MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_020062	AGC	2	6	1031007	1031012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223915
22003	NC_020062	CCT	2	6	1031020	1031025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223915
22004	NC_020062	CG	3	6	1031049	1031054	0 %	0 %	50 %	50 %	440223915
22005	NC_020062	GTCT	2	8	1031109	1031116	0 %	50 %	25 %	25 %	440223915
22006	NC_020062	GTCG	2	8	1031182	1031189	0 %	25 %	50 %	25 %	440223915
22007	NC_020062	GCG	2	6	1031254	1031259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223915
22008	NC_020062	GAC	2	6	1031276	1031281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223915
22009	NC_020062	TTGCC	2	10	1031314	1031323	0 %	40 %	20 %	40 %	440223915
22010	NC_020062	TCCA	2	8	1031430	1031437	25 %	25 %	0 %	50 %	440223915
22011	NC_020062	GCG	2	6	1031440	1031445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223915
22012	NC_020062	ATC	2	6	1031591	1031596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223915
22013	NC_020062	GAA	2	6	1031611	1031616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223915
22014	NC_020062	GGC	2	6	1031668	1031673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223916
22015	NC_020062	GGT	2	6	1031682	1031687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223916
22016	NC_020062	CCG	2	6	1031721	1031726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223916
22017	NC_020062	CTG	2	6	1031737	1031742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223916
22018	NC_020062	GCCG	2	8	1031755	1031762	0 %	0 %	50 %	50 %	440223916
22019	NC_020062	CGT	2	6	1031815	1031820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223916
22020	NC_020062	CCGG	2	8	1031821	1031828	0 %	0 %	50 %	50 %	440223916
22021	NC_020062	TCC	2	6	1031854	1031859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223916
22022	NC_020062	CGA	2	6	1031937	1031942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223916
22023	NC_020062	GTC	2	6	1031947	1031952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223916
22024	NC_020062	GCA	2	6	1032093	1032098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223916
22025	NC_020062	GCC	2	6	1032130	1032135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223916
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22028	NC_020062	CAT	2	6	1032205	1032210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223916
22029	NC_020062	TCG	2	6	1032212	1032217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223916
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22031	NC_020062	TCT	2	6	1032264	1032269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223916
22032	NC_020062	ATG	2	6	1032293	1032298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223916
22033	NC_020062	GCG	2	6	1032318	1032323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223916
22034	NC_020062	TCA	2	6	1032336	1032341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223916
22035	NC_020062	TCG	2	6	1032347	1032352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223916
22036	NC_020062	TGA	2	6	1032357	1032362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223916
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22042	NC_020062	CGC	2	6	1032588	1032593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223916
22043	NC_020062	CGATCG	2	12	1032594	1032605	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223916
22044	NC_020062	GCA	2	6	1032614	1032619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223916
22045	NC_020062	CGCC	2	8	1032690	1032697	0 %	0 %	25 %	75 %	440223916
22046	NC_020062	CGA	2	6	1032741	1032746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223916
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22048	NC_020062	CG	3	6	1032759	1032764	0 %	0 %	50 %	50 %	440223916
22049	NC_020062	TTC	2	6	1032772	1032777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223916
22050	NC_020062	CGA	2	6	1032795	1032800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223916
22051	NC_020062	GGTGAT	2	12	1032874	1032885	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	440223916
22052	NC_020062	CTC	2	6	1032905	1032910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22053	NC_020062	CGA	2	6	1032915	1032920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22054	NC_020062	T	6	6	1032979	1032984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22055	NC_020062	GGC	2	6	1033018	1033023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22056	NC_020062	TGA	2	6	1033166	1033171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223917
22057	NC_020062	TGT	2	6	1033351	1033356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223917
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22064	NC_020062	CGCC	2	8	1033786	1033793	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22065	NC_020062	TCC	2	6	1033826	1033831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22066	NC_020062	TGA	2	6	1033874	1033879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223918
