MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36502	NC_020062	GAG	2	6	1700792	1700797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224520
36503	NC_020062	GAT	2	6	1700825	1700830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224520
36504	NC_020062	TTG	2	6	1700848	1700853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36505	NC_020062	GCCG	2	8	1700935	1700942	0 %	0 %	50 %	50 %	440224521
36506	NC_020062	CG	3	6	1700970	1700975	0 %	0 %	50 %	50 %	440224521
36507	NC_020062	CAG	2	6	1700993	1700998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224521
36508	NC_020062	GGC	2	6	1701019	1701024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224521
36509	NC_020062	CAC	2	6	1701116	1701121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224521
36510	NC_020062	GAT	2	6	1701218	1701223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224521
36511	NC_020062	AGT	2	6	1701238	1701243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36512	NC_020062	TCG	2	6	1701273	1701278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224522
36513	NC_020062	GCC	2	6	1701339	1701344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224522
36514	NC_020062	TCC	2	6	1701359	1701364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224522
36515	NC_020062	CTG	2	6	1701386	1701391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224522
36516	NC_020062	GGCGT	2	10	1701510	1701519	0 %	20 %	60 %	20 %	440224522
36517	NC_020062	GCA	2	6	1701546	1701551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224522
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36519	NC_020062	GGCGC	2	10	1701620	1701629	0 %	0 %	60 %	40 %	440224522
36520	NC_020062	GCC	2	6	1701701	1701706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224522
36521	NC_020062	GCA	2	6	1701877	1701882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224522
36522	NC_020062	ATGG	2	8	1701895	1701902	25 %	25 %	50 %	0 %	440224522
36523	NC_020062	CTCGTA	2	12	1701998	1702009	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440224522
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36527	NC_020062	GAT	2	6	1702211	1702216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224523
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36532	NC_020062	C	6	6	1702534	1702539	0 %	0 %	0 %	100 %	440224523
36533	NC_020062	GC	3	6	1702558	1702563	0 %	0 %	50 %	50 %	440224523
36534	NC_020062	CCA	2	6	1702675	1702680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224523
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36538	NC_020062	GGAT	2	8	1702931	1702938	25 %	25 %	50 %	0 %	440224524
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36544	NC_020062	CGGC	2	8	1703309	1703316	0 %	0 %	50 %	50 %	440224524
36545	NC_020062	GGC	2	6	1703337	1703342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224524
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36547	NC_020062	GTC	2	6	1703446	1703451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224524
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36551	NC_020062	CGA	2	6	1703713	1703718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224524
36552	NC_020062	TCC	2	6	1703737	1703742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36553	NC_020062	GCGG	2	8	1703777	1703784	0 %	0 %	75 %	25 %	440224525
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36559	NC_020062	CAAG	2	8	1704190	1704197	50 %	0 %	25 %	25 %	440224525
36560	NC_020062	GTA	2	6	1704206	1704211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224525
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36583	NC_020062	CGC	4	12	1705138	1705149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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36602	NC_020062	CG	3	6	1706067	1706072	0 %	0 %	50 %	50 %	440224528
36603	NC_020062	TGA	2	6	1706131	1706136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224528
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36606	NC_020062	CGT	2	6	1706396	1706401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224528
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36616	NC_020062	ATT	2	6	1706762	1706767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36730	NC_020062	GC	3	6	1712450	1712455	0 %	0 %	50 %	50 %	440224534
36731	NC_020062	CGT	2	6	1712523	1712528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224534
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36733	NC_020062	GTC	2	6	1712649	1712654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224534
36734	NC_020062	CGA	2	6	1712665	1712670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224534
36735	NC_020062	GCC	2	6	1712708	1712713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224534
36736	NC_020062	CTT	2	6	1712734	1712739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224534
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36741	NC_020062	ATCA	2	8	1712936	1712943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36742	NC_020062	TAC	2	6	1712993	1712998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224535
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36844	NC_020062	CG	3	6	1717298	1717303	0 %	0 %	50 %	50 %	440224539
36845	NC_020062	CG	3	6	1717334	1717339	0 %	0 %	50 %	50 %	440224539
