MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39502	NC_020062	GC	3	6	1844008	1844013	0 %	0 %	50 %	50 %	440224658
39503	NC_020062	TCG	2	6	1844073	1844078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224658
39504	NC_020062	CTG	2	6	1844081	1844086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224658
39505	NC_020062	CGG	2	6	1844094	1844099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224658
39506	NC_020062	CGA	2	6	1844104	1844109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224658
39507	NC_020062	CG	3	6	1844120	1844125	0 %	0 %	50 %	50 %	440224658
39508	NC_020062	CAT	2	6	1844135	1844140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224658
39509	NC_020062	GCA	2	6	1844177	1844182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224658
39510	NC_020062	CGC	2	6	1844183	1844188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224658
39511	NC_020062	CCG	2	6	1844217	1844222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224658
39512	NC_020062	CTAC	2	8	1844285	1844292	25 %	25 %	0 %	50 %	440224659
39513	NC_020062	CTA	2	6	1844311	1844316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224659
39514	NC_020062	TCG	2	6	1844444	1844449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224659
39515	NC_020062	CCG	2	6	1844504	1844509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224659
39516	NC_020062	CCA	2	6	1844525	1844530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224659
39517	NC_020062	CCG	2	6	1844555	1844560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224659
39518	NC_020062	TCA	2	6	1844592	1844597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224659
39519	NC_020062	GCT	2	6	1844611	1844616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224659
39520	NC_020062	TCG	2	6	1844711	1844716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224659
39521	NC_020062	TCGA	2	8	1844737	1844744	25 %	25 %	25 %	25 %	440224659
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39524	NC_020062	CG	3	6	1844801	1844806	0 %	0 %	50 %	50 %	440224659
39525	NC_020062	TGC	2	6	1844870	1844875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224659
39526	NC_020062	CGA	2	6	1844949	1844954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224659
39527	NC_020062	TCG	2	6	1845008	1845013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224659
39528	NC_020062	CGT	2	6	1845015	1845020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224659
39529	NC_020062	CG	3	6	1845026	1845031	0 %	0 %	50 %	50 %	440224659
39530	NC_020062	GCC	2	6	1845081	1845086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224659
39531	NC_020062	GATC	2	8	1845153	1845160	25 %	25 %	25 %	25 %	440224659
39532	NC_020062	GCCGA	2	10	1845193	1845202	20 %	0 %	40 %	40 %	440224659
39533	NC_020062	CTC	3	9	1845340	1845348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224659
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39535	NC_020062	GCT	2	6	1845395	1845400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224659
39536	NC_020062	CGA	2	6	1845417	1845422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224659
39537	NC_020062	GC	4	8	1845459	1845466	0 %	0 %	50 %	50 %	440224659
39538	NC_020062	CG	3	6	1845485	1845490	0 %	0 %	50 %	50 %	440224659
39539	NC_020062	GCC	2	6	1845520	1845525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224659
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39547	NC_020062	CGATC	2	10	1845837	1845846	20 %	20 %	20 %	40 %	440224659
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39554	NC_020062	GAT	3	9	1846119	1846127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224659
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39589	NC_020062	GGCC	2	8	1847747	1847754	0 %	0 %	50 %	50 %	440224659
39590	NC_020062	CGG	2	6	1847768	1847773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224659
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39593	NC_020062	CG	3	6	1848006	1848011	0 %	0 %	50 %	50 %	440224660
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39597	NC_020062	ATCC	2	8	1848218	1848225	25 %	25 %	0 %	50 %	440224660
39598	NC_020062	CAT	2	6	1848253	1848258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224660
39599	NC_020062	GGCG	2	8	1848275	1848282	0 %	0 %	75 %	25 %	440224660
39600	NC_020062	GCA	2	6	1848311	1848316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224660
39601	NC_020062	TGC	2	6	1848318	1848323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224660
39602	NC_020062	GACGT	2	10	1848362	1848371	20 %	20 %	40 %	20 %	440224660
39603	NC_020062	ATG	2	6	1848420	1848425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224660
39604	NC_020062	GC	3	6	1848465	1848470	0 %	0 %	50 %	50 %	440224660
39605	NC_020062	ATC	2	6	1848488	1848493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224660
