MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_020062	GAT	2	6	1978678	1978683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224777
42503	NC_020062	GGGC	2	8	1978734	1978741	0 %	0 %	75 %	25 %	440224777
42504	NC_020062	CAT	2	6	1978816	1978821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224777
42505	NC_020062	AGC	2	6	1978842	1978847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224777
42506	NC_020062	GCA	2	6	1978948	1978953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224777
42507	NC_020062	CTCG	2	8	1978987	1978994	0 %	25 %	25 %	50 %	440224777
42508	NC_020062	GC	3	6	1979001	1979006	0 %	0 %	50 %	50 %	440224777
42509	NC_020062	GAT	2	6	1979008	1979013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224777
42510	NC_020062	GAC	2	6	1979042	1979047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224777
42511	NC_020062	CCGTG	2	10	1979083	1979092	0 %	20 %	40 %	40 %	440224777
42512	NC_020062	CGC	2	6	1979093	1979098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224777
42513	NC_020062	GAG	2	6	1979105	1979110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224777
42514	NC_020062	ACG	2	6	1979128	1979133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224777
42515	NC_020062	TTC	2	6	1979138	1979143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224777
42516	NC_020062	CGAC	2	8	1979226	1979233	25 %	0 %	25 %	50 %	440224777
42517	NC_020062	CCA	2	6	1979241	1979246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224777
42518	NC_020062	CCT	2	6	1979250	1979255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224777
42519	NC_020062	GACC	2	8	1979320	1979327	25 %	0 %	25 %	50 %	440224777
42520	NC_020062	GGT	2	6	1979404	1979409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224777
42521	NC_020062	TCG	2	6	1979436	1979441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224777
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42524	NC_020062	GAC	2	6	1979549	1979554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224777
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42531	NC_020062	GCCG	2	8	1979795	1979802	0 %	0 %	50 %	50 %	440224777
42532	NC_020062	TCG	2	6	1979820	1979825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224777
42533	NC_020062	TCC	2	6	1979830	1979835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224777
42534	NC_020062	CGT	2	6	1980007	1980012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224777
42535	NC_020062	ATC	2	6	1980062	1980067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224778
42536	NC_020062	CGC	2	6	1980116	1980121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224778
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42538	NC_020062	CGC	2	6	1980165	1980170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224778
42539	NC_020062	GTC	2	6	1980251	1980256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224778
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42542	NC_020062	GAT	2	6	1980412	1980417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224778
42543	NC_020062	TCGCT	2	10	1980441	1980450	0 %	40 %	20 %	40 %	440224778
42544	NC_020062	TTCG	2	8	1980473	1980480	0 %	50 %	25 %	25 %	440224778
42545	NC_020062	CTG	2	6	1980488	1980493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224778
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42549	NC_020062	CCG	2	6	1980581	1980586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224778
42550	NC_020062	GCC	2	6	1980622	1980627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42551	NC_020062	CGA	2	6	1980701	1980706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224779
42552	NC_020062	CTC	2	6	1980788	1980793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224779
42553	NC_020062	CAG	2	6	1980929	1980934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224779
42554	NC_020062	CGT	2	6	1980937	1980942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224779
42555	NC_020062	CATC	2	8	1980987	1980994	25 %	25 %	0 %	50 %	440224780
42556	NC_020062	GCA	2	6	1981018	1981023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224780
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42558	NC_020062	GGAC	2	8	1981142	1981149	25 %	0 %	50 %	25 %	440224780
42559	NC_020062	AAG	2	6	1981157	1981162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224780
42560	NC_020062	TC	3	6	1981222	1981227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42561	NC_020062	CGGCA	2	10	1981228	1981237	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42562	NC_020062	GAT	2	6	1981266	1981271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42563	NC_020062	GCA	2	6	1981324	1981329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42564	NC_020062	TGA	2	6	1981330	1981335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224781
42565	NC_020062	ACG	2	6	1981351	1981356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224781
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42574	NC_020062	CGA	2	6	1981673	1981678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224781
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42584	NC_020062	CGA	2	6	1982126	1982131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224781
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42587	NC_020062	GCG	3	9	1982313	1982321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224781
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42590	NC_020062	CGA	2	6	1982402	1982407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224781
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42592	NC_020062	GGACG	2	10	1982530	1982539	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
42593	NC_020062	TCA	2	6	1982621	1982626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224782
