MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_020062	AAGC	2	8	1009195	1009202	50 %	0 %	25 %	25 %	440223896
21502	NC_020062	GCT	2	6	1009221	1009226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223896
21503	NC_020062	ACG	2	6	1009243	1009248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223896
21504	NC_020062	GC	3	6	1009274	1009279	0 %	0 %	50 %	50 %	440223896
21505	NC_020062	TAC	2	6	1009316	1009321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223896
21506	NC_020062	ATC	2	6	1009359	1009364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223896
21507	NC_020062	GGA	2	6	1009514	1009519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223896
21508	NC_020062	AGC	2	6	1009528	1009533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223896
21509	NC_020062	CGCC	2	8	1009553	1009560	0 %	0 %	25 %	75 %	440223896
21510	NC_020062	GCC	2	6	1009616	1009621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223896
21511	NC_020062	TTCG	2	8	1009685	1009692	0 %	50 %	25 %	25 %	440223896
21512	NC_020062	GTCC	2	8	1009768	1009775	0 %	25 %	25 %	50 %	440223896
21513	NC_020062	CGC	2	6	1009782	1009787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223896
21514	NC_020062	TCGCT	2	10	1009869	1009878	0 %	40 %	20 %	40 %	440223897
21515	NC_020062	GGA	2	6	1009912	1009917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223897
21516	NC_020062	CGG	2	6	1009924	1009929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223897
21517	NC_020062	TCA	2	6	1009937	1009942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223897
21518	NC_020062	TGC	2	6	1009974	1009979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223897
21519	NC_020062	CGT	2	6	1009987	1009992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223897
21520	NC_020062	CGG	2	6	1010004	1010009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223897
21521	NC_020062	TTC	2	6	1010018	1010023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223897
21522	NC_020062	CGA	2	6	1010043	1010048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223897
21523	NC_020062	CGC	2	6	1010063	1010068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223897
21524	NC_020062	ATG	2	6	1010169	1010174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223897
21525	NC_020062	GTT	2	6	1010221	1010226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223897
21526	NC_020062	GAC	2	6	1010236	1010241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223897
21527	NC_020062	GGC	2	6	1010338	1010343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223897
21528	NC_020062	GCC	2	6	1010348	1010353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223897
21529	NC_020062	TCC	2	6	1010375	1010380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223897
21530	NC_020062	GCC	3	9	1010429	1010437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223897
21531	NC_020062	CTT	2	6	1010516	1010521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223897
21532	NC_020062	TCC	2	6	1010546	1010551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223897
21533	NC_020062	GCC	2	6	1010553	1010558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223897
21534	NC_020062	TGCG	2	8	1010582	1010589	0 %	25 %	50 %	25 %	440223897
21535	NC_020062	TGA	2	6	1010631	1010636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223897
21536	NC_020062	CTA	2	6	1010703	1010708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21537	NC_020062	CTA	2	6	1010712	1010717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21538	NC_020062	CA	3	6	1010746	1010751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21539	NC_020062	CCGCT	2	10	1010802	1010811	0 %	20 %	20 %	60 %	440223898
21540	NC_020062	CG	3	6	1010886	1010891	0 %	0 %	50 %	50 %	440223898
21541	NC_020062	CTG	2	6	1010893	1010898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223898
21542	NC_020062	GGC	2	6	1010941	1010946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223898
21543	NC_020062	CTG	2	6	1010953	1010958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223898
21544	NC_020062	GAT	2	6	1011108	1011113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223898
21545	NC_020062	CGC	2	6	1011135	1011140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223898
21546	NC_020062	ATCG	2	8	1011237	1011244	25 %	25 %	25 %	25 %	440223898
21547	NC_020062	GCG	2	6	1011245	1011250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223898
21548	NC_020062	TCA	2	6	1011302	1011307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223898
21549	NC_020062	CGT	2	6	1011354	1011359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223898
21550	NC_020062	TCG	2	6	1011377	1011382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223898
21551	NC_020062	CGA	2	6	1011401	1011406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223898
21552	NC_020062	CGA	2	6	1011452	1011457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223898
21553	NC_020062	TGCC	2	8	1011503	1011510	0 %	25 %	25 %	50 %	440223898
21554	NC_020062	CTT	2	6	1011570	1011575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223898
21555	NC_020062	GCC	2	6	1011585	1011590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223898
21556	NC_020062	CGG	2	6	1011606	1011611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223898
21557	NC_020062	ATC	2	6	1011616	1011621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223898
21558	NC_020062	CGA	2	6	1011626	1011631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223898
21559	NC_020062	CGAT	2	8	1011647	1011654	25 %	25 %	25 %	25 %	440223898
21560	NC_020062	GCC	3	9	1011665	1011673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223898
21561	NC_020062	TC	3	6	1011706	1011711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21562	NC_020062	GAA	2	6	1011819	1011824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223899
21563	NC_020062	CAT	2	6	1011828	1011833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223899