39606	NC_020062	CTG	2	6	1848500	1848505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224660
39607	NC_020062	CTG	2	6	1848662	1848667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224660
39608	NC_020062	TGTCC	2	10	1848691	1848700	0 %	40 %	20 %	40 %	440224660
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39611	NC_020062	TGA	2	6	1848804	1848809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224660
39612	NC_020062	TTC	2	6	1848818	1848823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224660
39613	NC_020062	GGAA	2	8	1848844	1848851	50 %	0 %	50 %	0 %	440224660
39614	NC_020062	GGC	2	6	1848911	1848916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224660
39615	NC_020062	CG	3	6	1848933	1848938	0 %	0 %	50 %	50 %	440224660
39616	NC_020062	CGG	2	6	1848945	1848950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224660
39617	NC_020062	CTT	2	6	1848955	1848960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224660
39618	NC_020062	CGT	2	6	1849072	1849077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224660
39619	NC_020062	GC	3	6	1849111	1849116	0 %	0 %	50 %	50 %	440224660
39620	NC_020062	CG	3	6	1849149	1849154	0 %	0 %	50 %	50 %	440224660
39621	NC_020062	TGCC	2	8	1849171	1849178	0 %	25 %	25 %	50 %	440224660
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39653	NC_020062	CTG	2	6	1851337	1851342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224661
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39685	NC_020062	GC	3	6	1853008	1853013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39686	NC_020062	T	6	6	1853014	1853019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39687	NC_020062	GAT	2	6	1853035	1853040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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39702	NC_020062	GCT	2	6	1853746	1853751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224662
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39713	NC_020062	CG	3	6	1854226	1854231	0 %	0 %	50 %	50 %	440224663
39714	NC_020062	GCG	2	6	1854233	1854238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224663
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39723	NC_020062	CG	3	6	1854535	1854540	0 %	0 %	50 %	50 %	440224663
39724	NC_020062	GCT	3	9	1854542	1854550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224663
39725	NC_020062	CATCCT	2	12	1854551	1854562	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	440224663
39726	NC_020062	TCT	2	6	1854595	1854600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224663
39727	NC_020062	TGC	2	6	1854613	1854618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224663
39728	NC_020062	GATC	2	8	1854670	1854677	25 %	25 %	25 %	25 %	440224663
39729	NC_020062	GTT	2	6	1854705	1854710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224663
39730	NC_020062	CGAT	2	8	1854769	1854776	25 %	25 %	25 %	25 %	440224663
39731	NC_020062	ATC	2	6	1854783	1854788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224663
39732	NC_020062	GCC	2	6	1854795	1854800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224663
39733	NC_020062	GGT	2	6	1854814	1854819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224663
39734	NC_020062	GCT	2	6	1854852	1854857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224663
39735	NC_020062	GGC	2	6	1854930	1854935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224663
39736	NC_020062	GCT	2	6	1855022	1855027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224663
39737	NC_020062	CGT	2	6	1855031	1855036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224663
39738	NC_020062	CGGCA	2	10	1855076	1855085	20 %	0 %	40 %	40 %	440224663
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39740	NC_020062	TGA	2	6	1855171	1855176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224664
39741	NC_020062	CGC	2	6	1855198	1855203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224664
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39743	NC_020062	CTG	2	6	1855273	1855278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224664
39744	NC_020062	CAT	3	9	1855289	1855297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224664
39745	NC_020062	CGG	2	6	1855309	1855314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224664
39746	NC_020062	GCA	2	6	1855360	1855365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224664
39747	NC_020062	TGC	3	9	1855396	1855404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224664
39748	NC_020062	TCT	3	9	1855450	1855458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224664
39749	NC_020062	ATC	2	6	1855494	1855499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224664
39750	NC_020062	TGG	3	9	1855534	1855542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224664
39751	NC_020062	TTC	2	6	1855617	1855622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224664
