MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 44744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_020062	GAT	2	6	385608	385613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223304
8003	NC_020062	CGGAG	2	10	385648	385657	20 %	0 %	60 %	20 %	440223304
8004	NC_020062	TG	3	6	385680	385685	0 %	50 %	50 %	0 %	440223304
8005	NC_020062	CAT	2	6	385687	385692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223304
8006	NC_020062	CTCC	2	8	385756	385763	0 %	25 %	0 %	75 %	440223304
8007	NC_020062	TC	3	6	385780	385785	0 %	50 %	0 %	50 %	440223304
8008	NC_020062	CCAG	2	8	385786	385793	25 %	0 %	25 %	50 %	440223304
8009	NC_020062	GGC	2	6	385890	385895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223304
8010	NC_020062	GGC	2	6	385937	385942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223304
8011	NC_020062	CTTC	2	8	385984	385991	0 %	50 %	0 %	50 %	440223304
8012	NC_020062	TGG	2	6	386038	386043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223304
8013	NC_020062	CGG	2	6	386059	386064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223304
8014	NC_020062	CGA	2	6	386107	386112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223304
8015	NC_020062	GCT	2	6	386134	386139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223304
8016	NC_020062	GCA	2	6	386158	386163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223304
8017	NC_020062	GCC	2	6	386177	386182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223304
8018	NC_020062	TC	3	6	386250	386255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8019	NC_020062	CG	3	6	386313	386318	0 %	0 %	50 %	50 %	440223305
8020	NC_020062	ATG	2	6	386319	386324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223305
8021	NC_020062	TGA	3	9	386329	386337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223305
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8024	NC_020062	GT	3	6	386380	386385	0 %	50 %	50 %	0 %	440223305
8025	NC_020062	TGG	2	6	386398	386403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223305
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8029	NC_020062	GC	3	6	386505	386510	0 %	0 %	50 %	50 %	440223305
8030	NC_020062	GC	3	6	386556	386561	0 %	0 %	50 %	50 %	440223305
8031	NC_020062	GCAA	2	8	386589	386596	50 %	0 %	25 %	25 %	440223305
8032	NC_020062	CGCGC	2	10	386597	386606	0 %	0 %	40 %	60 %	440223305
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8044	NC_020062	GATA	2	8	387051	387058	50 %	25 %	25 %	0 %	440223306
8045	NC_020062	AGT	2	6	387084	387089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223306
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8049	NC_020062	GCA	2	6	387213	387218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223306
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8053	NC_020062	CGCGC	2	10	387310	387319	0 %	0 %	40 %	60 %	440223306
8054	NC_020062	GCGACC	2	12	387362	387373	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440223306
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8061	NC_020062	GAG	2	6	387683	387688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_020062	TCG	2	6	387696	387701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8101	NC_020062	AT	3	6	389305	389310	50 %	50 %	0 %	0 %	440223308
8102	NC_020062	GC	3	6	389363	389368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8103	NC_020062	A	7	7	389389	389395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_020062	ATG	2	6	389424	389429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_020062	GTC	2	6	389440	389445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_020062	GAG	2	6	389560	389565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223309
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8108	NC_020062	TGT	2	6	389643	389648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223309
8109	NC_020062	TCG	2	6	389684	389689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223309
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8119	NC_020062	CAG	2	6	390155	390160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223310
8120	NC_020062	GCCG	2	8	390197	390204	0 %	0 %	50 %	50 %	440223310
8121	NC_020062	GCG	2	6	390271	390276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223310
8122	NC_020062	AGGT	2	8	390282	390289	25 %	25 %	50 %	0 %	440223310
8123	NC_020062	ATA	2	6	390296	390301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223310
8124	NC_020062	CGG	2	6	390321	390326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223310
8125	NC_020062	CGA	2	6	390373	390378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223310
8126	NC_020062	CGG	2	6	390479	390484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223310
8127	NC_020062	TCCG	2	8	390539	390546	0 %	25 %	25 %	50 %	440223310
8128	NC_020062	GAT	2	6	390629	390634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223310
8129	NC_020062	GTT	2	6	390638	390643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223310
8130	NC_020062	GTC	2	6	390644	390649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223310
8131	NC_020062	GCC	2	6	390683	390688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223310
8132	NC_020062	CGA	2	6	390694	390699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223310
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8134	NC_020062	CTTC	2	8	390724	390731	0 %	50 %	0 %	50 %	440223310
8135	NC_020062	ATGA	2	8	390788	390795	50 %	25 %	25 %	0 %	440223310
8136	NC_020062	CCT	2	6	390889	390894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223310
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8139	NC_020062	CTT	2	6	390994	390999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223310
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8142	NC_020062	GAA	2	6	391082	391087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223310
8143	NC_020062	CG	3	6	391105	391110	0 %	0 %	50 %	50 %	440223310
8144	NC_020062	GCG	2	6	391130	391135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223310
