MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020062	AAT	2	6	596967	596972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_020062	CG	3	6	597007	597012	0 %	0 %	50 %	50 %	440223506
12503	NC_020062	TGA	2	6	597025	597030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223506
12504	NC_020062	CGC	2	6	597091	597096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223506
12505	NC_020062	ACG	2	6	597152	597157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223506
12506	NC_020062	TCC	2	6	597208	597213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223506
12507	NC_020062	CTG	3	9	597265	597273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223507
12508	NC_020062	GCG	2	6	597349	597354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223507
12509	NC_020062	CAGC	2	8	597355	597362	25 %	0 %	25 %	50 %	440223507
12510	NC_020062	ATGA	2	8	597472	597479	50 %	25 %	25 %	0 %	440223507
12511	NC_020062	GAA	2	6	597499	597504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223507
12512	NC_020062	GAA	2	6	597535	597540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223507
12513	NC_020062	ACGC	2	8	597552	597559	25 %	0 %	25 %	50 %	440223507
12514	NC_020062	TGC	2	6	597594	597599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223507
12515	NC_020062	AGAT	2	8	597629	597636	50 %	25 %	25 %	0 %	440223507
12516	NC_020062	AGAT	2	8	597638	597645	50 %	25 %	25 %	0 %	440223507
12517	NC_020062	CAT	2	6	597718	597723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223507
12518	NC_020062	CGATGC	2	12	597747	597758	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223507
12519	NC_020062	GCC	2	6	597781	597786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223507
12520	NC_020062	CAC	2	6	597847	597852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223507
12521	NC_020062	AT	3	6	597855	597860	50 %	50 %	0 %	0 %	440223507
12522	NC_020062	GTC	2	6	597863	597868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223507
12523	NC_020062	TC	3	6	597892	597897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12524	NC_020062	GC	3	6	598026	598031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12525	NC_020062	TCC	2	6	598055	598060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12526	NC_020062	GAAG	2	8	598141	598148	50 %	0 %	50 %	0 %	440223508
12527	NC_020062	CGG	3	9	598161	598169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223508
12528	NC_020062	TGC	2	6	598176	598181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223508
12529	NC_020062	AGG	2	6	598254	598259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223508
12530	NC_020062	AACG	2	8	598301	598308	50 %	0 %	25 %	25 %	440223508
12531	NC_020062	CCG	2	6	598309	598314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223508
12532	NC_020062	CCG	2	6	598368	598373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223508
12533	NC_020062	TCG	2	6	598467	598472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223508
12534	NC_020062	TC	3	6	598814	598819	0 %	50 %	0 %	50 %	440223509
12535	NC_020062	TCC	2	6	598889	598894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223509
12536	NC_020062	CGT	2	6	598906	598911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223509
12537	NC_020062	CGGA	2	8	598962	598969	25 %	0 %	50 %	25 %	440223509
12538	NC_020062	GGC	2	6	598980	598985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223509
12539	NC_020062	TCG	2	6	599031	599036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223509
12540	NC_020062	TTC	2	6	599057	599062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223509
12541	NC_020062	ATCGC	2	10	599067	599076	20 %	20 %	20 %	40 %	440223509
12542	NC_020062	CGA	2	6	599164	599169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223509
12543	NC_020062	CCG	2	6	599207	599212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223509
12544	NC_020062	GC	3	6	599222	599227	0 %	0 %	50 %	50 %	440223509
12545	NC_020062	CGC	2	6	599229	599234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223509
12546	NC_020062	CAGAG	2	10	599313	599322	40 %	0 %	40 %	20 %	440223509
12547	NC_020062	CG	3	6	599324	599329	0 %	0 %	50 %	50 %	440223509
12548	NC_020062	CGAC	2	8	599421	599428	25 %	0 %	25 %	50 %	440223509
12549	NC_020062	GCC	2	6	599435	599440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223509
12550	NC_020062	GCG	2	6	599463	599468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223509
12551	NC_020062	GAA	2	6	599527	599532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_020062	GCAG	2	8	599566	599573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12553	NC_020062	CGA	2	6	599574	599579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_020062	GTT	2	6	599580	599585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_020062	TGCG	2	8	599729	599736	0 %	25 %	50 %	25 %	440223510
12556	NC_020062	CGC	2	6	599739	599744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223510
12557	NC_020062	GTT	2	6	599755	599760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223510
12558	NC_020062	GGC	2	6	599790	599795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223510
12559	NC_020062	AT	3	6	599852	599857	50 %	50 %	0 %	0 %	440223510
12560	NC_020062	TCA	2	6	599876	599881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223510
12561	NC_020062	GCG	2	6	599915	599920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223510
12562	NC_020062	CTT	2	6	599931	599936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223510
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12564	NC_020062	GCT	2	6	599973	599978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223510
12565	NC_020062	GC	3	6	599999	600004	0 %	0 %	50 %	50 %	440223510
12566	NC_020062	CTT	2	6	600019	600024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223510
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12570	NC_020062	CTG	2	6	600175	600180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223510
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12577	NC_020062	TCG	2	6	600644	600649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223510
