MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_020062	TCGA	2	8	431773	431780	25 %	25 %	25 %	25 %	440223347
9002	NC_020062	TGG	2	6	431802	431807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223347
9003	NC_020062	AGC	2	6	431864	431869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223347
9004	NC_020062	CGA	2	6	431870	431875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223347
9005	NC_020062	GGC	2	6	431879	431884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223347
9006	NC_020062	CGA	2	6	431942	431947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223347
9007	NC_020062	CGA	2	6	431973	431978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223347
9008	NC_020062	TCG	2	6	432011	432016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223347
9009	NC_020062	GAG	2	6	432031	432036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223347
9010	NC_020062	TCA	2	6	432086	432091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223347
9011	NC_020062	CGA	2	6	432095	432100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223347
9012	NC_020062	TGA	2	6	432104	432109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223347
9013	NC_020062	CAG	2	6	432126	432131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223347
9014	NC_020062	TCG	2	6	432215	432220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223347
9015	NC_020062	CAT	2	6	432360	432365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223347
9016	NC_020062	CGG	2	6	432371	432376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223347
9017	NC_020062	GAT	2	6	432441	432446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223347
9018	NC_020062	TCG	3	9	432455	432463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223347
9019	NC_020062	GCT	2	6	432477	432482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223347
9020	NC_020062	TCC	2	6	432485	432490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223347
9021	NC_020062	CGA	2	6	432525	432530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223347
9022	NC_020062	GGC	2	6	432694	432699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223348
9023	NC_020062	CGG	2	6	432727	432732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223348
9024	NC_020062	ATG	2	6	432756	432761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223348
9025	NC_020062	CGA	2	6	432766	432771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223348
9026	NC_020062	CCGA	2	8	432780	432787	25 %	0 %	25 %	50 %	440223348
9027	NC_020062	TC	3	6	432831	432836	0 %	50 %	0 %	50 %	440223348
9028	NC_020062	TCG	2	6	432844	432849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223348
9029	NC_020062	TCC	2	6	432857	432862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223348
9030	NC_020062	GTC	2	6	433014	433019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223348
9031	NC_020062	CAA	2	6	433037	433042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223348
9032	NC_020062	CATG	2	8	433079	433086	25 %	25 %	25 %	25 %	440223348
9033	NC_020062	TGC	2	6	433100	433105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223348
9034	NC_020062	CG	3	6	433129	433134	0 %	0 %	50 %	50 %	440223348
9035	NC_020062	CGA	2	6	433182	433187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223348
9036	NC_020062	GGTGA	2	10	433233	433242	20 %	20 %	60 %	0 %	440223348
9037	NC_020062	CGG	2	6	433276	433281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223348
9038	NC_020062	GCG	2	6	433291	433296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223348
9039	NC_020062	CAA	2	6	433307	433312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223348
9040	NC_020062	GAA	2	6	433331	433336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223348
9041	NC_020062	CGATAT	2	12	433355	433366	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440223348
9042	NC_020062	CCG	2	6	433376	433381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223348
9043	NC_020062	GAT	2	6	433385	433390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223348
9044	NC_020062	T	6	6	433423	433428	0 %	100 %	0 %	0 %	440223348
9045	NC_020062	CCA	2	6	433432	433437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223348
9046	NC_020062	CGG	2	6	433490	433495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223348
9047	NC_020062	TTCGA	2	10	433497	433506	20 %	40 %	20 %	20 %	440223348
9048	NC_020062	GTC	2	6	433545	433550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223348
9049	NC_020062	CGA	2	6	433571	433576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223348
9050	NC_020062	CGG	2	6	433632	433637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223348
9051	NC_020062	CGG	2	6	433726	433731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223348
9052	NC_020062	GTCGCA	2	12	433737	433748	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223348
9053	NC_020062	ATC	2	6	433761	433766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223348
9054	NC_020062	CGA	2	6	433769	433774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223348
