MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_020062	GCGG	2	8	1956376	1956383	0 %	0 %	75 %	25 %	440224759
42003	NC_020062	ATG	2	6	1956582	1956587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224759
42004	NC_020062	GAC	2	6	1956622	1956627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224759
42005	NC_020062	GGCCC	2	10	1956660	1956669	0 %	0 %	40 %	60 %	440224759
42006	NC_020062	GAA	2	6	1956670	1956675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224759
42007	NC_020062	CAC	2	6	1956688	1956693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224759
42008	NC_020062	GCATCG	2	12	1956774	1956785	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440224759
42009	NC_020062	GATG	2	8	1956799	1956806	25 %	25 %	50 %	0 %	440224759
42010	NC_020062	ATCGC	2	10	1956816	1956825	20 %	20 %	20 %	40 %	440224759
42011	NC_020062	GCA	2	6	1956865	1956870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224759
42012	NC_020062	GTG	2	6	1956895	1956900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224759
42013	NC_020062	CTT	2	6	1956926	1956931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224759
42014	NC_020062	GC	4	8	1956956	1956963	0 %	0 %	50 %	50 %	440224759
42015	NC_020062	TCGA	2	8	1956986	1956993	25 %	25 %	25 %	25 %	440224759
42016	NC_020062	GCCTTG	2	12	1957056	1957067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224759
42017	NC_020062	GAGC	2	8	1957087	1957094	25 %	0 %	50 %	25 %	440224759
42018	NC_020062	GGA	2	6	1957109	1957114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42019	NC_020062	AAC	2	6	1957138	1957143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224760
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42021	NC_020062	GTCG	2	8	1957185	1957192	0 %	25 %	50 %	25 %	440224760
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42040	NC_020062	GAG	2	6	1958180	1958185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224760
42041	NC_020062	TG	3	6	1958200	1958205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42042	NC_020062	CGCA	2	8	1958210	1958217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42043	NC_020062	GCC	2	6	1958258	1958263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42044	NC_020062	GCC	2	6	1958333	1958338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42045	NC_020062	AT	3	6	1958348	1958353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42046	NC_020062	TGC	2	6	1958403	1958408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42049	NC_020062	GAC	2	6	1958571	1958576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42058	NC_020062	CG	3	6	1958902	1958907	0 %	0 %	50 %	50 %	440224761
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42105	NC_020062	AT	3	6	1960953	1960958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42106	NC_020062	CAG	2	6	1961077	1961082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224764
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42112	NC_020062	TCAGC	2	10	1961315	1961324	20 %	20 %	20 %	40 %	440224764
42113	NC_020062	CGCT	2	8	1961329	1961336	0 %	25 %	25 %	50 %	440224764
42114	NC_020062	TGC	2	6	1961402	1961407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224764
42115	NC_020062	GA	3	6	1961540	1961545	50 %	0 %	50 %	0 %	440224764
42116	NC_020062	CCG	2	6	1961598	1961603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224764
42117	NC_020062	CCGGG	2	10	1961609	1961618	0 %	0 %	60 %	40 %	440224764
42118	NC_020062	CAT	2	6	1961631	1961636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224764
42119	NC_020062	AGC	2	6	1961637	1961642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224764
42120	NC_020062	TTGCC	2	10	1961643	1961652	0 %	40 %	20 %	40 %	440224764
42121	NC_020062	GTT	2	6	1961691	1961696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224764
42122	NC_020062	CGC	2	6	1961715	1961720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224764
42123	NC_020062	CAT	2	6	1961736	1961741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224764
42124	NC_020062	GATC	2	8	1961747	1961754	25 %	25 %	25 %	25 %	440224764
42125	NC_020062	GTG	2	6	1961852	1961857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224764
42126	NC_020062	AAT	2	6	1961906	1961911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224764
42127	NC_020062	GACC	2	8	1961951	1961958	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42128	NC_020062	TCC	2	6	1962027	1962032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224765
42129	NC_020062	G	6	6	1962069	1962074	0 %	0 %	100 %	0 %	440224765
42130	NC_020062	GCC	3	9	1962099	1962107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224765
