MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_020062	ACC	2	6	686573	686578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223588
14502	NC_020062	GGC	2	6	686580	686585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223588
14503	NC_020062	TAAA	2	8	686656	686663	75 %	25 %	0 %	0 %	440223588
14504	NC_020062	GCG	2	6	686681	686686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223588
14505	NC_020062	TCG	2	6	686794	686799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223588
14506	NC_020062	GCA	2	6	686860	686865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223589
14507	NC_020062	GCAA	2	8	686904	686911	50 %	0 %	25 %	25 %	440223589
14508	NC_020062	GC	3	6	686918	686923	0 %	0 %	50 %	50 %	440223589
14509	NC_020062	TCT	2	6	686959	686964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223589
14510	NC_020062	GA	3	6	686973	686978	50 %	0 %	50 %	0 %	440223589
14511	NC_020062	CCG	2	6	687010	687015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223589
14512	NC_020062	TCTT	2	8	687036	687043	0 %	75 %	0 %	25 %	440223589
14513	NC_020062	AGA	2	6	687061	687066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223589
14514	NC_020062	CGC	2	6	687205	687210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223589
14515	NC_020062	GTTC	2	8	687223	687230	0 %	50 %	25 %	25 %	440223589
14516	NC_020062	GCC	2	6	687350	687355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223589
14517	NC_020062	CGA	2	6	687416	687421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223589
14518	NC_020062	CGG	2	6	687524	687529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223589
14519	NC_020062	GCA	2	6	687618	687623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223589
14520	NC_020062	CTG	2	6	687645	687650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223589
14521	NC_020062	CCGA	2	8	687702	687709	25 %	0 %	25 %	50 %	440223589
14522	NC_020062	GCC	2	6	687767	687772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223589
14523	NC_020062	T	6	6	687785	687790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_020062	TGG	2	6	687892	687897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_020062	CGC	2	6	687975	687980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14526	NC_020062	TCGC	2	8	688105	688112	0 %	25 %	25 %	50 %	440223590
14527	NC_020062	CGG	2	6	688238	688243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223590
14528	NC_020062	CCTA	2	8	688275	688282	25 %	25 %	0 %	50 %	440223590
14529	NC_020062	CTC	2	6	688334	688339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223590
14530	NC_020062	TGCC	2	8	688361	688368	0 %	25 %	25 %	50 %	440223590
14531	NC_020062	CAG	2	6	688392	688397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223590
14532	NC_020062	TTC	2	6	688423	688428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223590
14533	NC_020062	CGG	2	6	688429	688434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223590
14534	NC_020062	GC	3	6	688515	688520	0 %	0 %	50 %	50 %	440223590
14535	NC_020062	GCGA	2	8	688533	688540	25 %	0 %	50 %	25 %	440223590
14536	NC_020062	TCG	2	6	688546	688551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223590
14537	NC_020062	GAT	2	6	688565	688570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223590
14538	NC_020062	CGT	2	6	688580	688585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223590
14539	NC_020062	GC	3	6	688707	688712	0 %	0 %	50 %	50 %	440223590
14540	NC_020062	GAT	2	6	688728	688733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223590
14541	NC_020062	CGT	2	6	688817	688822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223590
14542	NC_020062	CGCAA	2	10	688902	688911	40 %	0 %	20 %	40 %	440223590
14543	NC_020062	TGC	2	6	688964	688969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223590
14544	NC_020062	GTC	3	9	689052	689060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223590
14545	NC_020062	CGCTG	2	10	689094	689103	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14546	NC_020062	GC	3	6	689113	689118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14547	NC_020062	TCG	2	6	689215	689220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14548	NC_020062	CGA	2	6	689254	689259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14549	NC_020062	CGG	2	6	689297	689302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14550	NC_020062	GCG	2	6	689412	689417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14551	NC_020062	CTA	2	6	689471	689476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14552	NC_020062	ATGC	2	8	689507	689514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14553	NC_020062	ATG	2	6	689665	689670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223591
14554	NC_020062	TC	3	6	689679	689684	0 %	50 %	0 %	50 %	440223591
14555	NC_020062	CGA	2	6	689711	689716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223591
14556	NC_020062	GC	3	6	689843	689848	0 %	0 %	50 %	50 %	440223591
14557	NC_020062	ATC	3	9	689856	689864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223591
14558	NC_020062	CGG	2	6	689873	689878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223591
14559	NC_020062	CTT	2	6	689930	689935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223591
14560	NC_020062	CCG	2	6	689956	689961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223591
14561	NC_020062	GTC	2	6	690033	690038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223591
14562	NC_020062	TTC	2	6	690054	690059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223591
