MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29501	NC_020062	GATC	2	8	1379189	1379196	25 %	25 %	25 %	25 %	440224229
29502	NC_020062	GGCG	2	8	1379210	1379217	0 %	0 %	75 %	25 %	440224229
29503	NC_020062	AAG	2	6	1379223	1379228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224229
29504	NC_020062	GCT	2	6	1379232	1379237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224229
29505	NC_020062	CCG	2	6	1379293	1379298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224229
29506	NC_020062	GACC	2	8	1379379	1379386	25 %	0 %	25 %	50 %	440224230
29507	NC_020062	GAT	2	6	1379452	1379457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224230
29508	NC_020062	CTT	2	6	1379499	1379504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224230
29509	NC_020062	GAGC	2	8	1379589	1379596	25 %	0 %	50 %	25 %	440224231
29510	NC_020062	CGG	2	6	1379616	1379621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224231
29511	NC_020062	ACG	2	6	1379656	1379661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224231
29512	NC_020062	TCCG	2	8	1379712	1379719	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29513	NC_020062	CTG	2	6	1379800	1379805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29514	NC_020062	GAA	2	6	1379834	1379839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29515	NC_020062	CATGC	2	10	1379969	1379978	20 %	20 %	20 %	40 %	440224232
29516	NC_020062	CAT	2	6	1380013	1380018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224232
29517	NC_020062	TCC	2	6	1380041	1380046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224232
29518	NC_020062	GTC	2	6	1380211	1380216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224232
29519	NC_020062	GAT	2	6	1380334	1380339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224232
29520	NC_020062	TGC	2	6	1380356	1380361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224232
29521	NC_020062	ACC	2	6	1380412	1380417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224232
29522	NC_020062	TCG	2	6	1380578	1380583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224232
29523	NC_020062	GCT	2	6	1380651	1380656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224232
29524	NC_020062	GC	3	6	1380686	1380691	0 %	0 %	50 %	50 %	440224232
29525	NC_020062	ACT	2	6	1380858	1380863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29526	NC_020062	GAA	2	6	1380881	1380886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29527	NC_020062	AAG	2	6	1380887	1380892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29528	NC_020062	GAT	2	6	1380900	1380905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29529	NC_020062	CAA	2	6	1380910	1380915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29530	NC_020062	CGG	2	6	1380945	1380950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29531	NC_020062	GC	3	6	1380969	1380974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29532	NC_020062	T	7	7	1381182	1381188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29533	NC_020062	CA	4	8	1381228	1381235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29534	NC_020062	CAAAA	2	10	1381307	1381316	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29535	NC_020062	ATA	2	6	1381335	1381340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29536	NC_020062	ACG	2	6	1381369	1381374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29537	NC_020062	GCA	2	6	1381410	1381415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29538	NC_020062	TGCC	2	8	1381416	1381423	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29539	NC_020062	TTC	2	6	1381593	1381598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224233
29540	NC_020062	CGG	3	9	1381655	1381663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224233
29541	NC_020062	CCG	2	6	1381682	1381687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224233
29542	NC_020062	CTG	2	6	1381720	1381725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224233
29543	NC_020062	CAA	2	6	1381770	1381775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224233
29544	NC_020062	TCGA	2	8	1381822	1381829	25 %	25 %	25 %	25 %	440224233
29545	NC_020062	GTCG	2	8	1381848	1381855	0 %	25 %	50 %	25 %	440224233
29546	NC_020062	ACGC	2	8	1381885	1381892	25 %	0 %	25 %	50 %	440224233
29547	NC_020062	CGA	2	6	1381982	1381987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224233
29548	NC_020062	ACC	2	6	1382008	1382013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224233
29549	NC_020062	CCTT	2	8	1382036	1382043	0 %	50 %	0 %	50 %	440224233
29550	NC_020062	GCCG	2	8	1382115	1382122	0 %	0 %	50 %	50 %	440224233
29551	NC_020062	TCG	2	6	1382180	1382185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224233
29552	NC_020062	TGCGA	2	10	1382282	1382291	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29553	NC_020062	CATT	2	8	1382409	1382416	25 %	50 %	0 %	25 %	440224234
29554	NC_020062	CAT	2	6	1382472	1382477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224234
29555	NC_020062	GAT	2	6	1382511	1382516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224234
29556	NC_020062	TGG	2	6	1382527	1382532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224234
29557	NC_020062	CA	3	6	1382559	1382564	50 %	0 %	0 %	50 %	440224234
29558	NC_020062	TGC	2	6	1382630	1382635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224234
