MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_020062	AAG	2	6	502626	502631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223410
10502	NC_020062	TCA	2	6	502690	502695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223410
10503	NC_020062	CCGT	2	8	502702	502709	0 %	25 %	25 %	50 %	440223410
10504	NC_020062	GCC	2	6	502722	502727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223410
10505	NC_020062	GGC	2	6	502734	502739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223410
10506	NC_020062	GAG	2	6	502740	502745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223410
10507	NC_020062	TCG	2	6	502747	502752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223410
10508	NC_020062	TGC	3	9	502753	502761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223410
10509	NC_020062	GCC	4	12	502779	502790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223410
10510	NC_020062	AGG	2	6	502843	502848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223410
10511	NC_020062	GCATCG	2	12	502867	502878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223410
10512	NC_020062	CT	3	6	502883	502888	0 %	50 %	0 %	50 %	440223410
10513	NC_020062	CGA	2	6	502894	502899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223410
10514	NC_020062	GCC	2	6	502923	502928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223410
10515	NC_020062	AGGC	2	8	502951	502958	25 %	0 %	50 %	25 %	440223410
10516	NC_020062	ATC	2	6	503186	503191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223411
10517	NC_020062	CTG	2	6	503206	503211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223411
10518	NC_020062	TTCC	2	8	503213	503220	0 %	50 %	0 %	50 %	440223411
10519	NC_020062	GAT	2	6	503266	503271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223411
10520	NC_020062	CGGG	2	8	503324	503331	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10521	NC_020062	CGG	2	6	503416	503421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10522	NC_020062	CGC	2	6	503449	503454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10523	NC_020062	T	6	6	503493	503498	0 %	100 %	0 %	0 %	440223412
10524	NC_020062	GAC	2	6	503499	503504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223412
10525	NC_020062	TTGCAT	2	12	503507	503518	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440223412
10526	NC_020062	CGG	2	6	503693	503698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223412
10527	NC_020062	CGT	2	6	503784	503789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223412
10528	NC_020062	TCG	2	6	503807	503812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223412
10529	NC_020062	CCG	2	6	503813	503818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223412
10530	NC_020062	GC	3	6	503837	503842	0 %	0 %	50 %	50 %	440223412
10531	NC_020062	GGC	2	6	503935	503940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223412
10532	NC_020062	GCCAAG	2	12	504091	504102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223412
10533	NC_020062	GC	3	6	504173	504178	0 %	0 %	50 %	50 %	440223412
10534	NC_020062	GTG	2	6	504214	504219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223412
10535	NC_020062	ACG	2	6	504220	504225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223412
10536	NC_020062	GAA	3	9	504226	504234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223412
10537	NC_020062	CCA	2	6	504293	504298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223412
10538	NC_020062	CCG	3	9	504303	504311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223412
10539	NC_020062	CGA	2	6	504321	504326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223412
10540	NC_020062	AAGGTC	2	12	504331	504342	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440223412
10541	NC_020062	CCAG	2	8	504368	504375	25 %	0 %	25 %	50 %	440223412
10542	NC_020062	ATG	2	6	504406	504411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223412
10543	NC_020062	TCG	2	6	504512	504517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223413
10544	NC_020062	TGG	2	6	504532	504537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223413
10545	NC_020062	TTC	2	6	504569	504574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223413
10546	NC_020062	ATCG	2	8	504600	504607	25 %	25 %	25 %	25 %	440223413
10547	NC_020062	GTT	2	6	504657	504662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223413
10548	NC_020062	CG	3	6	504724	504729	0 %	0 %	50 %	50 %	440223413
10549	NC_020062	TGC	2	6	504735	504740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223413
10550	NC_020062	GTG	2	6	504772	504777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223413
10551	NC_020062	TGC	2	6	504788	504793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223413
10552	NC_020062	CCG	2	6	504830	504835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223413
10553	NC_020062	CAT	2	6	504858	504863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223413
10554	NC_020062	CGG	2	6	504900	504905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223413
10555	NC_020062	CTTT	2	8	504930	504937	0 %	75 %	0 %	25 %	440223413
10556	NC_020062	TCG	2	6	504938	504943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223413
