MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

< Previous12...2930313233343536373839...8990Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_020062	GCC	2	6	779544	779549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223676
16502	NC_020062	GCG	3	9	779605	779613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223676
16503	NC_020062	CGG	2	6	779630	779635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223676
16504	NC_020062	CGA	2	6	779672	779677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223676
16505	NC_020062	GCC	2	6	779721	779726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223676
16506	NC_020062	ACG	2	6	779728	779733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223676
16507	NC_020062	GCA	2	6	779771	779776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223676
16508	NC_020062	CTC	2	6	779883	779888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223676
16509	NC_020062	AGA	2	6	779891	779896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223676
16510	NC_020062	TCG	2	6	779986	779991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223676
16511	NC_020062	AGT	2	6	780017	780022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223676
16512	NC_020062	GAC	2	6	780036	780041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223676
16513	NC_020062	AGC	2	6	780138	780143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223676
16514	NC_020062	CCG	2	6	780202	780207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223676
16515	NC_020062	AGC	2	6	780208	780213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223676
16516	NC_020062	GA	3	6	780244	780249	50 %	0 %	50 %	0 %	440223676
16517	NC_020062	GC	3	6	780293	780298	0 %	0 %	50 %	50 %	440223676
16518	NC_020062	CGG	2	6	780300	780305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223676
16519	NC_020062	CGG	2	6	780396	780401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223676
16520	NC_020062	CG	3	6	780479	780484	0 %	0 %	50 %	50 %	440223676
16521	NC_020062	ATCTT	2	10	780532	780541	20 %	60 %	0 %	20 %	440223676
16522	NC_020062	CGC	2	6	780704	780709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223677
16523	NC_020062	TGA	2	6	780882	780887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223677
16524	NC_020062	TCG	2	6	780977	780982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223677
16525	NC_020062	CG	3	6	780993	780998	0 %	0 %	50 %	50 %	440223677
16526	NC_020062	CGATGC	2	12	781020	781031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223677
16527	NC_020062	GCTGGC	2	12	781032	781043	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440223677
16528	NC_020062	TCG	2	6	781121	781126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223677
16529	NC_020062	GAT	2	6	781171	781176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223677
16530	NC_020062	GAGC	2	8	781201	781208	25 %	0 %	50 %	25 %	440223677
16531	NC_020062	GC	3	6	781243	781248	0 %	0 %	50 %	50 %	440223677
16532	NC_020062	GCC	2	6	781250	781255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223677
16533	NC_020062	CGGCG	2	10	781299	781308	0 %	0 %	60 %	40 %	440223677
16534	NC_020062	TCG	2	6	781362	781367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223677
16535	NC_020062	CGA	2	6	781389	781394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223677
16536	NC_020062	CG	3	6	781407	781412	0 %	0 %	50 %	50 %	440223677
16537	NC_020062	CAT	2	6	781431	781436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223677
16538	NC_020062	GCT	3	9	781493	781501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223677
16539	NC_020062	CCTT	2	8	781536	781543	0 %	50 %	0 %	50 %	440223677
16540	NC_020062	ATC	2	6	781582	781587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223677
16541	NC_020062	CGT	2	6	781656	781661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223677
16542	NC_020062	TGA	2	6	781695	781700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223677
16543	NC_020062	GTC	2	6	781763	781768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223677
16544	NC_020062	TCG	2	6	781790	781795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223677
16545	NC_020062	GCC	2	6	781855	781860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223677
16546	NC_020062	ACCG	2	8	781999	782006	25 %	0 %	25 %	50 %	440223677
16547	NC_020062	CGC	2	6	782128	782133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223677
16548	NC_020062	CGG	2	6	782151	782156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223677
16549	NC_020062	CGA	2	6	782175	782180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223677
16550	NC_020062	CGA	2	6	782229	782234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223677
16551	NC_020062	GA	3	6	782267	782272	50 %	0 %	50 %	0 %	440223677
16552	NC_020062	CG	3	6	782281	782286	0 %	0 %	50 %	50 %	440223677
16553	NC_020062	GGGC	2	8	782342	782349	0 %	0 %	75 %	25 %	440223677
16554	NC_020062	TGT	2	6	782389	782394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223678
16555	NC_020062	GAC	2	6	782453	782458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223678
16556	NC_020062	GCA	3	9	782521	782529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223678
16557	NC_020062	CGG	2	6	782546	782551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223678
16558	NC_020062	AGGA	2	8	782568	782575	50 %	0 %	50 %	0 %	440223678
16559	NC_020062	ATC	2	6	782595	782600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223678
16560	NC_020062	CGGCA	2	10	782603	782612	20 %	0 %	40 %	40 %	440223678
16561	NC_020062	GAT	2	6	782627	782632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223678
16562	NC_020062	TGGC	2	8	782634	782641	0 %	25 %	50 %	25 %	440223678
16563	NC_020062	GCA	2	6	782650	782655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223678
16564	NC_020062	GAT	2	6	782666	782671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223678
16565	NC_020062	CGA	2	6	782707	782712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223678
16566	NC_020062	TTC	2	6	782714	782719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223678
16567	NC_020062	GAT	2	6	782786	782791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223678
16568	NC_020062	ATC	2	6	782796	782801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223678
