MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33502	NC_020062	GAT	2	6	1562194	1562199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224392
33503	NC_020062	GAA	2	6	1562204	1562209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224392
33504	NC_020062	GCC	2	6	1562247	1562252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224392
33505	NC_020062	CGGC	2	8	1562304	1562311	0 %	0 %	50 %	50 %	440224392
33506	NC_020062	CGT	2	6	1562317	1562322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224392
33507	NC_020062	TTC	2	6	1562405	1562410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224392
33508	NC_020062	TCA	2	6	1562424	1562429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224392
33509	NC_020062	TGT	2	6	1562445	1562450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224392
33510	NC_020062	ATC	2	6	1562548	1562553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224392
33511	NC_020062	GTC	2	6	1562575	1562580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224392
33512	NC_020062	AGC	2	6	1562582	1562587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224392
33513	NC_020062	CCG	2	6	1562633	1562638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224392
33514	NC_020062	TTG	2	6	1562651	1562656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224392
33515	NC_020062	CCA	2	6	1562671	1562676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224392
33516	NC_020062	AACC	2	8	1562814	1562821	50 %	0 %	0 %	50 %	440224392
33517	NC_020062	GC	3	6	1562824	1562829	0 %	0 %	50 %	50 %	440224392
33518	NC_020062	GCC	2	6	1562890	1562895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224392
33519	NC_020062	TGA	2	6	1562931	1562936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224392
33520	NC_020062	GGCC	2	8	1562979	1562986	0 %	0 %	50 %	50 %	440224392
33521	NC_020062	GCC	2	6	1563029	1563034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224392
33522	NC_020062	GCCG	2	8	1563084	1563091	0 %	0 %	50 %	50 %	440224392
33523	NC_020062	GCGCAC	2	12	1563126	1563137	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440224393
33524	NC_020062	CCG	2	6	1563145	1563150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224393
33525	NC_020062	GCA	2	6	1563217	1563222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33526	NC_020062	GTCG	2	8	1563257	1563264	0 %	25 %	50 %	25 %	440224393
33527	NC_020062	CGG	2	6	1563281	1563286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224393
33528	NC_020062	AGC	2	6	1563289	1563294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33529	NC_020062	GC	3	6	1563319	1563324	0 %	0 %	50 %	50 %	440224393
33530	NC_020062	CGA	2	6	1563350	1563355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33531	NC_020062	CCA	2	6	1563398	1563403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224393
33532	NC_020062	GC	4	8	1563550	1563557	0 %	0 %	50 %	50 %	440224393
33533	NC_020062	TCG	2	6	1563796	1563801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33534	NC_020062	CGT	2	6	1563836	1563841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33535	NC_020062	GGT	2	6	1563897	1563902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224393
33536	NC_020062	CCAAG	2	10	1563926	1563935	40 %	0 %	20 %	40 %	440224393
33537	NC_020062	CGC	2	6	1563941	1563946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224393
33538	NC_020062	CGC	2	6	1563997	1564002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224393
33539	NC_020062	CCG	2	6	1564012	1564017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224393
33540	NC_020062	TGC	2	6	1564071	1564076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33541	NC_020062	CGC	2	6	1564091	1564096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224393
33542	NC_020062	CTT	3	9	1564107	1564115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224393
33543	NC_020062	CCG	2	6	1564196	1564201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224393
33544	NC_020062	TGC	2	6	1564225	1564230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33545	NC_020062	TCG	2	6	1564297	1564302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33546	NC_020062	CAG	2	6	1564338	1564343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33547	NC_020062	CTG	2	6	1564362	1564367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33548	NC_020062	GCA	2	6	1564376	1564381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33549	NC_020062	GTC	2	6	1564420	1564425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33550	NC_020062	TCG	2	6	1564429	1564434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33551	NC_020062	CGA	2	6	1564550	1564555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33552	NC_020062	GCA	2	6	1564559	1564564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33553	NC_020062	GCT	2	6	1564583	1564588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33554	NC_020062	CTG	2	6	1564594	1564599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33555	NC_020062	TGCG	2	8	1564697	1564704	0 %	25 %	50 %	25 %	440224393
33556	NC_020062	GC	3	6	1564712	1564717	0 %	0 %	50 %	50 %	440224393
33557	NC_020062	GGT	2	6	1564755	1564760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224393
33558	NC_020062	TCCG	2	8	1564790	1564797	0 %	25 %	25 %	50 %	440224393
33559	NC_020062	CGC	3	9	1564806	1564814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224393
33560	NC_020062	GAA	2	6	1564817	1564822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224393
33561	NC_020062	TGA	2	6	1564841	1564846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224393
33562	NC_020062	CGA	2	6	1564871	1564876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33563	NC_020062	GAC	2	6	1564920	1564925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224393
33564	NC_020062	CATA	2	8	1564998	1565005	50 %	25 %	0 %	25 %	440224393
33565	NC_020062	A	7	7	1565100	1565106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33566	NC_020062	AT	3	6	1565124	1565129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33567	NC_020062	CGAG	2	8	1565165	1565172	25 %	0 %	50 %	25 %	440224394
33568	NC_020062	CTT	2	6	1565200	1565205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224394
33569	NC_020062	GCC	2	6	1565255	1565260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224394
33570	NC_020062	GC	3	6	1565280	1565285	0 %	0 %	50 %	50 %	440224394
33571	NC_020062	GCTG	2	8	1565287	1565294	0 %	25 %	50 %	25 %	440224394
33572	NC_020062	GA	3	6	1565310	1565315	50 %	0 %	50 %	0 %	440224394
33573	NC_020062	CGC	2	6	1565337	1565342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224394