22067	NC_020062	TTTC	2	8	1033884	1033891	0 %	75 %	0 %	25 %	440223918
22068	NC_020062	CGG	2	6	1033928	1033933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223918
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22089	NC_020062	TGGGC	2	10	1035148	1035157	0 %	20 %	60 %	20 %	440223919
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22091	NC_020062	GCC	2	6	1035200	1035205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22092	NC_020062	GCG	2	6	1035213	1035218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22093	NC_020062	GCG	2	6	1035268	1035273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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22106	NC_020062	TGATC	2	10	1035922	1035931	20 %	40 %	20 %	20 %	440223920
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22115	NC_020062	GCT	2	6	1036314	1036319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223921
22116	NC_020062	TGG	2	6	1036332	1036337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223921
22117	NC_020062	CGA	2	6	1036371	1036376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223921
22118	NC_020062	GGA	2	6	1036390	1036395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223921
22119	NC_020062	GA	3	6	1036418	1036423	50 %	0 %	50 %	0 %	440223921
22120	NC_020062	CCCG	2	8	1036437	1036444	0 %	0 %	25 %	75 %	440223921
22121	NC_020062	GGCG	2	8	1036452	1036459	0 %	0 %	75 %	25 %	440223921
22122	NC_020062	CGATGG	2	12	1036506	1036517	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223921
22123	NC_020062	CCT	2	6	1036614	1036619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223921
22124	NC_020062	TGG	2	6	1036638	1036643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223921
22125	NC_020062	CGC	2	6	1036644	1036649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223921
22126	NC_020062	CCG	2	6	1036656	1036661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223921
22127	NC_020062	CCA	2	6	1036674	1036679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223921
22128	NC_020062	AGC	2	6	1036697	1036702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223921
22129	NC_020062	TGC	2	6	1036746	1036751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223921
22130	NC_020062	CCTG	2	8	1036849	1036856	0 %	25 %	25 %	50 %	440223922
22131	NC_020062	CGGCAA	2	12	1036862	1036873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223922
22132	NC_020062	ATC	2	6	1036908	1036913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223922
22133	NC_020062	GCC	2	6	1036921	1036926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223922
22134	NC_020062	CGA	2	6	1036937	1036942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223922
22135	NC_020062	CCG	2	6	1037149	1037154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223922
22136	NC_020062	GAT	2	6	1037163	1037168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223922
22137	NC_020062	CGA	2	6	1037230	1037235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223922
22138	NC_020062	TCG	2	6	1037383	1037388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223922
22139	NC_020062	CTT	3	9	1037390	1037398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223922
22140	NC_020062	CGG	2	6	1037426	1037431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223922
22141	NC_020062	CGA	2	6	1037462	1037467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223922
22142	NC_020062	GGCG	2	8	1037560	1037567	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22143	NC_020062	GAC	2	6	1037579	1037584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22144	NC_020062	TCC	2	6	1037616	1037621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22145	NC_020062	CCG	2	6	1037663	1037668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22146	NC_020062	TC	3	6	1037686	1037691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22147	NC_020062	TC	3	6	1037693	1037698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22148	NC_020062	GGC	2	6	1037716	1037721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22149	NC_020062	TCA	2	6	1037726	1037731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22150	NC_020062	CGG	2	6	1037755	1037760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22151	NC_020062	TGG	2	6	1037801	1037806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22152	NC_020062	TA	3	6	1037846	1037851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22153	NC_020062	GCT	2	6	1037885	1037890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22154	NC_020062	ATC	2	6	1037917	1037922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22155	NC_020062	CG	3	6	1037996	1038001	0 %	0 %	50 %	50 %	440223923
22156	NC_020062	ATCG	2	8	1038019	1038026	25 %	25 %	25 %	25 %	440223923
22157	NC_020062	TCGC	2	8	1038059	1038066	0 %	25 %	25 %	50 %	440223923