39752	NC_020062	GCC	2	6	1855662	1855667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224664
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39755	NC_020062	GCTCG	2	10	1855814	1855823	0 %	20 %	40 %	40 %	440224664
39756	NC_020062	CG	3	6	1855844	1855849	0 %	0 %	50 %	50 %	440224664
39757	NC_020062	CAC	2	6	1855938	1855943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224665
39758	NC_020062	CTT	2	6	1855972	1855977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224665
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39760	NC_020062	CAT	2	6	1856013	1856018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224665
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39763	NC_020062	GCA	2	6	1856060	1856065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224665
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39767	NC_020062	AGC	2	6	1856267	1856272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224665
39768	NC_020062	GGC	2	6	1856278	1856283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224665
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39770	NC_020062	TGC	3	9	1856333	1856341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224665
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39775	NC_020062	CGC	2	6	1856559	1856564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224665
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39783	NC_020062	TGT	2	6	1856910	1856915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224665
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39788	NC_020062	GAG	2	6	1857108	1857113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224666
39789	NC_020062	CTA	2	6	1857134	1857139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224666
39790	NC_020062	GCTG	2	8	1857203	1857210	0 %	25 %	50 %	25 %	440224666
39791	NC_020062	TCG	2	6	1857232	1857237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224666
39792	NC_020062	ATCG	2	8	1857276	1857283	25 %	25 %	25 %	25 %	440224666
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39794	NC_020062	GCG	2	6	1857412	1857417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224666
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39797	NC_020062	GA	3	6	1857564	1857569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39798	NC_020062	CTT	2	6	1857672	1857677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224667
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39800	NC_020062	GCG	2	6	1857754	1857759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224667
39801	NC_020062	GTC	2	6	1857844	1857849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224667
39802	NC_020062	CGA	2	6	1857927	1857932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224667
39803	NC_020062	TC	3	6	1857957	1857962	0 %	50 %	0 %	50 %	440224667
39804	NC_020062	ATG	2	6	1858018	1858023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224667
39805	NC_020062	AGA	2	6	1858040	1858045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224667
39806	NC_020062	TTG	2	6	1858047	1858052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224667
39807	NC_020062	AC	3	6	1858098	1858103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39808	NC_020062	TGA	2	6	1858238	1858243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224668
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39816	NC_020062	CCT	2	6	1858491	1858496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224668
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39818	NC_020062	GACG	2	8	1858520	1858527	25 %	0 %	50 %	25 %	440224668
39819	NC_020062	GCCG	2	8	1858534	1858541	0 %	0 %	50 %	50 %	440224668
39820	NC_020062	GGA	2	6	1858560	1858565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224668
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39826	NC_020062	GC	3	6	1858754	1858759	0 %	0 %	50 %	50 %	440224668
39827	NC_020062	TGA	2	6	1858769	1858774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224668
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39829	NC_020062	CGA	2	6	1858995	1859000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224668
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39832	NC_020062	CAG	2	6	1859149	1859154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224668
39833	NC_020062	GCT	2	6	1859173	1859178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224668
39834	NC_020062	GTT	2	6	1859194	1859199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224668
39835	NC_020062	CGA	2	6	1859219	1859224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224668
39836	NC_020062	GGGATC	2	12	1859229	1859240	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440224668
39837	NC_020062	CGA	2	6	1859243	1859248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224668
