MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_020062	CGA	2	6	732414	732419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223628
15502	NC_020062	CGG	2	6	732447	732452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223628
15503	NC_020062	GGC	2	6	732466	732471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223628
15504	NC_020062	CGG	2	6	732489	732494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223628
15505	NC_020062	CGC	2	6	732615	732620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223628
15506	NC_020062	AG	3	6	732688	732693	50 %	0 %	50 %	0 %	440223628
15507	NC_020062	GA	3	6	732716	732721	50 %	0 %	50 %	0 %	440223628
15508	NC_020062	CG	3	6	732743	732748	0 %	0 %	50 %	50 %	440223628
15509	NC_020062	CCG	2	6	732749	732754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223628
15510	NC_020062	TTG	2	6	732872	732877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223628
15511	NC_020062	GGC	2	6	732909	732914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223628
15512	NC_020062	AGC	2	6	732929	732934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223628
15513	NC_020062	TCG	2	6	733064	733069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223628
15514	NC_020062	TGG	2	6	733086	733091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223628
15515	NC_020062	GTCG	2	8	733135	733142	0 %	25 %	50 %	25 %	440223628
15516	NC_020062	CAG	2	6	733147	733152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223628
15517	NC_020062	CTT	2	6	733153	733158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223628
15518	NC_020062	GC	4	8	733233	733240	0 %	0 %	50 %	50 %	440223628
15519	NC_020062	GCG	2	6	733300	733305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223628
15520	NC_020062	GAT	2	6	733315	733320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223628
15521	NC_020062	CAC	2	6	733360	733365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223628
15522	NC_020062	CAGA	2	8	733386	733393	50 %	0 %	25 %	25 %	440223628
15523	NC_020062	TTC	2	6	733411	733416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223628
15524	NC_020062	CGAG	2	8	733425	733432	25 %	0 %	50 %	25 %	440223628
15525	NC_020062	CGGC	2	8	733616	733623	0 %	0 %	50 %	50 %	440223628
15526	NC_020062	ATGG	2	8	733642	733649	25 %	25 %	50 %	0 %	440223628
15527	NC_020062	TAG	2	6	733667	733672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223628
15528	NC_020062	GTC	2	6	733691	733696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223628
15529	NC_020062	GCC	2	6	733697	733702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223628
15530	NC_020062	CAT	2	6	733804	733809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223628
15531	NC_020062	CGG	2	6	733832	733837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223628
15532	NC_020062	GCG	2	6	733877	733882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223628
15533	NC_020062	GCC	2	6	733888	733893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223628
15534	NC_020062	GAC	2	6	733924	733929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223628
15535	NC_020062	GCC	3	9	733966	733974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223628
15536	NC_020062	CGC	2	6	733992	733997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223628
15537	NC_020062	CG	3	6	734025	734030	0 %	0 %	50 %	50 %	440223628
15538	NC_020062	GCA	2	6	734049	734054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223628
15539	NC_020062	GC	3	6	734147	734152	0 %	0 %	50 %	50 %	440223628
15540	NC_020062	CAG	2	6	734184	734189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223628
15541	NC_020062	CG	4	8	734193	734200	0 %	0 %	50 %	50 %	440223628
15542	NC_020062	CGC	2	6	734215	734220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223628
15543	NC_020062	GGCA	2	8	734234	734241	25 %	0 %	50 %	25 %	440223628
15544	NC_020062	GGC	2	6	734263	734268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223628
15545	NC_020062	TTC	2	6	734347	734352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223628
15546	NC_020062	TCG	2	6	734617	734622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223629
15547	NC_020062	GAG	2	6	734808	734813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223629
15548	NC_020062	CAA	2	6	734828	734833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223629
15549	NC_020062	CGC	2	6	734922	734927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223629
15550	NC_020062	GCCT	2	8	734959	734966	0 %	25 %	25 %	50 %	440223629
15551	NC_020062	CCG	2	6	735057	735062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15552	NC_020062	CGC	2	6	735073	735078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15553	NC_020062	ATCC	2	8	735082	735089	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15554	NC_020062	GCGACC	2	12	735186	735197	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440223630
15555	NC_020062	TTG	2	6	735198	735203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223630
15556	NC_020062	GGCGA	2	10	735268	735277	20 %	0 %	60 %	20 %	440223630
15557	NC_020062	GA	3	6	735276	735281	50 %	0 %	50 %	0 %	440223630
15558	NC_020062	GCA	2	6	735315	735320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223630
15559	NC_020062	CGC	2	6	735331	735336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223630
15560	NC_020062	CAGG	2	8	735361	735368	25 %	0 %	50 %	25 %	440223630
15561	NC_020062	GGC	2	6	735405	735410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223630
15562	NC_020062	CTG	2	6	735505	735510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223631
15563	NC_020062	TGA	3	9	735538	735546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223631