33574	NC_020062	TCT	2	6	1565351	1565356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224394
33575	NC_020062	CGA	2	6	1565406	1565411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224394
33576	NC_020062	CCG	2	6	1565463	1565468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224394
33577	NC_020062	GCGCT	2	10	1565605	1565614	0 %	20 %	40 %	40 %	440224394
33578	NC_020062	GCCG	2	8	1565667	1565674	0 %	0 %	50 %	50 %	440224394
33579	NC_020062	CGC	2	6	1565721	1565726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224394
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33582	NC_020062	GCC	2	6	1565790	1565795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224394
33583	NC_020062	CGG	2	6	1565873	1565878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224394
33584	NC_020062	GGT	2	6	1565923	1565928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224394
33585	NC_020062	TTG	2	6	1565936	1565941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224394
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33587	NC_020062	GAT	2	6	1565982	1565987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224394
33588	NC_020062	ACC	2	6	1566028	1566033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224394
33589	NC_020062	CAT	2	6	1566058	1566063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224394
33590	NC_020062	TTG	2	6	1566197	1566202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224394
33591	NC_020062	GA	3	6	1566203	1566208	50 %	0 %	50 %	0 %	440224394
33592	NC_020062	ATA	3	9	1566211	1566219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224394
33593	NC_020062	GTTC	2	8	1566246	1566253	0 %	50 %	25 %	25 %	440224394
33594	NC_020062	GCC	2	6	1566374	1566379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224394
33595	NC_020062	GGC	2	6	1566430	1566435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224394
33596	NC_020062	ATTG	2	8	1566487	1566494	25 %	50 %	25 %	0 %	440224394
33597	NC_020062	ATT	2	6	1566497	1566502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224394
33598	NC_020062	TCG	2	6	1566561	1566566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33599	NC_020062	CAT	2	6	1566614	1566619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33600	NC_020062	GCC	2	6	1566724	1566729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33601	NC_020062	CGA	2	6	1566735	1566740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33602	NC_020062	GC	3	6	1566833	1566838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33603	NC_020062	GCGG	2	8	1566869	1566876	0 %	0 %	75 %	25 %	440224395
33604	NC_020062	GCC	2	6	1566899	1566904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224395
33605	NC_020062	C	6	6	1566913	1566918	0 %	0 %	0 %	100 %	440224395
33606	NC_020062	TCA	2	6	1566978	1566983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224395
33607	NC_020062	AC	3	6	1567015	1567020	50 %	0 %	0 %	50 %	440224395
33608	NC_020062	TCTGCC	2	12	1567025	1567036	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	440224395
33609	NC_020062	CATCGA	2	12	1567074	1567085	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440224395
33610	NC_020062	GAA	2	6	1567162	1567167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224395
33611	NC_020062	TGC	2	6	1567168	1567173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224395
33612	NC_020062	AAG	2	6	1567225	1567230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224395
33613	NC_020062	CCA	2	6	1567237	1567242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224395
33614	NC_020062	GCTCT	2	10	1567342	1567351	0 %	40 %	20 %	40 %	440224395
33615	NC_020062	GAT	2	6	1567363	1567368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224395
33616	NC_020062	GAT	2	6	1567423	1567428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224395
33617	NC_020062	GAT	2	6	1567432	1567437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224395
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33729	NC_020062	GCT	2	6	1573139	1573144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224400
33730	NC_020062	ACG	2	6	1573327	1573332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224400
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33733	NC_020062	GGC	2	6	1573435	1573440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224400
33734	NC_020062	GAG	2	6	1573505	1573510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224401
33735	NC_020062	GAC	2	6	1573559	1573564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224401
33736	NC_020062	CGA	2	6	1573570	1573575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224401
33737	NC_020062	TCG	2	6	1573611	1573616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224401
33738	NC_020062	GTC	2	6	1573619	1573624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224401
33739	NC_020062	CGA	2	6	1573684	1573689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224401
33740	NC_020062	CAT	2	6	1573745	1573750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224401
33741	NC_020062	TCG	2	6	1573810	1573815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224401
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33768	NC_020062	CGAC	2	8	1574936	1574943	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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33770	NC_020062	CGG	2	6	1575041	1575046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33771	NC_020062	AAG	2	6	1575094	1575099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33772	NC_020062	GC	3	6	1575115	1575120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33773	NC_020062	GTA	2	6	1575161	1575166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224403
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33775	NC_020062	TCG	2	6	1575232	1575237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224403
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33843	NC_020062	CGCC	2	8	1578418	1578425	0 %	0 %	25 %	75 %	440224404
33844	NC_020062	GC	3	6	1578441	1578446	0 %	0 %	50 %	50 %	440224404
33845	NC_020062	GCC	2	6	1578485	1578490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224404
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33958	NC_020062	ACG	2	6	1582742	1582747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224409
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33962	NC_020062	TCT	2	6	1582875	1582880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224409
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