MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_020062	GC	3	6	894412	894417	0 %	0 %	50 %	50 %	440223790
19002	NC_020062	TGA	2	6	894443	894448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223790
19003	NC_020062	TGC	2	6	894492	894497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223790
19004	NC_020062	TCC	2	6	894505	894510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223790
19005	NC_020062	AGCCAA	2	12	894627	894638	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	440223790
19006	NC_020062	AGC	2	6	894664	894669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223790
19007	NC_020062	TC	3	6	894759	894764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19008	NC_020062	AGT	2	6	894773	894778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19009	NC_020062	CCT	2	6	894806	894811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19010	NC_020062	TGC	2	6	894825	894830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19011	NC_020062	CGCGTC	2	12	894846	894857	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19012	NC_020062	GCT	2	6	894914	894919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223791
19013	NC_020062	TCG	2	6	894958	894963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223791
19014	NC_020062	GGC	2	6	894993	894998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223791
19015	NC_020062	GTC	2	6	895044	895049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223791
19016	NC_020062	CAA	2	6	895052	895057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223791
19017	NC_020062	TGT	2	6	895061	895066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223791
19018	NC_020062	CGA	2	6	895067	895072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223791
19019	NC_020062	CCG	2	6	895276	895281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223791
19020	NC_020062	TGC	2	6	895313	895318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223791
19021	NC_020062	GCGG	2	8	895321	895328	0 %	0 %	75 %	25 %	440223791
19022	NC_020062	CAT	2	6	895340	895345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223791
19023	NC_020062	GCC	2	6	895356	895361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223791
19024	NC_020062	CGG	2	6	895379	895384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223791
19025	NC_020062	CCG	2	6	895399	895404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223791
19026	NC_020062	CCG	2	6	895426	895431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223791
19027	NC_020062	TGCGCC	2	12	895609	895620	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440223791
19028	NC_020062	GGC	2	6	895650	895655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223791
19029	NC_020062	AGG	2	6	895660	895665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223791
19030	NC_020062	GTC	2	6	895716	895721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223791
19031	NC_020062	GCT	2	6	895724	895729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223791
19032	NC_020062	GCA	2	6	895857	895862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19033	NC_020062	CGC	2	6	895872	895877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19034	NC_020062	GA	3	6	895938	895943	50 %	0 %	50 %	0 %	440223792
19035	NC_020062	GAC	2	6	895976	895981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223792
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19037	NC_020062	GCA	2	6	896041	896046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223792
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19039	NC_020062	TCG	2	6	896170	896175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223792
19040	NC_020062	CGT	2	6	896204	896209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223792
19041	NC_020062	GTT	2	6	896225	896230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223792
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19043	NC_020062	TCA	2	6	896263	896268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223792
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19045	NC_020062	CGGC	2	8	896362	896369	0 %	0 %	50 %	50 %	440223792
19046	NC_020062	TTG	2	6	896385	896390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223792
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19052	NC_020062	GAC	2	6	896555	896560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223792
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19054	NC_020062	T	6	6	896640	896645	0 %	100 %	0 %	0 %	440223792
19055	NC_020062	GAT	2	6	896652	896657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223792
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19057	NC_020062	CGG	2	6	896819	896824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223793
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19062	NC_020062	TTG	2	6	897083	897088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223793
19063	NC_020062	ACGC	2	8	897100	897107	25 %	0 %	25 %	50 %	440223793
19064	NC_020062	ATGCCA	2	12	897125	897136	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440223793
19065	NC_020062	TCG	2	6	897227	897232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223793
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19067	NC_020062	TCGGCC	2	12	897383	897394	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440223793
19068	NC_020062	GGC	2	6	897409	897414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223793
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19071	NC_020062	TCGGC	2	10	897579	897588	0 %	20 %	40 %	40 %	440223793
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19073	NC_020062	TCCG	2	8	897703	897710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19074	NC_020062	CAGG	2	8	897725	897732	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19075	NC_020062	GATC	2	8	897793	897800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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19087	NC_020062	GGC	2	6	898330	898335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223794