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42596	NC_020062	GTC	2	6	1982682	1982687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224782
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42599	NC_020062	TCG	2	6	1982917	1982922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224782
42600	NC_020062	GC	3	6	1982938	1982943	0 %	0 %	50 %	50 %	440224782
42601	NC_020062	CAGG	2	8	1982944	1982951	25 %	0 %	50 %	25 %	440224782
42602	NC_020062	AGAT	2	8	1982965	1982972	50 %	25 %	25 %	0 %	440224782
42603	NC_020062	CGA	2	6	1983014	1983019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224782
42604	NC_020062	GGC	2	6	1983020	1983025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224782
42605	NC_020062	GAT	2	6	1983092	1983097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224782
42606	NC_020062	AG	3	6	1983231	1983236	50 %	0 %	50 %	0 %	440224782
42607	NC_020062	CG	3	6	1983242	1983247	0 %	0 %	50 %	50 %	440224782
42608	NC_020062	GCC	2	6	1983263	1983268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224782
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42610	NC_020062	CTT	2	6	1983320	1983325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224782
42611	NC_020062	CGC	2	6	1983328	1983333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224782
42612	NC_020062	CCGA	2	8	1983360	1983367	25 %	0 %	25 %	50 %	440224782
42613	NC_020062	CGC	2	6	1983397	1983402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224782
42614	NC_020062	CGTGC	2	10	1983465	1983474	0 %	20 %	40 %	40 %	440224782
42615	NC_020062	CTG	2	6	1983626	1983631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
42616	NC_020062	CTG	2	6	1983635	1983640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
42617	NC_020062	TGC	3	9	1983651	1983659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
42618	NC_020062	CAT	2	6	1983673	1983678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224783
42619	NC_020062	GCC	2	6	1983692	1983697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224783
42620	NC_020062	TCG	2	6	1983741	1983746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
42621	NC_020062	GC	3	6	1983788	1983793	0 %	0 %	50 %	50 %	440224783
42622	NC_020062	TGT	2	6	1983840	1983845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224783
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42624	NC_020062	GC	5	10	1983902	1983911	0 %	0 %	50 %	50 %	440224783
42625	NC_020062	GCA	2	6	1983926	1983931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224783
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42628	NC_020062	TCG	2	6	1984035	1984040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
42629	NC_020062	CGG	2	6	1984051	1984056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224783
42630	NC_020062	GTA	2	6	1984095	1984100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224783
42631	NC_020062	TCA	2	6	1984107	1984112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224783
42632	NC_020062	CTG	2	6	1984238	1984243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
42633	NC_020062	TGG	2	6	1984314	1984319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224783
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42639	NC_020062	CTG	2	6	1984441	1984446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
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42642	NC_020062	GCC	2	6	1984556	1984561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224783
42643	NC_020062	CGCCT	2	10	1984569	1984578	0 %	20 %	20 %	60 %	440224783
42644	NC_020062	TG	3	6	1984616	1984621	0 %	50 %	50 %	0 %	440224783
42645	NC_020062	TGCTC	2	10	1984639	1984648	0 %	40 %	20 %	40 %	440224783
42646	NC_020062	TCA	2	6	1984686	1984691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224783
42647	NC_020062	GGCTGG	2	12	1984755	1984766	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	440224783
42648	NC_020062	GCCGGC	2	12	1984787	1984798	0 %	0 %	50 %	50 %	440224783
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42651	NC_020062	TC	3	6	1984897	1984902	0 %	50 %	0 %	50 %	440224783
42652	NC_020062	CTG	2	6	1984949	1984954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
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42655	NC_020062	ACC	2	6	1985191	1985196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224784
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42660	NC_020062	GGCGCC	2	12	1985389	1985400	0 %	0 %	50 %	50 %	440224784
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42664	NC_020062	GAA	2	6	1985601	1985606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224784
42665	NC_020062	GTCC	2	8	1985623	1985630	0 %	25 %	25 %	50 %	440224784
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42668	NC_020062	ATC	2	6	1985765	1985770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224784
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42679	NC_020062	GCC	2	6	1986064	1986069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224784
42680	NC_020062	CGG	2	6	1986109	1986114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224784
42681	NC_020062	CAG	2	6	1986115	1986120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224784
42682	NC_020062	GA	3	6	1986137	1986142	50 %	0 %	50 %	0 %	440224784
42683	NC_020062	GAT	2	6	1986172	1986177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224784
42684	NC_020062	GCACGA	2	12	1986186	1986197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224784
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42692	NC_020062	CCG	2	6	1986465	1986470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224784
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42700	NC_020062	CGT	2	6	1986784	1986789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224784
