MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27003	NC_020062	AGGTGA	2	12	1263043	1263054	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	440224123
27004	NC_020062	GCA	2	6	1263137	1263142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224123
27005	NC_020062	CCG	2	6	1263184	1263189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224123
27006	NC_020062	GAA	2	6	1263350	1263355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224123
27007	NC_020062	TCT	2	6	1263415	1263420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224123
27008	NC_020062	CG	3	6	1263458	1263463	0 %	0 %	50 %	50 %	440224123
27009	NC_020062	ACC	2	6	1263543	1263548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224123
27010	NC_020062	TTCC	2	8	1263577	1263584	0 %	50 %	0 %	50 %	440224123
27011	NC_020062	GAA	2	6	1263590	1263595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224123
27012	NC_020062	CCG	2	6	1263625	1263630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224123
27013	NC_020062	CGC	2	6	1263631	1263636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224123
27014	NC_020062	ATC	2	6	1263657	1263662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224123
27015	NC_020062	TTG	2	6	1263747	1263752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224123
27016	NC_020062	CTT	2	6	1263758	1263763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224123
27017	NC_020062	CCA	2	6	1263784	1263789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224123
27018	NC_020062	CGC	2	6	1263809	1263814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224123
27019	NC_020062	CGG	2	6	1263832	1263837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224123
27020	NC_020062	AT	3	6	1263875	1263880	50 %	50 %	0 %	0 %	440224123
27021	NC_020062	GCA	2	6	1263885	1263890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224123
27022	NC_020062	TCC	2	6	1263928	1263933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224123
27023	NC_020062	C	6	6	1264018	1264023	0 %	0 %	0 %	100 %	440224123
27024	NC_020062	TC	3	6	1264118	1264123	0 %	50 %	0 %	50 %	440224123
27025	NC_020062	CTG	2	6	1264141	1264146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224123
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27035	NC_020062	TGA	2	6	1264738	1264743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224124
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27038	NC_020062	ATCG	2	8	1264841	1264848	25 %	25 %	25 %	25 %	440224124
27039	NC_020062	ACGC	2	8	1264851	1264858	25 %	0 %	25 %	50 %	440224124
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27042	NC_020062	GAA	2	6	1265028	1265033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224124
27043	NC_020062	GCA	2	6	1265047	1265052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224124
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27045	NC_020062	GC	3	6	1265111	1265116	0 %	0 %	50 %	50 %	440224124
27046	NC_020062	TCC	2	6	1265170	1265175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224124
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27048	NC_020062	A	6	6	1265260	1265265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27049	NC_020062	AGA	2	6	1265296	1265301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224125
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27051	NC_020062	GTCG	2	8	1265365	1265372	0 %	25 %	50 %	25 %	440224125
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27053	NC_020062	GGA	2	6	1265462	1265467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224125
27054	NC_020062	CTG	2	6	1265478	1265483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224125
27055	NC_020062	GATCG	2	10	1265534	1265543	20 %	20 %	40 %	20 %	440224125
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27058	NC_020062	GCGG	2	8	1265588	1265595	0 %	0 %	75 %	25 %	440224125
27059	NC_020062	CCG	2	6	1265629	1265634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224125
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27069	NC_020062	AGA	2	6	1266144	1266149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224125
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27089	NC_020062	GCA	2	6	1266901	1266906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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27091	NC_020062	GGAC	2	8	1267023	1267030	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27092	NC_020062	TG	3	6	1267152	1267157	0 %	50 %	50 %	0 %	440224126
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27101	NC_020062	GC	3	6	1267765	1267770	0 %	0 %	50 %	50 %	440224127
27102	NC_020062	TCG	2	6	1267775	1267780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224127
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27107	NC_020062	TCC	2	6	1267955	1267960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224127
27108	NC_020062	GCC	2	6	1267976	1267981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224127
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27113	NC_020062	TAA	3	9	1268440	1268448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27114	NC_020062	CGC	2	6	1268511	1268516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27115	NC_020062	T	6	6	1268584	1268589	0 %	100 %	0 %	0 %	440224128
27116	NC_020062	TTG	2	6	1268668	1268673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224128
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27118	NC_020062	CGC	2	6	1268858	1268863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224128
27119	NC_020062	AGCC	2	8	1268867	1268874	25 %	0 %	25 %	50 %	440224128
27120	NC_020062	CTG	2	6	1268880	1268885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224128
27121	NC_020062	GCC	2	6	1268899	1268904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224128
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27123	NC_020062	GCC	2	6	1269012	1269017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224128
27124	NC_020062	GC	3	6	1269057	1269062	0 %	0 %	50 %	50 %	440224128
27125	NC_020062	GCG	2	6	1269068	1269073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224128
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27131	NC_020062	GGCA	2	8	1269469	1269476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27132	NC_020062	TGT	2	6	1269665	1269670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27133	NC_020062	ATCGC	2	10	1269692	1269701	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27134	NC_020062	CAA	2	6	1269743	1269748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27202	NC_020062	AGGG	2	8	1273135	1273142	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27203	NC_020062	CGC	2	6	1273199	1273204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224132