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19103	NC_020062	GC	3	6	899103	899108	0 %	0 %	50 %	50 %	440223795
19104	NC_020062	CGG	2	6	899195	899200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223795
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19109	NC_020062	GCGCC	2	10	899416	899425	0 %	0 %	40 %	60 %	440223796
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19119	NC_020062	TGC	3	9	899897	899905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223796
19120	NC_020062	TCG	3	9	899919	899927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223796
19121	NC_020062	CGA	2	6	899938	899943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223796
19122	NC_020062	CGT	2	6	899959	899964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223796
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19143	NC_020062	TGCT	2	8	901236	901243	0 %	50 %	25 %	25 %	440223797
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19151	NC_020062	GCC	2	6	901591	901596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19152	NC_020062	ATC	2	6	901601	901606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19185	NC_020062	GC	3	6	903225	903230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19239	NC_020062	GGC	2	6	905829	905834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223803
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19241	NC_020062	GCC	2	6	905858	905863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223803
19242	NC_020062	GGC	3	9	906021	906029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223803
19243	NC_020062	GCC	2	6	906070	906075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223803
19244	NC_020062	TC	3	6	906178	906183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19245	NC_020062	CTG	2	6	906248	906253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223804
19246	NC_020062	T	6	6	906340	906345	0 %	100 %	0 %	0 %	440223804
19247	NC_020062	TGC	2	6	906367	906372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19248	NC_020062	AT	3	6	906435	906440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19249	NC_020062	CTG	2	6	906474	906479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19251	NC_020062	AAT	2	6	906685	906690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19288	NC_020062	TCGG	2	8	909265	909272	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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19354	NC_020062	TGCC	2	8	912081	912088	0 %	25 %	25 %	50 %	440223809
19355	NC_020062	TCG	2	6	912146	912151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223809
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19358	NC_020062	GC	3	6	912309	912314	0 %	0 %	50 %	50 %	440223809
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19397	NC_020062	AAT	2	6	914243	914248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19452	NC_020062	GGT	2	6	916743	916748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19454	NC_020062	GAT	2	6	916817	916822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19468	NC_020062	ATC	2	6	917353	917358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223813
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19470	NC_020062	CGT	2	6	917397	917402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223813
19471	NC_020062	CGA	2	6	917448	917453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223813
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19473	NC_020062	ATC	2	6	917608	917613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223813
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19478	NC_020062	GGC	2	6	917724	917729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223813
19479	NC_020062	GAC	2	6	917758	917763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223813
19480	NC_020062	GC	3	6	917777	917782	0 %	0 %	50 %	50 %	440223813
19481	NC_020062	CGG	2	6	917805	917810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223813
19482	NC_020062	GCC	2	6	917842	917847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223813
19483	NC_020062	CGA	2	6	917859	917864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223813
19484	NC_020062	TGCCGA	2	12	917871	917882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223813
19485	NC_020062	TCG	3	9	917885	917893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223813
19486	NC_020062	GCG	2	6	917965	917970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223813
19487	NC_020062	TG	3	6	918050	918055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19488	NC_020062	TTGGC	2	10	918102	918111	0 %	40 %	40 %	20 %	440223814
19489	NC_020062	GTT	2	6	918177	918182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223814
19490	NC_020062	GAA	2	6	918273	918278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223814
19491	NC_020062	GGC	2	6	918288	918293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223814
19492	NC_020062	GCC	2	6	918473	918478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223814
19493	NC_020062	CGTC	2	8	918569	918576	0 %	25 %	25 %	50 %	440223814
19494	NC_020062	CGG	2	6	918599	918604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223814
19495	NC_020062	AGG	2	6	918619	918624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223814
19496	NC_020062	CTT	2	6	918666	918671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223814
19497	NC_020062	ATC	2	6	918703	918708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223814
19498	NC_020062	CGA	2	6	918769	918774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19499	NC_020062	CTG	2	6	918861	918866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19500	NC_020062	ATA	2	6	918867	918872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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