MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_020062	GCA	2	6	1287467	1287472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224149
27502	NC_020062	CTGCCT	2	12	1287497	1287508	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	440224149
27503	NC_020062	CGGA	2	8	1287648	1287655	25 %	0 %	50 %	25 %	440224149
27504	NC_020062	TGT	2	6	1287686	1287691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224149
27505	NC_020062	TC	3	6	1287702	1287707	0 %	50 %	0 %	50 %	440224149
27506	NC_020062	CGA	2	6	1287717	1287722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224149
27507	NC_020062	GGC	2	6	1287853	1287858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224149
27508	NC_020062	GTT	2	6	1287882	1287887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224149
27509	NC_020062	CGC	2	6	1287928	1287933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224149
27510	NC_020062	CG	3	6	1287949	1287954	0 %	0 %	50 %	50 %	440224149
27511	NC_020062	CGA	2	6	1287957	1287962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224149
27512	NC_020062	GGTC	2	8	1287999	1288006	0 %	25 %	50 %	25 %	440224149
27513	NC_020062	GAG	2	6	1288030	1288035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224149
27514	NC_020062	GCG	2	6	1288064	1288069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224149
27515	NC_020062	TCT	2	6	1288095	1288100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224149
27516	NC_020062	ATC	2	6	1288117	1288122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224149
27517	NC_020062	TGA	2	6	1288149	1288154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224149
27518	NC_020062	GAT	2	6	1288170	1288175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224149
27519	NC_020062	GAT	2	6	1288179	1288184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224149
27520	NC_020062	GCC	2	6	1288274	1288279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224149
27521	NC_020062	CAC	2	6	1288485	1288490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27522	NC_020062	CTTG	2	8	1288603	1288610	0 %	50 %	25 %	25 %	440224150
27523	NC_020062	TTC	2	6	1288611	1288616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224150
27524	NC_020062	TCG	2	6	1288632	1288637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224150
27525	NC_020062	TTC	2	6	1288695	1288700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224150
27526	NC_020062	GGT	2	6	1288702	1288707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224150
27527	NC_020062	TTG	2	6	1288748	1288753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224150
27528	NC_020062	GCC	2	6	1288781	1288786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224150
27529	NC_020062	AAT	2	6	1289009	1289014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224150
27530	NC_020062	CCG	2	6	1289043	1289048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224150
27531	NC_020062	CG	3	6	1289107	1289112	0 %	0 %	50 %	50 %	440224150
27532	NC_020062	TCT	2	6	1289172	1289177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224150
27533	NC_020062	GGC	2	6	1289309	1289314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224150
27534	NC_020062	AC	3	6	1289344	1289349	50 %	0 %	0 %	50 %	440224150
27535	NC_020062	AT	3	6	1289390	1289395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27536	NC_020062	AGC	2	6	1289431	1289436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27537	NC_020062	ATG	2	6	1289473	1289478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27538	NC_020062	GAA	2	6	1289527	1289532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27539	NC_020062	GC	4	8	1289541	1289548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27540	NC_020062	ATT	2	6	1289660	1289665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224151
27541	NC_020062	TGG	2	6	1289669	1289674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224151
27542	NC_020062	GCG	2	6	1289695	1289700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224151
27543	NC_020062	GTTCC	2	10	1289705	1289714	0 %	40 %	20 %	40 %	440224151
27544	NC_020062	ACG	2	6	1289725	1289730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224151
27545	NC_020062	GC	3	6	1289737	1289742	0 %	0 %	50 %	50 %	440224151
27546	NC_020062	GAA	2	6	1289749	1289754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224151
27547	NC_020062	GGT	2	6	1289757	1289762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224151
27548	NC_020062	GC	3	6	1289765	1289770	0 %	0 %	50 %	50 %	440224151
27549	NC_020062	GC	4	8	1289772	1289779	0 %	0 %	50 %	50 %	440224151
27550	NC_020062	GC	3	6	1289877	1289882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27551	NC_020062	CAT	2	6	1289928	1289933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224152
27552	NC_020062	GCA	2	6	1289972	1289977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224152
