MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_020062	GCT	2	6	1771412	1771417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224590
38003	NC_020062	CAAC	2	8	1771436	1771443	50 %	0 %	0 %	50 %	440224590
38004	NC_020062	GCC	2	6	1771450	1771455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224590
38005	NC_020062	GGA	2	6	1771463	1771468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224590
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38007	NC_020062	GC	3	6	1771511	1771516	0 %	0 %	50 %	50 %	440224590
38008	NC_020062	TAA	2	6	1771572	1771577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38009	NC_020062	GGT	2	6	1771612	1771617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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38011	NC_020062	CG	3	6	1771675	1771680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38012	NC_020062	CGA	2	6	1771830	1771835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224591
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38015	NC_020062	GCA	2	6	1772143	1772148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224592
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38017	NC_020062	CG	4	8	1772171	1772178	0 %	0 %	50 %	50 %	440224592
38018	NC_020062	TGT	2	6	1772190	1772195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224592
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38021	NC_020062	GCCG	2	8	1772313	1772320	0 %	0 %	50 %	50 %	440224592
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38092	NC_020062	T	6	6	1775190	1775195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38093	NC_020062	CTGG	2	8	1775212	1775219	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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38101	NC_020062	GTG	2	6	1775588	1775593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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38119	NC_020062	CAG	2	6	1776597	1776602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224596
38120	NC_020062	GCG	2	6	1776618	1776623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224596
38121	NC_020062	ATC	2	6	1776645	1776650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224596
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38123	NC_020062	CGA	2	6	1776800	1776805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224596
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38131	NC_020062	CGT	2	6	1777328	1777333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224596
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38218	NC_020062	CGAA	2	8	1782380	1782387	50 %	0 %	25 %	25 %	440224601
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38223	NC_020062	GAC	2	6	1782634	1782639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224602
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38228	NC_020062	CGC	2	6	1782880	1782885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224602
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38230	NC_020062	CGA	2	6	1783074	1783079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224602
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38232	NC_020062	CTG	2	6	1783282	1783287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224602
38233	NC_020062	CGC	2	6	1783289	1783294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224602
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38236	NC_020062	CCG	3	9	1783392	1783400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224602
38237	NC_020062	TC	3	6	1783436	1783441	0 %	50 %	0 %	50 %	440224603
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38239	NC_020062	CGT	2	6	1783486	1783491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224603
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38246	NC_020062	CTGAC	2	10	1783830	1783839	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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38264	NC_020062	TCCG	2	8	1784571	1784578	0 %	25 %	25 %	50 %	440224604
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38282	NC_020062	GCT	3	9	1785701	1785709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224605
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38299	NC_020062	GATC	2	8	1786588	1786595	25 %	25 %	25 %	25 %	440224606
38300	NC_020062	TGA	2	6	1786639	1786644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224606
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38327	NC_020062	GC	3	6	1787770	1787775	0 %	0 %	50 %	50 %	440224606
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38329	NC_020062	TGC	2	6	1788006	1788011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38330	NC_020062	CGGC	2	8	1788120	1788127	0 %	0 %	50 %	50 %	440224607
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38332	NC_020062	GC	3	6	1788210	1788215	0 %	0 %	50 %	50 %	440224607
38333	NC_020062	CGT	2	6	1788249	1788254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224607
38334	NC_020062	AT	3	6	1788342	1788347	50 %	50 %	0 %	0 %	440224607
38335	NC_020062	CGC	2	6	1788372	1788377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224607
38336	NC_020062	GCCC	2	8	1788419	1788426	0 %	0 %	25 %	75 %	440224607
38337	NC_020062	AGT	2	6	1788462	1788467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224607
38338	NC_020062	CGA	2	6	1788549	1788554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224607
38339	NC_020062	ATG	2	6	1788572	1788577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224607
38340	NC_020062	CGG	3	9	1788578	1788586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224607
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38343	NC_020062	TGCC	2	8	1788674	1788681	0 %	25 %	25 %	50 %	440224607
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38345	NC_020062	CAT	2	6	1788781	1788786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224607
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38347	NC_020062	CGG	3	9	1788846	1788854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224607
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38349	NC_020062	CG	3	6	1788955	1788960	0 %	0 %	50 %	50 %	440224607
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38467	NC_020062	TGA	2	6	1795028	1795033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224612
38468	NC_020062	GAA	2	6	1795039	1795044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224612
38469	NC_020062	CAT	2	6	1795053	1795058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224612
38470	NC_020062	ATG	2	6	1795132	1795137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224612
38471	NC_020062	C	6	6	1795188	1795193	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38472	NC_020062	CGC	2	6	1795252	1795257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38473	NC_020062	TCA	2	6	1795320	1795325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224613
38474	NC_020062	TCT	2	6	1795350	1795355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224613
38475	NC_020062	TGC	2	6	1795368	1795373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224613
38476	NC_020062	CGA	2	6	1795453	1795458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224613
38477	NC_020062	GCC	3	9	1795557	1795565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224613
38478	NC_020062	GCC	2	6	1795586	1795591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224613
38479	NC_020062	ACG	2	6	1795595	1795600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224613
38480	NC_020062	TTA	2	6	1795660	1795665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224613
38481	NC_020062	TGC	2	6	1795737	1795742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224613
38482	NC_020062	GCTG	2	8	1795761	1795768	0 %	25 %	50 %	25 %	440224613
38483	NC_020062	TCC	2	6	1795778	1795783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224613
38484	NC_020062	TCT	2	6	1795810	1795815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224613
38485	NC_020062	TCA	2	6	1795836	1795841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224613
38486	NC_020062	GAT	2	6	1795867	1795872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224613
38487	NC_020062	CG	3	6	1795947	1795952	0 %	0 %	50 %	50 %	440224613
38488	NC_020062	TCG	2	6	1796031	1796036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224613
38489	NC_020062	GCG	2	6	1796037	1796042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224613
38490	NC_020062	ATC	2	6	1796045	1796050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224613
38491	NC_020062	TGG	2	6	1796091	1796096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224613
38492	NC_020062	GAT	2	6	1796140	1796145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224613
38493	NC_020062	CTG	2	6	1796165	1796170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224613
38494	NC_020062	ATC	2	6	1796186	1796191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224613
38495	NC_020062	CCCTT	2	10	1796247	1796256	0 %	40 %	0 %	60 %	440224614
38496	NC_020062	TTG	2	6	1796276	1796281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224614
38497	NC_020062	TCG	2	6	1796318	1796323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224614
38498	NC_020062	TCG	2	6	1796366	1796371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224614
38499	NC_020062	GGCTC	2	10	1796408	1796417	0 %	20 %	40 %	40 %	440224614
38500	NC_020062	CG	3	6	1796444	1796449	0 %	0 %	50 %	50 %	440224614

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