21564	NC_020062	GGC	2	6	1011865	1011870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
21565	NC_020062	CGG	2	6	1011938	1011943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
21566	NC_020062	CGG	2	6	1011959	1011964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
21567	NC_020062	CGC	2	6	1011968	1011973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223899
21568	NC_020062	GAA	2	6	1012023	1012028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223899
21569	NC_020062	CGA	2	6	1012035	1012040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223899
21570	NC_020062	GCT	2	6	1012057	1012062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223899
21571	NC_020062	GCC	2	6	1012088	1012093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223899
21572	NC_020062	GGC	2	6	1012176	1012181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
21573	NC_020062	GCGGCA	2	12	1012219	1012230	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223899
21574	NC_020062	GGC	2	6	1012242	1012247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
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21584	NC_020062	CAA	2	6	1012761	1012766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223899
21585	NC_020062	AGG	2	6	1012781	1012786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223899
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21587	NC_020062	GC	3	6	1012908	1012913	0 %	0 %	50 %	50 %	440223899
21588	NC_020062	GTC	3	9	1012930	1012938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223899
21589	NC_020062	GGC	2	6	1012965	1012970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
21590	NC_020062	GC	3	6	1012969	1012974	0 %	0 %	50 %	50 %	440223899
21591	NC_020062	AGC	2	6	1013017	1013022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223899
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21599	NC_020062	CCT	3	9	1013249	1013257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223899
21600	NC_020062	TGC	2	6	1013297	1013302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223899
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21605	NC_020062	GGC	2	6	1013413	1013418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
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21613	NC_020062	ACG	2	6	1013777	1013782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223899
21614	NC_020062	ATC	2	6	1013810	1013815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21615	NC_020062	CCG	3	9	1013925	1013933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21616	NC_020062	AAC	2	6	1013976	1013981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21617	NC_020062	CCG	2	6	1013999	1014004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21618	NC_020062	GTT	2	6	1014039	1014044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21619	NC_020062	CAGA	2	8	1014077	1014084	50 %	0 %	25 %	25 %	440223900
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21718	NC_020062	CA	4	8	1018600	1018607	50 %	0 %	0 %	50 %	440223904
21719	NC_020062	AGA	2	6	1018644	1018649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223904
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21722	NC_020062	TGCT	2	8	1018854	1018861	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21723	NC_020062	CGG	2	6	1018864	1018869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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21728	NC_020062	TTG	2	6	1019150	1019155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223905
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21730	NC_020062	TCG	2	6	1019199	1019204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223905
21731	NC_020062	GGC	2	6	1019227	1019232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223905
21732	NC_020062	GCTCTT	2	12	1019242	1019253	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440223905
21733	NC_020062	TCG	2	6	1019301	1019306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223905
21734	NC_020062	TCG	2	6	1019327	1019332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223905
21735	NC_020062	TGC	2	6	1019343	1019348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223905
21736	NC_020062	GCTG	2	8	1019355	1019362	0 %	25 %	50 %	25 %	440223905
21737	NC_020062	CCAG	2	8	1019364	1019371	25 %	0 %	25 %	50 %	440223905
21738	NC_020062	CAT	2	6	1019383	1019388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223905
21739	NC_020062	CGCGG	2	10	1019389	1019398	0 %	0 %	60 %	40 %	440223905
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21741	NC_020062	CTG	2	6	1019422	1019427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223905
21742	NC_020062	GTCG	2	8	1019494	1019501	0 %	25 %	50 %	25 %	440223905
21743	NC_020062	AGC	2	6	1019576	1019581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223905
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21745	NC_020062	CGG	2	6	1019643	1019648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223905
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21748	NC_020062	GTA	2	6	1019734	1019739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223905
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21753	NC_020062	GGCC	2	8	1019907	1019914	0 %	0 %	50 %	50 %	440223905
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21758	NC_020062	GC	3	6	1020054	1020059	0 %	0 %	50 %	50 %	440223905
21759	NC_020062	GCA	2	6	1020110	1020115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223905
21760	NC_020062	GCC	2	6	1020134	1020139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223905
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21762	NC_020062	GCCA	2	8	1020184	1020191	25 %	0 %	25 %	50 %	440223905
21763	NC_020062	TCC	2	6	1020199	1020204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21764	NC_020062	TCA	2	6	1020239	1020244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21765	NC_020062	ATG	2	6	1020259	1020264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21766	NC_020062	CAG	2	6	1020272	1020277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21767	NC_020062	ATG	2	6	1020308	1020313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223906
