MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_020062	GCT	2	6	755824	755829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223653
16003	NC_020062	C	6	6	755924	755929	0 %	0 %	0 %	100 %	440223653
16004	NC_020062	CAG	2	6	755961	755966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223653
16005	NC_020062	TCC	2	6	755998	756003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16006	NC_020062	CCG	2	6	756103	756108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16007	NC_020062	TCGA	2	8	756173	756180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16008	NC_020062	GAGG	2	8	756255	756262	25 %	0 %	75 %	0 %	440223654
16009	NC_020062	CGG	2	6	756295	756300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223654
16010	NC_020062	GCCG	2	8	756304	756311	0 %	0 %	50 %	50 %	440223654
16011	NC_020062	GAT	2	6	756365	756370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223654
16012	NC_020062	GGC	2	6	756378	756383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223654
16013	NC_020062	GCGG	2	8	756411	756418	0 %	0 %	75 %	25 %	440223654
16014	NC_020062	GC	4	8	756491	756498	0 %	0 %	50 %	50 %	440223654
16015	NC_020062	TTC	2	6	756660	756665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223654
16016	NC_020062	CTGG	2	8	756680	756687	0 %	25 %	50 %	25 %	440223654
16017	NC_020062	TGG	2	6	756727	756732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223654
16018	NC_020062	TCG	2	6	756841	756846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223654
16019	NC_020062	GC	3	6	756853	756858	0 %	0 %	50 %	50 %	440223654
16020	NC_020062	CAT	2	6	756887	756892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223654
16021	NC_020062	GCG	2	6	756901	756906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223654
16022	NC_020062	TTC	2	6	756909	756914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223654
16023	NC_020062	TCA	2	6	756940	756945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223654
16024	NC_020062	ATCG	2	8	756971	756978	25 %	25 %	25 %	25 %	440223654
16025	NC_020062	CCG	2	6	756994	756999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223654
16026	NC_020062	TCT	2	6	757066	757071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223654
16027	NC_020062	GCT	2	6	757097	757102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223654
16028	NC_020062	CTT	2	6	757148	757153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223654
16029	NC_020062	ATC	2	6	757182	757187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223654
16030	NC_020062	TCG	2	6	757195	757200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223654
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16033	NC_020062	GGCGT	2	10	757365	757374	0 %	20 %	60 %	20 %	440223654
16034	NC_020062	CGT	2	6	757382	757387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223654
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16036	NC_020062	ATC	2	6	757434	757439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223654
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16038	NC_020062	GCCC	2	8	757506	757513	0 %	0 %	25 %	75 %	440223654
16039	NC_020062	GGC	2	6	757694	757699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223654
16040	NC_020062	TGG	2	6	757740	757745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223655
16041	NC_020062	CGG	2	6	757759	757764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223655
16042	NC_020062	AGCG	2	8	757775	757782	25 %	0 %	50 %	25 %	440223655
16043	NC_020062	GCG	2	6	757791	757796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223655
16044	NC_020062	CTG	2	6	757826	757831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223655
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16052	NC_020062	CTG	2	6	758183	758188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223655
16053	NC_020062	GCG	2	6	758279	758284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223655
16054	NC_020062	GTC	2	6	758309	758314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223655
16055	NC_020062	CGT	2	6	758461	758466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223655
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16058	NC_020062	GGGC	2	8	758521	758528	0 %	0 %	75 %	25 %	440223655
16059	NC_020062	CGGC	2	8	758541	758548	0 %	0 %	50 %	50 %	440223655
16060	NC_020062	GCGAC	2	10	758661	758670	20 %	0 %	40 %	40 %	440223655
16061	NC_020062	GCCG	2	8	758696	758703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16062	NC_020062	CGA	3	9	758771	758779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223656
16063	NC_020062	GTTGCC	2	12	758802	758813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223656
16064	NC_020062	CTG	2	6	758925	758930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223656
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16068	NC_020062	TCC	2	6	759001	759006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16069	NC_020062	CTG	2	6	759025	759030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223657
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16073	NC_020062	TGA	2	6	759283	759288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223657
