MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37002	NC_020062	CG	3	6	1724524	1724529	0 %	0 %	50 %	50 %	440224545
37003	NC_020062	CGGC	2	8	1724546	1724553	0 %	0 %	50 %	50 %	440224545
37004	NC_020062	CGC	2	6	1724567	1724572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224545
37005	NC_020062	TGGCG	2	10	1724615	1724624	0 %	20 %	60 %	20 %	440224545
37006	NC_020062	CTC	2	6	1724734	1724739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37007	NC_020062	GCG	2	6	1724751	1724756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37008	NC_020062	TCG	2	6	1724841	1724846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37009	NC_020062	TGA	2	6	1724871	1724876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224546
37010	NC_020062	TCC	2	6	1724880	1724885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224546
37011	NC_020062	GC	3	6	1724914	1724919	0 %	0 %	50 %	50 %	440224546
37012	NC_020062	CGC	2	6	1724935	1724940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224546
37013	NC_020062	CGG	2	6	1724980	1724985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224546
37014	NC_020062	ACG	2	6	1725006	1725011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224546
37015	NC_020062	CAAG	2	8	1725022	1725029	50 %	0 %	25 %	25 %	440224546
37016	NC_020062	GGC	2	6	1725065	1725070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224546
37017	NC_020062	CGT	2	6	1725106	1725111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224546
37018	NC_020062	CGT	2	6	1725154	1725159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224546
37019	NC_020062	GGC	2	6	1725185	1725190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224546
37020	NC_020062	CCG	2	6	1725237	1725242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224546
37021	NC_020062	ACC	2	6	1725270	1725275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224546
37022	NC_020062	CTA	2	6	1725277	1725282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224546
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37025	NC_020062	CGC	2	6	1725475	1725480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224546
37026	NC_020062	CCGCC	2	10	1725523	1725532	0 %	0 %	20 %	80 %	440224546
37027	NC_020062	GGC	2	6	1725590	1725595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224546
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37029	NC_020062	CGG	2	6	1725718	1725723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224546
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37033	NC_020062	TCG	2	6	1725862	1725867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37034	NC_020062	CGC	2	6	1725993	1725998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224547
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37040	NC_020062	CAG	2	6	1726221	1726226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224547
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37043	NC_020062	CCG	2	6	1726541	1726546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224547
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37046	NC_020062	CGA	2	6	1726656	1726661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224547
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37052	NC_020062	CAT	2	6	1727045	1727050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224547
37053	NC_020062	TGA	2	6	1727208	1727213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37054	NC_020062	GGC	2	6	1727254	1727259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37055	NC_020062	GTC	2	6	1727266	1727271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37056	NC_020062	ACG	2	6	1727298	1727303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37057	NC_020062	GCC	2	6	1727396	1727401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37058	NC_020062	CAC	2	6	1727406	1727411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37059	NC_020062	GA	3	6	1727454	1727459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37060	NC_020062	CGA	2	6	1727471	1727476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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37062	NC_020062	GCG	2	6	1727538	1727543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37063	NC_020062	TA	3	6	1727616	1727621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37064	NC_020062	TTGC	2	8	1727636	1727643	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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37076	NC_020062	GC	3	6	1727997	1728002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37077	NC_020062	CCGG	2	8	1728090	1728097	0 %	0 %	50 %	50 %	440224549
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37085	NC_020062	CG	4	8	1728539	1728546	0 %	0 %	50 %	50 %	440224550
37086	NC_020062	TGC	2	6	1728582	1728587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224550
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37092	NC_020062	CG	3	6	1728804	1728809	0 %	0 %	50 %	50 %	440224551
37093	NC_020062	GCCTGC	2	12	1728827	1728838	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440224551
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37097	NC_020062	CGG	2	6	1728918	1728923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37098	NC_020062	CT	3	6	1728928	1728933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37099	NC_020062	GTC	3	9	1728951	1728959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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37102	NC_020062	CG	3	6	1729028	1729033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37103	NC_020062	ACA	2	6	1729034	1729039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37104	NC_020062	TCC	2	6	1729059	1729064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37105	NC_020062	CAT	2	6	1729068	1729073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37106	NC_020062	TCGC	2	8	1729094	1729101	0 %	25 %	25 %	50 %	440224552