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22159	NC_020062	TTC	2	6	1038157	1038162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22160	NC_020062	GCC	2	6	1038163	1038168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22161	NC_020062	TCC	2	6	1038292	1038297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22162	NC_020062	TCC	3	9	1038327	1038335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22163	NC_020062	CTC	3	9	1038362	1038370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22164	NC_020062	CTC	3	9	1038406	1038414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22165	NC_020062	GAG	2	6	1038475	1038480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22166	NC_020062	GGC	2	6	1038497	1038502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22167	NC_020062	GC	3	6	1038580	1038585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22168	NC_020062	AGG	2	6	1038621	1038626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22169	NC_020062	CGC	2	6	1038655	1038660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223924
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22171	NC_020062	CAT	2	6	1038812	1038817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223924
22172	NC_020062	GCT	2	6	1038827	1038832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223924
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22175	NC_020062	CCGA	2	8	1039035	1039042	25 %	0 %	25 %	50 %	440223924
22176	NC_020062	GC	3	6	1039093	1039098	0 %	0 %	50 %	50 %	440223924
22177	NC_020062	CGG	3	9	1039106	1039114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223924
22178	NC_020062	CGA	2	6	1039141	1039146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223924
22179	NC_020062	CGAT	2	8	1039159	1039166	25 %	25 %	25 %	25 %	440223924
22180	NC_020062	CGG	2	6	1039283	1039288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223924
22181	NC_020062	TGCAGG	2	12	1039327	1039338	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223924
22182	NC_020062	ATCC	2	8	1039426	1039433	25 %	25 %	0 %	50 %	440223924
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22184	NC_020062	ATG	2	6	1039453	1039458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223924
22185	NC_020062	CAA	2	6	1039511	1039516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22186	NC_020062	T	6	6	1039560	1039565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22187	NC_020062	CTG	2	6	1039576	1039581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22188	NC_020062	GGC	2	6	1039587	1039592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22189	NC_020062	GCA	2	6	1039723	1039728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223925
22190	NC_020062	GAC	2	6	1039736	1039741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223925
22191	NC_020062	GCGAG	2	10	1039791	1039800	20 %	0 %	60 %	20 %	440223925
22192	NC_020062	GCT	2	6	1039807	1039812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223925
22193	NC_020062	TCG	2	6	1039922	1039927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223925
22194	NC_020062	CCG	3	9	1039944	1039952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223925
22195	NC_020062	TAT	2	6	1039973	1039978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223925
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22199	NC_020062	GGCG	2	8	1040158	1040165	0 %	0 %	75 %	25 %	440223925
22200	NC_020062	TGA	2	6	1040181	1040186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223925
22201	NC_020062	GCG	2	6	1040217	1040222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223925
22202	NC_020062	GGC	2	6	1040241	1040246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223925
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22213	NC_020062	CGG	2	6	1040936	1040941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223925
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22215	NC_020062	CAT	2	6	1040967	1040972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223925
22216	NC_020062	GCG	2	6	1041227	1041232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223925
22217	NC_020062	AGGCA	2	10	1041290	1041299	40 %	0 %	40 %	20 %	440223925
22218	NC_020062	GGC	2	6	1041340	1041345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22219	NC_020062	ATC	2	6	1041393	1041398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223926
22220	NC_020062	TGCCG	2	10	1041431	1041440	0 %	20 %	40 %	40 %	440223926
22221	NC_020062	TCTT	2	8	1041461	1041468	0 %	75 %	0 %	25 %	440223926
22222	NC_020062	GCAG	2	8	1041562	1041569	25 %	0 %	50 %	25 %	440223926
22223	NC_020062	CCG	2	6	1041584	1041589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223926
22224	NC_020062	TCG	2	6	1041598	1041603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223926
22225	NC_020062	GGC	2	6	1041701	1041706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223926
22226	NC_020062	TGT	2	6	1041711	1041716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223926