27553	NC_020062	CCG	2	6	1289978	1289983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224152
27554	NC_020062	GAA	2	6	1290052	1290057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224152
27555	NC_020062	TGA	2	6	1290147	1290152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224152
27556	NC_020062	CAA	2	6	1290189	1290194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224152
27557	NC_020062	TTC	2	6	1290253	1290258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224152
27558	NC_020062	CGCC	2	8	1290288	1290295	0 %	0 %	25 %	75 %	440224152
27559	NC_020062	ATC	2	6	1290334	1290339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224152
27560	NC_020062	GC	3	6	1290421	1290426	0 %	0 %	50 %	50 %	440224152
27561	NC_020062	CG	3	6	1290494	1290499	0 %	0 %	50 %	50 %	440224152
27562	NC_020062	CGT	2	6	1290501	1290506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224152
27563	NC_020062	TCG	2	6	1290512	1290517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224152
27564	NC_020062	GGAA	2	8	1290534	1290541	50 %	0 %	50 %	0 %	440224152
27565	NC_020062	TTC	2	6	1290568	1290573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224152
27566	NC_020062	GAA	2	6	1290619	1290624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224152
27567	NC_020062	GCA	2	6	1290679	1290684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224152
27568	NC_020062	GGC	2	6	1290697	1290702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224152
27569	NC_020062	GTG	2	6	1290703	1290708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224152
27570	NC_020062	ACGA	2	8	1290737	1290744	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27571	NC_020062	CGG	2	6	1290749	1290754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27572	NC_020062	CCA	2	6	1290794	1290799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224153
27573	NC_020062	TTC	2	6	1290883	1290888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224153
27574	NC_020062	TCA	2	6	1290940	1290945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224153
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27576	NC_020062	CGGG	2	8	1290988	1290995	0 %	0 %	75 %	25 %	440224153
27577	NC_020062	TCG	2	6	1291019	1291024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224153
27578	NC_020062	CTG	2	6	1291033	1291038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224153
27579	NC_020062	CAG	2	6	1291042	1291047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224153
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27583	NC_020062	GAC	2	6	1291309	1291314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224153
27584	NC_020062	AGC	2	6	1291373	1291378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224153
27585	NC_020062	CGC	2	6	1291386	1291391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224153
27586	NC_020062	CAGA	2	8	1291454	1291461	50 %	0 %	25 %	25 %	440224153
27587	NC_020062	GCAA	2	8	1291525	1291532	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27588	NC_020062	CGG	2	6	1291548	1291553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27589	NC_020062	GAT	2	6	1291627	1291632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224154
27590	NC_020062	GACC	2	8	1291651	1291658	25 %	0 %	25 %	50 %	440224154
27591	NC_020062	TGG	2	6	1291737	1291742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224154
27592	NC_020062	CTC	2	6	1291766	1291771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224154
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27596	NC_020062	GCC	2	6	1291886	1291891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224154
27597	NC_020062	ATGG	2	8	1291993	1292000	25 %	25 %	50 %	0 %	440224154
27598	NC_020062	CCG	2	6	1292016	1292021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224154
27599	NC_020062	CG	3	6	1292042	1292047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27600	NC_020062	GCGG	2	8	1292053	1292060	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27601	NC_020062	AGG	2	6	1292162	1292167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27602	NC_020062	TGA	2	6	1292234	1292239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27603	NC_020062	CCTT	2	8	1292247	1292254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27604	NC_020062	GTA	2	6	1292272	1292277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27605	NC_020062	AAG	2	6	1292298	1292303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224155
27606	NC_020062	GC	3	6	1292317	1292322	0 %	0 %	50 %	50 %	440224155
27607	NC_020062	CGG	2	6	1292339	1292344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224155
27608	NC_020062	GC	3	6	1292367	1292372	0 %	0 %	50 %	50 %	440224155
27609	NC_020062	CGCT	2	8	1292376	1292383	0 %	25 %	25 %	50 %	440224155
