MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_020062	GCG	2	6	1606931	1606936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224432
34503	NC_020062	TGC	2	6	1606949	1606954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224432
34504	NC_020062	ATC	2	6	1606956	1606961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224432
34505	NC_020062	GAA	2	6	1607003	1607008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224432
34506	NC_020062	GAC	2	6	1607091	1607096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224432
34507	NC_020062	TGC	2	6	1607125	1607130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224432
34508	NC_020062	TGC	2	6	1607140	1607145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224432
34509	NC_020062	AGCGC	2	10	1607172	1607181	20 %	0 %	40 %	40 %	440224432
34510	NC_020062	CGG	2	6	1607198	1607203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224432
34511	NC_020062	ACG	2	6	1607244	1607249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224432
34512	NC_020062	CGCGC	2	10	1607272	1607281	0 %	0 %	40 %	60 %	440224432
34513	NC_020062	GA	3	6	1607341	1607346	50 %	0 %	50 %	0 %	440224432
34514	NC_020062	GGC	2	6	1607405	1607410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224432
34515	NC_020062	AGC	2	6	1607427	1607432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224432
34516	NC_020062	GGCT	2	8	1607490	1607497	0 %	25 %	50 %	25 %	440224432
34517	NC_020062	TCA	2	6	1607517	1607522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224433
34518	NC_020062	GGAT	2	8	1607543	1607550	25 %	25 %	50 %	0 %	440224433
34519	NC_020062	CGA	2	6	1607582	1607587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224433
34520	NC_020062	GC	3	6	1607689	1607694	0 %	0 %	50 %	50 %	440224433
34521	NC_020062	CAC	2	6	1607797	1607802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224433
34522	NC_020062	GC	3	6	1607837	1607842	0 %	0 %	50 %	50 %	440224433
34523	NC_020062	CAG	2	6	1607851	1607856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224433
34524	NC_020062	TTC	2	6	1607857	1607862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224433
34525	NC_020062	TCG	2	6	1607888	1607893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224433
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34528	NC_020062	GC	3	6	1607935	1607940	0 %	0 %	50 %	50 %	440224433
34529	NC_020062	GAA	2	6	1608030	1608035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224433
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34532	NC_020062	CAA	2	6	1608163	1608168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224433
34533	NC_020062	TGCAT	2	10	1608204	1608213	20 %	40 %	20 %	20 %	440224433
34534	NC_020062	GGC	2	6	1608247	1608252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34535	NC_020062	CAT	2	6	1608254	1608259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34536	NC_020062	TGC	2	6	1608286	1608291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34538	NC_020062	CG	3	6	1608377	1608382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34539	NC_020062	CGGA	2	8	1608402	1608409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34540	NC_020062	CCA	2	6	1608419	1608424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34541	NC_020062	CCCG	2	8	1608437	1608444	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34542	NC_020062	GGC	2	6	1608541	1608546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224434
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34550	NC_020062	TCG	2	6	1608944	1608949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34551	NC_020062	CAT	2	6	1608983	1608988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34552	NC_020062	CCG	2	6	1608990	1608995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34553	NC_020062	TGA	2	6	1609145	1609150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34554	NC_020062	CGA	3	9	1609179	1609187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34555	NC_020062	CCG	3	9	1609226	1609234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224435
34556	NC_020062	CTG	2	6	1609243	1609248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224435
34557	NC_020062	GC	3	6	1609358	1609363	0 %	0 %	50 %	50 %	440224435
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34563	NC_020062	GGCG	2	8	1609630	1609637	0 %	0 %	75 %	25 %	440224435
34564	NC_020062	CCTT	2	8	1609658	1609665	0 %	50 %	0 %	50 %	440224435
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34596	NC_020062	GCG	2	6	1611007	1611012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34597	NC_020062	TGA	2	6	1611165	1611170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224436
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34601	NC_020062	GC	3	6	1611357	1611362	0 %	0 %	50 %	50 %	440224436
34602	NC_020062	TGC	2	6	1611363	1611368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224436
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34613	NC_020062	CGC	2	6	1611756	1611761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224436
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34617	NC_020062	TGTGG	2	10	1611848	1611857	0 %	40 %	60 %	0 %	440224436
34618	NC_020062	GGC	2	6	1611865	1611870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224436
34619	NC_020062	GGC	2	6	1611908	1611913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224436
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34637	NC_020062	CGG	2	6	1612404	1612409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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34640	NC_020062	GGA	2	6	1612558	1612563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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34642	NC_020062	GAC	2	6	1612715	1612720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224437
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34686	NC_020062	TAG	2	6	1614901	1614906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34851	NC_020062	GCT	2	6	1621952	1621957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224443
34852	NC_020062	CAGG	2	8	1621976	1621983	25 %	0 %	50 %	25 %	440224443
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34854	NC_020062	TCG	2	6	1622158	1622163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224443
34855	NC_020062	GATC	2	8	1622199	1622206	25 %	25 %	25 %	25 %	440224443
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34862	NC_020062	TGC	2	6	1622734	1622739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224443
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34957	NC_020062	CGGT	2	8	1627585	1627592	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34958	NC_020062	CAT	2	6	1627629	1627634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34960	NC_020062	ATC	2	6	1627654	1627659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34984	NC_020062	AGGCA	2	10	1628858	1628867	40 %	0 %	40 %	20 %	440224450
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34988	NC_020062	GTC	2	6	1629024	1629029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224450
34989	NC_020062	TGG	2	6	1629039	1629044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224450
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34991	NC_020062	CCG	2	6	1629127	1629132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224450
34992	NC_020062	CGT	2	6	1629239	1629244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224450
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