MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_020062	AAC	2	6	1237466	1237471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224100
26503	NC_020062	GC	3	6	1237494	1237499	0 %	0 %	50 %	50 %	440224100
26504	NC_020062	GCT	2	6	1237501	1237506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224100
26505	NC_020062	GGC	2	6	1237525	1237530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224100
26506	NC_020062	ACA	2	6	1237541	1237546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224100
26507	NC_020062	GCT	2	6	1237596	1237601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224100
26508	NC_020062	GCT	2	6	1237627	1237632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224100
26509	NC_020062	TTTCA	2	10	1237648	1237657	20 %	60 %	0 %	20 %	440224100
26510	NC_020062	TCA	2	6	1237667	1237672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26511	NC_020062	TCT	2	6	1237711	1237716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26512	NC_020062	TGA	2	6	1237839	1237844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26513	NC_020062	GATT	2	8	1237930	1237937	25 %	50 %	25 %	0 %	440224101
26514	NC_020062	CGA	2	6	1237949	1237954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224101
26515	NC_020062	CG	3	6	1237979	1237984	0 %	0 %	50 %	50 %	440224101
26516	NC_020062	GCC	2	6	1237989	1237994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224101
26517	NC_020062	CGT	2	6	1238142	1238147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224101
26518	NC_020062	TCG	2	6	1238155	1238160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224101
26519	NC_020062	TGT	2	6	1238219	1238224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224101
26520	NC_020062	CAT	2	6	1238226	1238231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224101
26521	NC_020062	GGGA	2	8	1238246	1238253	25 %	0 %	75 %	0 %	440224101
26522	NC_020062	GCA	2	6	1238259	1238264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224101
26523	NC_020062	TGA	2	6	1238281	1238286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224101
26524	NC_020062	CG	3	6	1238313	1238318	0 %	0 %	50 %	50 %	440224101
26525	NC_020062	AAG	2	6	1238321	1238326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224101
26526	NC_020062	CGT	2	6	1238357	1238362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224101
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26528	NC_020062	CGT	2	6	1238408	1238413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224101
26529	NC_020062	CCTT	2	8	1238479	1238486	0 %	50 %	0 %	50 %	440224101
26530	NC_020062	GGC	3	9	1238526	1238534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224101
26531	NC_020062	GCA	2	6	1238613	1238618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224101
26532	NC_020062	CGT	2	6	1238627	1238632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224101
26533	NC_020062	ACG	2	6	1238673	1238678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224101
26534	NC_020062	GCT	2	6	1238690	1238695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224101
26535	NC_020062	GCG	2	6	1238732	1238737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224101
26536	NC_020062	GGA	2	6	1238738	1238743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224101
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26538	NC_020062	GCA	2	6	1238930	1238935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224101
26539	NC_020062	GGC	2	6	1238953	1238958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224101
26540	NC_020062	GTT	2	6	1238983	1238988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224101
26541	NC_020062	GTC	2	6	1238994	1238999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224101
26542	NC_020062	GGC	2	6	1239008	1239013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224101
26543	NC_020062	CGG	2	6	1239021	1239026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224101
26544	NC_020062	TGA	2	6	1239088	1239093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224101
26545	NC_020062	GAT	2	6	1239203	1239208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224101
26546	NC_020062	CAA	2	6	1239362	1239367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224101
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26549	NC_020062	CTG	2	6	1239486	1239491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26550	NC_020062	AGC	2	6	1239568	1239573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26551	NC_020062	TCG	2	6	1239578	1239583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26552	NC_020062	TGG	2	6	1239606	1239611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26553	NC_020062	GCC	2	6	1239651	1239656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26554	NC_020062	TCA	2	6	1239770	1239775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224102
26555	NC_020062	GT	3	6	1239805	1239810	0 %	50 %	50 %	0 %	440224102
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26557	NC_020062	CG	3	6	1240047	1240052	0 %	0 %	50 %	50 %	440224103
26558	NC_020062	GCG	2	6	1240056	1240061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224103
26559	NC_020062	GCGG	2	8	1240064	1240071	0 %	0 %	75 %	25 %	440224103
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26565	NC_020062	GCAG	2	8	1240203	1240210	25 %	0 %	50 %	25 %	440224103
26566	NC_020062	CTTGC	2	10	1240217	1240226	0 %	40 %	20 %	40 %	440224103
26567	NC_020062	GGT	2	6	1240252	1240257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224103
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26569	NC_020062	GCG	2	6	1240459	1240464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26570	NC_020062	AAC	2	6	1240467	1240472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26571	NC_020062	CG	3	6	1240501	1240506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26572	NC_020062	TCAAA	2	10	1240564	1240573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26573	NC_020062	GC	3	6	1240574	1240579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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26578	NC_020062	ATG	2	6	1240930	1240935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224104
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26585	NC_020062	CAT	2	6	1241612	1241617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224105
26586	NC_020062	GCGT	2	8	1241652	1241659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26587	NC_020062	TCACA	2	10	1241662	1241671	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26588	NC_020062	ATCG	2	8	1241680	1241687	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26589	NC_020062	TCA	2	6	1241743	1241748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26590	NC_020062	ATGC	2	8	1241798	1241805	25 %	25 %	25 %	25 %	440224106