10557	NC_020062	GCC	2	6	504952	504957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223413
10558	NC_020062	CGG	2	6	504963	504968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223413
10559	NC_020062	CGAG	2	8	504971	504978	25 %	0 %	50 %	25 %	440223413
10560	NC_020062	CAT	2	6	504981	504986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223413
10561	NC_020062	GCG	2	6	504992	504997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223413
10562	NC_020062	CCT	2	6	505028	505033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223413
10563	NC_020062	CAC	2	6	505041	505046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223413
10564	NC_020062	GCT	2	6	505086	505091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223413
10565	NC_020062	CAT	2	6	505146	505151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223413
10566	NC_020062	TGC	2	6	505212	505217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223413
10567	NC_020062	GC	3	6	505242	505247	0 %	0 %	50 %	50 %	440223413
10568	NC_020062	GTC	2	6	505291	505296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223413
10569	NC_020062	TCG	2	6	505301	505306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223413
10570	NC_020062	TCG	2	6	505319	505324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223413
10571	NC_020062	TCG	3	9	505352	505360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223413
10572	NC_020062	ATC	2	6	505429	505434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223413
10573	NC_020062	CAG	2	6	505453	505458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223413
10574	NC_020062	CGT	2	6	505473	505478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223413
10575	NC_020062	GGA	2	6	505529	505534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223413
10576	NC_020062	CGCC	2	8	505760	505767	0 %	0 %	25 %	75 %	440223414
10577	NC_020062	AGC	2	6	505783	505788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223414
10578	NC_020062	CGA	2	6	505792	505797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223414
10579	NC_020062	CGT	2	6	505823	505828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223414
10580	NC_020062	ACG	2	6	505879	505884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223414
10581	NC_020062	GCG	2	6	505887	505892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223414
10582	NC_020062	CTG	3	9	506016	506024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223414
10583	NC_020062	CGA	2	6	506032	506037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223414
10584	NC_020062	GGC	2	6	506129	506134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223414
10585	NC_020062	GGCCG	2	10	506183	506192	0 %	0 %	60 %	40 %	440223414
10586	NC_020062	GC	4	8	506240	506247	0 %	0 %	50 %	50 %	440223414
10587	NC_020062	AT	3	6	506288	506293	50 %	50 %	0 %	0 %	440223414
10588	NC_020062	CAT	2	6	506368	506373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10589	NC_020062	TCG	2	6	506432	506437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223415
10590	NC_020062	CAT	2	6	506439	506444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223415
10591	NC_020062	GTC	2	6	506476	506481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223415
10592	NC_020062	GC	3	6	506496	506501	0 %	0 %	50 %	50 %	440223415
10593	NC_020062	CGA	2	6	506559	506564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223415
10594	NC_020062	GCC	2	6	506612	506617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223415
10595	NC_020062	ACG	2	6	506687	506692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223415
10596	NC_020062	TGC	2	6	506706	506711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223415
10597	NC_020062	GAC	2	6	506776	506781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223415
10598	NC_020062	TGC	2	6	506784	506789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223415
10599	NC_020062	GCC	2	6	506796	506801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223415
10600	NC_020062	TCCA	2	8	506893	506900	25 %	25 %	0 %	50 %	440223415
10601	NC_020062	GCA	2	6	506922	506927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223415
10602	NC_020062	GTC	2	6	506995	507000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223415
10603	NC_020062	TG	3	6	507050	507055	0 %	50 %	50 %	0 %	440223415
10604	NC_020062	CGT	2	6	507063	507068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223415
10605	NC_020062	GC	3	6	507161	507166	0 %	0 %	50 %	50 %	440223415
10606	NC_020062	CGC	2	6	507222	507227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223415
10607	NC_020062	ATCTGC	2	12	507230	507241	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440223415
10608	NC_020062	GC	3	6	507251	507256	0 %	0 %	50 %	50 %	440223415
10609	NC_020062	TTGCC	2	10	507294	507303	0 %	40 %	20 %	40 %	440223415
10610	NC_020062	GCTG	2	8	507312	507319	0 %	25 %	50 %	25 %	440223415
10611	NC_020062	GCA	2	6	507354	507359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223415
10612	NC_020062	CCT	2	6	507405	507410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223415
10613	NC_020062	GCG	2	6	507421	507426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223415
10614	NC_020062	GATC	2	8	507459	507466	25 %	25 %	25 %	25 %	440223415
