MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 48383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020125	ATT	2	6	199422	199427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313903
4502	NC_020125	CGAAA	2	10	199507	199516	60 %	0 %	20 %	20 %	442313903
4503	NC_020125	T	6	6	199530	199535	0 %	100 %	0 %	0 %	442313903
4504	NC_020125	GTAA	2	8	199593	199600	50 %	25 %	25 %	0 %	442313903
4505	NC_020125	TCT	2	6	199607	199612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313903
4506	NC_020125	TTCTT	2	10	199701	199710	0 %	80 %	0 %	20 %	442313903
4507	NC_020125	T	7	7	199737	199743	0 %	100 %	0 %	0 %	442313903
4508	NC_020125	CT	3	6	199745	199750	0 %	50 %	0 %	50 %	442313903
4509	NC_020125	TTA	2	6	199755	199760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313903
4510	NC_020125	CTTT	2	8	199771	199778	0 %	75 %	0 %	25 %	442313903
4511	NC_020125	TCC	2	6	199807	199812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_020125	ACGA	2	8	199979	199986	50 %	0 %	25 %	25 %	442313904
4513	NC_020125	AAT	2	6	200065	200070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313904
4514	NC_020125	CAA	2	6	200076	200081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313904
4515	NC_020125	TTA	2	6	200131	200136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313904
4516	NC_020125	GTC	2	6	200182	200187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313904
4517	NC_020125	ATT	2	6	200292	200297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313904
4518	NC_020125	CAAG	2	8	200352	200359	50 %	0 %	25 %	25 %	442313904
4519	NC_020125	ATG	2	6	200567	200572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313904
4520	NC_020125	GAA	2	6	200577	200582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313904
4521	NC_020125	GGA	2	6	200586	200591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313904
4522	NC_020125	AGAA	2	8	200596	200603	75 %	0 %	25 %	0 %	442313904
4523	NC_020125	CCG	2	6	200615	200620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313904
4524	NC_020125	AGGC	2	8	200657	200664	25 %	0 %	50 %	25 %	442313904
4525	NC_020125	A	6	6	200891	200896	100 %	0 %	0 %	0 %	442313904
4526	NC_020125	GAG	2	6	200957	200962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313905
4527	NC_020125	ATA	2	6	200976	200981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313905
4528	NC_020125	AT	3	6	200994	200999	50 %	50 %	0 %	0 %	442313905
4529	NC_020125	ATT	2	6	201020	201025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313905
4530	NC_020125	CAG	2	6	201096	201101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313905
4531	NC_020125	GAA	2	6	201106	201111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313905
4532	NC_020125	ACGG	2	8	201116	201123	25 %	0 %	50 %	25 %	442313905
4533	NC_020125	TA	3	6	201132	201137	50 %	50 %	0 %	0 %	442313905
4534	NC_020125	GAA	2	6	201248	201253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313905
4535	NC_020125	ATA	2	6	201300	201305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313905
4536	NC_020125	A	6	6	201319	201324	100 %	0 %	0 %	0 %	442313905
4537	NC_020125	GAA	3	9	201548	201556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313905
4538	NC_020125	ATA	2	6	201666	201671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313905
4539	NC_020125	TCT	2	6	201690	201695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313905
4540	NC_020125	GA	5	10	201743	201752	50 %	0 %	50 %	0 %	442313905
4541	NC_020125	TAT	2	6	201764	201769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313905
4542	NC_020125	GGA	2	6	201800	201805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313905
4543	NC_020125	AACCAA	2	12	201867	201878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_020125	TAA	2	6	201917	201922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_020125	ACC	2	6	201977	201982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313906
4546	NC_020125	GA	3	6	202006	202011	50 %	0 %	50 %	0 %	442313906
4547	NC_020125	ATT	2	6	202046	202051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313906
4548	NC_020125	AAGGC	2	10	202161	202170	40 %	0 %	40 %	20 %	442313906
4549	NC_020125	TCA	2	6	202189	202194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313906
4550	NC_020125	GA	3	6	202219	202224	50 %	0 %	50 %	0 %	442313906
4551	NC_020125	AAG	2	6	202409	202414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313907
4552	NC_020125	GCTT	2	8	202460	202467	0 %	50 %	25 %	25 %	442313907
4553	NC_020125	TAT	2	6	202493	202498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313907
4554	NC_020125	GAAA	2	8	202570	202577	75 %	0 %	25 %	0 %	442313907
4555	NC_020125	AAAC	2	8	202623	202630	75 %	0 %	0 %	25 %	442313907
4556	NC_020125	TAA	2	6	202652	202657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313907
4557	NC_020125	CAA	2	6	202680	202685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313907
4558	NC_020125	ATC	2	6	202715	202720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313908
4559	NC_020125	GT	3	6	202746	202751	0 %	50 %	50 %	0 %	442313908
4560	NC_020125	CAA	2	6	202793	202798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313908
4561	NC_020125	ACT	2	6	202845	202850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313908
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4563	NC_020125	AGCA	2	8	202950	202957	50 %	0 %	25 %	25 %	442313908
4564	NC_020125	AAGT	2	8	202986	202993	50 %	25 %	25 %	0 %	442313908
4565	NC_020125	TAT	2	6	203096	203101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313908
4566	NC_020125	AT	3	6	203202	203207	50 %	50 %	0 %	0 %	442313908
4567	NC_020125	TGA	2	6	203212	203217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313908
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4569	NC_020125	TAC	2	6	203328	203333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313908
4570	NC_020125	ACC	2	6	203336	203341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313908
4571	NC_020125	TAA	2	6	203373	203378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313908