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8146	NC_020062	GGCT	2	8	391173	391180	0 %	25 %	50 %	25 %	440223310
8147	NC_020062	CGC	2	6	391270	391275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223310
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8151	NC_020062	GTC	2	6	391665	391670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223310
8152	NC_020062	GCC	2	6	391759	391764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223310
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8154	NC_020062	CT	3	6	391814	391819	0 %	50 %	0 %	50 %	440223310
8155	NC_020062	GCG	3	9	391870	391878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223310
8156	NC_020062	GCC	2	6	392028	392033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223310
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8159	NC_020062	CTTT	2	8	392141	392148	0 %	75 %	0 %	25 %	440223310
8160	NC_020062	CTTT	2	8	392173	392180	0 %	75 %	0 %	25 %	440223311
8161	NC_020062	AG	3	6	392183	392188	50 %	0 %	50 %	0 %	440223311
8162	NC_020062	ATG	2	6	392192	392197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223311
8163	NC_020062	CGGC	2	8	392203	392210	0 %	0 %	50 %	50 %	440223311
8164	NC_020062	GGA	2	6	392245	392250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223311
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8166	NC_020062	CCGG	2	8	392469	392476	0 %	0 %	50 %	50 %	440223311
8167	NC_020062	CGT	2	6	392539	392544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223311
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8172	NC_020062	GAT	2	6	392695	392700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223311
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8177	NC_020062	TGCG	2	8	392819	392826	0 %	25 %	50 %	25 %	440223311
8178	NC_020062	TCG	2	6	392855	392860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223311
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8180	NC_020062	CGCTGG	2	12	392909	392920	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440223311
8181	NC_020062	GCT	2	6	392931	392936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223311
8182	NC_020062	CGG	2	6	392976	392981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223311
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8186	NC_020062	CG	3	6	393352	393357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8187	NC_020062	GAA	2	6	393424	393429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223312
8188	NC_020062	CGA	2	6	393450	393455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223312
8189	NC_020062	TGC	2	6	393463	393468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223312
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8194	NC_020062	GC	4	8	393680	393687	0 %	0 %	50 %	50 %	440223312
8195	NC_020062	GAT	2	6	393772	393777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223312
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8197	NC_020062	ATC	2	6	393833	393838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223312
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8200	NC_020062	GC	3	6	393910	393915	0 %	0 %	50 %	50 %	440223312
8201	NC_020062	AGC	2	6	393953	393958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223312
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8203	NC_020062	TGA	2	6	393987	393992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223312
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8219	NC_020062	GCG	3	9	394615	394623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223313
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8223	NC_020062	CTG	2	6	394812	394817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223313
8224	NC_020062	AGC	2	6	394825	394830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223313
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8226	NC_020062	GCC	2	6	394855	394860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223313
8227	NC_020062	GAT	2	6	394878	394883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223313
8228	NC_020062	TTC	2	6	394888	394893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223313
8229	NC_020062	CCCA	2	8	394945	394952	25 %	0 %	0 %	75 %	440223313
8230	NC_020062	GAT	3	9	395016	395024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223313
8231	NC_020062	T	6	6	395085	395090	0 %	100 %	0 %	0 %	440223313
8232	NC_020062	CTT	2	6	395105	395110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8233	NC_020062	GGC	2	6	395154	395159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8234	NC_020062	GCG	2	6	395160	395165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8235	NC_020062	GCG	2	6	395168	395173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8236	NC_020062	GGA	2	6	395207	395212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8237	NC_020062	GC	5	10	395225	395234	0 %	0 %	50 %	50 %	440223314
8238	NC_020062	T	6	6	395236	395241	0 %	100 %	0 %	0 %	440223314
8239	NC_020062	CGC	2	6	395265	395270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223314
8240	NC_020062	CGG	2	6	395411	395416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223314
8241	NC_020062	CG	3	6	395500	395505	0 %	0 %	50 %	50 %	440223314
8242	NC_020062	TTC	2	6	395517	395522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223314
8243	NC_020062	CTT	2	6	395617	395622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223314
8244	NC_020062	TGA	2	6	395644	395649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223314
8245	NC_020062	CAT	2	6	395663	395668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223314
8246	NC_020062	CTT	2	6	395675	395680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223314
8247	NC_020062	GCC	2	6	395691	395696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223314
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8252	NC_020062	GTCGG	2	10	395787	395796	0 %	20 %	60 %	20 %	440223314
