MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_020062	GGC	2	6	825764	825769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223720
17502	NC_020062	TGT	2	6	825801	825806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223720
17503	NC_020062	GAT	2	6	825828	825833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223720
17504	NC_020062	GCG	2	6	825839	825844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223720
17505	NC_020062	GTG	2	6	825864	825869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223720
17506	NC_020062	CGC	2	6	825911	825916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223720
17507	NC_020062	GCC	2	6	825934	825939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223720
17508	NC_020062	TTC	2	6	825954	825959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223720
17509	NC_020062	CGG	2	6	826098	826103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223720
17510	NC_020062	GTCCTT	2	12	826206	826217	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440223720
17511	NC_020062	GAA	2	6	826218	826223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223720
17512	NC_020062	GCC	2	6	826228	826233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223720
17513	NC_020062	ATG	2	6	826314	826319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223720
17514	NC_020062	CGCA	2	8	826335	826342	25 %	0 %	25 %	50 %	440223720
17515	NC_020062	CGTC	2	8	826364	826371	0 %	25 %	25 %	50 %	440223720
17516	NC_020062	GC	3	6	826402	826407	0 %	0 %	50 %	50 %	440223720
17517	NC_020062	TCC	2	6	826501	826506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17518	NC_020062	GGC	2	6	826530	826535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17519	NC_020062	GCC	2	6	826539	826544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223721
17520	NC_020062	TGG	2	6	826568	826573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223721
17521	NC_020062	CGC	2	6	826619	826624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223721
17522	NC_020062	CCG	2	6	826654	826659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223721
17523	NC_020062	GACG	2	8	826676	826683	25 %	0 %	50 %	25 %	440223721
17524	NC_020062	GAT	2	6	826718	826723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223721
17525	NC_020062	CG	3	6	826737	826742	0 %	0 %	50 %	50 %	440223721
17526	NC_020062	TTC	2	6	826857	826862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223721
17527	NC_020062	GTT	2	6	826881	826886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223721
17528	NC_020062	AGC	2	6	826916	826921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223721
17529	NC_020062	CGC	2	6	826946	826951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223721
17530	NC_020062	CGG	2	6	826952	826957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223721
17531	NC_020062	CTT	2	6	827004	827009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223721
17532	NC_020062	CGA	2	6	827036	827041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223721
17533	NC_020062	CGA	2	6	827093	827098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223721
17534	NC_020062	CAG	2	6	827133	827138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223721
17535	NC_020062	CGG	2	6	827189	827194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223721
17536	NC_020062	CGG	2	6	827198	827203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223721
17537	NC_020062	ATCGGC	2	12	827214	827225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223721
17538	NC_020062	GCC	2	6	827247	827252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223721
17539	NC_020062	ATC	2	6	827299	827304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223721
17540	NC_020062	GCG	2	6	827462	827467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223721
17541	NC_020062	CGG	2	6	827501	827506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223721
17542	NC_020062	TGA	2	6	827561	827566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223721
17543	NC_020062	CG	3	6	827588	827593	0 %	0 %	50 %	50 %	440223721
17544	NC_020062	GAA	2	6	827661	827666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223721
17545	NC_020062	CCGCG	2	10	827678	827687	0 %	0 %	40 %	60 %	440223721
17546	NC_020062	GGC	2	6	827691	827696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223721
17547	NC_020062	CGA	2	6	827765	827770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223721
17548	NC_020062	GC	3	6	827802	827807	0 %	0 %	50 %	50 %	440223721
17549	NC_020062	GGC	2	6	827838	827843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223721
17550	NC_020062	GCG	2	6	827857	827862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223721
17551	NC_020062	CGAT	2	8	827863	827870	25 %	25 %	25 %	25 %	440223721
17552	NC_020062	CAT	2	6	827945	827950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223721
17553	NC_020062	GCAC	2	8	827953	827960	25 %	0 %	25 %	50 %	440223721
17554	NC_020062	GTC	2	6	828075	828080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17555	NC_020062	CAGCT	2	10	828135	828144	20 %	20 %	20 %	40 %	440223722
17556	NC_020062	GCG	2	6	828184	828189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223722
17557	NC_020062	G	6	6	828199	828204	0 %	0 %	100 %	0 %	440223722
17558	NC_020062	CGG	2	6	828220	828225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223722
17559	NC_020062	CTT	2	6	828248	828253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223722
17560	NC_020062	CGA	2	6	828295	828300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223722
17561	NC_020062	GC	3	6	828351	828356	0 %	0 %	50 %	50 %	440223722
17562	NC_020062	CAG	2	6	828404	828409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223722
17563	NC_020062	GC	3	6	828421	828426	0 %	0 %	50 %	50 %	440223722
17564	NC_020062	TCC	2	6	828486	828491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17565	NC_020062	TTAT	2	8	828499	828506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17566	NC_020062	AT	3	6	828642	828647	50 %	50 %	0 %	0 %	440223723
17567	NC_020062	GCA	3	9	828658	828666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223723
17568	NC_020062	AGGC	2	8	828674	828681	25 %	0 %	50 %	25 %	440223723
17569	NC_020062	GTC	2	6	828783	828788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223723
