MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020062	CTC	2	6	550420	550425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11502	NC_020062	TGA	2	6	550455	550460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_020062	ATG	2	6	550480	550485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_020062	TGG	2	6	550499	550504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_020062	GGC	2	6	550579	550584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223463
11506	NC_020062	GC	3	6	550596	550601	0 %	0 %	50 %	50 %	440223463
11507	NC_020062	CCG	2	6	550634	550639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223463
11508	NC_020062	GCG	2	6	550653	550658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223463
11509	NC_020062	CAT	2	6	550686	550691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223463
11510	NC_020062	GC	3	6	550709	550714	0 %	0 %	50 %	50 %	440223463
11511	NC_020062	GACGCC	2	12	550744	550755	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440223463
11512	NC_020062	GGC	2	6	550777	550782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223463
11513	NC_020062	GGC	2	6	550812	550817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223463
11514	NC_020062	TCA	2	6	550872	550877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223463
11515	NC_020062	GCG	2	6	551007	551012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223463
11516	NC_020062	TCG	2	6	551022	551027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223463
11517	NC_020062	GGAT	2	8	551056	551063	25 %	25 %	50 %	0 %	440223463
11518	NC_020062	GGC	2	6	551110	551115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223463
11519	NC_020062	CGA	2	6	551262	551267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223463
11520	NC_020062	TC	3	6	551271	551276	0 %	50 %	0 %	50 %	440223463
11521	NC_020062	AAC	2	6	551291	551296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223463
11522	NC_020062	CCAT	2	8	551342	551349	25 %	25 %	0 %	50 %	440223463
11523	NC_020062	CCGG	2	8	551387	551394	0 %	0 %	50 %	50 %	440223463
11524	NC_020062	AAG	2	6	551428	551433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223463
11525	NC_020062	TCCG	2	8	551437	551444	0 %	25 %	25 %	50 %	440223463
11526	NC_020062	TCG	2	6	551465	551470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223463
11527	NC_020062	AT	3	6	551505	551510	50 %	50 %	0 %	0 %	440223463
11528	NC_020062	CCG	2	6	551537	551542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223463
11529	NC_020062	ACG	2	6	551546	551551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223463
11530	NC_020062	GCG	2	6	551559	551564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223463
11531	NC_020062	CGC	2	6	551571	551576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223463
11532	NC_020062	GAC	2	6	551629	551634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223463
11533	NC_020062	TGC	2	6	551685	551690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223463
11534	NC_020062	GAT	2	6	551713	551718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223463
11535	NC_020062	TGGA	2	8	551729	551736	25 %	25 %	50 %	0 %	440223463
11536	NC_020062	ATG	2	6	551767	551772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223464
11537	NC_020062	TGCA	2	8	551841	551848	25 %	25 %	25 %	25 %	440223464
11538	NC_020062	GCA	3	9	551846	551854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223464
11539	NC_020062	GA	3	6	551861	551866	50 %	0 %	50 %	0 %	440223464
11540	NC_020062	GCC	2	6	551931	551936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223464
11541	NC_020062	GAT	2	6	551937	551942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223464
11542	NC_020062	TCGC	2	8	552030	552037	0 %	25 %	25 %	50 %	440223464
11543	NC_020062	TGA	2	6	552059	552064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223464
11544	NC_020062	ATC	2	6	552067	552072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223464
11545	NC_020062	AGC	2	6	552073	552078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223464
11546	NC_020062	CGA	2	6	552107	552112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223464
11547	NC_020062	CG	3	6	552245	552250	0 %	0 %	50 %	50 %	440223464
11548	NC_020062	TGA	3	9	552254	552262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223464
11549	NC_020062	GCGG	2	8	552291	552298	0 %	0 %	75 %	25 %	440223464
11550	NC_020062	GCC	2	6	552393	552398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223464
11551	NC_020062	GGT	2	6	552420	552425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223464
11552	NC_020062	CTTCGG	2	12	552455	552466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223464
11553	NC_020062	ACCG	2	8	552639	552646	25 %	0 %	25 %	50 %	440223464
11554	NC_020062	GCCCGC	2	12	552701	552712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223464
11555	NC_020062	TCGC	2	8	552739	552746	0 %	25 %	25 %	50 %	440223464
11556	NC_020062	AGT	2	6	552831	552836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223464
11557	NC_020062	TCA	2	6	552884	552889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223464
11558	NC_020062	CGTC	2	8	552935	552942	0 %	25 %	25 %	50 %	440223465
11559	NC_020062	GCA	2	6	553024	553029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223465
11560	NC_020062	TCG	2	6	553032	553037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223465