21768	NC_020062	ACG	2	6	1020314	1020319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223906
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21809	NC_020062	TTG	2	6	1021957	1021962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21818	NC_020062	TGA	2	6	1022618	1022623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223908
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21828	NC_020062	CGG	2	6	1022933	1022938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223908
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21830	NC_020062	CAGC	2	8	1023014	1023021	25 %	0 %	25 %	50 %	440223908
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21832	NC_020062	CCT	2	6	1023050	1023055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223908
21833	NC_020062	T	6	6	1023128	1023133	0 %	100 %	0 %	0 %	440223908
21834	NC_020062	AGGC	2	8	1023156	1023163	25 %	0 %	50 %	25 %	440223908
21835	NC_020062	CAGGG	2	10	1023232	1023241	20 %	0 %	60 %	20 %	440223908
21836	NC_020062	CCA	2	6	1023344	1023349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223908
21837	NC_020062	GCT	2	6	1023423	1023428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223908
21838	NC_020062	CGA	2	6	1023470	1023475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223908
21839	NC_020062	GGTT	2	8	1023503	1023510	0 %	50 %	50 %	0 %	440223908
21840	NC_020062	GTC	2	6	1023520	1023525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223908
21841	NC_020062	GC	3	6	1023618	1023623	0 %	0 %	50 %	50 %	440223908
21842	NC_020062	CAT	2	6	1023644	1023649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223908
21843	NC_020062	GCT	2	6	1023653	1023658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223908
21844	NC_020062	TCG	2	6	1023670	1023675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223908
21845	NC_020062	ATCGCG	2	12	1023699	1023710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223908
21846	NC_020062	CAT	2	6	1023746	1023751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223908
21847	NC_020062	AGTC	2	8	1023804	1023811	25 %	25 %	25 %	25 %	440223908
21848	NC_020062	CGG	2	6	1023816	1023821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223908
21849	NC_020062	GATC	2	8	1023857	1023864	25 %	25 %	25 %	25 %	440223908
21850	NC_020062	GCA	2	6	1023877	1023882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223909
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21862	NC_020062	CGA	2	6	1024699	1024704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223909
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21902	NC_020062	TCGCT	2	10	1026034	1026043	0 %	40 %	20 %	40 %	440223911
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21906	NC_020062	GAC	2	6	1026266	1026271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223911
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21926	NC_020062	CGGC	2	8	1027320	1027327	0 %	0 %	50 %	50 %	440223911
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21932	NC_020062	GCC	2	6	1027634	1027639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223912
21933	NC_020062	CATCGA	2	12	1027806	1027817	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440223912
21934	NC_020062	CGA	2	6	1027848	1027853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223912
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21940	NC_020062	GGGCGT	2	12	1028080	1028091	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	440223912
21941	NC_020062	GC	3	6	1028142	1028147	0 %	0 %	50 %	50 %	440223912
21942	NC_020062	GAC	2	6	1028262	1028267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21943	NC_020062	CTT	2	6	1028279	1028284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21944	NC_020062	ATC	2	6	1028328	1028333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21945	NC_020062	TTC	2	6	1028357	1028362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223913
21946	NC_020062	TTG	2	6	1028381	1028386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223913
21947	NC_020062	TGA	2	6	1028400	1028405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223913
21948	NC_020062	GCC	2	6	1028527	1028532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223913
21949	NC_020062	CGA	3	9	1028574	1028582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223913
21950	NC_020062	CGGC	2	8	1028594	1028601	0 %	0 %	50 %	50 %	440223913
21951	NC_020062	GTC	2	6	1028761	1028766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223913
21952	NC_020062	CGT	2	6	1028772	1028777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223913
21953	NC_020062	CGA	2	6	1028823	1028828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223913
21954	NC_020062	GC	3	6	1028874	1028879	0 %	0 %	50 %	50 %	440223913
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21956	NC_020062	AGGA	2	8	1028957	1028964	50 %	0 %	50 %	0 %	440223913
21957	NC_020062	CTT	2	6	1028986	1028991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223913
21958	NC_020062	TTG	2	6	1029083	1029088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223913
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21960	NC_020062	GAA	2	6	1029169	1029174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223913
21961	NC_020062	TGA	2	6	1029195	1029200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223913
21962	NC_020062	TCC	2	6	1029299	1029304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21963	NC_020062	AGGG	2	8	1029343	1029350	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21964	NC_020062	T	6	6	1029422	1029427	0 %	100 %	0 %	0 %	440223914
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21992	NC_020062	CGC	3	9	1030603	1030611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223915
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21997	NC_020062	CG	3	6	1030769	1030774	0 %	0 %	50 %	50 %	440223915
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