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8264	NC_020062	GTTC	2	8	396472	396479	0 %	50 %	25 %	25 %	440223314
8265	NC_020062	TCC	2	6	396496	396501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8266	NC_020062	GCCC	2	8	396521	396528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8267	NC_020062	TCC	2	6	396607	396612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8268	NC_020062	AATT	2	8	396671	396678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8269	NC_020062	ATC	2	6	396684	396689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8273	NC_020062	TCG	2	6	396820	396825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223315
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8282	NC_020062	TGC	2	6	397210	397215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223315
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8299	NC_020062	GAGC	2	8	397963	397970	25 %	0 %	50 %	25 %	440223316
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8303	NC_020062	CCGCG	2	10	398254	398263	0 %	0 %	40 %	60 %	440223316
8304	NC_020062	CCAT	2	8	398278	398285	25 %	25 %	0 %	50 %	440223316
8305	NC_020062	CGA	2	6	398350	398355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223316
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8308	NC_020062	TA	3	6	398653	398658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8309	NC_020062	ATCG	2	8	398713	398720	25 %	25 %	25 %	25 %	440223317
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8319	NC_020062	CGATC	2	10	399255	399264	20 %	20 %	20 %	40 %	440223317
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8322	NC_020062	CGT	2	6	399493	399498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223317
8323	NC_020062	GCCGT	2	10	399613	399622	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8324	NC_020062	GCA	2	6	399663	399668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223318
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8343	NC_020062	GCC	3	9	400248	400256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223318
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8349	NC_020062	CAT	2	6	400410	400415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223318
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8351	NC_020062	CG	3	6	400461	400466	0 %	0 %	50 %	50 %	440223318
8352	NC_020062	CTG	2	6	400474	400479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223318
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8355	NC_020062	TGC	2	6	400608	400613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223318
8356	NC_020062	GTT	2	6	400629	400634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223318
8357	NC_020062	GACG	2	8	400644	400651	25 %	0 %	50 %	25 %	440223318
8358	NC_020062	TCG	3	9	400670	400678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223318
8359	NC_020062	TGG	2	6	400786	400791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8360	NC_020062	CCG	2	6	400839	400844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8361	NC_020062	GGC	2	6	400966	400971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8362	NC_020062	TGA	2	6	400982	400987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8363	NC_020062	GC	4	8	401114	401121	0 %	0 %	50 %	50 %	440223319
8364	NC_020062	TCA	2	6	401194	401199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8365	NC_020062	CTG	2	6	401205	401210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8366	NC_020062	TTAT	2	8	401216	401223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8367	NC_020062	TAT	2	6	401319	401324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8368	NC_020062	TCGG	2	8	401328	401335	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8369	NC_020062	CAAT	2	8	401368	401375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8370	NC_020062	CTTG	2	8	401381	401388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8371	NC_020062	ATTT	2	8	401448	401455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8372	NC_020062	AT	3	6	401480	401485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8379	NC_020062	AT	3	6	401782	401787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8380	NC_020062	TCA	2	6	401791	401796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8381	NC_020062	GCG	2	6	401905	401910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8382	NC_020062	GCG	2	6	401915	401920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8383	NC_020062	GATCT	2	10	401958	401967	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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8484	NC_020062	CAATA	2	10	406597	406606	60 %	20 %	0 %	20 %	440223323
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8486	NC_020062	GCA	2	6	406685	406690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
8487	NC_020062	GC	3	6	406691	406696	0 %	0 %	50 %	50 %	440223323
8488	NC_020062	CGA	2	6	406829	406834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
8489	NC_020062	GGCATC	2	12	406855	406866	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223323
8490	NC_020062	CGT	2	6	406878	406883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223323
8491	NC_020062	GCTG	2	8	406935	406942	0 %	25 %	50 %	25 %	440223323
8492	NC_020062	GCTG	2	8	406968	406975	0 %	25 %	50 %	25 %	440223323
8493	NC_020062	GGCGCG	2	12	406999	407010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
8494	NC_020062	CAA	2	6	407016	407021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223323
8495	NC_020062	GAC	2	6	407055	407060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
8496	NC_020062	TCGGC	2	10	407132	407141	0 %	20 %	40 %	40 %	440223323
8497	NC_020062	CAGC	2	8	407205	407212	25 %	0 %	25 %	50 %	440223323
8498	NC_020062	CGG	2	6	407247	407252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
8499	NC_020062	ACG	2	6	407257	407262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
8500	NC_020062	GATC	2	8	407276	407283	25 %	25 %	25 %	25 %	440223323

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