10615	NC_020062	AAG	2	6	507497	507502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223415
10616	NC_020062	CG	3	6	507522	507527	0 %	0 %	50 %	50 %	440223415
10617	NC_020062	GAA	2	6	507583	507588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223415
10618	NC_020062	GCC	3	9	507611	507619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223415
10619	NC_020062	GCC	2	6	507701	507706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223415
10620	NC_020062	GCGCC	2	10	507775	507784	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10621	NC_020062	CAA	2	6	507815	507820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10624	NC_020062	CAT	3	9	508019	508027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223416
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10739	NC_020062	TCG	2	6	513477	513482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223418
10740	NC_020062	CGG	3	9	513493	513501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223418
10741	NC_020062	CGA	2	6	513517	513522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223418
10742	NC_020062	GC	3	6	513528	513533	0 %	0 %	50 %	50 %	440223418
10743	NC_020062	GGCC	2	8	513570	513577	0 %	0 %	50 %	50 %	440223418
10744	NC_020062	GGGCG	2	10	513584	513593	0 %	0 %	80 %	20 %	440223418
10745	NC_020062	CTG	2	6	513620	513625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223418
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10747	NC_020062	GCG	2	6	513743	513748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223418
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10751	NC_020062	TGC	2	6	513871	513876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223418
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10755	NC_020062	GCA	2	6	513981	513986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223418
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10759	NC_020062	TCTG	2	8	514227	514234	0 %	50 %	25 %	25 %	440223418
10760	NC_020062	GAT	2	6	514258	514263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223418
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10787	NC_020062	GTTT	2	8	515583	515590	0 %	75 %	25 %	0 %	440223419
10788	NC_020062	TGC	2	6	515600	515605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223419
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10842	NC_020062	GCC	2	6	517899	517904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223422
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10844	NC_020062	GC	3	6	518006	518011	0 %	0 %	50 %	50 %	440223422
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10849	NC_020062	TGA	2	6	518328	518333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223422
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10851	NC_020062	CCGGC	2	10	518385	518394	0 %	0 %	40 %	60 %	440223422
10852	NC_020062	CTG	2	6	518422	518427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223422
10853	NC_020062	CG	3	6	518444	518449	0 %	0 %	50 %	50 %	440223422
10854	NC_020062	GGCC	2	8	518460	518467	0 %	0 %	50 %	50 %	440223422
10855	NC_020062	CGA	2	6	518522	518527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223422
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10857	NC_020062	GTG	2	6	518572	518577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223422
10858	NC_020062	GCT	2	6	518595	518600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223422
10859	NC_020062	CCGC	2	8	518657	518664	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10860	NC_020062	CCA	2	6	518675	518680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10861	NC_020062	CG	3	6	518729	518734	0 %	0 %	50 %	50 %	440223423
10862	NC_020062	AGG	2	6	518745	518750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223423
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10865	NC_020062	GGC	2	6	518873	518878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223423
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10867	NC_020062	GTGCG	2	10	518952	518961	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10868	NC_020062	AAG	2	6	518965	518970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10869	NC_020062	C	7	7	519000	519006	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10870	NC_020062	GCG	2	6	519014	519019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10871	NC_020062	GTC	2	6	519062	519067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10873	NC_020062	TAA	2	6	519124	519129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10874	NC_020062	AGA	2	6	519134	519139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10875	NC_020062	CTC	2	6	519183	519188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10879	NC_020062	CTTCTG	2	12	519312	519323	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440223424
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10888	NC_020062	ATG	2	6	519773	519778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223425
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10979	NC_020062	GCCC	2	8	524957	524964	0 %	0 %	25 %	75 %	440223428
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11000	NC_020062	TCC	2	6	526018	526023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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