29559	NC_020062	CCG	2	6	1382675	1382680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224234
29560	NC_020062	CCATT	2	10	1382747	1382756	20 %	40 %	0 %	40 %	440224234
29561	NC_020062	TA	3	6	1382770	1382775	50 %	50 %	0 %	0 %	440224234
29562	NC_020062	CGGC	2	8	1382777	1382784	0 %	0 %	50 %	50 %	440224234
29563	NC_020062	CTG	2	6	1382809	1382814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224234
29564	NC_020062	CCT	2	6	1382822	1382827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224234
29565	NC_020062	GGC	2	6	1382923	1382928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224234
29566	NC_020062	CTG	2	6	1383064	1383069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224234
29567	NC_020062	TCG	2	6	1383110	1383115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224234
29568	NC_020062	GGCT	2	8	1383118	1383125	0 %	25 %	50 %	25 %	440224234
29569	NC_020062	GTTCCG	2	12	1383190	1383201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224234
29570	NC_020062	GGC	2	6	1383229	1383234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224234
29571	NC_020062	CGA	2	6	1383321	1383326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224234
29572	NC_020062	CCG	2	6	1383353	1383358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224234
29573	NC_020062	CGTCAT	2	12	1383378	1383389	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440224234
29574	NC_020062	CG	3	6	1383462	1383467	0 %	0 %	50 %	50 %	440224234
29575	NC_020062	CGG	2	6	1383510	1383515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224234
29576	NC_020062	AGC	2	6	1383528	1383533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224234
29577	NC_020062	AAG	2	6	1383550	1383555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224234
29578	NC_020062	GCA	2	6	1383607	1383612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224234
29579	NC_020062	GC	3	6	1383636	1383641	0 %	0 %	50 %	50 %	440224234
29580	NC_020062	ATC	2	6	1383694	1383699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224234
29581	NC_020062	CGA	2	6	1383722	1383727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224234
29582	NC_020062	ATC	2	6	1383739	1383744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29583	NC_020062	CAACG	2	10	1383879	1383888	40 %	0 %	20 %	40 %	440224235
29584	NC_020062	CGGTGC	2	12	1383890	1383901	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440224235
29585	NC_020062	CGC	2	6	1383959	1383964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224235
29586	NC_020062	CCG	2	6	1383984	1383989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224235
29587	NC_020062	GAT	2	6	1383990	1383995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224235
29588	NC_020062	CCG	2	6	1384010	1384015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224235
29589	NC_020062	GAG	2	6	1384054	1384059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224235
29590	NC_020062	ATT	2	6	1384120	1384125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224235
29591	NC_020062	CG	3	6	1384213	1384218	0 %	0 %	50 %	50 %	440224236
29592	NC_020062	TCG	2	6	1384339	1384344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224236
29593	NC_020062	GC	3	6	1384353	1384358	0 %	0 %	50 %	50 %	440224236
29594	NC_020062	GGCC	2	8	1384378	1384385	0 %	0 %	50 %	50 %	440224236
29595	NC_020062	TGT	2	6	1384574	1384579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224236
29596	NC_020062	GTT	2	6	1384636	1384641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29597	NC_020062	TC	3	6	1384659	1384664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29598	NC_020062	GC	3	6	1384769	1384774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29599	NC_020062	CTG	2	6	1384834	1384839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29600	NC_020062	GC	3	6	1385044	1385049	0 %	0 %	50 %	50 %	440224237
29601	NC_020062	TC	3	6	1385186	1385191	0 %	50 %	0 %	50 %	440224237
29602	NC_020062	GGT	2	6	1385253	1385258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224237
29603	NC_020062	GAC	2	6	1385259	1385264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224237
29604	NC_020062	CGC	2	6	1385319	1385324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224237
29605	NC_020062	AATC	2	8	1385354	1385361	50 %	25 %	0 %	25 %	440224237
29606	NC_020062	TCG	2	6	1385428	1385433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224237
29607	NC_020062	TTG	2	6	1385444	1385449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224237
29608	NC_020062	CGGC	2	8	1385454	1385461	0 %	0 %	50 %	50 %	440224237
29609	NC_020062	CGCCC	2	10	1385543	1385552	0 %	0 %	20 %	80 %	440224237
