MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_020062	CTC	2	6	1866690	1866695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40002	NC_020062	AGC	2	6	1866742	1866747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40003	NC_020062	GCA	2	6	1866765	1866770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40004	NC_020062	CCT	2	6	1866787	1866792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40005	NC_020062	CAA	2	6	1866862	1866867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40006	NC_020062	ACT	2	6	1866878	1866883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40007	NC_020062	CAT	2	6	1866967	1866972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224676
40008	NC_020062	TCGCC	2	10	1867053	1867062	0 %	20 %	20 %	60 %	440224676
40009	NC_020062	CT	3	6	1867079	1867084	0 %	50 %	0 %	50 %	440224676
40010	NC_020062	GCC	2	6	1867112	1867117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224676
40011	NC_020062	CGTTCG	2	12	1867166	1867177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224676
40012	NC_020062	GCCA	2	8	1867234	1867241	25 %	0 %	25 %	50 %	440224676
40013	NC_020062	CGA	2	6	1867294	1867299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224676
40014	NC_020062	CGA	2	6	1867380	1867385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224676
40015	NC_020062	CGG	2	6	1867419	1867424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224676
40016	NC_020062	CCA	2	6	1867431	1867436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224676
40017	NC_020062	CCG	2	6	1867522	1867527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40018	NC_020062	TCTG	2	8	1867528	1867535	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40019	NC_020062	GCA	2	6	1867629	1867634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40020	NC_020062	CAC	2	6	1867687	1867692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40021	NC_020062	GAA	2	6	1867707	1867712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224677
40022	NC_020062	GC	3	6	1867751	1867756	0 %	0 %	50 %	50 %	440224677
40023	NC_020062	GTAG	2	8	1867776	1867783	25 %	25 %	50 %	0 %	440224677
40024	NC_020062	GTG	2	6	1867810	1867815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224677
40025	NC_020062	CGT	2	6	1867832	1867837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224677
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40031	NC_020062	AT	4	8	1868112	1868119	50 %	50 %	0 %	0 %	440224677
40032	NC_020062	GC	3	6	1868156	1868161	0 %	0 %	50 %	50 %	440224677
40033	NC_020062	GTAG	2	8	1868181	1868188	25 %	25 %	50 %	0 %	440224677
40034	NC_020062	TCGG	2	8	1868208	1868215	0 %	25 %	50 %	25 %	440224677
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40040	NC_020062	GGA	2	6	1868470	1868475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224677
40041	NC_020062	GTC	2	6	1868583	1868588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224677
40042	NC_020062	TCCAA	2	10	1868696	1868705	40 %	20 %	0 %	40 %	440224677
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40044	NC_020062	TTG	2	6	1868760	1868765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224677
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40050	NC_020062	CGA	2	6	1869099	1869104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224677
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40052	NC_020062	CGT	2	6	1869149	1869154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224677
40053	NC_020062	CGGA	2	8	1869165	1869172	25 %	0 %	50 %	25 %	440224677
40054	NC_020062	TGC	2	6	1869209	1869214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224677
40055	NC_020062	TCG	2	6	1869226	1869231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224677
40056	NC_020062	GATC	2	8	1869257	1869264	25 %	25 %	25 %	25 %	440224677
40057	NC_020062	CAA	2	6	1869340	1869345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40058	NC_020062	GCT	2	6	1869455	1869460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40059	NC_020062	CAG	2	6	1869484	1869489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224678
40060	NC_020062	ACCAC	2	10	1869509	1869518	40 %	0 %	0 %	60 %	440224678
40061	NC_020062	GTG	2	6	1869536	1869541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224678
40062	NC_020062	ATA	2	6	1869569	1869574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224678
40063	NC_020062	GCTG	2	8	1869579	1869586	0 %	25 %	50 %	25 %	440224678
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40109	NC_020062	CGTT	2	8	1871937	1871944	0 %	50 %	25 %	25 %	440224679
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40118	NC_020062	CAC	2	6	1872480	1872485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224680
40119	NC_020062	GCTGCC	2	12	1872527	1872538	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440224680
40120	NC_020062	C	6	6	1872556	1872561	0 %	0 %	0 %	100 %	440224680
40121	NC_020062	ATC	2	6	1872568	1872573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224680
40122	NC_020062	GCA	2	6	1872628	1872633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224680