9055	NC_020062	CAG	2	6	433794	433799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223348
9056	NC_020062	TCG	2	6	433812	433817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223348
9057	NC_020062	TCG	2	6	433822	433827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223348
9058	NC_020062	ACG	2	6	433875	433880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_020062	T	6	6	433930	433935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_020062	GAT	2	6	433951	433956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_020062	GC	4	8	434045	434052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9062	NC_020062	CA	3	6	434057	434062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9063	NC_020062	GCT	2	6	434146	434151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223349
9064	NC_020062	TGG	2	6	434164	434169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223349
9065	NC_020062	CGG	2	6	434214	434219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223349
9066	NC_020062	TTTC	2	8	434233	434240	0 %	75 %	0 %	25 %	440223349
9067	NC_020062	AAC	2	6	434242	434247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223349
9068	NC_020062	CTTGC	2	10	434305	434314	0 %	40 %	20 %	40 %	440223349
9069	NC_020062	GAT	2	6	434322	434327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223349
9070	NC_020062	TGG	2	6	434371	434376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223349
9071	NC_020062	TTC	2	6	434437	434442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223349
9072	NC_020062	TCA	2	6	434444	434449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223349
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9075	NC_020062	CAT	2	6	434533	434538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223349
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9079	NC_020062	GGCGCA	2	12	434602	434613	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223350
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9085	NC_020062	TCG	2	6	434814	434819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223350
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9090	NC_020062	GAG	2	6	434951	434956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223350
9091	NC_020062	TCC	2	6	434970	434975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223350
9092	NC_020062	CGC	2	6	434983	434988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223350
9093	NC_020062	GC	3	6	435101	435106	0 %	0 %	50 %	50 %	440223350
9094	NC_020062	ATC	2	6	435132	435137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223350
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9098	NC_020062	TCGC	2	8	435350	435357	0 %	25 %	25 %	50 %	440223351
9099	NC_020062	GCA	2	6	435364	435369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223351
9100	NC_020062	ACG	2	6	435429	435434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223351
9101	NC_020062	A	6	6	435516	435521	100 %	0 %	0 %	0 %	440223351
9102	NC_020062	ATC	2	6	435582	435587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223351
9103	NC_020062	CG	4	8	435626	435633	0 %	0 %	50 %	50 %	440223351
9104	NC_020062	CCA	2	6	435802	435807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223351
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9106	NC_020062	GC	3	6	435847	435852	0 %	0 %	50 %	50 %	440223351
9107	NC_020062	TGCGA	2	10	435859	435868	20 %	20 %	40 %	20 %	440223351
9108	NC_020062	CGC	2	6	435941	435946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223351
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9110	NC_020062	G	6	6	436120	436125	0 %	0 %	100 %	0 %	440223351
9111	NC_020062	TTG	2	6	436135	436140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223351
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9118	NC_020062	GATC	2	8	436599	436606	25 %	25 %	25 %	25 %	440223352
9119	NC_020062	GC	3	6	436627	436632	0 %	0 %	50 %	50 %	440223352
9120	NC_020062	CCG	2	6	436654	436659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223352
9121	NC_020062	CCG	2	6	436694	436699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223352
9122	NC_020062	ATTCA	2	10	436723	436732	40 %	40 %	0 %	20 %	440223352
9123	NC_020062	CGA	2	6	436839	436844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223352
9124	NC_020062	CCG	2	6	436858	436863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223352
9125	NC_020062	CTG	2	6	436879	436884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223352
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9142	NC_020062	TCG	2	6	437675	437680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223353
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9145	NC_020062	CTGC	2	8	437728	437735	0 %	25 %	25 %	50 %	440223353
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9168	NC_020062	GC	3	6	438697	438702	0 %	0 %	50 %	50 %	440223353