42131	NC_020062	GCA	2	6	1962125	1962130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224765
42132	NC_020062	GCC	2	6	1962133	1962138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224765
42133	NC_020062	CGA	2	6	1962149	1962154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224765
42134	NC_020062	CTT	3	9	1962177	1962185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224765
42135	NC_020062	CTT	2	6	1962237	1962242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224765
42136	NC_020062	GAGC	2	8	1962254	1962261	25 %	0 %	50 %	25 %	440224765
42137	NC_020062	GGCA	2	8	1962268	1962275	25 %	0 %	50 %	25 %	440224765
42138	NC_020062	ATC	2	6	1962289	1962294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224765
42139	NC_020062	GCCGAG	2	12	1962312	1962323	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440224765
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42141	NC_020062	GCCA	2	8	1962425	1962432	25 %	0 %	25 %	50 %	440224765
42142	NC_020062	TG	3	6	1962443	1962448	0 %	50 %	50 %	0 %	440224765
42143	NC_020062	TTG	2	6	1962463	1962468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224765
42144	NC_020062	CGT	2	6	1962503	1962508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224765
42145	NC_020062	GCC	2	6	1962580	1962585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224765
42146	NC_020062	CCG	2	6	1962595	1962600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224765
42147	NC_020062	CCG	2	6	1962628	1962633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224765
42148	NC_020062	GAC	2	6	1962648	1962653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224765
42149	NC_020062	TTC	2	6	1962685	1962690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224765
42150	NC_020062	GTTT	2	8	1962699	1962706	0 %	75 %	25 %	0 %	440224765
42151	NC_020062	CT	3	6	1962712	1962717	0 %	50 %	0 %	50 %	440224765
42152	NC_020062	ACG	2	6	1962753	1962758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42153	NC_020062	ACG	2	6	1962785	1962790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224766
42154	NC_020062	CTCC	2	8	1962807	1962814	0 %	25 %	0 %	75 %	440224766
42155	NC_020062	CGGT	2	8	1962818	1962825	0 %	25 %	50 %	25 %	440224766
42156	NC_020062	CGCTGG	2	12	1962930	1962941	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440224766
42157	NC_020062	TTG	3	9	1963025	1963033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224766
42158	NC_020062	T	6	6	1963067	1963072	0 %	100 %	0 %	0 %	440224766
42159	NC_020062	GCG	2	6	1963092	1963097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224766
42160	NC_020062	TC	3	6	1963118	1963123	0 %	50 %	0 %	50 %	440224766
42161	NC_020062	AGCG	2	8	1963124	1963131	25 %	0 %	50 %	25 %	440224766
42162	NC_020062	GCA	2	6	1963245	1963250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224766
42163	NC_020062	GC	3	6	1963334	1963339	0 %	0 %	50 %	50 %	440224766
42164	NC_020062	CGCC	2	8	1963341	1963348	0 %	0 %	25 %	75 %	440224766
42165	NC_020062	TGAGC	2	10	1963464	1963473	20 %	20 %	40 %	20 %	440224766
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42168	NC_020062	GAC	2	6	1963558	1963563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224766
42169	NC_020062	AGGA	2	8	1963577	1963584	50 %	0 %	50 %	0 %	440224766
42170	NC_020062	GCGG	2	8	1963589	1963596	0 %	0 %	75 %	25 %	440224766
42171	NC_020062	CGG	2	6	1963623	1963628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224766
42172	NC_020062	GGC	2	6	1963652	1963657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224766
42173	NC_020062	ATA	2	6	1963669	1963674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224766
42174	NC_020062	GCG	2	6	1963691	1963696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224766
42175	NC_020062	GCT	2	6	1963708	1963713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224766
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42178	NC_020062	GAC	3	9	1963906	1963914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224766
42179	NC_020062	GC	3	6	1963918	1963923	0 %	0 %	50 %	50 %	440224766
42180	NC_020062	ACA	2	6	1963950	1963955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224766
42181	NC_020062	GCGCA	2	10	1963984	1963993	20 %	0 %	40 %	40 %	440224766
42182	NC_020062	CCAG	2	8	1964058	1964065	25 %	0 %	25 %	50 %	440224766
42183	NC_020062	GCGCA	2	10	1964122	1964131	20 %	0 %	40 %	40 %	440224766
42184	NC_020062	GCC	2	6	1964158	1964163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224766
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42186	NC_020062	CCAGA	2	10	1964188	1964197	40 %	0 %	20 %	40 %	440224766