39838	NC_020062	ACGT	2	8	1859312	1859319	25 %	25 %	25 %	25 %	440224668
39839	NC_020062	TGC	2	6	1859382	1859387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224668
39840	NC_020062	GAC	2	6	1859388	1859393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224668
39841	NC_020062	TCA	2	6	1859405	1859410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224668
39842	NC_020062	CGAGAA	2	12	1859418	1859429	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440224668
39843	NC_020062	GGC	2	6	1859472	1859477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224668
39844	NC_020062	GCTC	2	8	1859498	1859505	0 %	25 %	25 %	50 %	440224668
39845	NC_020062	GGCC	2	8	1859511	1859518	0 %	0 %	50 %	50 %	440224668
39846	NC_020062	TCG	2	6	1859528	1859533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224668
39847	NC_020062	ACG	2	6	1859539	1859544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224668
39848	NC_020062	CAC	2	6	1859574	1859579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224668
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39867	NC_020062	AGGT	2	8	1860775	1860782	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39868	NC_020062	CCGA	2	8	1860855	1860862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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39963	NC_020062	CAG	3	9	1865053	1865061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224674
39964	NC_020062	GGC	2	6	1865077	1865082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224674
39965	NC_020062	TCCT	2	8	1865104	1865111	0 %	50 %	0 %	50 %	440224674
39966	NC_020062	CCCATG	2	12	1865174	1865185	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	440224674
39967	NC_020062	GGAA	2	8	1865201	1865208	50 %	0 %	50 %	0 %	440224674
39968	NC_020062	CGA	2	6	1865262	1865267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224674
39969	NC_020062	CGT	2	6	1865439	1865444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224674
39970	NC_020062	GAC	2	6	1865499	1865504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224674
39971	NC_020062	CAG	2	6	1865529	1865534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224674
39972	NC_020062	CGGA	2	8	1865558	1865565	25 %	0 %	50 %	25 %	440224674
39973	NC_020062	CAA	2	6	1865604	1865609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224674
39974	NC_020062	GCC	2	6	1865614	1865619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224674
39975	NC_020062	ACA	2	6	1865696	1865701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224674
39976	NC_020062	TCG	2	6	1865723	1865728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224674
39977	NC_020062	TC	3	6	1865736	1865741	0 %	50 %	0 %	50 %	440224674
39978	NC_020062	GTC	2	6	1865762	1865767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39979	NC_020062	CCA	2	6	1865894	1865899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224675
39980	NC_020062	TGGC	2	8	1865900	1865907	0 %	25 %	50 %	25 %	440224675
39981	NC_020062	GAC	2	6	1865919	1865924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224675
39982	NC_020062	TTC	2	6	1865943	1865948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224675
39983	NC_020062	CGC	2	6	1865982	1865987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224675
39984	NC_020062	CGGG	2	8	1866106	1866113	0 %	0 %	75 %	25 %	440224675
39985	NC_020062	GCG	2	6	1866120	1866125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224675
39986	NC_020062	GCC	2	6	1866185	1866190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224675
39987	NC_020062	GA	3	6	1866207	1866212	50 %	0 %	50 %	0 %	440224675
39988	NC_020062	CG	3	6	1866252	1866257	0 %	0 %	50 %	50 %	440224675
39989	NC_020062	TGG	2	6	1866363	1866368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224675
39990	NC_020062	CGG	2	6	1866383	1866388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224675
39991	NC_020062	TCT	2	6	1866418	1866423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224675
39992	NC_020062	GAT	2	6	1866441	1866446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224675
39993	NC_020062	GCT	2	6	1866470	1866475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224675
39994	NC_020062	CGA	3	9	1866485	1866493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224675
39995	NC_020062	GGT	2	6	1866497	1866502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224675
39996	NC_020062	CCG	2	6	1866517	1866522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224675
39997	NC_020062	GCT	2	6	1866536	1866541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224675
39998	NC_020062	CACG	2	8	1866593	1866600	25 %	0 %	25 %	50 %	440224675
39999	NC_020062	TGCT	2	8	1866622	1866629	0 %	50 %	25 %	25 %	440224675
40000	NC_020062	TCA	2	6	1866631	1866636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224675

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