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9231	NC_020062	GCCG	2	8	441630	441637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9232	NC_020062	ATA	2	6	441727	441732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9233	NC_020062	GC	3	6	441759	441764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9234	NC_020062	GAA	2	6	441781	441786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9235	NC_020062	TCG	2	6	441821	441826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9237	NC_020062	GAA	2	6	441902	441907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9238	NC_020062	ATG	2	6	441923	441928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223358
9239	NC_020062	CATC	2	8	442001	442008	25 %	25 %	0 %	50 %	440223358
9240	NC_020062	GCCG	3	12	442086	442097	0 %	0 %	50 %	50 %	440223358
9241	NC_020062	ACCG	2	8	442154	442161	25 %	0 %	25 %	50 %	440223358
9242	NC_020062	GCT	2	6	442222	442227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223358
9243	NC_020062	CTG	2	6	442228	442233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223358
9244	NC_020062	TCA	2	6	442265	442270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223358
9245	NC_020062	CGT	2	6	442356	442361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223358
9246	NC_020062	TGCC	2	8	442412	442419	0 %	25 %	25 %	50 %	440223358
9247	NC_020062	CAT	2	6	442434	442439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223358
9248	NC_020062	GAT	2	6	442518	442523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223358
9249	NC_020062	CGCGG	2	10	442580	442589	0 %	0 %	60 %	40 %	440223358
9250	NC_020062	AAG	2	6	442700	442705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223358
9251	NC_020062	CT	3	6	442754	442759	0 %	50 %	0 %	50 %	440223358
9252	NC_020062	GCC	2	6	442784	442789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223358
9253	NC_020062	TGG	2	6	442813	442818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223358
9254	NC_020062	CATC	2	8	442821	442828	25 %	25 %	0 %	50 %	440223358
9255	NC_020062	TGC	2	6	442871	442876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223358
9256	NC_020062	GGCA	2	8	443022	443029	25 %	0 %	50 %	25 %	440223358
9257	NC_020062	TGC	2	6	443045	443050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223358
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9259	NC_020062	GCTC	2	8	443113	443120	0 %	25 %	25 %	50 %	440223358
9260	NC_020062	AGCGA	2	10	443143	443152	40 %	0 %	40 %	20 %	440223358
9261	NC_020062	GC	3	6	443168	443173	0 %	0 %	50 %	50 %	440223358
9262	NC_020062	TGCCG	2	10	443202	443211	0 %	20 %	40 %	40 %	440223358
9263	NC_020062	GA	3	6	443254	443259	50 %	0 %	50 %	0 %	440223358
9264	NC_020062	TCC	2	6	443397	443402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223359
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9267	NC_020062	CG	3	6	443551	443556	0 %	0 %	50 %	50 %	440223359
9268	NC_020062	CG	4	8	443605	443612	0 %	0 %	50 %	50 %	440223359
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9271	NC_020062	GATC	2	8	443731	443738	25 %	25 %	25 %	25 %	440223359
9272	NC_020062	TCG	2	6	443757	443762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223359
9273	NC_020062	GCC	2	6	443786	443791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223359
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9275	NC_020062	CGC	2	6	443854	443859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223359
9276	NC_020062	TC	3	6	443881	443886	0 %	50 %	0 %	50 %	440223359
9277	NC_020062	CG	3	6	443898	443903	0 %	0 %	50 %	50 %	440223359
9278	NC_020062	CG	4	8	444091	444098	0 %	0 %	50 %	50 %	440223359
9279	NC_020062	GTC	2	6	444155	444160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223359
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9281	NC_020062	TCG	2	6	444222	444227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223359
9282	NC_020062	GCC	2	6	444264	444269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223359
9283	NC_020062	GTG	2	6	444309	444314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223359
9284	NC_020062	GTA	2	6	444428	444433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9285	NC_020062	GGC	2	6	444498	444503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223360
9286	NC_020062	CAA	2	6	444512	444517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223360
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9288	NC_020062	CCT	2	6	444550	444555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223360
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9290	NC_020062	GCA	2	6	444664	444669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223360
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9303	NC_020062	TCG	2	6	445353	445358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9304	NC_020062	CCTT	2	8	445406	445413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9305	NC_020062	GATG	2	8	445457	445464	25 %	25 %	50 %	0 %	440223361
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9311	NC_020062	CGAA	2	8	445639	445646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9312	NC_020062	GAG	2	6	445788	445793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9313	NC_020062	AGC	2	6	445874	445879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9314	NC_020062	CGTT	2	8	445913	445920	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9315	NC_020062	TAGA	2	8	445956	445963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9316	NC_020062	GGC	2	6	446036	446041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223362