4572	NC_020125	A	7	7	203385	203391	100 %	0 %	0 %	0 %	442313908
4573	NC_020125	CAG	2	6	203452	203457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313909
4574	NC_020125	GAA	2	6	203493	203498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313909
4575	NC_020125	A	6	6	203574	203579	100 %	0 %	0 %	0 %	442313909
4576	NC_020125	ATA	2	6	203722	203727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313909
4577	NC_020125	AGCG	2	8	203738	203745	25 %	0 %	50 %	25 %	442313909
4578	NC_020125	ATA	2	6	203806	203811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313909
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4580	NC_020125	GAAA	2	8	203884	203891	75 %	0 %	25 %	0 %	442313909
4581	NC_020125	CTC	2	6	203893	203898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313909
4582	NC_020125	AGA	2	6	203933	203938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313909
4583	NC_020125	A	6	6	203957	203962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_020125	TAA	2	6	203974	203979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_020125	ACA	2	6	204041	204046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313910
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4588	NC_020125	AGTA	2	8	204196	204203	50 %	25 %	25 %	0 %	442313910
4589	NC_020125	TAT	2	6	204252	204257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313910
4590	NC_020125	TTAA	2	8	204329	204336	50 %	50 %	0 %	0 %	442313910
4591	NC_020125	A	6	6	204383	204388	100 %	0 %	0 %	0 %	442313910
4592	NC_020125	AGC	2	6	204477	204482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313911
4593	NC_020125	TAT	2	6	204488	204493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313911
4594	NC_020125	T	7	7	204528	204534	0 %	100 %	0 %	0 %	442313911
4595	NC_020125	T	6	6	204615	204620	0 %	100 %	0 %	0 %	442313911
4596	NC_020125	AGA	2	6	204642	204647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313911
4597	NC_020125	ATA	2	6	204709	204714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313911
4598	NC_020125	AAACG	2	10	204729	204738	60 %	0 %	20 %	20 %	442313911
4599	NC_020125	A	6	6	204780	204785	100 %	0 %	0 %	0 %	442313911
4600	NC_020125	TAA	2	6	204928	204933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313911
4601	NC_020125	TTG	2	6	204971	204976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_020125	A	6	6	204996	205001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_020125	ATG	2	6	205035	205040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313912
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4605	NC_020125	A	6	6	205091	205096	100 %	0 %	0 %	0 %	442313912
4606	NC_020125	GAA	2	6	205128	205133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313912
4607	NC_020125	AAT	2	6	205190	205195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313913
4608	NC_020125	GAA	2	6	205208	205213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313913
4609	NC_020125	CAA	2	6	205454	205459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313913
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4611	NC_020125	ATA	2	6	205497	205502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313913
4612	NC_020125	ATTG	2	8	205510	205517	25 %	50 %	25 %	0 %	442313913
4613	NC_020125	CCAA	2	8	205539	205546	50 %	0 %	0 %	50 %	442313913
4614	NC_020125	ATT	2	6	205567	205572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313913
4615	NC_020125	ACG	2	6	205659	205664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313913
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4617	NC_020125	TCAA	2	8	205902	205909	50 %	25 %	0 %	25 %	442313913
4618	NC_020125	AG	3	6	205915	205920	50 %	0 %	50 %	0 %	442313913
4619	NC_020125	A	6	6	205937	205942	100 %	0 %	0 %	0 %	442313913
4620	NC_020125	A	6	6	205945	205950	100 %	0 %	0 %	0 %	442313913
4621	NC_020125	TGA	2	6	205969	205974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313913
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4623	NC_020125	GA	3	6	206104	206109	50 %	0 %	50 %	0 %	442313913
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4625	NC_020125	CTG	2	6	206211	206216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313913
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4643	NC_020125	AGA	2	6	206867	206872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313913
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4705	NC_020125	TCAA	2	8	210129	210136	50 %	25 %	0 %	25 %	442313914
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4721	NC_020125	TTTGG	2	10	210925	210934	0 %	60 %	40 %	0 %	442313915
4722	NC_020125	GAAA	2	8	210973	210980	75 %	0 %	25 %	0 %	442313915
4723	NC_020125	A	6	6	210978	210983	100 %	0 %	0 %	0 %	442313915
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4733	NC_020125	GCT	2	6	211573	211578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313915
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4739	NC_020125	GAA	2	6	211909	211914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313915
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4741	NC_020125	A	6	6	211958	211963	100 %	0 %	0 %	0 %	442313915
4742	NC_020125	ACACA	2	10	212070	212079	60 %	0 %	0 %	40 %	442313915
4743	NC_020125	ACG	2	6	212146	212151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313915
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4745	NC_020125	A	6	6	212234	212239	100 %	0 %	0 %	0 %	442313915
4746	NC_020125	TATTT	2	10	212261	212270	20 %	80 %	0 %	0 %	442313915
4747	NC_020125	T	6	6	212268	212273	0 %	100 %	0 %	0 %	442313915
4748	NC_020125	TGGC	2	8	212276	212283	0 %	25 %	50 %	25 %	442313915
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4989	NC_020125	GCA	2	6	223221	223226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313924
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4996	NC_020125	ATG	3	9	223528	223536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313925
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