42701	NC_020062	GCC	2	6	1986799	1986804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224784
42702	NC_020062	GAGAA	2	10	1986809	1986818	60 %	0 %	40 %	0 %	440224784
42703	NC_020062	GCG	2	6	1986822	1986827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224784
42704	NC_020062	GC	3	6	1986867	1986872	0 %	0 %	50 %	50 %	440224784
42705	NC_020062	CGG	2	6	1986894	1986899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224784
42706	NC_020062	GTCA	2	8	1986919	1986926	25 %	25 %	25 %	25 %	440224784
42707	NC_020062	TC	3	6	1986959	1986964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42708	NC_020062	GC	3	6	1987033	1987038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42709	NC_020062	ATGC	2	8	1987049	1987056	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42710	NC_020062	GCC	2	6	1987247	1987252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224785
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42712	NC_020062	TTCT	2	8	1987444	1987451	0 %	75 %	0 %	25 %	440224785
42713	NC_020062	GCG	2	6	1987493	1987498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224785
42714	NC_020062	GGCA	2	8	1987553	1987560	25 %	0 %	50 %	25 %	440224785
42715	NC_020062	CCG	2	6	1987670	1987675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224785
42716	NC_020062	GGC	2	6	1987751	1987756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224785
42717	NC_020062	CGGCCT	2	12	1987759	1987770	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440224785
42718	NC_020062	AT	3	6	1987790	1987795	50 %	50 %	0 %	0 %	440224785
42719	NC_020062	ATC	2	6	1987800	1987805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224785
42720	NC_020062	CCGC	2	8	1987846	1987853	0 %	0 %	25 %	75 %	440224785
42721	NC_020062	TGG	2	6	1987972	1987977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224785
42722	NC_020062	CGGT	2	8	1987993	1988000	0 %	25 %	50 %	25 %	440224785
42723	NC_020062	ACG	2	6	1988041	1988046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224785
42724	NC_020062	GCCG	2	8	1988115	1988122	0 %	0 %	50 %	50 %	440224785
42725	NC_020062	ACT	2	6	1988143	1988148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224785
42726	NC_020062	ACA	2	6	1988152	1988157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224785
42727	NC_020062	CGA	2	6	1988189	1988194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224785
42728	NC_020062	GC	3	6	1988228	1988233	0 %	0 %	50 %	50 %	440224785
42729	NC_020062	TCC	3	9	1988256	1988264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224785
42730	NC_020062	CCGA	2	8	1988301	1988308	25 %	0 %	25 %	50 %	440224785
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42732	NC_020062	GTG	2	6	1988529	1988534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224785
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42836	NC_020062	CA	3	6	1993694	1993699	50 %	0 %	0 %	50 %	440224791
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42843	NC_020062	CCCT	2	8	1994003	1994010	0 %	25 %	0 %	75 %	440224791
42844	NC_020062	CATG	2	8	1994019	1994026	25 %	25 %	25 %	25 %	440224791
42845	NC_020062	GCC	2	6	1994035	1994040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224791
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42962	NC_020062	CTT	2	6	1999025	1999030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224796
42963	NC_020062	CGA	2	6	1999054	1999059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224796
42964	NC_020062	CAT	2	6	1999070	1999075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224796
42965	NC_020062	CTT	2	6	1999103	1999108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224796
42966	NC_020062	GGA	2	6	1999127	1999132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224796
42967	NC_020062	GGGC	2	8	1999162	1999169	0 %	0 %	75 %	25 %	440224796
42968	NC_020062	GC	3	6	1999254	1999259	0 %	0 %	50 %	50 %	440224796
42969	NC_020062	A	6	6	1999267	1999272	100 %	0 %	0 %	0 %	440224796
42970	NC_020062	AGC	2	6	1999322	1999327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224796
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42972	NC_020062	ATGC	2	8	1999382	1999389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42973	NC_020062	CCG	2	6	1999392	1999397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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42975	NC_020062	GGC	2	6	1999487	1999492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224797
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42977	NC_020062	GC	4	8	1999557	1999564	0 %	0 %	50 %	50 %	440224797
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42980	NC_020062	GCCG	2	8	1999670	1999677	0 %	0 %	50 %	50 %	440224797
42981	NC_020062	GTC	2	6	1999697	1999702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224797
42982	NC_020062	GCCG	2	8	1999709	1999716	0 %	0 %	50 %	50 %	440224797
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42990	NC_020062	TCT	2	6	2000221	2000226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224797
42991	NC_020062	AGC	2	6	2000232	2000237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224797
42992	NC_020062	GCC	4	12	2000240	2000251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224797
42993	NC_020062	CGGCG	2	10	2000290	2000299	0 %	0 %	60 %	40 %	440224797
42994	NC_020062	CTC	2	6	2000369	2000374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224797
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42997	NC_020062	CTT	2	6	2000513	2000518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224797
42998	NC_020062	GCC	2	6	2000528	2000533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224797
42999	NC_020062	ATC	2	6	2000612	2000617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224797
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