36846	NC_020062	TCT	2	6	1717361	1717366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224539
36847	NC_020062	GC	4	8	1717385	1717392	0 %	0 %	50 %	50 %	440224539
36848	NC_020062	GGCA	2	8	1717407	1717414	25 %	0 %	50 %	25 %	440224539
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36850	NC_020062	GCT	2	6	1717436	1717441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224539
36851	NC_020062	TCG	2	6	1717450	1717455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224539
36852	NC_020062	GCC	2	6	1717464	1717469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224539
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36951	NC_020062	CGT	2	6	1722270	1722275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224543
36952	NC_020062	GAC	2	6	1722290	1722295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224543
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36954	NC_020062	GAG	2	6	1722391	1722396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36955	NC_020062	ATC	2	6	1722409	1722414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36956	NC_020062	CGG	2	6	1722439	1722444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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36958	NC_020062	ATC	2	6	1722490	1722495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36959	NC_020062	CCA	2	6	1722514	1722519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36960	NC_020062	GCCT	2	8	1722522	1722529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36961	NC_020062	CGC	2	6	1722554	1722559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36962	NC_020062	TC	3	6	1722581	1722586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36963	NC_020062	CCA	2	6	1722587	1722592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36964	NC_020062	CGG	2	6	1722619	1722624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36965	NC_020062	TCC	2	6	1722640	1722645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36966	NC_020062	ATC	2	6	1722677	1722682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224544
36967	NC_020062	TCG	2	6	1722727	1722732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224544
36968	NC_020062	TTC	2	6	1722736	1722741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224544
36969	NC_020062	CAGAG	2	10	1722774	1722783	40 %	0 %	40 %	20 %	440224544
36970	NC_020062	GCC	2	6	1722838	1722843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224544
36971	NC_020062	GCG	2	6	1722844	1722849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224544
36972	NC_020062	CGGG	2	8	1722850	1722857	0 %	0 %	75 %	25 %	440224544
36973	NC_020062	TCG	2	6	1722887	1722892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224544
36974	NC_020062	ATC	2	6	1722924	1722929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224544
36975	NC_020062	GCG	2	6	1723016	1723021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224544
36976	NC_020062	GTA	2	6	1723077	1723082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224544
36977	NC_020062	CGC	2	6	1723089	1723094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224544
36978	NC_020062	GAA	2	6	1723117	1723122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224544
36979	NC_020062	GC	3	6	1723146	1723151	0 %	0 %	50 %	50 %	440224544
36980	NC_020062	GGCA	2	8	1723158	1723165	25 %	0 %	50 %	25 %	440224544
36981	NC_020062	CTT	2	6	1723169	1723174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224544
36982	NC_020062	TAGCCG	2	12	1723258	1723269	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440224544
36983	NC_020062	TTG	2	6	1723273	1723278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224544
36984	NC_020062	TCG	2	6	1723334	1723339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224544
36985	NC_020062	ACC	2	6	1723432	1723437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224544
36986	NC_020062	ACCGAG	2	12	1723443	1723454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224544
36987	NC_020062	ATC	2	6	1723532	1723537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36988	NC_020062	GAA	2	6	1723611	1723616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36989	NC_020062	GCC	2	6	1723740	1723745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224545
36990	NC_020062	A	6	6	1723777	1723782	100 %	0 %	0 %	0 %	440224545
36991	NC_020062	TGA	2	6	1723916	1723921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224545
36992	NC_020062	GCT	2	6	1723974	1723979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224545
36993	NC_020062	ACC	2	6	1723987	1723992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224545
36994	NC_020062	CTG	2	6	1724065	1724070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224545
36995	NC_020062	AG	3	6	1724079	1724084	50 %	0 %	50 %	0 %	440224545
36996	NC_020062	CAGA	2	8	1724103	1724110	50 %	0 %	25 %	25 %	440224545
36997	NC_020062	GGA	2	6	1724159	1724164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224545
36998	NC_020062	ACA	2	6	1724391	1724396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224545
36999	NC_020062	TGA	2	6	1724398	1724403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224545
37000	NC_020062	CGCA	2	8	1724418	1724425	25 %	0 %	25 %	50 %	440224545

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