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9319	NC_020062	AGC	2	6	446128	446133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223362
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9321	NC_020062	CGG	2	6	446180	446185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223362
9322	NC_020062	ACG	2	6	446275	446280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223362
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9327	NC_020062	CGA	2	6	446578	446583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223362
9328	NC_020062	ATC	2	6	446586	446591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223362
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9332	NC_020062	CAT	2	6	446723	446728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223362
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9337	NC_020062	GTC	2	6	447035	447040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223362
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9349	NC_020062	GAG	2	6	447537	447542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223362
9350	NC_020062	GC	3	6	447559	447564	0 %	0 %	50 %	50 %	440223362
9351	NC_020062	GTG	2	6	447660	447665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9352	NC_020062	TGGCA	2	10	447696	447705	20 %	20 %	40 %	20 %	440223363
9353	NC_020062	ATAC	2	8	447708	447715	50 %	25 %	0 %	25 %	440223363
9354	NC_020062	GGC	2	6	447750	447755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223363
9355	NC_020062	TCGT	2	8	447766	447773	0 %	50 %	25 %	25 %	440223363
9356	NC_020062	TGC	2	6	447776	447781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223363
9357	NC_020062	GGC	2	6	447864	447869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223363
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9361	NC_020062	GCT	3	9	448002	448010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223363
9362	NC_020062	TGC	2	6	448011	448016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223363
9363	NC_020062	TC	3	6	448071	448076	0 %	50 %	0 %	50 %	440223363
9364	NC_020062	CAT	2	6	448152	448157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223363
9365	NC_020062	TCA	2	6	448199	448204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223363
9366	NC_020062	TCCGC	2	10	448261	448270	0 %	20 %	20 %	60 %	440223363
9367	NC_020062	GAA	2	6	448287	448292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223363
9368	NC_020062	CG	3	6	448329	448334	0 %	0 %	50 %	50 %	440223363
9369	NC_020062	GGC	2	6	448367	448372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223363
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9373	NC_020062	TCG	4	12	448538	448549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223363
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9383	NC_020062	GC	3	6	448981	448986	0 %	0 %	50 %	50 %	440223364
9384	NC_020062	TGC	2	6	448988	448993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223364
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9388	NC_020062	TCA	2	6	449068	449073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223364
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9483	NC_020062	TTC	2	6	453517	453522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223368
9484	NC_020062	CGG	2	6	453566	453571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223368
9485	NC_020062	TGT	2	6	453640	453645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9486	NC_020062	GCC	2	6	453696	453701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9487	NC_020062	GCG	2	6	453716	453721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9488	NC_020062	CAG	2	6	453818	453823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223369
9489	NC_020062	GCGG	2	8	453849	453856	0 %	0 %	75 %	25 %	440223369
9490	NC_020062	TCG	2	6	453873	453878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223369
9491	NC_020062	GCG	2	6	453879	453884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223369
9492	NC_020062	CGG	2	6	453962	453967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223369
9493	NC_020062	CGG	2	6	454072	454077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223369
9494	NC_020062	GCC	2	6	454098	454103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223369
9495	NC_020062	CGG	3	9	454112	454120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223369
9496	NC_020062	CG	3	6	454148	454153	0 %	0 %	50 %	50 %	440223369
9497	NC_020062	CAG	2	6	454249	454254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223369
9498	NC_020062	CCTGG	2	10	454354	454363	0 %	20 %	40 %	40 %	440223369
9499	NC_020062	GCA	2	6	454378	454383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223369
9500	NC_020062	TGC	2	6	454397	454402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223369

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