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27210	NC_020062	CGG	2	6	1273486	1273491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224132
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27226	NC_020062	CCCG	2	8	1274350	1274357	0 %	0 %	25 %	75 %	440224132
27227	NC_020062	GAG	2	6	1274402	1274407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224133
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27229	NC_020062	TCG	2	6	1274526	1274531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224133
27230	NC_020062	TCG	2	6	1274565	1274570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224133
27231	NC_020062	TCG	2	6	1274697	1274702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224133
27232	NC_020062	GACA	2	8	1274846	1274853	50 %	0 %	25 %	25 %	440224133
27233	NC_020062	AGCGGC	2	12	1274968	1274979	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440224133
27234	NC_020062	TCG	2	6	1274997	1275002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224133
27235	NC_020062	GCC	2	6	1275023	1275028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224133
27236	NC_020062	GCC	2	6	1275038	1275043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224133
27237	NC_020062	CTG	2	6	1275074	1275079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224133
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27239	NC_020062	CGG	2	6	1275102	1275107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224133
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27242	NC_020062	CCG	2	6	1275270	1275275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224133
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27246	NC_020062	GCA	2	6	1275374	1275379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224133
27247	NC_020062	AGGC	2	8	1275425	1275432	25 %	0 %	50 %	25 %	440224134
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27249	NC_020062	TTTCG	2	10	1275467	1275476	0 %	60 %	20 %	20 %	440224134
27250	NC_020062	GCA	2	6	1275535	1275540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224134
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27263	NC_020062	TGG	2	6	1276217	1276222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224134
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27290	NC_020062	A	6	6	1277187	1277192	100 %	0 %	0 %	0 %	440224136
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27302	NC_020062	AGCGAG	2	12	1277875	1277886	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	440224137
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27328	NC_020062	AGC	2	6	1278946	1278951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224138
27329	NC_020062	AG	3	6	1278954	1278959	50 %	0 %	50 %	0 %	440224138
27330	NC_020062	CAGG	2	8	1279003	1279010	25 %	0 %	50 %	25 %	440224138
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27332	NC_020062	TCG	2	6	1279077	1279082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224138
27333	NC_020062	TGC	2	6	1279115	1279120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224138
27334	NC_020062	CGC	2	6	1279152	1279157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224138
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27336	NC_020062	CGT	2	6	1279236	1279241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224138
27337	NC_020062	TCG	2	6	1279379	1279384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224138
27338	NC_020062	GTT	2	6	1279448	1279453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224138
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27340	NC_020062	TTC	2	6	1279484	1279489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224138
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27342	NC_020062	CGC	2	6	1279850	1279855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27343	NC_020062	CGAT	2	8	1279920	1279927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27344	NC_020062	CG	3	6	1280094	1280099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27345	NC_020062	AGC	2	6	1280119	1280124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27346	NC_020062	AC	3	6	1280136	1280141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27347	NC_020062	GC	3	6	1280164	1280169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27348	NC_020062	GGC	2	6	1280202	1280207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27349	NC_020062	GA	3	6	1280238	1280243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27350	NC_020062	TGGC	2	8	1280281	1280288	0 %	25 %	50 %	25 %	440224139
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27352	NC_020062	GCG	2	6	1280339	1280344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224139
27353	NC_020062	CGT	2	6	1280460	1280465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224139
27354	NC_020062	GCG	2	6	1280468	1280473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224139
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27394	NC_020062	CGG	2	6	1282419	1282424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224140
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27463	NC_020062	GCCG	2	8	1285309	1285316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27464	NC_020062	CCTT	2	8	1285321	1285328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27465	NC_020062	GCG	2	6	1285385	1285390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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27468	NC_020062	GCCGG	2	10	1285619	1285628	0 %	0 %	60 %	40 %	440224147
27469	NC_020062	CGG	2	6	1285768	1285773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224147
27470	NC_020062	CCT	2	6	1285822	1285827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27471	NC_020062	GTCG	2	8	1285868	1285875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27472	NC_020062	TCG	2	6	1285991	1285996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27473	NC_020062	TA	3	6	1285998	1286003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27474	NC_020062	TCT	2	6	1286022	1286027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224148
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27476	NC_020062	CCT	2	6	1286139	1286144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224148
27477	NC_020062	AGGCG	2	10	1286165	1286174	20 %	0 %	60 %	20 %	440224148
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27479	NC_020062	CGAC	2	8	1286293	1286300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27480	NC_020062	GCT	2	6	1286328	1286333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27481	NC_020062	GCA	2	6	1286339	1286344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27482	NC_020062	TGCA	2	8	1286360	1286367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27483	NC_020062	GAT	2	6	1286452	1286457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224149
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