26591	NC_020062	ATC	2	6	1241806	1241811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224106
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26594	NC_020062	CT	3	6	1241971	1241976	0 %	50 %	0 %	50 %	440224106
26595	NC_020062	CCCA	2	8	1241981	1241988	25 %	0 %	0 %	75 %	440224106
26596	NC_020062	TTC	2	6	1241991	1241996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224106
26597	NC_020062	TC	3	6	1242030	1242035	0 %	50 %	0 %	50 %	440224106
26598	NC_020062	AGAT	2	8	1242068	1242075	50 %	25 %	25 %	0 %	440224106
26599	NC_020062	CG	3	6	1242127	1242132	0 %	0 %	50 %	50 %	440224106
26600	NC_020062	TAA	2	6	1242212	1242217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224106
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26603	NC_020062	CT	3	6	1242495	1242500	0 %	50 %	0 %	50 %	440224107
26604	NC_020062	AAG	2	6	1242519	1242524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224107
26605	NC_020062	AC	3	6	1242564	1242569	50 %	0 %	0 %	50 %	440224107
26606	NC_020062	CTT	2	6	1242632	1242637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224107
26607	NC_020062	TCGGCG	2	12	1242719	1242730	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440224107
26608	NC_020062	GCC	2	6	1242860	1242865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224107
26609	NC_020062	GTAG	2	8	1242892	1242899	25 %	25 %	50 %	0 %	440224107
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26611	NC_020062	TCTT	2	8	1243116	1243123	0 %	75 %	0 %	25 %	440224107
26612	NC_020062	GAC	2	6	1243166	1243171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224107
26613	NC_020062	AGC	2	6	1243182	1243187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224107
26614	NC_020062	AAC	2	6	1243274	1243279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224107
26615	NC_020062	TCC	2	6	1243326	1243331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224107
26616	NC_020062	C	6	6	1243359	1243364	0 %	0 %	0 %	100 %	440224107
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26618	NC_020062	GA	3	6	1243488	1243493	50 %	0 %	50 %	0 %	440224107
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26848	NC_020062	TTCA	2	8	1255456	1255463	25 %	50 %	0 %	25 %	440224116
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26853	NC_020062	GA	3	6	1255682	1255687	50 %	0 %	50 %	0 %	440224116
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26855	NC_020062	ACC	2	6	1255879	1255884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224116
26856	NC_020062	CTT	2	6	1255899	1255904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224116
26857	NC_020062	TCC	2	6	1255975	1255980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224116
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26862	NC_020062	GC	3	6	1256230	1256235	0 %	0 %	50 %	50 %	440224116
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26867	NC_020062	CGG	2	6	1256411	1256416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224117
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26870	NC_020062	CCAG	2	8	1256581	1256588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26871	NC_020062	GA	3	6	1256682	1256687	50 %	0 %	50 %	0 %	440224118
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26968	NC_020062	CG	3	6	1261505	1261510	0 %	0 %	50 %	50 %	440224121
26969	NC_020062	GCT	2	6	1261531	1261536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224121
26970	NC_020062	GTT	2	6	1261541	1261546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224122
26971	NC_020062	GCG	2	6	1261651	1261656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224122
26972	NC_020062	GATG	2	8	1261668	1261675	25 %	25 %	50 %	0 %	440224122
26973	NC_020062	GATC	2	8	1261686	1261693	25 %	25 %	25 %	25 %	440224122
26974	NC_020062	TGC	2	6	1261856	1261861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224122
26975	NC_020062	ACGATG	2	12	1261927	1261938	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440224122
26976	NC_020062	GTG	2	6	1261954	1261959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224122
26977	NC_020062	ATC	2	6	1261966	1261971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224122
26978	NC_020062	CCG	2	6	1262069	1262074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224122
26979	NC_020062	CAT	2	6	1262082	1262087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224122
26980	NC_020062	GAT	2	6	1262097	1262102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224122
26981	NC_020062	CGT	2	6	1262103	1262108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224122
26982	NC_020062	CTT	2	6	1262130	1262135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224122
26983	NC_020062	AAGA	2	8	1262151	1262158	75 %	0 %	25 %	0 %	440224122
26984	NC_020062	GAT	2	6	1262178	1262183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224122
26985	NC_020062	AGC	2	6	1262359	1262364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224122
26986	NC_020062	CGA	2	6	1262381	1262386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224122
26987	NC_020062	AG	3	6	1262409	1262414	50 %	0 %	50 %	0 %	440224122
26988	NC_020062	CG	3	6	1262423	1262428	0 %	0 %	50 %	50 %	440224122
26989	NC_020062	GCG	2	6	1262441	1262446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224122
26990	NC_020062	CGAT	2	8	1262461	1262468	25 %	25 %	25 %	25 %	440224122
26991	NC_020062	TGG	3	9	1262506	1262514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26992	NC_020062	AGCC	2	8	1262519	1262526	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26993	NC_020062	CGT	2	6	1262596	1262601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224123
26994	NC_020062	AGG	2	6	1262706	1262711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224123
26995	NC_020062	CGA	2	6	1262743	1262748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224123
26996	NC_020062	GGCT	2	8	1262781	1262788	0 %	25 %	50 %	25 %	440224123
26997	NC_020062	ATC	2	6	1262804	1262809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224123
26998	NC_020062	ACG	2	6	1262811	1262816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224123
26999	NC_020062	GCC	2	6	1262834	1262839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224123
27000	NC_020062	CCA	2	6	1262846	1262851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224123

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