15564	NC_020062	CGG	2	6	735560	735565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223631
15565	NC_020062	ACGA	2	8	735602	735609	50 %	0 %	25 %	25 %	440223631
15566	NC_020062	GC	3	6	735612	735617	0 %	0 %	50 %	50 %	440223631
15567	NC_020062	TGCG	2	8	735627	735634	0 %	25 %	50 %	25 %	440223631
15568	NC_020062	AGT	2	6	735819	735824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223632
15569	NC_020062	GC	3	6	735919	735924	0 %	0 %	50 %	50 %	440223632
15570	NC_020062	CAC	2	6	735936	735941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223632
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15572	NC_020062	TTA	2	6	735975	735980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223632
15573	NC_020062	CG	3	6	736052	736057	0 %	0 %	50 %	50 %	440223632
15574	NC_020062	TCG	2	6	736070	736075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223632
15575	NC_020062	AAT	2	6	736168	736173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223632
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15578	NC_020062	CGGC	2	8	736308	736315	0 %	0 %	50 %	50 %	440223632
15579	NC_020062	GGC	2	6	736367	736372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223632
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15581	NC_020062	TGC	2	6	736496	736501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223632
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15583	NC_020062	GCCG	2	8	736534	736541	0 %	0 %	50 %	50 %	440223632
15584	NC_020062	TGC	2	6	736625	736630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223632
15585	NC_020062	TCG	2	6	736649	736654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223632
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15587	NC_020062	ATC	2	6	736712	736717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15588	NC_020062	AGC	2	6	736786	736791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223633
15589	NC_020062	CGG	2	6	736839	736844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223633
15590	NC_020062	CGGCT	2	10	736868	736877	0 %	20 %	40 %	40 %	440223633
15591	NC_020062	CGC	2	6	736884	736889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223633
15592	NC_020062	CGG	2	6	736890	736895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223633
15593	NC_020062	TGC	3	9	736929	736937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223633
15594	NC_020062	CGC	2	6	736987	736992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223633
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15601	NC_020062	CGT	2	6	737167	737172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223633
15602	NC_020062	GGC	2	6	737227	737232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223633
15603	NC_020062	CCG	2	6	737241	737246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223633
15604	NC_020062	GC	3	6	737258	737263	0 %	0 %	50 %	50 %	440223633
15605	NC_020062	TCG	2	6	737289	737294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223633
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15608	NC_020062	ATGAA	2	10	737415	737424	60 %	20 %	20 %	0 %	440223633
15609	NC_020062	GCT	2	6	737434	737439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223633
15610	NC_020062	CGG	2	6	737488	737493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223633
15611	NC_020062	CG	3	6	737577	737582	0 %	0 %	50 %	50 %	440223633
15612	NC_020062	AGG	2	6	737592	737597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223633
15613	NC_020062	TGA	2	6	737601	737606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223633
15614	NC_020062	TGC	2	6	737770	737775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15615	NC_020062	TGGC	2	8	737839	737846	0 %	25 %	50 %	25 %	440223634
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15618	NC_020062	GACC	2	8	737970	737977	25 %	0 %	25 %	50 %	440223634
15619	NC_020062	ATC	2	6	737980	737985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223634
15620	NC_020062	TGG	2	6	738025	738030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223634
15621	NC_020062	GCC	2	6	738064	738069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223634
15622	NC_020062	AGG	2	6	738082	738087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223634
15623	NC_020062	TC	3	6	738142	738147	0 %	50 %	0 %	50 %	440223634
15624	NC_020062	AGA	2	6	738220	738225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223634
15625	NC_020062	GCC	2	6	738235	738240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223634
15626	NC_020062	TTCC	2	8	738294	738301	0 %	50 %	0 %	50 %	440223634
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15633	NC_020062	TGC	2	6	738719	738724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15634	NC_020062	CCA	2	6	738758	738763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15635	NC_020062	CCG	2	6	738791	738796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223635
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15642	NC_020062	GGCAA	2	10	738882	738891	40 %	0 %	40 %	20 %	440223635
15643	NC_020062	TCG	2	6	738917	738922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223635
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15647	NC_020062	TGC	2	6	739020	739025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223635
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15660	NC_020062	TCG	2	6	739535	739540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223635
15661	NC_020062	CGG	2	6	739647	739652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15662	NC_020062	CCG	2	6	739659	739664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15663	NC_020062	CAAATC	2	12	739666	739677	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15664	NC_020062	ACG	2	6	739687	739692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15700	NC_020062	CTG	2	6	741399	741404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223638