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16091	NC_020062	AATG	2	8	760188	760195	50 %	25 %	25 %	0 %	440223657
16092	NC_020062	GC	3	6	760276	760281	0 %	0 %	50 %	50 %	440223657
16093	NC_020062	TCC	2	6	760336	760341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16094	NC_020062	GATC	2	8	760342	760349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16103	NC_020062	GAGGG	2	10	760915	760924	20 %	0 %	80 %	0 %	440223658
16104	NC_020062	CGA	2	6	760956	760961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223658
16105	NC_020062	TGC	2	6	761013	761018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223658
16106	NC_020062	GAC	2	6	761050	761055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223658
16107	NC_020062	GGCG	2	8	761058	761065	0 %	0 %	75 %	25 %	440223658
16108	NC_020062	TC	3	6	761228	761233	0 %	50 %	0 %	50 %	440223658
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16111	NC_020062	GAGCT	2	10	761263	761272	20 %	20 %	40 %	20 %	440223658
16112	NC_020062	GC	3	6	761323	761328	0 %	0 %	50 %	50 %	440223658
16113	NC_020062	GCAGC	2	10	761374	761383	20 %	0 %	40 %	40 %	440223658
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16119	NC_020062	TCC	2	6	761859	761864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223658
16120	NC_020062	GGC	2	6	761895	761900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223658
16121	NC_020062	TTG	2	6	761944	761949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_020062	AGA	2	6	761953	761958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_020062	TGC	2	6	762004	762009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16124	NC_020062	CGG	2	6	762042	762047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223659
16125	NC_020062	GGC	3	9	762104	762112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223659
16126	NC_020062	CGG	2	6	762140	762145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223659
16127	NC_020062	CGG	2	6	762193	762198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223659
16128	NC_020062	GTT	2	6	762248	762253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223659
16129	NC_020062	TCG	2	6	762258	762263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223659
16130	NC_020062	GCCG	2	8	762275	762282	0 %	0 %	50 %	50 %	440223659
16131	NC_020062	GAT	2	6	762425	762430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223659
16132	NC_020062	CAGCGC	2	12	762500	762511	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440223659
16133	NC_020062	ATG	2	6	762581	762586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223659
16134	NC_020062	CGT	2	6	762625	762630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223659
16135	NC_020062	CCA	2	6	762634	762639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223659
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16139	NC_020062	GCA	2	6	762829	762834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223659
16140	NC_020062	GATG	2	8	762999	763006	25 %	25 %	50 %	0 %	440223660
16141	NC_020062	CAGG	2	8	763069	763076	25 %	0 %	50 %	25 %	440223660
16142	NC_020062	CGC	3	9	763086	763094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223660
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16144	NC_020062	CGA	2	6	763335	763340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223660
16145	NC_020062	CGGT	2	8	763351	763358	0 %	25 %	50 %	25 %	440223660
16146	NC_020062	GC	3	6	763374	763379	0 %	0 %	50 %	50 %	440223660
16147	NC_020062	GCC	2	6	763396	763401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223660
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16149	NC_020062	TCG	3	9	763464	763472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223660
16150	NC_020062	CGC	2	6	763503	763508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223660
16151	NC_020062	TCG	2	6	763550	763555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223660
16152	NC_020062	CGCTGG	2	12	763604	763615	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440223660
16153	NC_020062	CCG	2	6	763616	763621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223660
16154	NC_020062	AGGC	2	8	763633	763640	25 %	0 %	50 %	25 %	440223660
16155	NC_020062	CAG	2	6	763645	763650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223660
16156	NC_020062	GCC	3	9	763670	763678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223660
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16158	NC_020062	CG	3	6	763806	763811	0 %	0 %	50 %	50 %	440223660
16159	NC_020062	GCCG	2	8	763833	763840	0 %	0 %	50 %	50 %	440223660
16160	NC_020062	GCA	2	6	763887	763892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223660
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16163	NC_020062	GAT	2	6	764089	764094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223661
16164	NC_020062	GA	3	6	764279	764284	50 %	0 %	50 %	0 %	440223661
16165	NC_020062	CGA	3	9	764292	764300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223661
16166	NC_020062	GCCGG	2	10	764302	764311	0 %	0 %	60 %	40 %	440223661
16167	NC_020062	CGC	2	6	764368	764373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223661
