MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_020062	TGC	2	6	918878	918883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19502	NC_020062	CAG	2	6	918903	918908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19503	NC_020062	T	7	7	918992	918998	0 %	100 %	0 %	0 %	440223815
19504	NC_020062	ATCG	2	8	919113	919120	25 %	25 %	25 %	25 %	440223815
19505	NC_020062	CGA	2	6	919131	919136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223815
19506	NC_020062	ACC	2	6	919157	919162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223815
19507	NC_020062	GCG	2	6	919172	919177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223815
19508	NC_020062	GGCA	2	8	919188	919195	25 %	0 %	50 %	25 %	440223815
19509	NC_020062	AAC	2	6	919215	919220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223815
19510	NC_020062	GCC	2	6	919221	919226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223815
19511	NC_020062	AG	3	6	919238	919243	50 %	0 %	50 %	0 %	440223815
19512	NC_020062	TCC	2	6	919248	919253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223815
19513	NC_020062	CAG	2	6	919285	919290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223815
19514	NC_020062	CCT	2	6	919393	919398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223815
19515	NC_020062	GC	4	8	919406	919413	0 %	0 %	50 %	50 %	440223815
19516	NC_020062	CGC	3	9	919411	919419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223815
19517	NC_020062	ACG	2	6	919447	919452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223815
19518	NC_020062	TGG	2	6	919485	919490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19519	NC_020062	CGA	2	6	919518	919523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19520	NC_020062	GC	3	6	919545	919550	0 %	0 %	50 %	50 %	440223816
19521	NC_020062	TTC	2	6	919553	919558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223816
19522	NC_020062	CGT	2	6	919569	919574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223816
19523	NC_020062	CGA	2	6	919590	919595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223816
19524	NC_020062	TGCG	2	8	919631	919638	0 %	25 %	50 %	25 %	440223816
19525	NC_020062	GCC	2	6	919754	919759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223816
19526	NC_020062	CGA	2	6	919776	919781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223816
19527	NC_020062	TGT	2	6	919792	919797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223816
19528	NC_020062	GCG	2	6	919808	919813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223816
19529	NC_020062	TCG	2	6	919901	919906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223816
19530	NC_020062	CGC	2	6	919920	919925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223816
19531	NC_020062	ATCC	2	8	919927	919934	25 %	25 %	0 %	50 %	440223816
19532	NC_020062	GAT	2	6	920014	920019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223816
19533	NC_020062	TCG	3	9	920037	920045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223816
19534	NC_020062	GAA	2	6	920067	920072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223816
19535	NC_020062	TTG	2	6	920099	920104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223816
19536	NC_020062	GTG	2	6	920111	920116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223816
19537	NC_020062	GC	3	6	920387	920392	0 %	0 %	50 %	50 %	440223816
19538	NC_020062	GAA	2	6	920395	920400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223816
19539	NC_020062	GCC	2	6	920542	920547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223816
19540	NC_020062	CTC	2	6	920551	920556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223816
19541	NC_020062	CAG	2	6	920572	920577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223816
19542	NC_020062	CATC	2	8	920595	920602	25 %	25 %	0 %	50 %	440223816
19543	NC_020062	AGC	2	6	920615	920620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223816
19544	NC_020062	GGC	2	6	920647	920652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223816
19545	NC_020062	CTG	2	6	920689	920694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223816
19546	NC_020062	CATTT	2	10	920821	920830	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19547	NC_020062	GTC	2	6	920839	920844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19548	NC_020062	CTT	2	6	920846	920851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19549	NC_020062	TGC	2	6	920883	920888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19550	NC_020062	CGAT	2	8	920913	920920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19551	NC_020062	GCTCG	2	10	920944	920953	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19552	NC_020062	GC	3	6	920984	920989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19553	NC_020062	AGG	2	6	921178	921183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223817
19554	NC_020062	GGC	2	6	921245	921250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223817
19555	NC_020062	TGCGT	2	10	921262	921271	0 %	40 %	40 %	20 %	440223817
19556	NC_020062	GAA	2	6	921298	921303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223817
19557	NC_020062	AG	3	6	921369	921374	50 %	0 %	50 %	0 %	440223817
19558	NC_020062	GAG	2	6	921409	921414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223817
19559	NC_020062	AGC	2	6	921480	921485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223817
19560	NC_020062	T	8	8	921547	921554	0 %	100 %	0 %	0 %	440223817
19561	NC_020062	ATT	2	6	921561	921566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223817
19562	NC_020062	CAT	2	6	921583	921588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19563	NC_020062	ACCG	2	8	921642	921649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19564	NC_020062	CGC	2	6	921769	921774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19565	NC_020062	A	6	6	921785	921790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19566	NC_020062	AT	3	6	921840	921845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19567	NC_020062	GAA	2	6	921897	921902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223818
19568	NC_020062	ACC	2	6	921917	921922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223818
19569	NC_020062	CCT	2	6	921938	921943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223818
19570	NC_020062	TTC	2	6	921951	921956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223818
19571	NC_020062	AACGG	2	10	921957	921966	40 %	0 %	40 %	20 %	440223818
19572	NC_020062	CG	3	6	921989	921994	0 %	0 %	50 %	50 %	440223818