37107	NC_020062	TCA	2	6	1729171	1729176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224552
37108	NC_020062	TTC	2	6	1729357	1729362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37109	NC_020062	TC	3	6	1729361	1729366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37110	NC_020062	TCA	2	6	1729383	1729388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37114	NC_020062	TTC	2	6	1729456	1729461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37115	NC_020062	GCA	2	6	1729525	1729530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224553
37116	NC_020062	CGT	2	6	1729537	1729542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
37117	NC_020062	GAC	2	6	1729570	1729575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224553
37118	NC_020062	TCC	2	6	1729591	1729596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224553
37119	NC_020062	GCC	2	6	1729781	1729786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224553
37120	NC_020062	CGC	2	6	1729827	1729832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224553
37121	NC_020062	CGT	2	6	1729837	1729842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
37122	NC_020062	ATG	2	6	1729893	1729898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224553
37123	NC_020062	T	6	6	1729902	1729907	0 %	100 %	0 %	0 %	440224553
37124	NC_020062	GGT	2	6	1729930	1729935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224553
37125	NC_020062	GCC	2	6	1729972	1729977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224553
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37127	NC_020062	CGG	2	6	1730118	1730123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224553
37128	NC_020062	GC	3	6	1730128	1730133	0 %	0 %	50 %	50 %	440224553
37129	NC_020062	AGC	2	6	1730160	1730165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224553
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37131	NC_020062	AT	3	6	1730344	1730349	50 %	50 %	0 %	0 %	440224553
37132	NC_020062	GCAA	2	8	1730354	1730361	50 %	0 %	25 %	25 %	440224553
37133	NC_020062	TGA	2	6	1730389	1730394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224553
37134	NC_020062	GA	3	6	1730393	1730398	50 %	0 %	50 %	0 %	440224553
37135	NC_020062	GCC	2	6	1730399	1730404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224553
37136	NC_020062	TCG	2	6	1730424	1730429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
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37140	NC_020062	CAC	2	6	1730614	1730619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224553
37141	NC_020062	CTG	2	6	1730654	1730659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
37142	NC_020062	T	6	6	1730666	1730671	0 %	100 %	0 %	0 %	440224553
37143	NC_020062	CCT	2	6	1730682	1730687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224553
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37145	NC_020062	G	6	6	1730705	1730710	0 %	0 %	100 %	0 %	440224553
37146	NC_020062	GATC	2	8	1730745	1730752	25 %	25 %	25 %	25 %	440224553
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37151	NC_020062	TCG	2	6	1730919	1730924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
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37173	NC_020062	GAA	2	6	1731765	1731770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37174	NC_020062	CAC	2	6	1731839	1731844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224554
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37197	NC_020062	ATA	2	6	1732891	1732896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37198	NC_020062	AT	3	6	1733003	1733008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37199	NC_020062	AAT	2	6	1733030	1733035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37200	NC_020062	AAC	2	6	1733123	1733128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37201	NC_020062	CG	3	6	1733178	1733183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37202	NC_020062	TGT	2	6	1733211	1733216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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37204	NC_020062	CAT	2	6	1733246	1733251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37206	NC_020062	CCTG	2	8	1733394	1733401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37207	NC_020062	GCGCG	2	10	1733435	1733444	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37208	NC_020062	ATC	2	6	1733453	1733458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37214	NC_020062	GGTTC	2	10	1733691	1733700	0 %	40 %	40 %	20 %	440224555
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37217	NC_020062	GCT	2	6	1733870	1733875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224555
37218	NC_020062	GCG	2	6	1733898	1733903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224555
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37220	NC_020062	GGCTG	2	10	1733975	1733984	0 %	20 %	60 %	20 %	440224555
37221	NC_020062	CCG	2	6	1733989	1733994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224555
37222	NC_020062	CTGT	2	8	1734015	1734022	0 %	50 %	25 %	25 %	440224555
37223	NC_020062	CGG	2	6	1734047	1734052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224555
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37226	NC_020062	GAA	2	6	1734321	1734326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224555
37227	NC_020062	CGG	3	9	1734404	1734412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224555
37228	NC_020062	GCC	2	6	1734457	1734462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224555