14563	NC_020062	GCC	2	6	690119	690124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14564	NC_020062	TCA	2	6	690131	690136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14565	NC_020062	GCC	2	6	690173	690178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14566	NC_020062	GCGT	2	8	690198	690205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14567	NC_020062	GCGA	2	8	690254	690261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14568	NC_020062	CG	4	8	690270	690277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14569	NC_020062	CTA	2	6	690288	690293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14570	NC_020062	CCG	2	6	690427	690432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223592
14571	NC_020062	TCG	2	6	690481	690486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223592
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14573	NC_020062	TCG	2	6	690571	690576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223592
14574	NC_020062	TGGC	2	8	690610	690617	0 %	25 %	50 %	25 %	440223592
14575	NC_020062	GC	3	6	690643	690648	0 %	0 %	50 %	50 %	440223592
14576	NC_020062	GACG	2	8	690722	690729	25 %	0 %	50 %	25 %	440223592
14577	NC_020062	CAG	2	6	690949	690954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223592
14578	NC_020062	T	6	6	691021	691026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_020062	GC	4	8	691048	691055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14580	NC_020062	CGG	2	6	691118	691123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223593
14581	NC_020062	GAC	2	6	691125	691130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223593
14582	NC_020062	ACG	2	6	691216	691221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223593
14583	NC_020062	GGCC	2	8	691236	691243	0 %	0 %	50 %	50 %	440223593
14584	NC_020062	ATC	2	6	691276	691281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223593
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14586	NC_020062	AAG	2	6	691498	691503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223593
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14588	NC_020062	GC	3	6	691560	691565	0 %	0 %	50 %	50 %	440223593
14589	NC_020062	GCA	2	6	691620	691625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223593
14590	NC_020062	TCA	3	9	691637	691645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223593
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14592	NC_020062	GTG	2	6	691746	691751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_020062	GGC	2	6	691784	691789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14594	NC_020062	CAA	2	6	691830	691835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223594
14595	NC_020062	GC	3	6	691837	691842	0 %	0 %	50 %	50 %	440223594
14596	NC_020062	CG	3	6	691844	691849	0 %	0 %	50 %	50 %	440223594
14597	NC_020062	TTC	2	6	691914	691919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223594
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14601	NC_020062	GC	3	6	692043	692048	0 %	0 %	50 %	50 %	440223594
14602	NC_020062	CGG	2	6	692147	692152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223594
14603	NC_020062	GGCGA	2	10	692185	692194	20 %	0 %	60 %	20 %	440223594
14604	NC_020062	GC	3	6	692275	692280	0 %	0 %	50 %	50 %	440223594
14605	NC_020062	TCC	2	6	692281	692286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223594
14606	NC_020062	CGAG	2	8	692321	692328	25 %	0 %	50 %	25 %	440223594
14607	NC_020062	TTCGGC	2	12	692448	692459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223594
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14609	NC_020062	CGC	2	6	692524	692529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223594
14610	NC_020062	GCC	2	6	692634	692639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223594
14611	NC_020062	GC	3	6	692650	692655	0 %	0 %	50 %	50 %	440223594
14612	NC_020062	GGC	2	6	692693	692698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223594
14613	NC_020062	ATG	2	6	692701	692706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223594
14614	NC_020062	ATC	2	6	692745	692750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14615	NC_020062	TC	4	8	692749	692756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14616	NC_020062	TCTA	2	8	692763	692770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14617	NC_020062	GAA	2	6	692774	692779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14618	NC_020062	GACG	2	8	692901	692908	25 %	0 %	50 %	25 %	440223595
14619	NC_020062	GC	3	6	692917	692922	0 %	0 %	50 %	50 %	440223595
14620	NC_020062	GGCG	2	8	692946	692953	0 %	0 %	75 %	25 %	440223595
14621	NC_020062	CGA	2	6	693050	693055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223595
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14623	NC_020062	GCC	2	6	693130	693135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223595
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14982	NC_020062	GAT	2	6	708678	708683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223610
14983	NC_020062	CGG	2	6	708704	708709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223610
14984	NC_020062	GC	3	6	708728	708733	0 %	0 %	50 %	50 %	440223610
14985	NC_020062	CCG	2	6	708787	708792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14986	NC_020062	A	6	6	708877	708882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14987	NC_020062	TTG	2	6	708892	708897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14988	NC_020062	GAA	2	6	708926	708931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14989	NC_020062	TCA	2	6	708978	708983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14990	NC_020062	CGG	2	6	709003	709008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223611
14991	NC_020062	GCC	2	6	709052	709057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223611
14992	NC_020062	GCG	2	6	709073	709078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223611
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14994	NC_020062	TTGC	2	8	709283	709290	0 %	50 %	25 %	25 %	440223611
14995	NC_020062	GGC	2	6	709322	709327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223611
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