7282	NC_020125	AG	3	6	325575	325580	50 %	0 %	50 %	0 %	442314014
7283	NC_020125	TCT	2	6	325596	325601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314014
7284	NC_020125	TAC	2	6	325628	325633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314014
7285	NC_020125	AAAG	2	8	325693	325700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7286	NC_020125	TTTTA	2	10	325722	325731	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7287	NC_020125	TAT	2	6	325739	325744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7288	NC_020125	ATC	2	6	325809	325814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314015
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7291	NC_020125	A	6	6	325922	325927	100 %	0 %	0 %	0 %	442314015
7292	NC_020125	TTC	2	6	325985	325990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314015
7293	NC_020125	TGA	2	6	326098	326103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314015
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7297	NC_020125	A	6	6	326266	326271	100 %	0 %	0 %	0 %	442314015
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7307	NC_020125	TTG	2	6	326816	326821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314015
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7309	NC_020125	CTG	2	6	326858	326863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314015
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7325	NC_020125	TTTA	2	8	327644	327651	25 %	75 %	0 %	0 %	442314015
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7333	NC_020125	T	6	6	327895	327900	0 %	100 %	0 %	0 %	442314015
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7350	NC_020125	CTA	2	6	328652	328657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7362	NC_020125	ATT	2	6	329261	329266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314017
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7365	NC_020125	TA	3	6	329427	329432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7366	NC_020125	TAT	2	6	329521	329526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7367	NC_020125	ATG	2	6	329532	329537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7368	NC_020125	TCT	2	6	329556	329561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7369	NC_020125	AAT	2	6	329655	329660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7370	NC_020125	A	8	8	329662	329669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7371	NC_020125	ATGG	2	8	329694	329701	25 %	25 %	50 %	0 %	442314018
7372	NC_020125	ATC	2	6	329735	329740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314018
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