42187	NC_020062	TCG	2	6	1964216	1964221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224766
42188	NC_020062	GA	4	8	1964246	1964253	50 %	0 %	50 %	0 %	440224766
42189	NC_020062	CGGC	2	8	1964259	1964266	0 %	0 %	50 %	50 %	440224766
42190	NC_020062	GCG	2	6	1964334	1964339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224766
42191	NC_020062	TCG	2	6	1964351	1964356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224766
42192	NC_020062	ACGGTG	2	12	1964489	1964500	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440224766
42193	NC_020062	GCC	2	6	1964506	1964511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224766
42194	NC_020062	GATC	2	8	1964517	1964524	25 %	25 %	25 %	25 %	440224766
42195	NC_020062	CG	3	6	1964558	1964563	0 %	0 %	50 %	50 %	440224766
42196	NC_020062	TGC	2	6	1964597	1964602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224766
42197	NC_020062	GCC	2	6	1964647	1964652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224766
42198	NC_020062	CGC	2	6	1964689	1964694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224766
42199	NC_020062	CCAC	2	8	1964724	1964731	25 %	0 %	0 %	75 %	440224766
42200	NC_020062	CTG	2	6	1964827	1964832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224766
42201	NC_020062	GCT	2	6	1964839	1964844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224766
42202	NC_020062	CGA	2	6	1964856	1964861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224766
42203	NC_020062	TGA	2	6	1964871	1964876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224766
42204	NC_020062	GTG	2	6	1964939	1964944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224766
42205	NC_020062	ACG	2	6	1964945	1964950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224766
42206	NC_020062	TCC	2	6	1964969	1964974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224766
42207	NC_020062	ATA	2	6	1965043	1965048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224766
42208	NC_020062	CCCG	2	8	1965302	1965309	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42209	NC_020062	TA	3	6	1965333	1965338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42210	NC_020062	TCA	2	6	1965454	1965459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224767
42211	NC_020062	CGA	2	6	1965466	1965471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224767
42212	NC_020062	GCC	2	6	1965479	1965484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224767
42213	NC_020062	TCG	2	6	1965517	1965522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224767
42214	NC_020062	CGC	2	6	1965583	1965588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224767
42215	NC_020062	ATG	2	6	1965691	1965696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224767
42216	NC_020062	CTCA	2	8	1965704	1965711	25 %	25 %	0 %	50 %	440224767
42217	NC_020062	CG	3	6	1965733	1965738	0 %	0 %	50 %	50 %	440224767
42218	NC_020062	GGCG	2	8	1965746	1965753	0 %	0 %	75 %	25 %	440224767
42219	NC_020062	GTC	2	6	1965792	1965797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224767
42220	NC_020062	AGC	2	6	1965808	1965813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224767
42221	NC_020062	GCT	2	6	1965833	1965838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224767
42222	NC_020062	CAA	2	6	1965845	1965850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224767
42223	NC_020062	CCG	2	6	1965853	1965858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224767
42224	NC_020062	CAT	3	9	1965860	1965868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224767
42225	NC_020062	CCAG	2	8	1965870	1965877	25 %	0 %	25 %	50 %	440224767
42226	NC_020062	CG	3	6	1965985	1965990	0 %	0 %	50 %	50 %	440224767
42227	NC_020062	GGC	2	6	1966011	1966016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224767
42228	NC_020062	CGA	2	6	1966034	1966039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224767
42229	NC_020062	GGC	2	6	1966082	1966087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224767
42230	NC_020062	GTC	2	6	1966148	1966153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224767
42231	NC_020062	GCT	2	6	1966169	1966174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224767
42232	NC_020062	GTCTTC	2	12	1966197	1966208	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440224767
42233	NC_020062	CCG	2	6	1966213	1966218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224767
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42338	NC_020062	GC	3	6	1971338	1971343	0 %	0 %	50 %	50 %	440224772