27610	NC_020062	TCT	2	6	1292392	1292397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224155
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27612	NC_020062	ATC	2	6	1292549	1292554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224155
27613	NC_020062	GC	4	8	1292596	1292603	0 %	0 %	50 %	50 %	440224155
27614	NC_020062	AGCG	2	8	1292648	1292655	25 %	0 %	50 %	25 %	440224155
27615	NC_020062	TGA	2	6	1292701	1292706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224155
27616	NC_020062	TCT	2	6	1292758	1292763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224156
27617	NC_020062	TCG	2	6	1292785	1292790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224156
27618	NC_020062	TCA	2	6	1292819	1292824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224156
27619	NC_020062	TCG	2	6	1292839	1292844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224156
27620	NC_020062	CTG	2	6	1292883	1292888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224156
27621	NC_020062	TCG	2	6	1292907	1292912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224156
27622	NC_020062	AC	3	6	1292913	1292918	50 %	0 %	0 %	50 %	440224156
27623	NC_020062	TCA	2	6	1292986	1292991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224156
27624	NC_020062	CGA	2	6	1293000	1293005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224156
27625	NC_020062	GCC	2	6	1293072	1293077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224156
27626	NC_020062	GGC	2	6	1293101	1293106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224156
27627	NC_020062	CGG	2	6	1293125	1293130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224156
27628	NC_020062	GAC	2	6	1293135	1293140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224156
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27630	NC_020062	CAT	2	6	1293174	1293179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224156
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27633	NC_020062	GGC	2	6	1293271	1293276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224156
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27635	NC_020062	ATG	2	6	1293553	1293558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224156
27636	NC_020062	TGA	2	6	1293584	1293589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224156
27637	NC_020062	CGG	2	6	1293629	1293634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224156
27638	NC_020062	CGG	2	6	1293695	1293700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224156
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27641	NC_020062	TGGC	2	8	1293755	1293762	0 %	25 %	50 %	25 %	440224156
27642	NC_020062	TCA	2	6	1293776	1293781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224156
27643	NC_020062	CGC	2	6	1293798	1293803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224156
27644	NC_020062	TCACC	2	10	1293842	1293851	20 %	20 %	0 %	60 %	440224156
27645	NC_020062	AAC	2	6	1293882	1293887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224156
27646	NC_020062	TCG	2	6	1293898	1293903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224156
27647	NC_020062	TGCT	2	8	1293958	1293965	0 %	50 %	25 %	25 %	440224156
27648	NC_020062	CCG	2	6	1293970	1293975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224156
27649	NC_020062	GATC	2	8	1293996	1294003	25 %	25 %	25 %	25 %	440224156
27650	NC_020062	AAT	2	6	1294057	1294062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224156
27651	NC_020062	CT	3	6	1294210	1294215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27652	NC_020062	CAT	2	6	1294229	1294234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224157
27653	NC_020062	TGA	2	6	1294293	1294298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224157
27654	NC_020062	GT	3	6	1294354	1294359	0 %	50 %	50 %	0 %	440224157
27655	NC_020062	TG	3	6	1294400	1294405	0 %	50 %	50 %	0 %	440224157
27656	NC_020062	CGA	2	6	1294446	1294451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224157
27657	NC_020062	TTC	2	6	1294462	1294467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224157
27658	NC_020062	CG	3	6	1294477	1294482	0 %	0 %	50 %	50 %	440224157
27659	NC_020062	CGGC	2	8	1294584	1294591	0 %	0 %	50 %	50 %	440224157
27660	NC_020062	CG	3	6	1294643	1294648	0 %	0 %	50 %	50 %	440224157
27661	NC_020062	GC	3	6	1294705	1294710	0 %	0 %	50 %	50 %	440224157
27662	NC_020062	CGG	3	9	1294743	1294751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224157
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27668	NC_020062	CCCTT	2	10	1294915	1294924	0 %	40 %	0 %	60 %	440224157
27669	NC_020062	C	6	6	1294975	1294980	0 %	0 %	0 %	100 %	440224157
27670	NC_020062	GCG	2	6	1295006	1295011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224157
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27672	NC_020062	GGCC	2	8	1295115	1295122	0 %	0 %	50 %	50 %	440224157