19573	NC_020062	GGCC	2	8	922025	922032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19574	NC_020062	GGCC	2	8	922047	922054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19575	NC_020062	CGG	2	6	922125	922130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223819
19576	NC_020062	CG	4	8	922155	922162	0 %	0 %	50 %	50 %	440223819
19577	NC_020062	GCAA	2	8	922184	922191	50 %	0 %	25 %	25 %	440223819
19578	NC_020062	CGTT	2	8	922242	922249	0 %	50 %	25 %	25 %	440223819
19579	NC_020062	TTG	2	6	922259	922264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223819
19580	NC_020062	GCT	2	6	922284	922289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223819
19581	NC_020062	AGC	2	6	922352	922357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223819
19582	NC_020062	CGT	2	6	922366	922371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223819
19583	NC_020062	CGT	2	6	922405	922410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223819
19584	NC_020062	GCGTC	2	10	922437	922446	0 %	20 %	40 %	40 %	440223819
19585	NC_020062	CTG	2	6	922453	922458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223819
19586	NC_020062	TCG	2	6	922466	922471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223819
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19588	NC_020062	CGG	2	6	922624	922629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223819
19589	NC_020062	GAA	2	6	922665	922670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223819
19590	NC_020062	GGAT	2	8	922780	922787	25 %	25 %	50 %	0 %	440223819
19591	NC_020062	ATA	2	6	922798	922803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223819
19592	NC_020062	CCG	2	6	922856	922861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223819
19593	NC_020062	AT	3	6	922925	922930	50 %	50 %	0 %	0 %	440223819
19594	NC_020062	TCG	2	6	922932	922937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223819
19595	NC_020062	TCGT	2	8	923033	923040	0 %	50 %	25 %	25 %	440223819
19596	NC_020062	TCA	2	6	923142	923147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223819
19597	NC_020062	GCGG	2	8	923148	923155	0 %	0 %	75 %	25 %	440223819
19598	NC_020062	CAGC	2	8	923234	923241	25 %	0 %	25 %	50 %	440223819
19599	NC_020062	GAT	2	6	923284	923289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223819
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19601	NC_020062	GGC	2	6	923348	923353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19602	NC_020062	GTT	2	6	923355	923360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19603	NC_020062	CGC	2	6	923384	923389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223820
19604	NC_020062	ATG	2	6	923412	923417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223820
19605	NC_020062	GC	3	6	923476	923481	0 %	0 %	50 %	50 %	440223820
19606	NC_020062	TCAC	2	8	923550	923557	25 %	25 %	0 %	50 %	440223820
19607	NC_020062	TTG	2	6	923604	923609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223820
19608	NC_020062	GGC	2	6	923621	923626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223820
19609	NC_020062	GGCG	2	8	923642	923649	0 %	0 %	75 %	25 %	440223820
19610	NC_020062	GCC	2	6	923671	923676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223820
19611	NC_020062	GTC	2	6	923703	923708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223820
19612	NC_020062	TCG	2	6	923778	923783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223820
19613	NC_020062	TGC	2	6	923788	923793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223820
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19617	NC_020062	CTT	2	6	923957	923962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223820
19618	NC_020062	AATG	2	8	923965	923972	50 %	25 %	25 %	0 %	440223820
19619	NC_020062	CTTCT	2	10	923984	923993	0 %	60 %	0 %	40 %	440223820
19620	NC_020062	CG	3	6	924004	924009	0 %	0 %	50 %	50 %	440223820
19621	NC_020062	TGC	2	6	924043	924048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223820
19622	NC_020062	TGCT	2	8	924132	924139	0 %	50 %	25 %	25 %	440223820
19623	NC_020062	TAT	2	6	924169	924174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223820
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19626	NC_020062	CGA	2	6	924630	924635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223821
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19864	NC_020062	TGA	3	9	935451	935459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19867	NC_020062	TTC	2	6	935565	935570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223829
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19981	NC_020062	GGC	2	6	940382	940387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223834
19982	NC_020062	GGCC	2	8	940411	940418	0 %	0 %	50 %	50 %	440223834
19983	NC_020062	CAT	2	6	940468	940473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223834
19984	NC_020062	GCT	2	6	940480	940485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223834
19985	NC_020062	ACCTCA	2	12	940491	940502	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	440223834
19986	NC_020062	CCG	2	6	940507	940512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223834
19987	NC_020062	GTC	2	6	940568	940573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223834
19988	NC_020062	TTG	2	6	940650	940655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223834
19989	NC_020062	AAG	2	6	940661	940666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223834
19990	NC_020062	CAC	2	6	940684	940689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223834
19991	NC_020062	CGGC	2	8	940692	940699	0 %	0 %	50 %	50 %	440223834
19992	NC_020062	ACC	2	6	940703	940708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223834
19993	NC_020062	TCT	2	6	940717	940722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223834
19994	NC_020062	GAA	2	6	940763	940768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223834
19995	NC_020062	GA	3	6	940834	940839	50 %	0 %	50 %	0 %	440223834
19996	NC_020062	GAT	2	6	940970	940975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223835
19997	NC_020062	TGA	2	6	940977	940982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223835
19998	NC_020062	GGC	2	6	940991	940996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223835
19999	NC_020062	CAC	2	6	941027	941032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223835
20000	NC_020062	CAG	2	6	941139	941144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835

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