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15710	NC_020062	GCCA	2	8	741718	741725	25 %	0 %	25 %	50 %	440223639
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15725	NC_020062	CTTCGT	2	12	742441	742452	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440223640
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15728	NC_020062	ATCG	2	8	742570	742577	25 %	25 %	25 %	25 %	440223640
15729	NC_020062	TCGCAC	2	12	742620	742631	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	440223640
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15733	NC_020062	GGC	2	6	742845	742850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223641
15734	NC_020062	CTTC	2	8	742865	742872	0 %	50 %	0 %	50 %	440223641
15735	NC_020062	CTTC	2	8	742958	742965	0 %	50 %	0 %	50 %	440223641
15736	NC_020062	TCG	2	6	742975	742980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223641
15737	NC_020062	GC	3	6	743050	743055	0 %	0 %	50 %	50 %	440223641
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15739	NC_020062	TGA	2	6	743132	743137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223641
15740	NC_020062	CGT	2	6	743150	743155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223641
15741	NC_020062	GATGT	2	10	743245	743254	20 %	40 %	40 %	0 %	440223641
15742	NC_020062	CGT	2	6	743277	743282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223641
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15858	NC_020062	GGC	2	6	749255	749260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223648
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15860	NC_020062	AGA	2	6	749334	749339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223648
15861	NC_020062	GC	3	6	749347	749352	0 %	0 %	50 %	50 %	440223648
15862	NC_020062	GCA	2	6	749401	749406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223648
15863	NC_020062	CGG	2	6	749454	749459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223648
15864	NC_020062	CGG	2	6	749466	749471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223648
15865	NC_020062	GC	3	6	749483	749488	0 %	0 %	50 %	50 %	440223648
15866	NC_020062	AAC	2	6	749520	749525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223648
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15869	NC_020062	GCTGCC	2	12	749609	749620	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440223648
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15873	NC_020062	CG	3	6	749802	749807	0 %	0 %	50 %	50 %	440223649
15874	NC_020062	GAA	2	6	749819	749824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223649
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15909	NC_020062	GAC	2	6	751455	751460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223650
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15914	NC_020062	TCGG	2	8	751735	751742	0 %	25 %	50 %	25 %	440223650
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15919	NC_020062	TCGCG	2	10	752016	752025	0 %	20 %	40 %	40 %	440223650
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15931	NC_020062	TG	3	6	752463	752468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15932	NC_020062	CGG	2	6	752470	752475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15955	NC_020062	GTT	2	6	753757	753762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15974	NC_020062	GCG	2	6	754490	754495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223652
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15977	NC_020062	GTG	2	6	754553	754558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223652
15978	NC_020062	ATC	2	6	754565	754570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223652
15979	NC_020062	CTC	2	6	754644	754649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223653
15980	NC_020062	CG	3	6	754712	754717	0 %	0 %	50 %	50 %	440223653
15981	NC_020062	CGAT	2	8	754772	754779	25 %	25 %	25 %	25 %	440223653
15982	NC_020062	ATG	2	6	754870	754875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223653
15983	NC_020062	GAT	2	6	754896	754901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223653
15984	NC_020062	CCG	2	6	754937	754942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223653
15985	NC_020062	ATG	2	6	755029	755034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223653
15986	NC_020062	AG	3	6	755094	755099	50 %	0 %	50 %	0 %	440223653
15987	NC_020062	GCGG	2	8	755219	755226	0 %	0 %	75 %	25 %	440223653
15988	NC_020062	GGC	2	6	755259	755264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223653
15989	NC_020062	TCGAT	2	10	755336	755345	20 %	40 %	20 %	20 %	440223653
15990	NC_020062	GATC	2	8	755353	755360	25 %	25 %	25 %	25 %	440223653
15991	NC_020062	TGCG	2	8	755428	755435	0 %	25 %	50 %	25 %	440223653
15992	NC_020062	CCT	2	6	755483	755488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223653
15993	NC_020062	GCC	2	6	755503	755508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223653
15994	NC_020062	CGT	2	6	755561	755566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223653
15995	NC_020062	TGG	2	6	755567	755572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223653
15996	NC_020062	GC	3	6	755645	755650	0 %	0 %	50 %	50 %	440223653
15997	NC_020062	TGG	2	6	755681	755686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223653
15998	NC_020062	GCC	2	6	755697	755702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223653
15999	NC_020062	CGA	3	9	755714	755722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223653
16000	NC_020062	GC	3	6	755761	755766	0 %	0 %	50 %	50 %	440223653

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