22227	NC_020062	CGG	2	6	1041749	1041754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223926
22228	NC_020062	GAC	2	6	1041828	1041833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223926
22229	NC_020062	TAG	2	6	1041844	1041849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223926
22230	NC_020062	CGC	2	6	1041866	1041871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223926
22231	NC_020062	CGC	3	9	1041900	1041908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223926
22232	NC_020062	ACG	2	6	1041910	1041915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223926
22233	NC_020062	GCA	2	6	1041980	1041985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223926
22234	NC_020062	CGG	2	6	1042002	1042007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223926
22235	NC_020062	TCG	2	6	1042021	1042026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223926
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22302	NC_020062	GGA	2	6	1044837	1044842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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22343	NC_020062	AGCC	2	8	1046417	1046424	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22344	NC_020062	TCGA	2	8	1046445	1046452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22345	NC_020062	GCA	2	6	1046493	1046498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223929
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22462	NC_020062	CG	3	6	1052638	1052643	0 %	0 %	50 %	50 %	440223936
22463	NC_020062	ATCTC	2	10	1052679	1052688	20 %	40 %	0 %	40 %	440223936
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22465	NC_020062	GCA	2	6	1052725	1052730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223936
22466	NC_020062	GC	3	6	1052739	1052744	0 %	0 %	50 %	50 %	440223936
22467	NC_020062	CGG	2	6	1052780	1052785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223936
22468	NC_020062	CTGG	2	8	1052888	1052895	0 %	25 %	50 %	25 %	440223936
22469	NC_020062	CAT	2	6	1052936	1052941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223936
22470	NC_020062	GCA	2	6	1052990	1052995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223936
22471	NC_020062	GCA	2	6	1053110	1053115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223936
22472	NC_020062	ACCCGA	2	12	1053135	1053146	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	440223936
22473	NC_020062	TGCACC	2	12	1053184	1053195	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	440223936
22474	NC_020062	GTT	2	6	1053313	1053318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223936
22475	NC_020062	CG	4	8	1053345	1053352	0 %	0 %	50 %	50 %	440223936
22476	NC_020062	CG	3	6	1053409	1053414	0 %	0 %	50 %	50 %	440223936
22477	NC_020062	AG	3	6	1053434	1053439	50 %	0 %	50 %	0 %	440223936
22478	NC_020062	CTTT	2	8	1053470	1053477	0 %	75 %	0 %	25 %	440223936
22479	NC_020062	GCC	2	6	1053537	1053542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223936
22480	NC_020062	GCT	2	6	1053544	1053549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223936
22481	NC_020062	GCTCTC	2	12	1053552	1053563	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	440223936
22482	NC_020062	TTC	2	6	1053567	1053572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223936
22483	NC_020062	CGT	2	6	1053595	1053600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223936
22484	NC_020062	GCT	2	6	1053661	1053666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223936
22485	NC_020062	GCC	2	6	1053695	1053700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223936
22486	NC_020062	CG	3	6	1053727	1053732	0 %	0 %	50 %	50 %	440223936
22487	NC_020062	CGA	2	6	1053899	1053904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223937
22488	NC_020062	CGG	2	6	1053932	1053937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223937
22489	NC_020062	GTG	2	6	1053954	1053959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223937
22490	NC_020062	CCCGC	2	10	1053981	1053990	0 %	0 %	20 %	80 %	440223937
22491	NC_020062	TGCA	2	8	1054015	1054022	25 %	25 %	25 %	25 %	440223937
22492	NC_020062	TGG	2	6	1054051	1054056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223937
22493	NC_020062	TTCG	2	8	1054062	1054069	0 %	50 %	25 %	25 %	440223937
22494	NC_020062	CCG	2	6	1054141	1054146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223937
22495	NC_020062	GCG	2	6	1054177	1054182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223937
22496	NC_020062	GTG	2	6	1054200	1054205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223937
22497	NC_020062	CG	3	6	1054223	1054228	0 %	0 %	50 %	50 %	440223937
22498	NC_020062	GCT	2	6	1054259	1054264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223937
22499	NC_020062	GATGAC	2	12	1054272	1054283	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440223937
22500	NC_020062	GCT	2	6	1054331	1054336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223937

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