MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31504	NC_020062	GC	3	6	1471877	1471882	0 %	0 %	50 %	50 %	440224313
31505	NC_020062	GAG	2	6	1471912	1471917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224313
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31510	NC_020062	CAG	2	6	1472053	1472058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224313
31511	NC_020062	GAT	2	6	1472062	1472067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224313
31512	NC_020062	CGA	2	6	1472086	1472091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224313
31513	NC_020062	GAC	3	9	1472107	1472115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224313
31514	NC_020062	CCGG	2	8	1472162	1472169	0 %	0 %	50 %	50 %	440224313
31515	NC_020062	TGA	2	6	1472211	1472216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224313
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31523	NC_020062	ACCGA	2	10	1472803	1472812	40 %	0 %	20 %	40 %	440224314
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31532	NC_020062	GCCG	2	8	1473156	1473163	0 %	0 %	50 %	50 %	440224314
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31539	NC_020062	GC	3	6	1473577	1473582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31540	NC_020062	CGT	2	6	1473758	1473763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224316
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31614	NC_020062	A	6	6	1477395	1477400	100 %	0 %	0 %	0 %	440224319
31615	NC_020062	GCG	3	9	1477401	1477409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224319
31616	NC_020062	TC	3	6	1477437	1477442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31617	NC_020062	TGGAT	2	10	1477446	1477455	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31618	NC_020062	AGCC	2	8	1477470	1477477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31619	NC_020062	GCC	2	6	1477535	1477540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31620	NC_020062	CCAG	2	8	1477686	1477693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31621	NC_020062	CGT	2	6	1477708	1477713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31622	NC_020062	CTG	2	6	1477732	1477737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31734	NC_020062	CGTGGG	2	12	1482911	1482922	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	440224324
31735	NC_020062	CCG	2	6	1482954	1482959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224324
31736	NC_020062	CGG	2	6	1482965	1482970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224324
31737	NC_020062	GCCG	2	8	1483029	1483036	0 %	0 %	50 %	50 %	440224324
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31739	NC_020062	GCC	2	6	1483069	1483074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224324
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31742	NC_020062	TGA	2	6	1483406	1483411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224324
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31746	NC_020062	GA	4	8	1483681	1483688	50 %	0 %	50 %	0 %	440224324
31747	NC_020062	ATCG	2	8	1483740	1483747	25 %	25 %	25 %	25 %	440224324
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31757	NC_020062	CTG	3	9	1484057	1484065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224325
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31802	NC_020062	CCGT	2	8	1486005	1486012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31803	NC_020062	TCA	2	6	1486092	1486097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224328
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31832	NC_020062	ATA	2	6	1487996	1488001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31833	NC_020062	ATG	2	6	1488053	1488058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31834	NC_020062	ATC	2	6	1488112	1488117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224330
31835	NC_020062	CGA	2	6	1488173	1488178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224330
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31837	NC_020062	CGT	2	6	1488249	1488254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224330
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31842	NC_020062	GCCC	2	8	1488427	1488434	0 %	0 %	25 %	75 %	440224330
31843	NC_020062	GAT	2	6	1488453	1488458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224330
31844	NC_020062	ATC	2	6	1488471	1488476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224330
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31846	NC_020062	CCG	2	6	1488773	1488778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224331
31847	NC_020062	GAA	2	6	1488896	1488901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224331
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31849	NC_020062	GGC	2	6	1489028	1489033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224331
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31935	NC_020062	TC	3	6	1493570	1493575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31936	NC_020062	CAT	2	6	1493589	1493594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224335
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31966	NC_020062	TGC	2	6	1495452	1495457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224336
31967	NC_020062	CTG	2	6	1495498	1495503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224336
31968	NC_020062	GCG	2	6	1495504	1495509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224336
31969	NC_020062	TGA	2	6	1495515	1495520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224336
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31973	NC_020062	CG	3	6	1495713	1495718	0 %	0 %	50 %	50 %	440224336
31974	NC_020062	CCGAA	2	10	1495740	1495749	40 %	0 %	20 %	40 %	440224336
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31981	NC_020062	CAG	2	6	1496014	1496019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224336
31982	NC_020062	GAC	2	6	1496041	1496046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224336
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31984	NC_020062	TCCT	2	8	1496109	1496116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31985	NC_020062	GT	3	6	1496170	1496175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31986	NC_020062	CTT	2	6	1496177	1496182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31992	NC_020062	CTG	2	6	1496376	1496381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224337
31993	NC_020062	TCA	2	6	1496404	1496409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224337
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31996	NC_020062	TCGA	2	8	1496478	1496485	25 %	25 %	25 %	25 %	440224337
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31999	NC_020062	CG	3	6	1496557	1496562	0 %	0 %	50 %	50 %	440224337
32000	NC_020062	TCG	2	6	1496563	1496568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224337

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