40123	NC_020062	GCT	2	6	1872656	1872661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224680
40124	NC_020062	AGC	2	6	1872768	1872773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224680
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40126	NC_020062	CG	3	6	1872822	1872827	0 %	0 %	50 %	50 %	440224680
40127	NC_020062	CGA	2	6	1872834	1872839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224680
40128	NC_020062	AT	3	6	1872887	1872892	50 %	50 %	0 %	0 %	440224680
40129	NC_020062	GAGGC	2	10	1872934	1872943	20 %	0 %	60 %	20 %	440224680
40130	NC_020062	GGCA	2	8	1873002	1873009	25 %	0 %	50 %	25 %	440224680
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40137	NC_020062	TCG	2	6	1873347	1873352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224680
40138	NC_020062	GC	3	6	1873374	1873379	0 %	0 %	50 %	50 %	440224680
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40145	NC_020062	T	6	6	1873941	1873946	0 %	100 %	0 %	0 %	440224680
40146	NC_020062	CGC	2	6	1873984	1873989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40147	NC_020062	ATT	3	9	1874012	1874020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40148	NC_020062	TA	3	6	1874077	1874082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40149	NC_020062	GCG	2	6	1874146	1874151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40150	NC_020062	GCG	3	9	1874167	1874175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40151	NC_020062	ACTT	2	8	1874375	1874382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40152	NC_020062	ATC	2	6	1874422	1874427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40155	NC_020062	TCA	2	6	1874603	1874608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40156	NC_020062	GGA	2	6	1874622	1874627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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40217	NC_020062	GA	3	6	1877702	1877707	50 %	0 %	50 %	0 %	440224683
40218	NC_020062	GAC	2	6	1877716	1877721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224683
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40221	NC_020062	GAT	2	6	1877992	1877997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224683
40222	NC_020062	GAT	2	6	1878058	1878063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224683
40223	NC_020062	AT	3	6	1878096	1878101	50 %	50 %	0 %	0 %	440224683
40224	NC_020062	GC	3	6	1878112	1878117	0 %	0 %	50 %	50 %	440224683
40225	NC_020062	CAGC	2	8	1878127	1878134	25 %	0 %	25 %	50 %	440224683
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40227	NC_020062	GT	3	6	1878213	1878218	0 %	50 %	50 %	0 %	440224683
40228	NC_020062	AGGC	2	8	1878332	1878339	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40229	NC_020062	GCC	2	6	1878345	1878350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40230	NC_020062	CGG	2	6	1878367	1878372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40231	NC_020062	CTT	2	6	1878384	1878389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224684
40232	NC_020062	TTGG	2	8	1878399	1878406	0 %	50 %	50 %	0 %	440224684
40233	NC_020062	TTG	2	6	1878481	1878486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224684
40234	NC_020062	GAC	2	6	1878519	1878524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224684
40235	NC_020062	CCG	2	6	1878530	1878535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224684
40236	NC_020062	GGC	2	6	1878600	1878605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224684
40237	NC_020062	GTT	2	6	1878639	1878644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224684
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40239	NC_020062	CGG	2	6	1878656	1878661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224684
40240	NC_020062	TTG	2	6	1878664	1878669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224684
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40242	NC_020062	TCT	2	6	1878845	1878850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224684
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40244	NC_020062	GCA	2	6	1878914	1878919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224684
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40247	NC_020062	TGA	2	6	1879073	1879078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224684
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40253	NC_020062	CATG	2	8	1879247	1879254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40254	NC_020062	TCAT	2	8	1879333	1879340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40255	NC_020062	CCGT	2	8	1879361	1879368	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40256	NC_020062	CAA	2	6	1879369	1879374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40257	NC_020062	GAA	2	6	1879397	1879402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224685
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40284	NC_020062	AGG	2	6	1880600	1880605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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40297	NC_020062	GGAA	2	8	1880988	1880995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40298	NC_020062	GGC	2	6	1881089	1881094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224687