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12580	NC_020062	CTC	2	6	600773	600778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223510
12581	NC_020062	GTA	2	6	600879	600884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12583	NC_020062	CAGC	2	8	600951	600958	25 %	0 %	25 %	50 %	440223511
12584	NC_020062	CGC	2	6	600971	600976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223511
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12587	NC_020062	GCCC	2	8	601034	601041	0 %	0 %	25 %	75 %	440223511
12588	NC_020062	GGC	2	6	601042	601047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223511
12589	NC_020062	CTGC	2	8	601068	601075	0 %	25 %	25 %	50 %	440223511
12590	NC_020062	CG	4	8	601085	601092	0 %	0 %	50 %	50 %	440223511
12591	NC_020062	GAA	2	6	601308	601313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223511
12592	NC_020062	GAG	2	6	601329	601334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223511
12593	NC_020062	GCG	2	6	601339	601344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223511
12594	NC_020062	TCA	2	6	601358	601363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223511
12595	NC_020062	GAT	2	6	601446	601451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223511
12596	NC_020062	GAT	2	6	601470	601475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223511
12597	NC_020062	GAAA	2	8	601485	601492	75 %	0 %	25 %	0 %	440223511
12598	NC_020062	CCG	2	6	601501	601506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223511
12599	NC_020062	ATG	2	6	601510	601515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223511
12600	NC_020062	GCT	2	6	601546	601551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223511
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12602	NC_020062	CGG	3	9	601634	601642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223511
12603	NC_020062	GA	3	6	601753	601758	50 %	0 %	50 %	0 %	440223511
12604	NC_020062	CGGCGA	2	12	601775	601786	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223511
12605	NC_020062	GAAC	2	8	601787	601794	50 %	0 %	25 %	25 %	440223511
12606	NC_020062	GTC	2	6	601831	601836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223511
12607	NC_020062	GCG	2	6	601862	601867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_020062	GCC	2	6	601895	601900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12609	NC_020062	GCGCC	2	10	601919	601928	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12610	NC_020062	GAG	2	6	601947	601952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_020062	TC	3	6	601983	601988	0 %	50 %	0 %	50 %	440223512
12612	NC_020062	GCC	2	6	602019	602024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223512
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12617	NC_020062	GCT	2	6	602341	602346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223512
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12621	NC_020062	ACCC	2	8	602551	602558	25 %	0 %	0 %	75 %	440223512
12622	NC_020062	ATAG	2	8	602559	602566	50 %	25 %	25 %	0 %	440223512
12623	NC_020062	CAG	2	6	602739	602744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12624	NC_020062	CGG	2	6	602763	602768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12625	NC_020062	AGA	2	6	602817	602822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12626	NC_020062	CGT	2	6	602823	602828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12628	NC_020062	TCG	2	6	602935	602940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12629	NC_020062	TCA	2	6	602987	602992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12855	NC_020062	TTG	2	6	612836	612841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223522
12856	NC_020062	ACA	2	6	612862	612867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12857	NC_020062	A	6	6	612867	612872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12858	NC_020062	TTCCA	2	10	612894	612903	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12859	NC_020062	GAC	2	6	612916	612921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12980	NC_020062	AG	3	6	618152	618157	50 %	0 %	50 %	0 %	440223528
12981	NC_020062	CCG	2	6	618190	618195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223528
12982	NC_020062	GCC	2	6	618207	618212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223528
12983	NC_020062	GCC	2	6	618223	618228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223528
12984	NC_020062	GA	3	6	618322	618327	50 %	0 %	50 %	0 %	440223528
12985	NC_020062	GCC	2	6	618390	618395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223528
12986	NC_020062	GCA	2	6	618431	618436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223528
12987	NC_020062	CAT	2	6	618444	618449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223528
12988	NC_020062	CACGAT	2	12	618453	618464	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440223528
12989	NC_020062	GCC	2	6	618555	618560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223528
12990	NC_020062	GAC	2	6	618609	618614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223528
12991	NC_020062	CGG	2	6	618618	618623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223528
12992	NC_020062	GGC	2	6	618768	618773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223528
12993	NC_020062	GACA	2	8	618774	618781	50 %	0 %	25 %	25 %	440223528
12994	NC_020062	GATC	2	8	618782	618789	25 %	25 %	25 %	25 %	440223528
12995	NC_020062	GAT	2	6	618828	618833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223528
12996	NC_020062	GCCG	2	8	618885	618892	0 %	0 %	50 %	50 %	440223528
12997	NC_020062	ATC	2	6	618913	618918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223528
12998	NC_020062	ACG	2	6	618919	618924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223528
12999	NC_020062	ATG	3	9	618925	618933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223528
13000	NC_020062	TC	3	6	618944	618949	0 %	50 %	0 %	50 %	440223528

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