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16174	NC_020062	AGGA	2	8	764519	764526	50 %	0 %	50 %	0 %	440223661
16175	NC_020062	GCGA	2	8	764542	764549	25 %	0 %	50 %	25 %	440223661
16176	NC_020062	ATG	2	6	764552	764557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223661
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16184	NC_020062	GAA	2	6	764836	764841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223661
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16190	NC_020062	GTA	2	6	764993	764998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223662
16191	NC_020062	AGAT	2	8	765018	765025	50 %	25 %	25 %	0 %	440223662
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16194	NC_020062	GAT	2	6	765110	765115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223662
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16209	NC_020062	AGT	2	6	765730	765735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223662
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16220	NC_020062	CCG	2	6	766155	766160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223663
16221	NC_020062	GTC	2	6	766181	766186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223663
16222	NC_020062	CTGC	2	8	766191	766198	0 %	25 %	25 %	50 %	440223663
16223	NC_020062	CGA	2	6	766239	766244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223663
16224	NC_020062	CGG	2	6	766270	766275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223663
16225	NC_020062	TCA	2	6	766380	766385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223663
16226	NC_020062	GGC	2	6	766402	766407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223663
16227	NC_020062	GCG	2	6	766455	766460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223663
16228	NC_020062	GTC	2	6	766484	766489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223663
16229	NC_020062	TTC	2	6	766508	766513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223663
16230	NC_020062	CGA	2	6	766524	766529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223663
16231	NC_020062	CGG	2	6	766566	766571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223663
16232	NC_020062	CTT	2	6	766612	766617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223663
16233	NC_020062	AGT	2	6	766650	766655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223663
16234	NC_020062	AG	3	6	766739	766744	50 %	0 %	50 %	0 %	440223663
16235	NC_020062	AGCC	2	8	766790	766797	25 %	0 %	25 %	50 %	440223663
16236	NC_020062	GAC	2	6	766840	766845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223663
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16238	NC_020062	GAGCT	2	10	766865	766874	20 %	20 %	40 %	20 %	440223663
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16476	NC_020062	TGC	2	6	778427	778432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223675
16477	NC_020062	TCA	2	6	778514	778519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223675
16478	NC_020062	CG	3	6	778661	778666	0 %	0 %	50 %	50 %	440223675
16479	NC_020062	CTG	2	6	778669	778674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223675
16480	NC_020062	CAT	2	6	778785	778790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223675
16481	NC_020062	CGG	4	12	778829	778840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223675
16482	NC_020062	CT	3	6	778948	778953	0 %	50 %	0 %	50 %	440223675
16483	NC_020062	GCA	2	6	778957	778962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223675
16484	NC_020062	CGC	2	6	779043	779048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223675
16485	NC_020062	CGG	2	6	779070	779075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223675
16486	NC_020062	TTC	2	6	779140	779145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223675
16487	NC_020062	GCC	2	6	779149	779154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223675
16488	NC_020062	CTG	2	6	779158	779163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223675
16489	NC_020062	GCG	2	6	779164	779169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223675
16490	NC_020062	TGG	3	9	779183	779191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223675
16491	NC_020062	CACGC	2	10	779208	779217	20 %	0 %	20 %	60 %	440223675
16492	NC_020062	TTC	2	6	779282	779287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16493	NC_020062	GGC	2	6	779298	779303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16494	NC_020062	CTG	2	6	779331	779336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16495	NC_020062	CGC	2	6	779386	779391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223676
16496	NC_020062	CTT	3	9	779408	779416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223676
16497	NC_020062	CATC	2	8	779429	779436	25 %	25 %	0 %	50 %	440223676
16498	NC_020062	GCCGG	2	10	779448	779457	0 %	0 %	60 %	40 %	440223676
16499	NC_020062	GAC	2	6	779502	779507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223676
16500	NC_020062	GCT	2	6	779528	779533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223676

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