29610	NC_020062	CTA	2	6	1385559	1385564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29611	NC_020062	CGCC	2	8	1385584	1385591	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29612	NC_020062	ACC	2	6	1385615	1385620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29613	NC_020062	GGA	2	6	1385670	1385675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29614	NC_020062	GAT	2	6	1385696	1385701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29615	NC_020062	TGA	2	6	1385784	1385789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29616	NC_020062	ACC	2	6	1385913	1385918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29617	NC_020062	GC	3	6	1385942	1385947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29618	NC_020062	CGA	2	6	1386020	1386025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29619	NC_020062	GC	3	6	1386083	1386088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29620	NC_020062	CGA	3	9	1386112	1386120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29621	NC_020062	CGG	2	6	1386129	1386134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29622	NC_020062	CGA	2	6	1386157	1386162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29623	NC_020062	ACAG	2	8	1386228	1386235	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29624	NC_020062	ATA	2	6	1386242	1386247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29715	NC_020062	AAGC	2	8	1390595	1390602	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29716	NC_020062	CGGC	2	8	1390690	1390697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29717	NC_020062	TTCAG	2	10	1390733	1390742	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29718	NC_020062	CTGCG	2	10	1390831	1390840	0 %	20 %	40 %	40 %	440224243
29719	NC_020062	ATTT	2	8	1390841	1390848	25 %	75 %	0 %	0 %	440224243
29720	NC_020062	AGC	2	6	1390875	1390880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224243
29721	NC_020062	GA	3	6	1390897	1390902	50 %	0 %	50 %	0 %	440224243
29722	NC_020062	GCG	2	6	1390909	1390914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224243
29723	NC_020062	AGCGCG	2	12	1390995	1391006	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440224243
29724	NC_020062	AAAC	2	8	1391054	1391061	75 %	0 %	0 %	25 %	440224243
29725	NC_020062	CG	3	6	1391140	1391145	0 %	0 %	50 %	50 %	440224243
29726	NC_020062	GCA	2	6	1391193	1391198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224243
29727	NC_020062	GTT	2	6	1391210	1391215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224243
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29729	NC_020062	CG	3	6	1391352	1391357	0 %	0 %	50 %	50 %	440224243
29730	NC_020062	T	6	6	1391429	1391434	0 %	100 %	0 %	0 %	440224243
29731	NC_020062	CAA	2	6	1391443	1391448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224243
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29733	NC_020062	CGG	2	6	1391535	1391540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224243
29734	NC_020062	TGC	2	6	1391579	1391584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224243
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29971	NC_020062	CCA	2	6	1403913	1403918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224254
29972	NC_020062	ACC	2	6	1403922	1403927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224254
29973	NC_020062	GCC	2	6	1403984	1403989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224254
29974	NC_020062	CCG	2	6	1404025	1404030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224254
29975	NC_020062	GAA	2	6	1404035	1404040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224254
29976	NC_020062	CG	3	6	1404047	1404052	0 %	0 %	50 %	50 %	440224254
29977	NC_020062	CAA	2	6	1404109	1404114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224254
29978	NC_020062	GGC	2	6	1404164	1404169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224254
29979	NC_020062	TCG	2	6	1404170	1404175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224254
29980	NC_020062	CG	4	8	1404181	1404188	0 %	0 %	50 %	50 %	440224254
29981	NC_020062	GGC	2	6	1404193	1404198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224254
29982	NC_020062	GC	3	6	1404197	1404202	0 %	0 %	50 %	50 %	440224254
29983	NC_020062	AC	3	6	1404231	1404236	50 %	0 %	0 %	50 %	440224254
29984	NC_020062	ATC	2	6	1404371	1404376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224254
29985	NC_020062	GAAGGC	2	12	1404446	1404457	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	440224254
29986	NC_020062	TCC	2	6	1404470	1404475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224254
29987	NC_020062	CGT	2	6	1404550	1404555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224254
29988	NC_020062	TCC	2	6	1404585	1404590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224254
29989	NC_020062	GCG	2	6	1404665	1404670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224254
29990	NC_020062	GA	3	6	1404709	1404714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29991	NC_020062	GCC	2	6	1404720	1404725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29992	NC_020062	CCT	2	6	1404785	1404790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29993	NC_020062	CCT	2	6	1404873	1404878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29994	NC_020062	TGG	2	6	1404928	1404933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224255
29995	NC_020062	TTGC	2	8	1404963	1404970	0 %	50 %	25 %	25 %	440224255
29996	NC_020062	CGG	2	6	1404995	1405000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224255
29997	NC_020062	CAT	2	6	1405055	1405060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224255
29998	NC_020062	GCG	2	6	1405105	1405110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224255
29999	NC_020062	CGG	2	6	1405142	1405147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224255
30000	NC_020062	GTC	2	6	1405251	1405256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224255

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