MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_020062	GCTTC	2	10	454423	454432	0 %	40 %	20 %	40 %	440223369
9503	NC_020062	GCA	2	6	454476	454481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223369
9504	NC_020062	CGG	2	6	454531	454536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223369
9505	NC_020062	GGC	2	6	454538	454543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223369
9506	NC_020062	GCA	2	6	454629	454634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223369
9507	NC_020062	AGCCG	2	10	454792	454801	20 %	0 %	40 %	40 %	440223369
9508	NC_020062	TGA	2	6	454872	454877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223370
9509	NC_020062	CGG	2	6	454880	454885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223370
9510	NC_020062	GTG	2	6	454896	454901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223370
9511	NC_020062	GGC	2	6	454915	454920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223370
9512	NC_020062	CGA	2	6	454998	455003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223370
9513	NC_020062	CGA	2	6	455118	455123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223370
9514	NC_020062	TCG	2	6	455162	455167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223370
9515	NC_020062	AGCG	2	8	455195	455202	25 %	0 %	50 %	25 %	440223370
9516	NC_020062	CCG	2	6	455228	455233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223370
9517	NC_020062	CCGC	2	8	455307	455314	0 %	0 %	25 %	75 %	440223370
9518	NC_020062	CGAG	2	8	455385	455392	25 %	0 %	50 %	25 %	440223370
9519	NC_020062	AGTG	2	8	455441	455448	25 %	25 %	50 %	0 %	440223370
9520	NC_020062	AGC	3	9	455516	455524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223370
9521	NC_020062	TCG	3	9	455529	455537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223370
9522	NC_020062	GTGC	2	8	455565	455572	0 %	25 %	50 %	25 %	440223370
9523	NC_020062	GTG	2	6	455573	455578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223370
9524	NC_020062	CCG	2	6	455580	455585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223370
9525	NC_020062	TCA	2	6	455603	455608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223370
9526	NC_020062	GTT	2	6	455677	455682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223370
9527	NC_020062	GTA	2	6	455725	455730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223370
9528	NC_020062	CTT	2	6	455767	455772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223370
9529	NC_020062	GAG	2	6	455792	455797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223370
9530	NC_020062	TGC	2	6	455811	455816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223370
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9532	NC_020062	TGA	2	6	455892	455897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223370
9533	NC_020062	GCA	2	6	455898	455903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223370
9534	NC_020062	TGC	2	6	455921	455926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223370
9535	NC_020062	TCT	2	6	455952	455957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223370
9536	NC_020062	GCC	2	6	456052	456057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223370
9537	NC_020062	TCG	2	6	456161	456166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223370
9538	NC_020062	GCG	2	6	456277	456282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223370
9539	NC_020062	GCA	2	6	456357	456362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223370
9540	NC_020062	GC	4	8	456365	456372	0 %	0 %	50 %	50 %	440223370
9541	NC_020062	GCCCGA	2	12	456385	456396	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440223370
9542	NC_020062	GAC	2	6	456451	456456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223370
9543	NC_020062	TAA	2	6	456537	456542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223370
9544	NC_020062	AG	3	6	456597	456602	50 %	0 %	50 %	0 %	440223371
9545	NC_020062	CAG	2	6	456678	456683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223371
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9549	NC_020062	ACC	2	6	456837	456842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223371
9550	NC_020062	GAAAG	2	10	456844	456853	60 %	0 %	40 %	0 %	440223371
9551	NC_020062	TGA	2	6	456884	456889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223371
9552	NC_020062	CCGC	2	8	456893	456900	0 %	0 %	25 %	75 %	440223371
9553	NC_020062	GAG	2	6	456925	456930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223371
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9558	NC_020062	GAC	2	6	457110	457115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223371
9559	NC_020062	CTGA	2	8	457132	457139	25 %	25 %	25 %	25 %	440223371
9560	NC_020062	GGC	2	6	457140	457145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223371
9561	NC_020062	CCG	2	6	457247	457252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223371
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9563	NC_020062	GCCG	2	8	457355	457362	0 %	0 %	50 %	50 %	440223371
9564	NC_020062	GA	3	6	457393	457398	50 %	0 %	50 %	0 %	440223371
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9567	NC_020062	CG	3	6	457461	457466	0 %	0 %	50 %	50 %	440223372
9568	NC_020062	CG	3	6	457486	457491	0 %	0 %	50 %	50 %	440223372
9569	NC_020062	CAGG	2	8	457576	457583	25 %	0 %	50 %	25 %	440223372
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9574	NC_020062	CGG	2	6	457774	457779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223372
9575	NC_020062	CCG	2	6	457861	457866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223372
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9579	NC_020062	AGC	2	6	458231	458236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223372
9580	NC_020062	GAC	2	6	458321	458326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223372
9581	NC_020062	CAG	2	6	458348	458353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223372
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9583	NC_020062	CGCTG	2	10	458438	458447	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9584	NC_020062	GTCA	2	8	458451	458458	25 %	25 %	25 %	25 %	440223373
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9588	NC_020062	TCT	2	6	458667	458672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223373
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9592	NC_020062	TCG	2	6	458882	458887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223373
9593	NC_020062	GCT	2	6	458937	458942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223373
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9602	NC_020062	CTG	2	6	459505	459510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223373
9603	NC_020062	CGGC	2	8	459513	459520	0 %	0 %	50 %	50 %	440223373
9604	NC_020062	T	6	6	459592	459597	0 %	100 %	0 %	0 %	440223373
9605	NC_020062	GAA	2	6	459598	459603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223373
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9613	NC_020062	GCG	2	6	460060	460065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223373
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9615	NC_020062	GCAG	2	8	460152	460159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9616	NC_020062	GTT	2	6	460180	460185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9617	NC_020062	CTA	2	6	460192	460197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9618	NC_020062	ATT	2	6	460207	460212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9619	NC_020062	GCA	2	6	460368	460373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9620	NC_020062	ATT	2	6	460438	460443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9622	NC_020062	ATAGT	2	10	460499	460508	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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9683	NC_020062	AT	3	6	463847	463852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9867	NC_020062	GCA	2	6	472429	472434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223382
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