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40310	NC_020062	AACG	2	8	1881912	1881919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40311	NC_020062	CGTT	2	8	1881949	1881956	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40312	NC_020062	AG	3	6	1881964	1881969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40313	NC_020062	AGC	2	6	1882013	1882018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40329	NC_020062	GAC	2	6	1883410	1883415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40337	NC_020062	TCA	2	6	1883660	1883665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224690
40338	NC_020062	TCA	2	6	1883733	1883738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224690
40339	NC_020062	CAG	2	6	1883756	1883761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224690
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40342	NC_020062	CGC	2	6	1883809	1883814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224690
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40349	NC_020062	CG	3	6	1884048	1884053	0 %	0 %	50 %	50 %	440224690
40350	NC_020062	CGG	2	6	1884096	1884101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224690
40351	NC_020062	GCA	2	6	1884106	1884111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224690
40352	NC_020062	CGG	2	6	1884205	1884210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224690
40353	NC_020062	CAT	2	6	1884262	1884267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224690
40354	NC_020062	ACG	2	6	1884288	1884293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224690
40355	NC_020062	GC	3	6	1884315	1884320	0 %	0 %	50 %	50 %	440224690
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40457	NC_020062	TCGA	2	8	1888405	1888412	25 %	25 %	25 %	25 %	440224694
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40468	NC_020062	TGT	2	6	1888982	1888987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224695
40469	NC_020062	GCG	2	6	1889081	1889086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224695
40470	NC_020062	CCCTG	2	10	1889102	1889111	0 %	20 %	20 %	60 %	440224695
40471	NC_020062	GAC	2	6	1889118	1889123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224695
40472	NC_020062	TG	3	6	1889161	1889166	0 %	50 %	50 %	0 %	440224695
40473	NC_020062	ACGAAG	2	12	1889167	1889178	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440224695
40474	NC_020062	CTT	2	6	1889190	1889195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224695
40475	NC_020062	GCA	2	6	1889198	1889203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224695
40476	NC_020062	TCG	2	6	1889260	1889265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224695
40477	NC_020062	AGC	2	6	1889269	1889274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224695
40478	NC_020062	GCC	2	6	1889325	1889330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224695
40479	NC_020062	TCC	2	6	1889362	1889367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224695
40480	NC_020062	CCG	2	6	1889454	1889459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224695
40481	NC_020062	ATC	2	6	1889497	1889502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224695
40482	NC_020062	CAT	2	6	1889528	1889533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224695
40483	NC_020062	ATC	2	6	1889551	1889556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224695
40484	NC_020062	GGA	2	6	1889565	1889570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224695
40485	NC_020062	GAT	2	6	1889589	1889594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224695
40486	NC_020062	CGT	2	6	1889601	1889606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224695
40487	NC_020062	CGG	2	6	1889681	1889686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224695
40488	NC_020062	AT	3	6	1889733	1889738	50 %	50 %	0 %	0 %	440224695
40489	NC_020062	CG	3	6	1889785	1889790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40490	NC_020062	CGG	2	6	1889803	1889808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40491	NC_020062	CAGC	2	8	1889909	1889916	25 %	0 %	25 %	50 %	440224696
40492	NC_020062	GCC	2	6	1889919	1889924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224696
40493	NC_020062	CCTT	2	8	1889938	1889945	0 %	50 %	0 %	50 %	440224696
40494	NC_020062	AAT	2	6	1890041	1890046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224696
40495	NC_020062	ATC	2	6	1890136	1890141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224696
40496	NC_020062	CCTT	2	8	1890169	1890176	0 %	50 %	0 %	50 %	440224696
40497	NC_020062	CGGCA	2	10	1890177	1890186	20 %	0 %	40 %	40 %	440224696
40498	NC_020062	CGGC	2	8	1890224	1890231	0 %	0 %	50 %	50 %	440224696
40499	NC_020062	GAC	2	6	1890246	1890251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224696
40500	NC_020062	CTT	3	9	1890321	1890329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224696

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