17570	NC_020062	TCG	2	6	828822	828827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223723
17571	NC_020062	GTTCGC	2	12	828923	828934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223723
17572	NC_020062	TCG	2	6	828951	828956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223723
17573	NC_020062	GAT	2	6	828974	828979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223723
17574	NC_020062	AGC	2	6	829038	829043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223723
17575	NC_020062	GCG	2	6	829064	829069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223723
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17579	NC_020062	CAC	2	6	829217	829222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223723
17580	NC_020062	TGC	2	6	829230	829235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223723
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17585	NC_020062	TCA	2	6	829453	829458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223723
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17587	NC_020062	CGT	2	6	829579	829584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223724
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17589	NC_020062	GGGC	2	8	829631	829638	0 %	0 %	75 %	25 %	440223724
17590	NC_020062	CGC	2	6	829684	829689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223724
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17593	NC_020062	CGC	2	6	830005	830010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223724
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17599	NC_020062	GCC	2	6	830375	830380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223724
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17603	NC_020062	CG	3	6	830643	830648	0 %	0 %	50 %	50 %	440223724
17604	NC_020062	CCA	2	6	830656	830661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223724
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17606	NC_020062	C	6	6	830749	830754	0 %	0 %	0 %	100 %	440223724
17607	NC_020062	GTC	2	6	830771	830776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223724
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17609	NC_020062	GC	3	6	830816	830821	0 %	0 %	50 %	50 %	440223724
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17619	NC_020062	TTC	2	6	831133	831138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223725
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17621	NC_020062	GCT	2	6	831200	831205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223725
17622	NC_020062	GCG	2	6	831206	831211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223725
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17725	NC_020062	GAT	2	6	835185	835190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17727	NC_020062	TCG	2	6	835302	835307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223729
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17741	NC_020062	TCA	2	6	835959	835964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223729
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17761	NC_020062	CGC	2	6	836774	836779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223730
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17859	NC_020062	CGG	2	6	841318	841323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223733
17860	NC_020062	GGC	2	6	841327	841332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223733
17861	NC_020062	ATG	2	6	841363	841368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223733
17862	NC_020062	CGGG	2	8	841379	841386	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17863	NC_020062	GATC	2	8	841413	841420	25 %	25 %	25 %	25 %	440223734
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17870	NC_020062	GAT	2	6	841719	841724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223734
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17882	NC_020062	GCAT	2	8	842152	842159	25 %	25 %	25 %	25 %	440223734
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17952	NC_020062	AGTG	2	8	845970	845977	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17978	NC_020062	GCA	2	6	847074	847079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17979	NC_020062	GCC	2	6	847170	847175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17980	NC_020062	CG	3	6	847210	847215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17981	NC_020062	CATCTC	2	12	847273	847284	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17982	NC_020062	CAG	2	6	847285	847290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17983	NC_020062	CGC	2	6	847421	847426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17984	NC_020062	CGT	2	6	847461	847466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17985	NC_020062	GGC	2	6	847485	847490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17986	NC_020062	GC	3	6	847489	847494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17987	NC_020062	CCG	3	9	847550	847558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17988	NC_020062	GATC	2	8	847578	847585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17989	NC_020062	CGG	2	6	847605	847610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17990	NC_020062	GTC	2	6	847612	847617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17991	NC_020062	AGCGCG	2	12	847823	847834	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17992	NC_020062	GTG	2	6	848002	848007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17993	NC_020062	GAC	2	6	848015	848020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17994	NC_020062	TGC	2	6	848057	848062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223743
17995	NC_020062	TGA	2	6	848071	848076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223743
17996	NC_020062	ATC	2	6	848081	848086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223743
17997	NC_020062	AGC	3	9	848157	848165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223743
17998	NC_020062	CGT	3	9	848188	848196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223743
17999	NC_020062	CGA	2	6	848209	848214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223743
18000	NC_020062	TGC	2	6	848283	848288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223743

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