37229	NC_020062	CGG	2	6	1734477	1734482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224555
37230	NC_020062	GA	3	6	1734586	1734591	50 %	0 %	50 %	0 %	440224555
37231	NC_020062	GA	3	6	1734631	1734636	50 %	0 %	50 %	0 %	440224555
37232	NC_020062	GGCT	2	8	1734693	1734700	0 %	25 %	50 %	25 %	440224555
37233	NC_020062	GCGA	2	8	1734763	1734770	25 %	0 %	50 %	25 %	440224555
37234	NC_020062	GC	3	6	1734818	1734823	0 %	0 %	50 %	50 %	440224555
37235	NC_020062	CCA	2	6	1734829	1734834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224555
37236	NC_020062	CGC	3	9	1734842	1734850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224555
37237	NC_020062	ACC	2	6	1734933	1734938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37238	NC_020062	TCA	2	6	1734941	1734946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37239	NC_020062	TTC	2	6	1735013	1735018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37240	NC_020062	GAG	2	6	1735113	1735118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37241	NC_020062	AGC	2	6	1735197	1735202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37242	NC_020062	ATC	2	6	1735350	1735355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224556
37243	NC_020062	CGT	2	6	1735383	1735388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224556
37244	NC_020062	TGG	2	6	1735411	1735416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224556
37245	NC_020062	ATC	2	6	1735432	1735437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224556
37246	NC_020062	GCGG	2	8	1735463	1735470	0 %	0 %	75 %	25 %	440224556
37247	NC_020062	GGC	2	6	1735472	1735477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224556
37248	NC_020062	CTG	2	6	1735496	1735501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224556
37249	NC_020062	CGG	3	9	1735508	1735516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224556
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37253	NC_020062	AG	3	6	1735702	1735707	50 %	0 %	50 %	0 %	440224556
37254	NC_020062	TC	3	6	1735708	1735713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37255	NC_020062	TC	3	6	1735741	1735746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37256	NC_020062	TC	3	6	1735770	1735775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37257	NC_020062	GCG	2	6	1735776	1735781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37258	NC_020062	AG	3	6	1735809	1735814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37259	NC_020062	GACC	2	8	1735873	1735880	25 %	0 %	25 %	50 %	440224557
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37266	NC_020062	TTCC	2	8	1736337	1736344	0 %	50 %	0 %	50 %	440224557
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37268	NC_020062	CGT	2	6	1736392	1736397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224557
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37278	NC_020062	TC	3	6	1736957	1736962	0 %	50 %	0 %	50 %	440224557
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37282	NC_020062	CG	3	6	1737188	1737193	0 %	0 %	50 %	50 %	440224557
37283	NC_020062	CGG	2	6	1737202	1737207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224557
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37286	NC_020062	AGGA	2	8	1737335	1737342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37287	NC_020062	AAG	2	6	1737498	1737503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224558
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37347	NC_020062	AGCGA	2	10	1739983	1739992	40 %	0 %	40 %	20 %	440224559
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37352	NC_020062	CGG	2	6	1740206	1740211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224559
37353	NC_020062	GTCT	2	8	1740214	1740221	0 %	50 %	25 %	25 %	440224559
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37357	NC_020062	CTTGC	2	10	1740396	1740405	0 %	40 %	20 %	40 %	440224560
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37362	NC_020062	CG	3	6	1740587	1740592	0 %	0 %	50 %	50 %	440224560
37363	NC_020062	GCT	3	9	1740626	1740634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224560
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37469	NC_020062	GTC	2	6	1745449	1745454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224565
37470	NC_020062	GA	3	6	1745456	1745461	50 %	0 %	50 %	0 %	440224565
37471	NC_020062	GCG	2	6	1745641	1745646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224565
37472	NC_020062	CG	3	6	1745660	1745665	0 %	0 %	50 %	50 %	440224565
37473	NC_020062	CGCC	2	8	1745750	1745757	0 %	0 %	25 %	75 %	440224566
37474	NC_020062	ACGGC	2	10	1745761	1745770	20 %	0 %	40 %	40 %	440224566
37475	NC_020062	CGC	2	6	1745835	1745840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224566
37476	NC_020062	GC	3	6	1745839	1745844	0 %	0 %	50 %	50 %	440224566
37477	NC_020062	CGG	2	6	1745848	1745853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224566
37478	NC_020062	TCG	2	6	1745896	1745901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224566
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37480	NC_020062	GCC	2	6	1745948	1745953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224566
37481	NC_020062	GATC	2	8	1746008	1746015	25 %	25 %	25 %	25 %	440224566
37482	NC_020062	CAGC	2	8	1746069	1746076	25 %	0 %	25 %	50 %	440224566
37483	NC_020062	CGT	3	9	1746105	1746113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224566
37484	NC_020062	GAT	2	6	1746117	1746122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224566
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37492	NC_020062	CCA	2	6	1746738	1746743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224567
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