11561	NC_020062	TCG	2	6	553068	553073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223465
11562	NC_020062	AGC	2	6	553077	553082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223465
11563	NC_020062	GC	4	8	553104	553111	0 %	0 %	50 %	50 %	440223465
11564	NC_020062	GCT	3	9	553123	553131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223465
11565	NC_020062	GCCC	2	8	553132	553139	0 %	0 %	25 %	75 %	440223465
11566	NC_020062	CGA	2	6	553180	553185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223465
11567	NC_020062	AGG	2	6	553239	553244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223465
11568	NC_020062	GCA	2	6	553282	553287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223465
11569	NC_020062	AGG	2	6	553330	553335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223465
11570	NC_020062	GAG	2	6	553424	553429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223465
11571	NC_020062	ATG	2	6	553458	553463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223465
11572	NC_020062	CGA	2	6	553465	553470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223465
11573	NC_020062	TCC	2	6	553518	553523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223465
11574	NC_020062	CGATA	2	10	553528	553537	40 %	20 %	20 %	20 %	440223465
11575	NC_020062	GCGG	2	8	553633	553640	0 %	0 %	75 %	25 %	440223466
11576	NC_020062	CGG	2	6	553663	553668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223466
11577	NC_020062	CAC	2	6	553732	553737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223466
11578	NC_020062	GC	3	6	553959	553964	0 %	0 %	50 %	50 %	440223466
11579	NC_020062	CTC	2	6	553987	553992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223466
11580	NC_020062	TTC	2	6	554080	554085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223466
11581	NC_020062	TGC	2	6	554090	554095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223466
11582	NC_020062	GCG	2	6	554195	554200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223466
11583	NC_020062	CG	4	8	554199	554206	0 %	0 %	50 %	50 %	440223466
11584	NC_020062	CAT	2	6	554241	554246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223466
11585	NC_020062	TGC	2	6	554340	554345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223466
11586	NC_020062	TTG	2	6	554408	554413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223466
11587	NC_020062	CG	3	6	554452	554457	0 %	0 %	50 %	50 %	440223466
11588	NC_020062	GCTC	2	8	554460	554467	0 %	25 %	25 %	50 %	440223466
11589	NC_020062	AG	4	8	554485	554492	50 %	0 %	50 %	0 %	440223466
11590	NC_020062	GAT	2	6	554533	554538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223466
11591	NC_020062	TGG	2	6	554544	554549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223466
11592	NC_020062	CCG	2	6	554584	554589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11593	NC_020062	GCC	2	6	554622	554627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11594	NC_020062	AGGGAG	2	12	554633	554644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_020062	GGC	2	6	554653	554658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_020062	AGTC	2	8	554765	554772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11597	NC_020062	GCG	2	6	554827	554832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223467
11598	NC_020062	CAG	3	9	554930	554938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223467
11599	NC_020062	GC	3	6	555041	555046	0 %	0 %	50 %	50 %	440223467
11600	NC_020062	TCA	2	6	555094	555099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223467
11601	NC_020062	CGG	2	6	555169	555174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223467
11602	NC_020062	GGCAGC	2	12	555191	555202	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223467
11603	NC_020062	TGA	2	6	555244	555249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223467
11604	NC_020062	AT	3	6	555260	555265	50 %	50 %	0 %	0 %	440223467
11605	NC_020062	GCC	2	6	555266	555271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223467
11606	NC_020062	CCAG	2	8	555286	555293	25 %	0 %	25 %	50 %	440223467
11607	NC_020062	GC	3	6	555325	555330	0 %	0 %	50 %	50 %	440223467
11608	NC_020062	TGC	2	6	555425	555430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223467
11609	NC_020062	GAT	2	6	555452	555457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223467
11610	NC_020062	ATCG	2	8	555464	555471	25 %	25 %	25 %	25 %	440223467
11611	NC_020062	CCG	2	6	555508	555513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223467
11612	NC_020062	CTG	2	6	555533	555538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223467
11613	NC_020062	GC	3	6	555560	555565	0 %	0 %	50 %	50 %	440223467
11614	NC_020062	GCG	2	6	555592	555597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223467
11615	NC_020062	GAA	2	6	555691	555696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223467
11616	NC_020062	GTC	2	6	555731	555736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223467
11617	NC_020062	GAC	2	6	555746	555751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223467
11618	NC_020062	AG	3	6	555757	555762	50 %	0 %	50 %	0 %	440223467
11619	NC_020062	CGA	3	9	555778	555786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223467
11620	NC_020062	ATC	2	6	555804	555809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223467