42339	NC_020062	GC	4	8	1971369	1971376	0 %	0 %	50 %	50 %	440224772
42340	NC_020062	CTC	2	6	1971454	1971459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42341	NC_020062	ATTAC	2	10	1971478	1971487	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42342	NC_020062	GA	3	6	1971533	1971538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42343	NC_020062	GAT	2	6	1971549	1971554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224773
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42345	NC_020062	TCG	2	6	1971625	1971630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224773
42346	NC_020062	GGC	2	6	1971653	1971658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224773
42347	NC_020062	TCG	2	6	1971673	1971678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224773
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42349	NC_020062	CTC	2	6	1971761	1971766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224773
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42463	NC_020062	GAC	2	6	1977034	1977039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224776
42464	NC_020062	ACA	2	6	1977056	1977061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224776
42465	NC_020062	CATC	2	8	1977078	1977085	25 %	25 %	0 %	50 %	440224776
42466	NC_020062	GAA	2	6	1977092	1977097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224776
42467	NC_020062	GGCGC	2	10	1977143	1977152	0 %	0 %	60 %	40 %	440224776
42468	NC_020062	CCG	2	6	1977209	1977214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224776
42469	NC_020062	CGG	3	9	1977249	1977257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224776
42470	NC_020062	TGC	2	6	1977293	1977298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224776
42471	NC_020062	GAAG	2	8	1977336	1977343	50 %	0 %	50 %	0 %	440224776
42472	NC_020062	CGA	2	6	1977348	1977353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224776
42473	NC_020062	GCGG	2	8	1977366	1977373	0 %	0 %	75 %	25 %	440224776
42474	NC_020062	C	6	6	1977400	1977405	0 %	0 %	0 %	100 %	440224776
42475	NC_020062	GTC	2	6	1977424	1977429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224776
42476	NC_020062	ACC	2	6	1977490	1977495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224776
42477	NC_020062	ATT	2	6	1977669	1977674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224777
42478	NC_020062	TCG	2	6	1977750	1977755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224777
42479	NC_020062	GGT	2	6	1977781	1977786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224777
42480	NC_020062	GC	5	10	1977787	1977796	0 %	0 %	50 %	50 %	440224777
42481	NC_020062	GACG	2	8	1977826	1977833	25 %	0 %	50 %	25 %	440224777
42482	NC_020062	AAG	2	6	1977866	1977871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224777
42483	NC_020062	TCA	2	6	1977897	1977902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224777
42484	NC_020062	CGG	2	6	1977914	1977919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224777
42485	NC_020062	CCG	2	6	1977949	1977954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224777
42486	NC_020062	TCA	2	6	1978050	1978055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224777
42487	NC_020062	TTC	2	6	1978094	1978099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224777
42488	NC_020062	GAG	2	6	1978121	1978126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224777
42489	NC_020062	ACC	2	6	1978131	1978136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224777
42490	NC_020062	GGC	2	6	1978160	1978165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224777
42491	NC_020062	TCT	2	6	1978167	1978172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224777
42492	NC_020062	CGA	2	6	1978231	1978236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224777
42493	NC_020062	TCT	2	6	1978267	1978272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224777
42494	NC_020062	GAAG	2	8	1978303	1978310	50 %	0 %	50 %	0 %	440224777
42495	NC_020062	CACGTC	2	12	1978357	1978368	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	440224777
42496	NC_020062	CAA	2	6	1978426	1978431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224777
42497	NC_020062	GCC	2	6	1978439	1978444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224777
42498	NC_020062	TGA	2	6	1978458	1978463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224777
42499	NC_020062	GGC	2	6	1978469	1978474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224777
42500	NC_020062	CGCA	2	8	1978495	1978502	25 %	0 %	25 %	50 %	440224777

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