MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_020062	ATGAAG	2	12	479359	479370	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440223387
10003	NC_020062	CGG	2	6	479382	479387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223387
10004	NC_020062	GAT	2	6	479436	479441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223387
10005	NC_020062	GC	3	6	479479	479484	0 %	0 %	50 %	50 %	440223387
10006	NC_020062	GC	4	8	479704	479711	0 %	0 %	50 %	50 %	440223387
10007	NC_020062	ATG	2	6	479807	479812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_020062	GGC	2	6	479818	479823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_020062	AAT	2	6	479922	479927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_020062	TGGC	2	8	480067	480074	0 %	25 %	50 %	25 %	440223388
10011	NC_020062	ATC	2	6	480144	480149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223388
10012	NC_020062	TTC	2	6	480276	480281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223388
10013	NC_020062	TGG	2	6	480292	480297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223388
10014	NC_020062	ACA	2	6	480499	480504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223388
10015	NC_020062	CCG	2	6	480522	480527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223388
10016	NC_020062	ATG	2	6	480567	480572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223388
10017	NC_020062	CGCTT	2	10	480689	480698	0 %	40 %	20 %	40 %	440223388
10018	NC_020062	CCA	2	6	480718	480723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223388
10019	NC_020062	CAA	2	6	480740	480745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223388
10020	NC_020062	CG	3	6	480775	480780	0 %	0 %	50 %	50 %	440223388
10021	NC_020062	GGC	2	6	480929	480934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223388
10022	NC_020062	ACGC	2	8	481055	481062	25 %	0 %	25 %	50 %	440223388
10023	NC_020062	TCG	2	6	481084	481089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223388
10024	NC_020062	GCGA	2	8	481113	481120	25 %	0 %	50 %	25 %	440223388
10025	NC_020062	GACA	2	8	481190	481197	50 %	0 %	25 %	25 %	440223388
10026	NC_020062	ATCG	2	8	481314	481321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10027	NC_020062	AAT	2	6	481327	481332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_020062	AGT	2	6	481341	481346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_020062	TAT	2	6	481455	481460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_020062	ACT	2	6	481477	481482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_020062	ATC	2	6	481574	481579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223389
10032	NC_020062	CAA	2	6	481786	481791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223389
10033	NC_020062	GAAA	2	8	481878	481885	75 %	0 %	25 %	0 %	440223389
10034	NC_020062	GAGG	2	8	481918	481925	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_020062	ATT	2	6	482084	482089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223390
10036	NC_020062	TATC	2	8	482161	482168	25 %	50 %	0 %	25 %	440223390
10037	NC_020062	AGT	2	6	482173	482178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223390
10038	NC_020062	GTC	2	6	482213	482218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223390
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10044	NC_020062	TTTCT	2	10	482529	482538	0 %	80 %	0 %	20 %	440223390
10045	NC_020062	AAAC	2	8	482550	482557	75 %	0 %	0 %	25 %	440223390
10046	NC_020062	GTC	2	6	482630	482635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223390
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10050	NC_020062	CAT	2	6	482901	482906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_020062	GGC	2	6	482995	483000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_020062	GAA	2	6	483032	483037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_020062	ACG	2	6	483041	483046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_020062	AATAA	2	10	483068	483077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_020062	AGG	2	6	483086	483091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_020062	AGCG	2	8	483110	483117	25 %	0 %	50 %	25 %	440223391
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10070	NC_020062	AT	3	6	483696	483701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10075	NC_020062	CT	3	6	483801	483806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10094	NC_020062	ATA	2	6	484527	484532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223392
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10097	NC_020062	TC	3	6	484709	484714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10099	NC_020062	CAGC	2	8	484730	484737	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10108	NC_020062	GCCGC	2	10	485281	485290	0 %	0 %	40 %	60 %	440223393
10109	NC_020062	TCG	2	6	485292	485297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223393
10110	NC_020062	GC	3	6	485360	485365	0 %	0 %	50 %	50 %	440223393
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10113	NC_020062	AT	3	6	485476	485481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_020062	TGC	2	6	485485	485490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_020062	GGC	2	6	485507	485512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10119	NC_020062	GCGCA	2	10	485737	485746	20 %	0 %	40 %	40 %	440223394
10120	NC_020062	CAGG	2	8	485770	485777	25 %	0 %	50 %	25 %	440223394
10121	NC_020062	GTC	2	6	485785	485790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223394
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10123	NC_020062	CCG	2	6	485960	485965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223394
10124	NC_020062	TTA	2	6	485982	485987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223394
10125	NC_020062	CGG	2	6	486063	486068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223394
10126	NC_020062	CCG	2	6	486071	486076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223394
10127	NC_020062	TGC	2	6	486087	486092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223394
10128	NC_020062	CGA	2	6	486111	486116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223394
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10136	NC_020062	CGT	2	6	486718	486723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10137	NC_020062	ACG	2	6	486829	486834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223395
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10164	NC_020062	CGG	2	6	487981	487986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10240	NC_020062	GCC	2	6	491540	491545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223399
10241	NC_020062	GGTCGA	2	12	491546	491557	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223399
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10243	NC_020062	ACGG	2	8	491701	491708	25 %	0 %	50 %	25 %	440223399
10244	NC_020062	GAT	2	6	491720	491725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223399
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10249	NC_020062	GGA	2	6	491822	491827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10263	NC_020062	ACCG	2	8	492792	492799	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10264	NC_020062	GC	3	6	492817	492822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10364	NC_020062	CGA	2	6	497356	497361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223404
10365	NC_020062	TGC	2	6	497454	497459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223404
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10380	NC_020062	GTG	2	6	498186	498191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223405
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10387	NC_020062	ATTCCC	2	12	498534	498545	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10417	NC_020062	GGCG	2	8	499659	499666	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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10474	NC_020062	AT	3	6	501581	501586	50 %	50 %	0 %	0 %	440223409
10475	NC_020062	CGA	2	6	501599	501604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223409
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10479	NC_020062	GCC	3	9	501851	501859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10480	NC_020062	ATT	2	6	501954	501959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223410
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10482	NC_020062	GCG	2	6	501997	502002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223410
10483	NC_020062	GTT	3	9	502025	502033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223410
10484	NC_020062	TCC	2	6	502108	502113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223410
10485	NC_020062	GGC	2	6	502134	502139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223410
10486	NC_020062	CGC	2	6	502157	502162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223410
10487	NC_020062	ATG	2	6	502167	502172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223410
10488	NC_020062	TGG	2	6	502189	502194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223410
10489	NC_020062	CAT	2	6	502226	502231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223410
10490	NC_020062	CTG	2	6	502263	502268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223410
10491	NC_020062	GC	4	8	502368	502375	0 %	0 %	50 %	50 %	440223410
10492	NC_020062	CTT	2	6	502377	502382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223410
10493	NC_020062	TGT	3	9	502429	502437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223410
10494	NC_020062	GC	4	8	502478	502485	0 %	0 %	50 %	50 %	440223410
10495	NC_020062	CCG	2	6	502529	502534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223410
10496	NC_020062	TGC	2	6	502537	502542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223410
10497	NC_020062	CGAT	2	8	502553	502560	25 %	25 %	25 %	25 %	440223410
10498	NC_020062	GCA	2	6	502561	502566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223410
10499	NC_020062	AGG	2	6	502567	502572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223410
10500	NC_020062	GCG	2	6	502580	502585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223410

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