11621	NC_020062	CTGT	2	8	555828	555835	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11622	NC_020062	GTC	2	6	555893	555898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11624	NC_020062	GCG	2	6	555945	555950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223468
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11660	NC_020062	CCCA	2	8	557588	557595	25 %	0 %	0 %	75 %	440223468
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11685	NC_020062	C	6	6	558626	558631	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11686	NC_020062	G	6	6	558661	558666	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11687	NC_020062	TCG	2	6	558686	558691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11739	NC_020062	GAT	2	6	561270	561275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223470
11740	NC_020062	CGA	2	6	561368	561373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223470
11741	NC_020062	GAT	3	9	561429	561437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223470
11742	NC_020062	ATG	2	6	561478	561483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223470
11743	NC_020062	CG	3	6	561497	561502	0 %	0 %	50 %	50 %	440223470
11744	NC_020062	GAT	2	6	561591	561596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223470
11745	NC_020062	CGA	2	6	561647	561652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223471
11746	NC_020062	AGGT	2	8	561700	561707	25 %	25 %	50 %	0 %	440223471
11747	NC_020062	GCGG	2	8	561774	561781	0 %	0 %	75 %	25 %	440223471
11748	NC_020062	TCA	3	9	561794	561802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223471
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11752	NC_020062	GC	3	6	561974	561979	0 %	0 %	50 %	50 %	440223471
11753	NC_020062	GCT	2	6	561995	562000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223471
11754	NC_020062	GCC	2	6	562005	562010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223471
11755	NC_020062	CGAGGT	2	12	562055	562066	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223471
11756	NC_020062	GCA	2	6	562163	562168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223471
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11758	NC_020062	GAT	2	6	562311	562316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223471
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11760	NC_020062	TCC	2	6	562435	562440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11761	NC_020062	GCCG	2	8	562474	562481	0 %	0 %	50 %	50 %	440223472
11762	NC_020062	CCA	2	6	562485	562490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223472
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11768	NC_020062	CGA	2	6	562620	562625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223472
11769	NC_020062	TGC	2	6	562678	562683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223472
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11788	NC_020062	GC	3	6	563203	563208	0 %	0 %	50 %	50 %	440223472
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11790	NC_020062	GC	3	6	563372	563377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11791	NC_020062	GGC	2	6	563408	563413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223473
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11845	NC_020062	CCTT	2	8	566167	566174	0 %	50 %	0 %	50 %	440223474
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11856	NC_020062	CTC	2	6	566512	566517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223475
11857	NC_020062	CTG	2	6	566555	566560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223475
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11981	NC_020062	CGC	2	6	572326	572331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223485
11982	NC_020062	GCC	2	6	572339	572344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223485
11983	NC_020062	GCG	2	6	572370	572375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223485
11984	NC_020062	CCG	3	9	572411	572419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223485
11985	NC_020062	GGCGG	2	10	572420	572429	0 %	0 %	80 %	20 %	440223485
11986	NC_020062	GCC	4	12	572462	572473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223485
11987	NC_020062	CCG	2	6	572494	572499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223485
11988	NC_020062	GAGG	2	8	572521	572528	25 %	0 %	75 %	0 %	440223485
11989	NC_020062	CG	3	6	572535	572540	0 %	0 %	50 %	50 %	440223485
11990	NC_020062	GTC	2	6	572552	572557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223485
11991	NC_020062	GCA	2	6	572604	572609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223485
11992	NC_020062	CGA	2	6	572638	572643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223485
11993	NC_020062	CGAC	2	8	572670	572677	25 %	0 %	25 %	50 %	440223485
11994	NC_020062	TCG	2	6	572706	572711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223485
11995	NC_020062	GGTC	2	8	572734	572741	0 %	25 %	50 %	25 %	440223485
11996	NC_020062	ACGGA	2	10	572889	572898	40 %	0 %	40 %	20 %	440223485
11997	NC_020062	GCTG	2	8	572910	572917	0 %	25 %	50 %	25 %	440223485
11998	NC_020062	ATT	2	6	572922	572927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223485
11999	NC_020062	GA	3	6	572984	572989	50 %	0 %	50 %	0 %	440223485
12000	NC_020062	GTT	2	6	573028	573033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223485

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