27673	NC_020062	CAG	2	6	1295210	1295215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224158
27674	NC_020062	TCC	2	6	1295223	1295228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224158
27675	NC_020062	GAG	2	6	1295234	1295239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224158
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27680	NC_020062	TCG	2	6	1295370	1295375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224158
27681	NC_020062	GCT	2	6	1295425	1295430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224158
27682	NC_020062	CGC	2	6	1295434	1295439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224158
27683	NC_020062	GCA	2	6	1295473	1295478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224158
27684	NC_020062	TC	3	6	1295637	1295642	0 %	50 %	0 %	50 %	440224158
27685	NC_020062	CGTC	2	8	1295647	1295654	0 %	25 %	25 %	50 %	440224158
27686	NC_020062	AG	3	6	1295660	1295665	50 %	0 %	50 %	0 %	440224158
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27690	NC_020062	CAA	2	6	1295889	1295894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224159
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27692	NC_020062	CGAG	2	8	1295966	1295973	25 %	0 %	50 %	25 %	440224159
27693	NC_020062	CGC	2	6	1296053	1296058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224159
27694	NC_020062	TGA	2	6	1296059	1296064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224159
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27696	NC_020062	GGC	2	6	1296087	1296092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224159
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27699	NC_020062	GCC	2	6	1296178	1296183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224159
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27703	NC_020062	TGG	2	6	1296557	1296562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224159
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27707	NC_020062	GC	3	6	1296718	1296723	0 %	0 %	50 %	50 %	440224159
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27710	NC_020062	CGG	2	6	1296857	1296862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224159
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27718	NC_020062	GTCA	2	8	1297121	1297128	25 %	25 %	25 %	25 %	440224160
27719	NC_020062	GC	3	6	1297156	1297161	0 %	0 %	50 %	50 %	440224160
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27721	NC_020062	TCG	2	6	1297228	1297233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224160
27722	NC_020062	AGC	2	6	1297254	1297259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224160
27723	NC_020062	GTC	2	6	1297260	1297265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224160
27724	NC_020062	GGC	2	6	1297274	1297279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224160
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27726	NC_020062	CGA	2	6	1297378	1297383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224160
27727	NC_020062	CAAA	2	8	1297444	1297451	75 %	0 %	0 %	25 %	440224160
27728	NC_020062	GC	3	6	1297534	1297539	0 %	0 %	50 %	50 %	440224160
27729	NC_020062	CGC	2	6	1297566	1297571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224160
27730	NC_020062	GCA	2	6	1297588	1297593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224160
27731	NC_020062	CGG	2	6	1297597	1297602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224160
27732	NC_020062	CAG	2	6	1297613	1297618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224160
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27983	NC_020062	CG	3	6	1308723	1308728	0 %	0 %	50 %	50 %	440224170
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27987	NC_020062	TCGC	2	8	1308896	1308903	0 %	25 %	25 %	50 %	440224170
27988	NC_020062	AGC	2	6	1308905	1308910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224170
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27991	NC_020062	GCCCA	2	10	1309007	1309016	20 %	0 %	20 %	60 %	440224170
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27993	NC_020062	TCC	2	6	1309095	1309100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27994	NC_020062	T	6	6	1309116	1309121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27995	NC_020062	GGGC	2	8	1309128	1309135	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27996	NC_020062	CCA	2	6	1309147	1309152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27997	NC_020062	GCG	2	6	1309161	1309166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27998	NC_020062	CTC	2	6	1309212	1309217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224171
27999	NC_020062	GAA	2	6	1309333	1309338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224171
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