16569	NC_020062	AT	3	6	782802	782807	50 %	50 %	0 %	0 %	440223678
16570	NC_020062	GCC	2	6	782814	782819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223678
16571	NC_020062	GCC	2	6	782841	782846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223678
16572	NC_020062	TCG	2	6	782866	782871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223678
16573	NC_020062	ACA	2	6	782878	782883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223678
16574	NC_020062	GAA	2	6	782906	782911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223678
16575	NC_020062	CCG	2	6	782922	782927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223678
16576	NC_020062	TCC	2	6	782942	782947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223678
16577	NC_020062	GAA	2	6	782972	782977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223678
16578	NC_020062	CGA	2	6	782983	782988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223678
16579	NC_020062	GC	3	6	783010	783015	0 %	0 %	50 %	50 %	440223678
16580	NC_020062	GCCGA	2	10	783044	783053	20 %	0 %	40 %	40 %	440223678
16581	NC_020062	CAG	2	6	783065	783070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223678
16582	NC_020062	GATG	2	8	783103	783110	25 %	25 %	50 %	0 %	440223678
16583	NC_020062	TAG	2	6	783240	783245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223678
16584	NC_020062	A	6	6	783279	783284	100 %	0 %	0 %	0 %	440223678
16585	NC_020062	GCG	2	6	783295	783300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223678
16586	NC_020062	CTG	2	6	783323	783328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223678
16587	NC_020062	ACG	2	6	783390	783395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223678
16588	NC_020062	GGC	2	6	783418	783423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223678
16589	NC_020062	CCA	2	6	783431	783436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223678
16590	NC_020062	TGCGG	2	10	783461	783470	0 %	20 %	60 %	20 %	440223678
16591	NC_020062	GCT	2	6	783508	783513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16592	NC_020062	CGA	2	6	783538	783543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223679
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16594	NC_020062	GCG	2	6	783655	783660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223679
16595	NC_020062	CCG	2	6	783661	783666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223679
16596	NC_020062	ACG	3	9	783690	783698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223679
16597	NC_020062	GCA	2	6	783718	783723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223679
16598	NC_020062	TGG	2	6	783733	783738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223679
16599	NC_020062	CAG	2	6	783779	783784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223679
16600	NC_020062	CG	3	6	783806	783811	0 %	0 %	50 %	50 %	440223679
16601	NC_020062	CGT	2	6	783815	783820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223679
16602	NC_020062	TCG	2	6	783840	783845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223679
16603	NC_020062	GC	3	6	783855	783860	0 %	0 %	50 %	50 %	440223679
16604	NC_020062	GAAGA	2	10	783975	783984	60 %	0 %	40 %	0 %	440223679
16605	NC_020062	CCG	2	6	783987	783992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223679
16606	NC_020062	AGGA	2	8	784044	784051	50 %	0 %	50 %	0 %	440223679
16607	NC_020062	AAT	2	6	784090	784095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223679
16608	NC_020062	CGG	2	6	784117	784122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223679
16609	NC_020062	GCT	2	6	784225	784230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223679
16610	NC_020062	CGC	2	6	784255	784260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223679
16611	NC_020062	ACC	2	6	784356	784361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223679
16612	NC_020062	GTC	2	6	784392	784397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223679
16613	NC_020062	GGGAT	2	10	784456	784465	20 %	20 %	60 %	0 %	440223679
16614	NC_020062	GCC	2	6	784554	784559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16615	NC_020062	GGC	2	6	784567	784572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16616	NC_020062	GAA	3	9	784597	784605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223680
16617	NC_020062	GGCC	2	8	784618	784625	0 %	0 %	50 %	50 %	440223680
16618	NC_020062	GCT	2	6	784653	784658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223680
16619	NC_020062	TTG	2	6	784679	784684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223680
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16859	NC_020062	TCT	2	6	796104	796109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223690
16860	NC_020062	GCTG	2	8	796120	796127	0 %	25 %	50 %	25 %	440223690
16861	NC_020062	CTG	2	6	796142	796147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223690
16862	NC_020062	GCAT	2	8	796179	796186	25 %	25 %	25 %	25 %	440223690
16863	NC_020062	GCT	2	6	796213	796218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223690
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16874	NC_020062	TTC	2	6	796730	796735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223690
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16979	NC_020062	CCG	2	6	801597	801602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223697
16980	NC_020062	CGGC	2	8	801761	801768	0 %	0 %	50 %	50 %	440223697
16981	NC_020062	TTTC	2	8	801829	801836	0 %	75 %	0 %	25 %	440223697
16982	NC_020062	TC	3	6	801921	801926	0 %	50 %	0 %	50 %	440223697
16983	NC_020062	CG	3	6	801981	801986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16986	NC_020062	CGC	2	6	802147	802152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223698
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16992	NC_020062	TCGA	2	8	802362	802369	25 %	25 %	25 %	25 %	440223698
16993	NC_020062	CGT	2	6	802376	802381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223698
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16999	NC_020062	TGGT	2	8	802485	802492	0 %	50 %	50 %	0 %	440223698
17000	NC_020062	CG	3	6	802499	802504	0 %	0 %	50 %	50 %	440223698

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